66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5289 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_5289  cytochrome c class I  100 
 
 		 920 aa  1899    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.825886 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5004  hypothetical protein  29.14 
 
 		 1010 aa  278  3e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1171  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  25.53 
 
 		 491 aa  108  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3236  cytochrome c class I  22.35 
 
 		 647 aa  108  5e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0631004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1100  blue (type 1) copper domain protein  25.67 
 
 		 673 aa  107  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.303689  normal  0.203492 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1880  blue (type 1) copper domain protein  25.55 
 
 		 722 aa  105  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.459048 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2205  cytochrome c class I  23.14 
 
 		 656 aa  102  3e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.170192  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1580  large, multifunctional secreted protein  24.38 
 
 		 506 aa  101  6e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.10938  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4773  cytochrome c class I  22.8 
 
 		 669 aa  97.4  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.358642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0336  hypothetical protein  24.62 
 
 		 502 aa  95.9  3e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4180  cytochrome c oxidase, subunit II  43.88 
 
 		 314 aa  94.4  8e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.548982  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1522  cytochrome c oxidase, subunit II  44.79 
 
 		 330 aa  87.4  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0515  cytochrome c class I  41.58 
 
 		 176 aa  87  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1588  cytochrome c oxidase, subunit II  44.94 
 
 		 342 aa  86.7  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6271  cytochrome c class I  23.02 
 
 		 663 aa  87  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000987167  normal  0.709184 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0229  cytochrome c oxidase, subunit II  42.57 
 
 		 316 aa  85.5  0.000000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0502681  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6886  cytochrome c oxidase, subunit II  42.71 
 
 		 313 aa  85.5  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5817  cytochrome c oxidase, subunit II  42.71 
 
 		 310 aa  85.1  0.000000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.156146  hitchhiker  0.00847969 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1439  hypothetical protein  24.24 
 
 		 509 aa  84  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.421301  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3989  cytochrome c oxidase, subunit II  43.75 
 
 		 330 aa  80.5  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2996  cytochrome c oxidase, subunit II  39.36 
 
 		 329 aa  80.5  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.941612  hitchhiker  0.00487692 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6137  blue (type 1) copper domain protein  24.29 
 
 		 669 aa  79.7  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0848  cytochrome c oxidase subunit II  38.83 
 
 		 351 aa  78.2  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2419  cytochrome c oxidase, subunit II  40.43 
 
 		 358 aa  77.8  0.0000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0372558  normal  0.514395 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4435  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I:cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  37.5 
 
 		 316 aa  77.4  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0428074  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6229  cytochrome c oxidase, subunit II  34.74 
 
 		 359 aa  76.3  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.24435  normal  0.0456922 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0726  cytochrome c oxidase, subunit II  35.43 
 
 		 388 aa  74.7  0.000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.631169  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5948  cytochrome c oxidase, subunit II  34.95 
 
 		 318 aa  74.7  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0024  cytochrome c oxidase, subunit II  34.41 
 
 		 362 aa  73.2  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.901821 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3795  cytochrome c oxidase subunit II  36.21 
 
 		 382 aa  72.8  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4872  cytochrome c oxidase subunit II  36.21 
 
 		 382 aa  72.8  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.780427  normal  0.052805 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0828  cytochrome c oxidase, subunit II  28.48 
 
 		 321 aa  72.8  0.00000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.304556 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0166  cytochrome c oxidase, subunit II  34.41 
 
 		 362 aa  72.4  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.129501  normal  0.0168942 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2275  cytochrome c oxidase, subunit II  34.31 
 
 		 337 aa  71.6  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.869151  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0222  cytochrome c oxidase, subunit II  35.48 
 
 		 362 aa  70.5  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0145699  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0533  cytochrome c oxidase, subunit II  33.79 
 
 		 405 aa  70.1  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.251737 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1600  cytochrome c oxidase, subunit II  27.35 
 
 		 337 aa  69.3  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.884566  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0414  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  38.95 
 
 		 311 aa  68.9  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2706  cytochrome c oxidase, subunit II  37.5 
 
 		 389 aa  68.9  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.363999 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1038  cytochrome c oxidase, subunit II  36.84 
 
 		 329 aa  69.3  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0922258 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1676  cytochrome c oxidase, subunit II  27.59 
 
 		 337 aa  68.9  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1538  cytochrome c oxidase, subunit II  35.79 
 
 		 399 aa  68.6  0.0000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1826  cytochrome c oxidase, subunit II, putative  38.68 
 
 		 408 aa  68.2  0.0000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.086817  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0851  cytochrome c oxidase, subunit II  36.84 
 
 		 350 aa  67  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0855  cytochrome c oxidase, subunit II  36.84 
 
 		 350 aa  67  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0803  cytochrome c oxidase, subunit II  36.84 
 
 		 350 aa  66.6  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.192306  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3632  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I  36.56 
 
 		 444 aa  65.9  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0045  cytochrome c oxidase, subunit II  33.33 
 
 		 300 aa  64.7  0.000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00101143 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1348  cytochrome c, monohaem  31.33 
 
 		 426 aa  64.3  0.000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.195405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3955  cytochrome c oxidase subunit II  35.48 
 
 		 391 aa  63.2  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.113374 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0252  cytochrome c oxidase, subunit II  29.35 
 
 		 302 aa  62.8  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.433496  normal  0.0258846 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5130  cytochrome c oxidase subunit II  34.82 
 
 		 384 aa  62  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0046  cytochrome c oxidase, subunit II  40.86 
 
 		 301 aa  62  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1564  cytochrome C oxidase polypeptide II  35.42 
 
 		 384 aa  62  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5936  cytochrome c oxidase subunit II  35.05 
 
 		 382 aa  62  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6209  cytochrome c oxidase, subunit II  35.05 
 
 		 382 aa  61.6  0.00000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7362  cytochrome c oxidase, subunit II  34.07 
 
 		 394 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.674364 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0222  cytochrome c oxidase, subunit II  35.11 
 
 		 288 aa  59.3  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2529  caa3-type cytochrome c oxidase, subunit II  30.3 
 
 		 318 aa  51.2  0.00009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.176117  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0421  glucose sorbosone dehydrogenase  27.39 
 
 		 363 aa  50.4  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000245782  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1425  NHL repeat-containing protein  25.31 
 
 		 446 aa  46.6  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3996  cytochrome c, class I  29.09 
 
 		 143 aa  46.2  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.91399  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1153  membrane-bound dehydrogenase domain protein  23.53 
 
 		 864 aa  46.2  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3264  c-type cytochrome  29.09 
 
 		 143 aa  45.8  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4792  cytochrome c oxidase, subunit II  37.5 
 
 		 354 aa  45.1  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0280165  normal  0.517537 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3430  hydroxylamine reductase  30.65 
 
 		 690 aa  45.1  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.133713  decreased coverage  0.000818462 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>