54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3763 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_3763  cytochrome c class I  100 
 
 
155 aa  306  6.999999999999999e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1188  hypothetical protein  39.87 
 
 
351 aa  85.9  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.914332 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3736  hypothetical protein  35.95 
 
 
136 aa  79  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4471  hypothetical protein  36.77 
 
 
377 aa  77  0.00000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.181787  decreased coverage  0.000989669 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2778  hypothetical protein  34.23 
 
 
335 aa  75.5  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.687972  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1709  cytochrome c class I  39.76 
 
 
129 aa  70.1  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0822  nitric oxide reductase, cytochrome c-containing subunit  35.77 
 
 
277 aa  67  0.00000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.198002  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1256  cytochrome c, class I  32.31 
 
 
272 aa  60.5  0.000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2768  cytochrome c class I  34.88 
 
 
290 aa  55.5  0.0000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.712603  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3436  cytochrome c, class I  35.66 
 
 
290 aa  55.5  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.441606  normal  0.713637 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0515  cytochrome c class I  33.85 
 
 
176 aa  54.7  0.0000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1903  cytochrome c oxidase, subunit II  33.73 
 
 
344 aa  47  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3430  hydroxylamine reductase  30.72 
 
 
690 aa  47  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.133713  decreased coverage  0.000818462 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0712  cytochrome c, class I  32.97 
 
 
184 aa  45.8  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.586308  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3357  cytochrome c class I  34.44 
 
 
179 aa  45.4  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.614662  normal  0.166545 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78490  cytochrome c  30.11 
 
 
110 aa  46.2  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.635362  normal  0.967273 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3671  monoheme cytochrome SoxX (sulfur oxidation)  35.43 
 
 
135 aa  45.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176373  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1855  cytochrome c oxidase, subunit II  32.41 
 
 
356 aa  45.1  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3471  cytochrome c, class I  32.17 
 
 
199 aa  44.7  0.0005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2860  hypothetical protein  32.08 
 
 
191 aa  44.3  0.0006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3717  monoheme cytochrome SoxX (sulfur oxidation)  30.53 
 
 
144 aa  43.9  0.0007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000435088  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2764  putative cytochrome c, putative soxX protein  30.56 
 
 
138 aa  43.9  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0341  cytochrome c class I  31.91 
 
 
305 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0386  cytochrome c class I  31.91 
 
 
305 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0274347  normal  0.666851 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3648  cytochrome c class I  32.58 
 
 
323 aa  43.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.238166  normal  0.256494 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4156  cytochrome c class I  32.22 
 
 
158 aa  42.7  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1826  cytochrome c oxidase, subunit II, putative  31.82 
 
 
408 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.086817  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6956  cytochrome c class I  30.08 
 
 
180 aa  42.7  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0327018 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3918  hypothetical protein  35.04 
 
 
156 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.32539 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0146  cytochrome c class I  31.13 
 
 
115 aa  42.7  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3426  cytochrome c class I  43.75 
 
 
263 aa  42.4  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3076  cytochrome c class I  30.7 
 
 
165 aa  42  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1001  Pyrrolo-quinoline quinone  31.08 
 
 
698 aa  41.6  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.132908 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1724  cytochrome c class I  29.93 
 
 
139 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.20972  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0983  cytochrome c oxidase, subunit II  29.63 
 
 
356 aa  41.6  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3817  cytochrome c, class I  31.58 
 
 
127 aa  41.6  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.376417  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3913  cytochrome c class I  32.98 
 
 
182 aa  41.6  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4085  cytochrome c, class I  41.67 
 
 
286 aa  41.2  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.699648  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2646  cytochrome c oxidase subunit II  29.13 
 
 
349 aa  40.8  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0991495  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0250  cytochrome c class I  31.58 
 
 
220 aa  40.8  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.312298  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2263  cytochrome c oxidase, subunit II  29.92 
 
 
367 aa  40.8  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0175262  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3742  cytochrome c, class I  28.97 
 
 
139 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.443469  hitchhiker  0.000332538 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0678  cytochrome c, class I  30.53 
 
 
173 aa  40.4  0.008  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3770  cytochrome c oxidase subunit II  27.36 
 
 
349 aa  40.4  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4062  cytochrome c oxidase, subunit II  28.3 
 
 
349 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3959  cytochrome c oxidase, subunit II  28.3 
 
 
349 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1909  monoheme cytochrome SoxX (sulfur oxidation)  32.65 
 
 
150 aa  40.4  0.009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00277827  normal  0.155687 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3704  cytochrome c oxidase, subunit II  28.3 
 
 
349 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.136015  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3687  cytochrome c oxidase, subunit II  28.3 
 
 
349 aa  40.4  0.009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0420  cytochrome c class I  29.79 
 
 
307 aa  40.4  0.01  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.556176  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3991  cytochrome c oxidase, subunit II  28.3 
 
 
349 aa  40.4  0.01  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0032  cytochrome c, class I  34.78 
 
 
160 aa  40.4  0.01  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00501524  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4154  cytochrome c oxidase subunit II  29.25 
 
 
349 aa  40.4  0.01  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3856  cytochrome c oxidase subunit II  29.25 
 
 
349 aa  40.4  0.01  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.15254  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>