More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3898 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_3898  cytochrome c oxidase subunit II  100 
 
 
285 aa  581  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2358  cytochrome c oxidase subunit II  85.36 
 
 
280 aa  498  1e-140  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.382023  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2474  cytochrome c oxidase, subunit II  67.7 
 
 
273 aa  391  1e-108  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.850241  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2425  cytochrome c oxidase subunit II  67.33 
 
 
314 aa  372  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.408327 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2594  cytochrome c oxidase subunit II  66.15 
 
 
272 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0132206  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2268  cytochrome c oxidase subunit II  65.37 
 
 
272 aa  362  3e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.130236  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3955  cytochrome c oxidase subunit II  54.38 
 
 
391 aa  321  9.000000000000001e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.113374 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0726  cytochrome c oxidase, subunit II  51.25 
 
 
388 aa  311  1e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.631169  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3795  cytochrome c oxidase subunit II  51.46 
 
 
382 aa  305  8.000000000000001e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4872  cytochrome c oxidase subunit II  51.46 
 
 
382 aa  305  8.000000000000001e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.780427  normal  0.052805 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3632  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I  57.2 
 
 
444 aa  304  1.0000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5130  cytochrome c oxidase subunit II  52.57 
 
 
384 aa  303  2.0000000000000002e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6209  cytochrome c oxidase, subunit II  53.46 
 
 
382 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5936  cytochrome c oxidase subunit II  53.46 
 
 
382 aa  302  4.0000000000000003e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1564  cytochrome C oxidase polypeptide II  57.14 
 
 
384 aa  302  5.000000000000001e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0254  cytochrome c oxidase subunit II  53.82 
 
 
269 aa  298  7e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00721127 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7362  cytochrome c oxidase, subunit II  52.38 
 
 
394 aa  292  4e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.674364 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2345  cytochrome c oxidase subunit II  46.49 
 
 
271 aa  258  1e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.215159  normal  0.967701 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0523  cytochrome c oxidase subunit II  34.47 
 
 
353 aa  156  5.0000000000000005e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00550922  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1640  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  29.69 
 
 
396 aa  152  5.9999999999999996e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.0000507027  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01285  Cytochrome c oxidase, subunit II:Cytochrome c, class I  29.14 
 
 
359 aa  151  1e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2207  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 2  33.69 
 
 
347 aa  149  5e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350149  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3471  cytochrome c oxidase subunit II  31.27 
 
 
370 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0997711  normal  0.165063 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5670  cytochrome c oxidase subunit II  35.47 
 
 
373 aa  145  7.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0294  cytochrome c oxidase subunit II  31.97 
 
 
408 aa  144  2e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00251297  hitchhiker  0.000594912 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0437  cytochrome c oxidase, subunit II  30.92 
 
 
267 aa  117  3e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0468935 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2958  cytochrome c oxidase subunit II  30.45 
 
 
269 aa  114  2.0000000000000002e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1588  cytochrome c oxidase, subunit II  33.49 
 
 
342 aa  110  3e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5948  cytochrome c oxidase, subunit II  29.22 
 
 
318 aa  108  9.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1903  cytochrome c oxidase, subunit II  31.25 
 
 
344 aa  107  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3558  cytochrome c oxidase subunit II  28.27 
 
 
370 aa  107  3e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.22857 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2263  cytochrome c oxidase, subunit II  28.94 
 
 
367 aa  106  4e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0175262  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04431  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  32.43 
 
 
291 aa  106  5e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3587  cytochrome c oxidase, subunit II  29.44 
 
 
279 aa  105  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.677515  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0828  cytochrome c oxidase, subunit II  30.65 
 
 
321 aa  105  1e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.304556 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3263  cytochrome c oxidase, subunit II  29.44 
 
 
279 aa  105  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.571759  normal  0.256995 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1777  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  32.2 
 
 
270 aa  103  2e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0414  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  28.44 
 
 
311 aa  104  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1600  cytochrome c oxidase, subunit II  31.65 
 
 
337 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.884566  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0222  cytochrome c oxidase, subunit II  31 
 
 
362 aa  103  3e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0145699  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1676  cytochrome c oxidase, subunit II  31.19 
 
 
337 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3459  cytochrome c oxidase, subunit II  28.97 
 
 
279 aa  102  5e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.927042  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05001  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  32.2 
 
 
270 aa  102  9e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.715952  normal  0.110072 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1538  cytochrome c oxidase, subunit II  27.6 
 
 
399 aa  102  1e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3989  cytochrome c oxidase, subunit II  30.33 
 
 
330 aa  101  1e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3573  cytochrome c oxidase subunit II  46.24 
 
 
360 aa  101  1e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6886  cytochrome c oxidase, subunit II  34.13 
 
 
313 aa  101  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0608  cytochrome c oxidase subunit II  31.38 
 
 
276 aa  99.8  4e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2996  cytochrome c oxidase, subunit II  28.31 
 
 
329 aa  99.8  4e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.941612  hitchhiker  0.00487692 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4435  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I:cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  32.2 
 
 
316 aa  99.4  5e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0428074  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2529  caa3-type cytochrome c oxidase, subunit II  30.13 
 
 
318 aa  99.8  5e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.176117  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2602  cytochrome c oxidase subunit II  29.04 
 
 
315 aa  99.8  5e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.405519 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4180  cytochrome c oxidase, subunit II  33.64 
 
 
314 aa  99.8  5e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.548982  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2862  cytochrome c oxidase subunit II  29.36 
 
 
272 aa  99.4  6e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0315403 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2275  cytochrome c oxidase, subunit II  29.82 
 
 
337 aa  99.4  6e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.869151  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06421  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  30.58 
 
 
274 aa  99.4  6e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0878998 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1211  Cytochrome-c oxidase  47.31 
 
 
351 aa  99  9e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.553445  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0528  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  26.37 
 
 
355 aa  98.2  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1348  cytochrome c, monohaem  28.38 
 
 
426 aa  98.2  1e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.195405  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5817  cytochrome c oxidase, subunit II  33.99 
 
 
310 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.156146  hitchhiker  0.00847969 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1779  cytochrome c oxidase, subunit II  26.42 
 
 
339 aa  98.2  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1522  cytochrome c oxidase, subunit II  30.46 
 
 
330 aa  97.4  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0024  cytochrome c oxidase, subunit II  33.76 
 
 
362 aa  97.1  3e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.901821 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0119  cytochrome c oxidase, subunit II  29.63 
 
 
375 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0166  cytochrome c oxidase, subunit II  34.39 
 
 
362 aa  97.1  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.129501  normal  0.0168942 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1826  cytochrome c oxidase, subunit II, putative  27.56 
 
 
408 aa  97.1  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.086817  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0122  cytochrome c oxidase, subunit II  29.17 
 
 
375 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.946881 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0252  cytochrome c oxidase, subunit II  30.67 
 
 
302 aa  95.5  9e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.433496  normal  0.0258846 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0293  cytochrome c oxidase, subunit II  30.14 
 
 
311 aa  95.5  9e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.142345  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05011  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  44.32 
 
 
267 aa  95.1  1e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0033  cytochrome c oxidase, subunit II  27.27 
 
 
279 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.979273  normal  0.511366 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0260  cytochrome c oxidase, subunit II  29.23 
 
 
288 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.150091  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04701  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  44.32 
 
 
267 aa  95.1  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0103  cytochrome c oxidase, subunit II  29.17 
 
 
375 aa  94  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.193198 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2349  cytochrome c oxidase, subunit II  29.74 
 
 
285 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.159121  normal  0.911923 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6229  cytochrome c oxidase, subunit II  33.76 
 
 
359 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.24435  normal  0.0456922 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0445  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  44.32 
 
 
267 aa  94.7  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0117  cytochrome c oxidase, subunit II  28.7 
 
 
375 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0102376 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0229  cytochrome c oxidase, subunit II  29.8 
 
 
316 aa  94.7  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0502681  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1674  cytochrome c oxidase, subunit II  28.45 
 
 
380 aa  93.6  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0222  cytochrome c oxidase, subunit II  28.11 
 
 
288 aa  93.6  4e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2072  cytochrome c oxidase, subunit II  27.03 
 
 
425 aa  93.2  4e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.54281 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05081  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  43.68 
 
 
267 aa  93.2  5e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.189517  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3958  cytochrome c oxidase, subunit II  27.89 
 
 
336 aa  92.8  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1940  cytochrome c oxidase, subunit II  26.11 
 
 
385 aa  92.4  8e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0684443  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0533  cytochrome c oxidase, subunit II  32.34 
 
 
405 aa  92.4  8e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.251737 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1244  cytochrome c oxidase, subunit II  40.82 
 
 
211 aa  92.4  8e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1645  cytochrome c oxidase, subunit II  25.7 
 
 
385 aa  92.4  8e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.856042  normal  0.904416 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0848  cytochrome c oxidase subunit II  28.7 
 
 
351 aa  92  9e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0079  cytochrome c oxidase, subunit II  28.24 
 
 
375 aa  92  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3540  cytochrome c oxidase, subunit II  25.21 
 
 
311 aa  92  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2419  cytochrome c oxidase, subunit II  27.24 
 
 
358 aa  91.7  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0372558  normal  0.514395 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0669  cytochrome c oxidase subunit II  24.68 
 
 
279 aa  91.3  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.12333  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1754  cytochrome c oxidase subunit II  44.66 
 
 
275 aa  91.3  2e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.636353  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3181  putative cytochrome C oxidase polypeptide II precursor  28.7 
 
 
398 aa  90.5  3e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.8149  normal  0.584186 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2489  cytochrome c oxidase, subunit II  28.02 
 
 
243 aa  89.7  5e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.500427  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3517  cytochrome c oxidase, subunit II  28.31 
 
 
511 aa  89.7  5e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1471  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I:cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  25.51 
 
 
401 aa  89  7e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2706  cytochrome c oxidase, subunit II  32.45 
 
 
389 aa  89  8e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.363999 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001445  cytochrome c oxidase polypeptide II  26.94 
 
 
356 aa  87.4  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.633895  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>