More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1038 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_1038  cytochrome c oxidase, subunit II  100 
 
 		 329 aa  679    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0922258 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5948  cytochrome c oxidase, subunit II  44.27 
 
 		 318 aa  293  2e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2996  cytochrome c oxidase, subunit II  40.81 
 
 		 329 aa  287  2e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.941612  hitchhiker  0.00487692 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1522  cytochrome c oxidase, subunit II  43.03 
 
 		 330 aa  268  8.999999999999999e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1588  cytochrome c oxidase, subunit II  41.56 
 
 		 342 aa  263  3e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4435  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I:cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  41.5 
 
 		 316 aa  263  4e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0428074  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6886  cytochrome c oxidase, subunit II  41.83 
 
 		 313 aa  261  8.999999999999999e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0222  cytochrome c oxidase, subunit II  42.05 
 
 		 362 aa  258  7e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0145699  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5817  cytochrome c oxidase, subunit II  42.48 
 
 		 310 aa  258  9e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.156146  hitchhiker  0.00847969 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0166  cytochrome c oxidase, subunit II  41.72 
 
 		 362 aa  258  1e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.129501  normal  0.0168942 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6229  cytochrome c oxidase, subunit II  42.67 
 
 		 359 aa  256  3e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.24435  normal  0.0456922 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0024  cytochrome c oxidase, subunit II  41.72 
 
 		 362 aa  255  9e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.901821 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4180  cytochrome c oxidase, subunit II  40.85 
 
 		 314 aa  251  2e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.548982  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0828  cytochrome c oxidase, subunit II  38.19 
 
 		 321 aa  231  1e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.304556 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0229  cytochrome c oxidase, subunit II  38.61 
 
 		 316 aa  228  1e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0502681  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0803  cytochrome c oxidase, subunit II  34.02 
 
 		 350 aa  212  9e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.192306  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0851  cytochrome c oxidase, subunit II  33.73 
 
 		 350 aa  210  3e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0855  cytochrome c oxidase, subunit II  33.73 
 
 		 350 aa  210  3e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0848  cytochrome c oxidase subunit II  31.87 
 
 		 351 aa  204  2e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2529  caa3-type cytochrome c oxidase, subunit II  35.58 
 
 		 318 aa  192  7e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.176117  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1244  cytochrome c oxidase, subunit II  46.7 
 
 		 211 aa  190  2e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3989  cytochrome c oxidase, subunit II  33.23 
 
 		 330 aa  189  4e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2706  cytochrome c oxidase, subunit II  32.84 
 
 		 389 aa  189  7e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.363999 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0414  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  33.77 
 
 		 311 aa  189  7e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0533  cytochrome c oxidase, subunit II  36.21 
 
 		 405 aa  182  5.0000000000000004e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.251737 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0252  cytochrome c oxidase, subunit II  34.32 
 
 		 302 aa  181  2e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.433496  normal  0.0258846 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2419  cytochrome c oxidase, subunit II  31.58 
 
 		 358 aa  179  5.999999999999999e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0372558  normal  0.514395 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0222  cytochrome c oxidase, subunit II  32.98 
 
 		 288 aa  176  4e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1538  cytochrome c oxidase, subunit II  32.45 
 
 		 399 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1348  cytochrome c, monohaem  33.33 
 
 		 426 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.195405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1826  cytochrome c oxidase, subunit II, putative  32.13 
 
 		 408 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.086817  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0046  cytochrome c oxidase, subunit II  32.78 
 
 		 301 aa  171  2e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0045  cytochrome c oxidase, subunit II  32.53 
 
 		 300 aa  168  9e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00101143 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2275  cytochrome c oxidase, subunit II  33.65 
 
 		 337 aa  167  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.869151  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1600  cytochrome c oxidase, subunit II  33.65 
 
 		 337 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.884566  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1676  cytochrome c oxidase, subunit II  33.33 
 
 		 337 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3795  cytochrome c oxidase subunit II  30.46 
 
 		 382 aa  157  2e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4872  cytochrome c oxidase subunit II  30.46 
 
 		 382 aa  157  2e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.780427  normal  0.052805 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1564  cytochrome C oxidase polypeptide II  29.12 
 
 		 384 aa  150  3e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0726  cytochrome c oxidase, subunit II  29.31 
 
 		 388 aa  146  6e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.631169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5936  cytochrome c oxidase subunit II  28.45 
 
 		 382 aa  144  3e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3632  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I  27.34 
 
 		 444 aa  142  7e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6209  cytochrome c oxidase, subunit II  28.16 
 
 		 382 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7362  cytochrome c oxidase, subunit II  27.51 
 
 		 394 aa  138  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.674364 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5130  cytochrome c oxidase subunit II  28.99 
 
 		 384 aa  138  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3955  cytochrome c oxidase subunit II  27.03 
 
 		 391 aa  129  5.0000000000000004e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.113374 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0544  cytochrome c oxidase, subunit II  25.28 
 
 		 544 aa  119  6e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.214831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4171  putative cytochrome c oxidase  25.28 
 
 		 538 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.82291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0033  cytochrome c oxidase, subunit II  27.66 
 
 		 279 aa  117  3e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.979273  normal  0.511366 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1645  cytochrome c oxidase, subunit II  25.56 
 
 		 385 aa  116  5e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.856042  normal  0.904416 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0426  cytochrome c oxidase, subunit II  27.61 
 
 		 525 aa  116  5e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3907  cytochrome c oxidase, subunit II  24.03 
 
 		 390 aa  116  6e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3197  cytochrome c oxidase, subunit II  26.24 
 
 		 525 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0672  cytochrome c oxidase, subunit II  26.24 
 
 		 525 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.275557  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0507  cytochrome c oxidase, subunit II  26.24 
 
 		 525 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0489  cytochrome c oxidase, subunit II  26.24 
 
 		 525 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3540  cytochrome c oxidase, subunit II  27.71 
 
 		 311 aa  115  7.999999999999999e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0170  cytochrome c oxidase, subunit II  26.24 
 
 		 517 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.32275  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1422  cytochrome c oxidase, subunit II  26.24 
 
 		 517 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2849  cytochrome c oxidase, subunit II  26.24 
 
 		 517 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0276  cytochrome c oxidase, subunit II  24.93 
 
 		 557 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0628  cytochrome c oxidase, subunit II  29.01 
 
 		 351 aa  114  3e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.197881 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1245  cytochrome c oxidase, subunit II  24.73 
 
 		 400 aa  113  3e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.731852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0104  cytochrome c oxidase subunit II  28.66 
 
 		 359 aa  113  4.0000000000000004e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.100023  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3263  cytochrome c oxidase, subunit II  27.23 
 
 		 279 aa  113  5e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.571759  normal  0.256995 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3587  cytochrome c oxidase, subunit II  27.23 
 
 		 279 aa  113  5e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.677515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1680  cytochrome c oxidase, subunit II  24.27 
 
 		 402 aa  113  5e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.450721  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3459  cytochrome c oxidase, subunit II  28.09 
 
 		 279 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.927042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2233  cytochrome c oxidase, subunit II  26.12 
 
 		 532 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.247804  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4506  cytochrome c oxidase, subunit II  29.27 
 
 		 304 aa  110  3e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.578189 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6176  cytochrome c oxidase, subunit II  26.12 
 
 		 531 aa  110  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.678657 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0456  cytochrome c oxidase, subunit II  25.36 
 
 		 532 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0878  cytochrome c oxidase, subunit II  24.93 
 
 		 401 aa  109  5e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2858  cytochrome c oxidase, subunit II  25.75 
 
 		 532 aa  109  6e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.760436 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2646  cytochrome c oxidase subunit II  28.29 
 
 		 349 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0991495  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2764  cytochrome c oxidase, subunit II  25.75 
 
 		 535 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.802533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1767  cytochrome c oxidase, subunit II  30.77 
 
 		 352 aa  109  7.000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.204958  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2847  cytochrome c oxidase, subunit II  25.75 
 
 		 532 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2902  cytochrome c oxidase, subunit II  25.75 
 
 		 535 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1940  cytochrome c oxidase, subunit II  25.38 
 
 		 385 aa  108  1e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0684443  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0783  cytochrome c oxidase, subunit II  29.39 
 
 		 372 aa  107  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0255  cytochrome-c oxidase  31.07 
 
 		 285 aa  107  4e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3463  cytochrome-c oxidase  31.07 
 
 		 285 aa  107  4e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0771  cytochrome c oxidase, subunit II  29.77 
 
 		 381 aa  106  4e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0315373  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0945  cytochrome oxidase subunit II  29.39 
 
 		 372 aa  106  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.891376  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4792  cytochrome c oxidase, subunit II  30.83 
 
 		 354 aa  106  5e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0280165  normal  0.517537 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0709  cytochrome c oxidase subunit II  28.41 
 
 		 355 aa  105  7e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.669005  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0237  cytochrome c oxidase, subunit II  25.08 
 
 		 418 aa  105  7e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0206186 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1449  cytochrome c oxidase, subunit II  27.59 
 
 		 346 aa  105  7e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.015711 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0218  cytochrome c oxidase, subunit II  25.08 
 
 		 418 aa  106  7e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.468069  normal  0.633646 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0362  putative cytochrome C oxidase polypeptide II precursor (cytochrome AA3 subunit 2) transmembrane protein  25.09 
 
 		 390 aa  105  8e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.934147 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3181  putative cytochrome C oxidase polypeptide II precursor  22.44 
 
 		 398 aa  105  9e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.8149  normal  0.584186 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3770  cytochrome c oxidase subunit II  26.86 
 
 		 349 aa  105  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1380  cytochrome c oxidase, subunit II  24.27 
 
 		 389 aa  105  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.459391  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2860  cytochrome c oxidase, subunit II  21.92 
 
 		 389 aa  104  2e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.699909  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0096  cytochrome c oxidase, subunit II  29.08 
 
 		 334 aa  104  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.296292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2026  cytochrome c oxidase, subunit II  28.8 
 
 		 346 aa  104  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000905775 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0183  cytochrome c oxidase, subunit II  27.76 
 
 		 377 aa  104  2e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.000324421  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0261  cytochrome c oxidase subunit II  26.15 
 
 		 422 aa  104  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.814908 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1237  cytochrome c oxidase, subunit II  25.82 
 
 		 303 aa  103  3e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.109976 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>