More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_0628 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_0628  cytochrome c oxidase, subunit II  100 
 
 
351 aa  724    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.197881 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0709  cytochrome c oxidase subunit II  59.27 
 
 
355 aa  428  1e-119  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.669005  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2263  cytochrome c oxidase, subunit II  36.68 
 
 
367 aa  227  2e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0175262  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3558  cytochrome c oxidase subunit II  37.83 
 
 
370 aa  226  5.0000000000000005e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.22857 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0407  cytochrome c oxidase, subunit II  37.14 
 
 
435 aa  218  1e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3540  cytochrome c oxidase, subunit II  37.38 
 
 
311 aa  198  1.0000000000000001e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3991  cytochrome c oxidase, subunit II  33.54 
 
 
349 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3856  cytochrome c oxidase subunit II  33.54 
 
 
349 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.15254  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3687  cytochrome c oxidase, subunit II  33.54 
 
 
349 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3704  cytochrome c oxidase, subunit II  33.54 
 
 
349 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.136015  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4154  cytochrome c oxidase subunit II  33.54 
 
 
349 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3959  cytochrome c oxidase, subunit II  33.54 
 
 
349 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4062  cytochrome c oxidase, subunit II  33.54 
 
 
349 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4046  cytochrome c oxidase, subunit II  33.23 
 
 
349 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1193  cytochrome c oxidase, subunit II  33.23 
 
 
349 aa  182  1e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2646  cytochrome c oxidase subunit II  32.61 
 
 
349 aa  181  2e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0991495  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3770  cytochrome c oxidase subunit II  32.61 
 
 
349 aa  179  7e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2991  cytochrome c oxidase, subunit II  33.75 
 
 
338 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.336386  normal  0.0255364 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3892  cytochrome c oxidase subunit II  37.21 
 
 
345 aa  175  9.999999999999999e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.740774  normal  0.178097 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0983  cytochrome c oxidase, subunit II  33.68 
 
 
356 aa  173  5e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1767  cytochrome c oxidase, subunit II  33.02 
 
 
352 aa  172  6.999999999999999e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.204958  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2347  cytochrome c oxidase, subunit II  33.43 
 
 
334 aa  171  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2072  cytochrome c oxidase, subunit II  32.02 
 
 
425 aa  168  1e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.54281 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0104  cytochrome c oxidase subunit II  32.49 
 
 
359 aa  167  2e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.100023  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5826  cytochrome c oxidase, subunit II  39.27 
 
 
330 aa  166  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2266  cytochrome c, monohaem  32.56 
 
 
336 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.380948  normal  0.0167103 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1449  cytochrome c oxidase, subunit II  33.13 
 
 
346 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.015711 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6572  cytochrome c, monohaem  32.89 
 
 
352 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.381109  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1292  cytochrome c oxidase, subunit II  34.31 
 
 
354 aa  162  6e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.493898  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5244  cytochrome c oxidase, subunit II  29.61 
 
 
326 aa  162  8.000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0788277  normal  0.868201 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6539  cytochrome c, monohaem  34.1 
 
 
434 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.537411  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6286  cytochrome c oxidase, subunit II  33.11 
 
 
352 aa  161  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.257472  normal  0.0263748 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1855  cytochrome c oxidase, subunit II  32.65 
 
 
356 aa  160  2e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4792  cytochrome c oxidase, subunit II  31.63 
 
 
354 aa  160  3e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0280165  normal  0.517537 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0945  cytochrome oxidase subunit II  31.33 
 
 
372 aa  159  5e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.891376  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0771  cytochrome c oxidase, subunit II  31.33 
 
 
381 aa  158  1e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0315373  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2183  putative cytochrome c oxidase polypeptide II precursor  36.56 
 
 
338 aa  157  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0732382 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0783  cytochrome c oxidase, subunit II  31.01 
 
 
372 aa  157  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5491  cytochrome c oxidase, subunit II  31.51 
 
 
355 aa  157  3e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31459  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0460  cytochrome c oxidase, subunit II  32.04 
 
 
353 aa  156  5.0000000000000005e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.354816  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2792  cytochrome c oxidase, subunit II  30.41 
 
 
330 aa  156  6e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.625738  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0079  putative cytochrome c oxidase subunit II  37.71 
 
 
342 aa  155  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.917681  hitchhiker  0.00234837 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6146  cytochrome c oxidase, subunit II  33.66 
 
 
353 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.870856  normal  0.304247 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2026  cytochrome c oxidase, subunit II  37.56 
 
 
346 aa  154  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000905775 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4760  cytochrome c oxidase subunit II  32.93 
 
 
327 aa  154  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.723293  normal  0.0836993 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0096  cytochrome c oxidase, subunit II  32.39 
 
 
334 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.296292  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1993  cytochrome c oxidase, subunit II  34.16 
 
 
314 aa  153  5e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0975891  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0697  cytochrome c oxidase, subunit II  38.33 
 
 
322 aa  153  5e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0118  cytochrome c oxidase, subunit IIC  36.96 
 
 
324 aa  151  1e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.134505  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5502  cytochrome c oxidase, subunit II  35.1 
 
 
370 aa  151  1e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.535121  normal  0.0572426 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1754  cytochrome c, monohaem  36.96 
 
 
324 aa  151  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3379  cytochrome c oxidase, subunit II  34.5 
 
 
318 aa  150  4e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0167  putative cytochrome c oxidase subunit II  35.16 
 
 
371 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.26265  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1705  cytochrome c, monohaem  35.46 
 
 
324 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.829367  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0879  cytochrome c oxidase, subunit II  31.72 
 
 
373 aa  147  3e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6354  cytochrome c oxidase subunit II  30.58 
 
 
334 aa  145  8.000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0314  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I:cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  31.56 
 
 
421 aa  144  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.659537  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3181  putative cytochrome C oxidase polypeptide II precursor  31.67 
 
 
398 aa  144  3e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.8149  normal  0.584186 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2962  cytochrome c oxidase, subunit II  29.71 
 
 
401 aa  140  1.9999999999999998e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2811  cytochrome c oxidase, subunit II  29.71 
 
 
401 aa  140  1.9999999999999998e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2529  caa3-type cytochrome c oxidase, subunit II  35.25 
 
 
318 aa  140  3e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.176117  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0362  putative cytochrome C oxidase polypeptide II precursor (cytochrome AA3 subunit 2) transmembrane protein  32.86 
 
 
390 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.934147 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0237  cytochrome c oxidase, subunit II  31.07 
 
 
418 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0206186 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0218  cytochrome c oxidase, subunit II  31.43 
 
 
418 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.468069  normal  0.633646 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3818  cytochrome c oxidase, subunit II  28.34 
 
 
388 aa  138  1e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.198752 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0229  cytochrome c oxidase, subunit II  31.06 
 
 
316 aa  138  1e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0502681  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4506  cytochrome c oxidase, subunit II  33.8 
 
 
304 aa  137  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.578189 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0533  cytochrome c oxidase, subunit II  35.84 
 
 
405 aa  137  2e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.251737 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11170  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit II  34.72 
 
 
315 aa  138  2e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.761021  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0325  cytochrome c oxidase subunit II  32.27 
 
 
382 aa  136  4e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0125401 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0261  cytochrome c oxidase subunit II  29.87 
 
 
422 aa  137  4e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.814908 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3907  cytochrome c oxidase, subunit II  27.76 
 
 
390 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3537  cytochrome c oxidase, subunit II  29.38 
 
 
389 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0700115  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2847  cytochrome c oxidase, subunit II  29.67 
 
 
532 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2860  cytochrome c oxidase, subunit II  29.94 
 
 
389 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.699909  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01290  cytochrome c oxidase, subunit II  30.2 
 
 
374 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.46157  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2858  cytochrome c oxidase, subunit II  29.67 
 
 
532 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.760436 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2233  cytochrome c oxidase, subunit II  29.67 
 
 
532 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.247804  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0456  cytochrome c oxidase, subunit II  29.67 
 
 
532 aa  134  3e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6176  cytochrome c oxidase, subunit II  29.33 
 
 
531 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.678657 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1676  cytochrome c oxidase, subunit II  31.65 
 
 
337 aa  132  6.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2275  cytochrome c oxidase, subunit II  31.01 
 
 
337 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.869151  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1600  cytochrome c oxidase, subunit II  31.33 
 
 
337 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.884566  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1380  cytochrome c oxidase, subunit II  26.91 
 
 
389 aa  131  2.0000000000000002e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.459391  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0426  cytochrome c oxidase, subunit II  29.67 
 
 
525 aa  130  3e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1940  cytochrome c oxidase, subunit II  29.75 
 
 
385 aa  130  3e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0684443  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1903  cytochrome c oxidase, subunit II  34.05 
 
 
344 aa  130  4.0000000000000003e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0180  cytochrome c oxidase subunit II  30.21 
 
 
366 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0252  cytochrome c oxidase, subunit II  29.1 
 
 
302 aa  129  8.000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.433496  normal  0.0258846 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1674  cytochrome c oxidase, subunit II  28.06 
 
 
380 aa  128  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1645  cytochrome c oxidase, subunit II  29.72 
 
 
385 aa  128  2.0000000000000002e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.856042  normal  0.904416 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2764  cytochrome c oxidase, subunit II  29 
 
 
535 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.802533  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1522  cytochrome c oxidase, subunit II  28.23 
 
 
330 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2902  cytochrome c oxidase, subunit II  29 
 
 
535 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3989  cytochrome c oxidase, subunit II  30.09 
 
 
330 aa  127  3e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3011  Cytochrome-c oxidase  28.83 
 
 
380 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.913445  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0103  cytochrome c oxidase, subunit II  28.52 
 
 
375 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.193198 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0119  cytochrome c oxidase, subunit II  28.19 
 
 
375 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0878  cytochrome c oxidase, subunit II  29.64 
 
 
401 aa  125  1e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1680  cytochrome c oxidase, subunit II  26.76 
 
 
402 aa  125  1e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.450721  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>