More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0167 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0167  putative cytochrome c oxidase subunit II  100 
 
 		 371 aa  747    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.26265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4792  cytochrome c oxidase, subunit II  69.14 
 
 		 354 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0280165  normal  0.517537 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0697  cytochrome c oxidase, subunit II  54.55 
 
 		 322 aa  311  9e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5244  cytochrome c oxidase, subunit II  45.26 
 
 		 326 aa  260  3e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0788277  normal  0.868201 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1449  cytochrome c oxidase, subunit II  41.41 
 
 		 346 aa  253  5.000000000000001e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.015711 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5826  cytochrome c oxidase, subunit II  48.96 
 
 		 330 aa  238  9e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2347  cytochrome c oxidase, subunit II  41.28 
 
 		 334 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2991  cytochrome c oxidase, subunit II  44.86 
 
 		 338 aa  231  1e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.336386  normal  0.0255364 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0096  cytochrome c oxidase, subunit II  42.22 
 
 		 334 aa  225  8e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.296292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6354  cytochrome c oxidase subunit II  39.02 
 
 		 334 aa  224  3e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5491  cytochrome c oxidase, subunit II  38.05 
 
 		 355 aa  216  7e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0079  putative cytochrome c oxidase subunit II  45.49 
 
 		 342 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.917681  hitchhiker  0.00234837 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1767  cytochrome c oxidase, subunit II  37.8 
 
 		 352 aa  213  4.9999999999999996e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.204958  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4760  cytochrome c oxidase subunit II  37.65 
 
 		 327 aa  211  1e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.723293  normal  0.0836993 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3379  cytochrome c oxidase, subunit II  43.58 
 
 		 318 aa  210  4e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0460  cytochrome c oxidase, subunit II  37.81 
 
 		 353 aa  209  4e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.354816  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6286  cytochrome c oxidase, subunit II  45.42 
 
 		 352 aa  209  7e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.257472  normal  0.0263748 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2183  putative cytochrome c oxidase polypeptide II precursor  45.53 
 
 		 338 aa  209  9e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0732382 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5502  cytochrome c oxidase, subunit II  46.25 
 
 		 370 aa  208  1e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.535121  normal  0.0572426 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6572  cytochrome c, monohaem  46.8 
 
 		 352 aa  208  1e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.381109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0771  cytochrome c oxidase, subunit II  41.04 
 
 		 381 aa  206  6e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0315373  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0945  cytochrome oxidase subunit II  40.72 
 
 		 372 aa  205  9e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.891376  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0783  cytochrome c oxidase, subunit II  40.39 
 
 		 372 aa  203  4e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3540  cytochrome c oxidase, subunit II  36.34 
 
 		 311 aa  203  5e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1705  cytochrome c, monohaem  35.9 
 
 		 324 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.829367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6539  cytochrome c, monohaem  43.87 
 
 		 434 aa  199  6e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.537411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2266  cytochrome c, monohaem  38.87 
 
 		 336 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.380948  normal  0.0167103 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1292  cytochrome c oxidase, subunit II  43.87 
 
 		 354 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.493898  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2026  cytochrome c oxidase, subunit II  43.64 
 
 		 346 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000905775 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2792  cytochrome c oxidase, subunit II  35.45 
 
 		 330 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.625738  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6146  cytochrome c oxidase, subunit II  43.87 
 
 		 353 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.870856  normal  0.304247 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0118  cytochrome c oxidase, subunit IIC  37.31 
 
 		 324 aa  195  1e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.134505  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2263  cytochrome c oxidase, subunit II  37.06 
 
 		 367 aa  195  1e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0175262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1754  cytochrome c, monohaem  42.05 
 
 		 324 aa  194  2e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3558  cytochrome c oxidase subunit II  34.78 
 
 		 370 aa  193  3e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.22857 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0104  cytochrome c oxidase subunit II  32.33 
 
 		 359 aa  184  2.0000000000000003e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.100023  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1993  cytochrome c oxidase, subunit II  37.23 
 
 		 314 aa  180  2.9999999999999997e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0975891  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3892  cytochrome c oxidase subunit II  35.19 
 
 		 345 aa  175  9.999999999999999e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.740774  normal  0.178097 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2072  cytochrome c oxidase, subunit II  31.54 
 
 		 425 aa  167  2.9999999999999998e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.54281 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0709  cytochrome c oxidase subunit II  33.22 
 
 		 355 aa  157  3e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.669005  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11170  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit II  42.66 
 
 		 315 aa  155  8e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.761021  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0628  cytochrome c oxidase, subunit II  30.93 
 
 		 351 aa  153  4e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.197881 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3856  cytochrome c oxidase subunit II  30.09 
 
 		 349 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.15254  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3687  cytochrome c oxidase, subunit II  30.09 
 
 		 349 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3704  cytochrome c oxidase, subunit II  30.09 
 
 		 349 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.136015  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3959  cytochrome c oxidase, subunit II  30.09 
 
 		 349 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4154  cytochrome c oxidase subunit II  30.09 
 
 		 349 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4062  cytochrome c oxidase, subunit II  30.09 
 
 		 349 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3991  cytochrome c oxidase, subunit II  30.09 
 
 		 349 aa  152  1e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4046  cytochrome c oxidase, subunit II  29.79 
 
 		 349 aa  150  4e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1193  cytochrome c oxidase, subunit II  29.79 
 
 		 349 aa  150  5e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0407  cytochrome c oxidase, subunit II  38.66 
 
 		 435 aa  149  8e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2646  cytochrome c oxidase subunit II  29.5 
 
 		 349 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0991495  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3770  cytochrome c oxidase subunit II  29.79 
 
 		 349 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0983  cytochrome c oxidase, subunit II  34.03 
 
 		 356 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1676  cytochrome c oxidase, subunit II  31.25 
 
 		 337 aa  130  3e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1600  cytochrome c oxidase, subunit II  31.25 
 
 		 337 aa  130  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.884566  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1855  cytochrome c oxidase, subunit II  33.06 
 
 		 356 aa  129  6e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2275  cytochrome c oxidase, subunit II  31.45 
 
 		 337 aa  126  5e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.869151  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3849  cytochrome c oxidase, subunit II  38.6 
 
 		 235 aa  125  9e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.26025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0156  cytochrome c oxidase, subunit II  36.45 
 
 		 232 aa  125  2e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4180  cytochrome c oxidase, subunit II  31.08 
 
 		 314 aa  124  2e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.548982  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0183  cytochrome c oxidase, subunit II  29.51 
 
 		 377 aa  122  7e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.000324421  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4435  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I:cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  30.89 
 
 		 316 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0428074  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0325  cytochrome c oxidase subunit II  30.24 
 
 		 382 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0125401 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1522  cytochrome c oxidase, subunit II  37.2 
 
 		 330 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1777  cytochrome c oxidase, subunit II  29.03 
 
 		 377 aa  120  3.9999999999999996e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.302976  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0229  cytochrome c oxidase, subunit II  33.19 
 
 		 316 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0502681  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0252  cytochrome c oxidase, subunit II  29.97 
 
 		 302 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.433496  normal  0.0258846 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3795  cytochrome c oxidase subunit II  28.94 
 
 		 382 aa  116  6.9999999999999995e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4872  cytochrome c oxidase subunit II  28.94 
 
 		 382 aa  116  6.9999999999999995e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.780427  normal  0.052805 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0222  cytochrome c oxidase, subunit II  32.39 
 
 		 362 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0145699  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5130  cytochrome c oxidase subunit II  29.46 
 
 		 384 aa  115  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0828  cytochrome c oxidase, subunit II  32.2 
 
 		 321 aa  114  2.0000000000000002e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.304556 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0166  cytochrome c oxidase, subunit II  32.39 
 
 		 362 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.129501  normal  0.0168942 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6886  cytochrome c oxidase, subunit II  36.02 
 
 		 313 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6229  cytochrome c oxidase, subunit II  32.09 
 
 		 359 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.24435  normal  0.0456922 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1588  cytochrome c oxidase, subunit II  32.22 
 
 		 342 aa  109  7.000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2313  cytochrome c oxidase, subunit II  34.57 
 
 		 244 aa  109  1e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.210732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0848  cytochrome c oxidase subunit II  31.95 
 
 		 351 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5948  cytochrome c oxidase, subunit II  30.87 
 
 		 318 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0851  cytochrome c oxidase, subunit II  28.62 
 
 		 350 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0154  cytochrome c oxidase, subunit II  28.32 
 
 		 518 aa  107  3e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0855  cytochrome c oxidase, subunit II  28.62 
 
 		 350 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01475  chain II protein of putative cytochrome c oxidase  29.13 
 
 		 234 aa  107  3e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0024  cytochrome c oxidase, subunit II  30.77 
 
 		 362 aa  106  5e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.901821 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4311  cytochrome c oxidase, subunit II  28.57 
 
 		 518 aa  106  7e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.997623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2706  cytochrome c oxidase, subunit II  31.64 
 
 		 389 aa  106  7e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.363999 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4606  cytochrome c oxidase, subunit II  27.86 
 
 		 513 aa  105  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0254  cytochrome c oxidase subunit II  28.35 
 
 		 269 aa  105  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00721127 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0533  cytochrome c oxidase, subunit II  33.51 
 
 		 405 aa  105  1e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.251737 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4112  cytochrome c oxidase, subunit II  27.86 
 
 		 518 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001445  cytochrome c oxidase polypeptide II  26.59 
 
 		 356 aa  105  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.633895  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1471  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I:cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  28.36 
 
 		 401 aa  105  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0803  cytochrome c oxidase, subunit II  27.92 
 
 		 350 aa  105  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.192306  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4180  cytochrome c oxidase, subunit II  28.21 
 
 		 518 aa  104  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1903  cytochrome c oxidase, subunit II  33.2 
 
 		 344 aa  105  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3955  cytochrome c oxidase subunit II  27.86 
 
 		 391 aa  105  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.113374 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3999  cytochrome c oxidase subunit II  27.62 
 
 		 524 aa  103  3e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3864  cytochrome c oxidase, subunit II  27.5 
 
 		 513 aa  103  4e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>