43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2011 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2011  hypothetical protein  100 
 
 		 152 aa  312  9e-85  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0446  cytochrome c class I  50 
 
 		 169 aa  120  5e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000163065  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1274  cytochrome c class I  46.23 
 
 		 166 aa  115  1.9999999999999998e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0692  cytochrome c class I  31.08 
 
 		 153 aa  89.4  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.189823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0328  cytochrome c, class I  28.89 
 
 		 262 aa  57  0.00000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000605449  hitchhiker  0.0000000937241 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0202  cytochrome c class I  30.23 
 
 		 264 aa  53.5  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2002  electron transport protein SCO1/SenC  30.61 
 
 		 363 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3450  cytochrome c, class I  34.12 
 
 		 326 aa  52.8  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.60831  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1634  cytochrome c, class I  35.23 
 
 		 444 aa  52.8  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0773  cytochrome c, class I  31.76 
 
 		 326 aa  50.4  0.000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0477  mulitcopper oxidase domain-containing protein  31.52 
 
 		 487 aa  49.7  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2213  cytochrome c, mono- and diheme variant  44.68 
 
 		 435 aa  49.7  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2549  hypothetical protein  31.46 
 
 		 419 aa  48.5  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000354774  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3183  electron transport protein SCO1/SenC  28.89 
 
 		 327 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.106344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2666  electron transport protein SCO1/SenC  28.89 
 
 		 327 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.239586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2061  multicopper oxidase domain-containing protein  30.43 
 
 		 535 aa  47.8  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.429703  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1966  multicopper oxidase domain-containing protein  30.43 
 
 		 535 aa  47.4  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.328521  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2533  electron transport protein SCO1/SenC  28.89 
 
 		 327 aa  47.4  0.00008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0548  mulitcopper oxidase domain-containing protein  30.43 
 
 		 487 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.181487  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0659  mulitcopper oxidase domain-containing protein  30.43 
 
 		 535 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.870882  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1613  multicopper oxidase domain-containing protein  30.43 
 
 		 535 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0798  mulitcopper oxidase domain-containing protein  30.43 
 
 		 535 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0408  hypothetical protein  27.91 
 
 		 149 aa  45.4  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0357243  normal  0.780002 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0944  mulitcopper oxidase domain-containing protein  31.11 
 
 		 487 aa  45.4  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1770  nitrous-oxide reductase NosZ  27.08 
 
 		 864 aa  46.2  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1298  nitrous-oxide reductase  27.84 
 
 		 865 aa  46.2  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.0000502464  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2297  hypothetical protein  29.03 
 
 		 302 aa  45.1  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0292911 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00360  Cytochrome c-551  41.03 
 
 		 104 aa  45.4  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.66895  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4930  cytochrome c family protein  24.58 
 
 		 229 aa  45.1  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4298  electron transport protein SCO1/SenC  26.21 
 
 		 356 aa  44.3  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.576554  normal  0.116198 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0718  cytochrome c class I  32.26 
 
 		 457 aa  43.9  0.0007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0002252  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2655  cytochrome c class I  28.39 
 
 		 144 aa  43.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3477  cytochrome c class I  27.91 
 
 		 425 aa  43.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.333881  normal  0.501976 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0650  electron transport protein SCO1/SenC  26.37 
 
 		 340 aa  43.5  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0910  cytochrome c class I  29.76 
 
 		 117 aa  41.6  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.58157e-33 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4957  Pyrrolo-quinoline quinone  34.34 
 
 		 698 aa  41.6  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.897916 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3190  cytochrome c class I  26.15 
 
 		 111 aa  41.6  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01315  Cytochrome c3  47.37 
 
 		 427 aa  41.6  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15700  cytochrome c, mono- and diheme variants family  29.57 
 
 		 259 aa  41.2  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.871134  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0515  cytochrome c class I  28.74 
 
 		 176 aa  41.2  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1724  cytochrome c class I  28.44 
 
 		 139 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.20972  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3134  cytochrome c, class I  32.31 
 
 		 129 aa  40.8  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1986  cytochrome c, class I  23.17 
 
 		 101 aa  40  0.01  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0022172  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>