67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A1256 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007614  Nmul_A1256  cytochrome c, class I  100 
 
 		 272 aa  567  1e-161  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0822  nitric oxide reductase, cytochrome c-containing subunit  61.01 
 
 		 277 aa  370  1e-101  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.198002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3436  cytochrome c, class I  55.86 
 
 		 290 aa  347  2e-94  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.441606  normal  0.713637 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2768  cytochrome c class I  55.86 
 
 		 290 aa  347  2e-94  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.712603  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3033  cytochrome c class I  34.8 
 
 		 238 aa  128  8.000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2759  cytochrome c class I  34.76 
 
 		 253 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1249  cytochrome c class I  34.16 
 
 		 238 aa  125  6e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3114  nitric-oxide reductase  37.59 
 
 		 149 aa  110  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.848793  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0121  nitric-oxide reductase  39.13 
 
 		 146 aa  105  7e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.281519  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1469  putative nitric-oxide reductase subunit C  34.31 
 
 		 144 aa  105  8e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0490072 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1981  nitric-oxide reductase  37.86 
 
 		 148 aa  104  1e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0562  nitric-oxide reductase subunit C  36.03 
 
 		 141 aa  102  5e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00000000244582  normal  0.667506 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06810  nitric-oxide reductase subunit C  37.23 
 
 		 146 aa  100  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0624  nitric-oxide reductase subunit C  37.23 
 
 		 146 aa  99.8  4e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.7522  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1641  nitric-oxide reductase, small subunit  38.51 
 
 		 150 aa  98.6  9e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0224  nitric-oxide reductase, small subunit  38.36 
 
 		 150 aa  98.6  1e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.501338  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4386  cytochrome c class I  35.21 
 
 		 150 aa  97.1  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0248  nitric-oxide reductase, small subunit  37.67 
 
 		 150 aa  97.1  3e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6289  cytochrome c class I  35.92 
 
 		 150 aa  96.7  4e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0600  nitric-oxide reductase, C subunit  34.29 
 
 		 148 aa  95.5  8e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2597  cytochrome c class I  35.45 
 
 		 141 aa  93.2  5e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.570262  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2484  nitric-oxide reductase  35.81 
 
 		 150 aa  92.4  7e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.595154 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1850  nitric-oxide reductase  34.93 
 
 		 173 aa  91.3  1e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2088  nitric-oxide reductase subunit C  35.21 
 
 		 150 aa  91.7  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.601343  normal  0.740001 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3183  nitric-oxide reductase subunit C  35.14 
 
 		 150 aa  90.9  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0696448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1515  nitric-oxide reductase  35.14 
 
 		 150 aa  91.3  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0970  hypothetical protein  36.05 
 
 		 147 aa  91.3  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2117  nitric-oxide reductase  32.64 
 
 		 150 aa  87.8  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.916968 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3190  cytochrome c, class I  34.31 
 
 		 142 aa  87.4  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1969  nitric-oxide reductase  35.81 
 
 		 150 aa  87.4  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0324  nitric oxide reductase subunit C, cytochrome c  35.81 
 
 		 150 aa  87  3e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.115359  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2254  hypothetical protein  30.5 
 
 		 133 aa  79.7  0.00000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2401  hypothetical protein  37.74 
 
 		 200 aa  78.6  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1983  nitric-oxide reductase subunit NorC  35.58 
 
 		 228 aa  67.8  0.0000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000092612  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3763  cytochrome c class I  32.31 
 
 		 155 aa  60.5  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1709  cytochrome c class I  32.43 
 
 		 129 aa  59.3  0.00000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1729  methyl-accepting chemotaxis protein  28.42 
 
 		 862 aa  55.1  0.000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.371209  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3430  hydroxylamine reductase  30.3 
 
 		 690 aa  54.7  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.133713  decreased coverage  0.000818462 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2061  multicopper oxidase domain-containing protein  30.93 
 
 		 535 aa  53.5  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.429703  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2666  electron transport protein SCO1/SenC  30 
 
 		 327 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.239586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1966  multicopper oxidase domain-containing protein  30.93 
 
 		 535 aa  53.1  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.328521  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0944  mulitcopper oxidase domain-containing protein  29.81 
 
 		 487 aa  52.4  0.000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0010  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  29.21 
 
 		 863 aa  51.6  0.00001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0271061  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1522  cytochrome c oxidase, subunit II  35.37 
 
 		 330 aa  52  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3183  electron transport protein SCO1/SenC  30 
 
 		 327 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.106344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2533  electron transport protein SCO1/SenC  30 
 
 		 327 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0477  mulitcopper oxidase domain-containing protein  29.9 
 
 		 487 aa  50.4  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3736  hypothetical protein  26.36 
 
 		 136 aa  50.1  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0798  mulitcopper oxidase domain-containing protein  29.9 
 
 		 535 aa  49.7  0.00005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0659  mulitcopper oxidase domain-containing protein  29.9 
 
 		 535 aa  49.7  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.870882  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0548  mulitcopper oxidase domain-containing protein  29.9 
 
 		 487 aa  49.7  0.00005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.181487  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1613  multicopper oxidase domain-containing protein  29.9 
 
 		 535 aa  49.7  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3540  cytochrome c oxidase, subunit II  34.83 
 
 		 311 aa  49.3  0.00007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0515  cytochrome c class I  31.88 
 
 		 176 aa  47.8  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3989  cytochrome c oxidase, subunit II  36.94 
 
 		 330 aa  47.4  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00210  cytochrome C2  28 
 
 		 113 aa  45.1  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6323  cytochrome c class I  31.82 
 
 		 130 aa  45.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4471  hypothetical protein  37.5 
 
 		 377 aa  45.4  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.181787  decreased coverage  0.000989669 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0202  cytochrome c class I  26.06 
 
 		 264 aa  44.3  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1770  nitrous-oxide reductase NosZ  25.27 
 
 		 864 aa  44.7  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0773  cytochrome c, class I  27.59 
 
 		 326 aa  44.7  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0440  nitrous-oxide reductase  26.97 
 
 		 864 aa  43.9  0.003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.136119  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6886  cytochrome c oxidase, subunit II  34.55 
 
 		 313 aa  43.9  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2002  electron transport protein SCO1/SenC  31.33 
 
 		 363 aa  43.1  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0123  cytochrome c class I  28.95 
 
 		 418 aa  42.7  0.006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.266844  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1972  heme-binding protein  26.32 
 
 		 1110 aa  42.7  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2275  cytochrome c oxidase, subunit II  34.41 
 
 		 337 aa  42.4  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.869151  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>