More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_6146 on replicon NC_010512
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6146  cytochrome c oxidase, subunit II  100 
 
 
353 aa  697    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.870856  normal  0.304247 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6539  cytochrome c, monohaem  95.75 
 
 
434 aa  625  1e-178  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.537411  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1292  cytochrome c oxidase, subunit II  95.47 
 
 
354 aa  619  1e-176  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.493898  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6286  cytochrome c oxidase, subunit II  83.33 
 
 
352 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.257472  normal  0.0263748 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6572  cytochrome c, monohaem  82.77 
 
 
352 aa  536  1e-151  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.381109  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5502  cytochrome c oxidase, subunit II  82.05 
 
 
370 aa  476  1e-133  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.535121  normal  0.0572426 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0771  cytochrome c oxidase, subunit II  70.89 
 
 
381 aa  426  1e-118  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0315373  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0783  cytochrome c oxidase, subunit II  70 
 
 
372 aa  414  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0945  cytochrome oxidase subunit II  70.32 
 
 
372 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.891376  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5491  cytochrome c oxidase, subunit II  60.19 
 
 
355 aa  366  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31459  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2183  putative cytochrome c oxidase polypeptide II precursor  57.53 
 
 
338 aa  360  3e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0732382 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2026  cytochrome c oxidase, subunit II  56.45 
 
 
346 aa  348  8e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000905775 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0079  putative cytochrome c oxidase subunit II  57.78 
 
 
342 aa  346  3e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.917681  hitchhiker  0.00234837 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0460  cytochrome c oxidase, subunit II  50.87 
 
 
353 aa  332  7.000000000000001e-90  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.354816  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1449  cytochrome c oxidase, subunit II  44.12 
 
 
346 aa  249  6e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.015711 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3379  cytochrome c oxidase, subunit II  46.42 
 
 
318 aa  245  8e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0697  cytochrome c oxidase, subunit II  54.34 
 
 
322 aa  238  1e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5826  cytochrome c oxidase, subunit II  49.57 
 
 
330 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3540  cytochrome c oxidase, subunit II  40.91 
 
 
311 aa  230  3e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5244  cytochrome c oxidase, subunit II  41.03 
 
 
326 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0788277  normal  0.868201 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1767  cytochrome c oxidase, subunit II  42.76 
 
 
352 aa  224  1e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.204958  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4760  cytochrome c oxidase subunit II  43.55 
 
 
327 aa  224  1e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.723293  normal  0.0836993 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6354  cytochrome c oxidase subunit II  40.58 
 
 
334 aa  223  4e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2792  cytochrome c oxidase, subunit II  41.91 
 
 
330 aa  222  7e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.625738  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4792  cytochrome c oxidase, subunit II  38.79 
 
 
354 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0280165  normal  0.517537 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2347  cytochrome c oxidase, subunit II  41.99 
 
 
334 aa  219  7e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2991  cytochrome c oxidase, subunit II  41.53 
 
 
338 aa  216  5e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.336386  normal  0.0255364 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1993  cytochrome c oxidase, subunit II  45.28 
 
 
314 aa  216  5.9999999999999996e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0975891  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0096  cytochrome c oxidase, subunit II  41.21 
 
 
334 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.296292  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2266  cytochrome c, monohaem  40.58 
 
 
336 aa  211  1e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.380948  normal  0.0167103 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0167  putative cytochrome c oxidase subunit II  43.87 
 
 
371 aa  210  3e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.26265  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3558  cytochrome c oxidase subunit II  38.46 
 
 
370 aa  202  5e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.22857 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2263  cytochrome c oxidase, subunit II  40.26 
 
 
367 aa  201  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0175262  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1705  cytochrome c, monohaem  41.57 
 
 
324 aa  186  5e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.829367  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0104  cytochrome c oxidase subunit II  33.53 
 
 
359 aa  183  4.0000000000000006e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.100023  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3892  cytochrome c oxidase subunit II  45.09 
 
 
345 aa  180  2.9999999999999997e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.740774  normal  0.178097 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11170  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit II  47.22 
 
 
315 aa  179  5.999999999999999e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.761021  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2072  cytochrome c oxidase, subunit II  33.95 
 
 
425 aa  176  5e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.54281 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0118  cytochrome c oxidase, subunit IIC  41.57 
 
 
324 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.134505  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1754  cytochrome c, monohaem  40.78 
 
 
324 aa  172  9e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0628  cytochrome c oxidase, subunit II  35.28 
 
 
351 aa  171  2e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.197881 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4046  cytochrome c oxidase, subunit II  28.96 
 
 
349 aa  157  3e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2646  cytochrome c oxidase subunit II  28.96 
 
 
349 aa  157  4e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0991495  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1193  cytochrome c oxidase, subunit II  28.96 
 
 
349 aa  157  4e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0407  cytochrome c oxidase, subunit II  35.76 
 
 
435 aa  156  5.0000000000000005e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3770  cytochrome c oxidase subunit II  28.96 
 
 
349 aa  155  8e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3856  cytochrome c oxidase subunit II  28.96 
 
 
349 aa  155  9e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.15254  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3687  cytochrome c oxidase, subunit II  28.96 
 
 
349 aa  155  9e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3704  cytochrome c oxidase, subunit II  28.96 
 
 
349 aa  155  9e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.136015  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4154  cytochrome c oxidase subunit II  28.96 
 
 
349 aa  155  9e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3959  cytochrome c oxidase, subunit II  28.96 
 
 
349 aa  155  9e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4062  cytochrome c oxidase, subunit II  28.96 
 
 
349 aa  155  9e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3991  cytochrome c oxidase, subunit II  33.33 
 
 
349 aa  155  1e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0709  cytochrome c oxidase subunit II  31.8 
 
 
355 aa  145  1e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.669005  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0983  cytochrome c oxidase, subunit II  31.14 
 
 
356 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01475  chain II protein of putative cytochrome c oxidase  38.86 
 
 
234 aa  131  2.0000000000000002e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1855  cytochrome c oxidase, subunit II  31.14 
 
 
356 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3849  cytochrome c oxidase, subunit II  35.83 
 
 
235 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.26025  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0252  cytochrome c oxidase, subunit II  29.22 
 
 
302 aa  120  3e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.433496  normal  0.0258846 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0229  cytochrome c oxidase, subunit II  32.23 
 
 
316 aa  120  3e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0502681  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3523  quinol oxidase AA3, subunit II  33.64 
 
 
301 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0156  cytochrome c oxidase, subunit II  37 
 
 
232 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4180  cytochrome c oxidase, subunit II  31.27 
 
 
314 aa  117  3.9999999999999997e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.548982  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0511  cytochrome c oxidase subunit II  35.62 
 
 
298 aa  116  5e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.263206  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2313  cytochrome c oxidase, subunit II  42.66 
 
 
244 aa  116  5e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.210732  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2406  cytochrome c oxidase, subunit II  27.68 
 
 
377 aa  116  5e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6229  cytochrome c oxidase, subunit II  31.52 
 
 
359 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.24435  normal  0.0456922 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3098  QoxB, quinol oxidase subunit II  37.13 
 
 
261 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01290  cytochrome c oxidase, subunit II  29.84 
 
 
374 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.46157  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04013  Cytochrome c oxidase, subunit II  28.46 
 
 
387 aa  114  3e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.94805  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0180  cytochrome c oxidase subunit II  29.44 
 
 
366 aa  113  6e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06272  cytochrome c oxidase, subunit II  27.62 
 
 
405 aa  113  6e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0879  cytochrome c oxidase, subunit II  25.74 
 
 
373 aa  112  8.000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0314  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I:cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  26.62 
 
 
421 aa  112  9e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.659537  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0258  cytochrome c oxidase, subunit II  27.2 
 
 
528 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1522  cytochrome c oxidase, subunit II  32 
 
 
330 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6886  cytochrome c oxidase, subunit II  34.27 
 
 
313 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1380  cytochrome c oxidase, subunit II  26.77 
 
 
389 aa  111  2.0000000000000002e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.459391  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0222  cytochrome c oxidase, subunit II  31.96 
 
 
362 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0145699  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1405  cytochrome-c oxidase  33.33 
 
 
343 aa  110  3e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0686645  normal  0.926821 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1826  cytochrome c oxidase, subunit II, putative  29.57 
 
 
408 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.086817  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1645  cytochrome c oxidase, subunit II  25.37 
 
 
385 aa  110  4.0000000000000004e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.856042  normal  0.904416 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0533  cytochrome c oxidase, subunit II  30.47 
 
 
405 aa  110  5e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.251737 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5130  cytochrome c oxidase subunit II  30.33 
 
 
384 aa  110  5e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5817  cytochrome c oxidase, subunit II  35.39 
 
 
310 aa  109  6e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.156146  hitchhiker  0.00847969 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3263  cytochrome c oxidase, subunit II  31.34 
 
 
279 aa  109  7.000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.571759  normal  0.256995 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1940  cytochrome c oxidase, subunit II  24.81 
 
 
385 aa  109  7.000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0684443  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3587  cytochrome c oxidase, subunit II  31.34 
 
 
279 aa  109  7.000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.677515  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3999  cytochrome c oxidase subunit II  25.71 
 
 
524 aa  109  8.000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0183  cytochrome c oxidase, subunit II  26.12 
 
 
377 aa  108  1e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.000324421  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1777  cytochrome c oxidase, subunit II  25.75 
 
 
377 aa  108  1e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.302976  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0848  cytochrome c oxidase subunit II  29.51 
 
 
351 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0166  cytochrome c oxidase, subunit II  33.9 
 
 
362 aa  108  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.129501  normal  0.0168942 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0062  cytochrome c oxidase, subunit II  26.62 
 
 
374 aa  107  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0885746  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0362  putative cytochrome C oxidase polypeptide II precursor (cytochrome AA3 subunit 2) transmembrane protein  25.68 
 
 
390 aa  107  3e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.934147 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0325  cytochrome c oxidase subunit II  28.25 
 
 
382 aa  107  3e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0125401 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0658  cytochrome C oxidase subunit II transmembrane region  30.36 
 
 
279 aa  107  3e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.508316  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0261  cytochrome c oxidase subunit II  27.67 
 
 
422 aa  107  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.814908 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0414  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  27.6 
 
 
311 aa  107  4e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0036  cytochrome c oxidase, subunit II  30.15 
 
 
378 aa  107  4e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>