More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3471 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3471  cytochrome c oxidase subunit II  100 
 
 		 370 aa  765    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0997711  normal  0.165063 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5670  cytochrome c oxidase subunit II  59.25 
 
 		 373 aa  486  1e-136  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2207  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 2  51.76 
 
 		 347 aa  340  2e-92  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0523  cytochrome c oxidase subunit II  49.59 
 
 		 353 aa  250  2e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00550922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0294  cytochrome c oxidase subunit II  36.06 
 
 		 408 aa  236  6e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00251297  hitchhiker  0.000594912 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01285  Cytochrome c oxidase, subunit II:Cytochrome c, class I  35.03 
 
 		 359 aa  233  6e-60  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1640  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  34.97 
 
 		 396 aa  197  2.0000000000000003e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.0000507027  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3955  cytochrome c oxidase subunit II  31.91 
 
 		 391 aa  168  1e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.113374 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4872  cytochrome c oxidase subunit II  31.6 
 
 		 382 aa  160  4e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.780427  normal  0.052805 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3795  cytochrome c oxidase subunit II  31.6 
 
 		 382 aa  160  4e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3632  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I  31.6 
 
 		 444 aa  159  9e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5130  cytochrome c oxidase subunit II  37.7 
 
 		 384 aa  157  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0726  cytochrome c oxidase, subunit II  34.18 
 
 		 388 aa  156  6e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.631169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5936  cytochrome c oxidase subunit II  32.12 
 
 		 382 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6209  cytochrome c oxidase, subunit II  32.12 
 
 		 382 aa  153  5e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2474  cytochrome c oxidase, subunit II  34.19 
 
 		 273 aa  151  2e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.850241  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1564  cytochrome C oxidase polypeptide II  33.47 
 
 		 384 aa  149  6e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2594  cytochrome c oxidase subunit II  32.91 
 
 		 272 aa  149  6e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0132206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2268  cytochrome c oxidase subunit II  33.33 
 
 		 272 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.130236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3898  cytochrome c oxidase subunit II  31.27 
 
 		 285 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7362  cytochrome c oxidase, subunit II  32.34 
 
 		 394 aa  146  5e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.674364 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2358  cytochrome c oxidase subunit II  29.56 
 
 		 280 aa  146  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.382023  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2425  cytochrome c oxidase subunit II  30.69 
 
 		 314 aa  144  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.408327 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0254  cytochrome c oxidase subunit II  29.2 
 
 		 269 aa  141  1.9999999999999998e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00721127 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2958  cytochrome c oxidase subunit II  32.21 
 
 		 269 aa  136  5e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2345  cytochrome c oxidase subunit II  30.28 
 
 		 271 aa  132  1.0000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.215159  normal  0.967701 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0567  cytochrome c oxidase, subunit II  29.67 
 
 		 320 aa  116  6e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0584  cytochrome c oxidase, subunit II  29.67 
 
 		 320 aa  116  6e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0437  cytochrome c oxidase, subunit II  30.71 
 
 		 267 aa  110  3e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0468935 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4071  cytochrome c oxidase, subunit II  27.24 
 
 		 328 aa  109  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2419  cytochrome c oxidase, subunit II  27.97 
 
 		 358 aa  108  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0372558  normal  0.514395 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0848  cytochrome c oxidase subunit II  29.64 
 
 		 351 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1674  cytochrome c oxidase, subunit II  28.82 
 
 		 380 aa  103  4e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1779  cytochrome c oxidase, subunit II  28.33 
 
 		 339 aa  102  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3958  cytochrome c oxidase, subunit II  25.97 
 
 		 336 aa  99.4  8e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1826  cytochrome c oxidase, subunit II, putative  23.18 
 
 		 408 aa  99.4  8e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.086817  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3989  cytochrome c oxidase, subunit II  27.24 
 
 		 330 aa  99  1e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1680  cytochrome c oxidase, subunit II  27.78 
 
 		 402 aa  99  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.450721  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1522  cytochrome c oxidase, subunit II  27.49 
 
 		 330 aa  98.2  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0533  cytochrome c oxidase, subunit II  25.76 
 
 		 405 aa  98.2  2e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.251737 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2602  cytochrome c oxidase subunit II  25.08 
 
 		 315 aa  98.2  2e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.405519 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1588  cytochrome c oxidase, subunit II  26.72 
 
 		 342 aa  97.8  3e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0446  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  25.49 
 
 		 324 aa  97.1  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.112901 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0414  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  25.4 
 
 		 311 aa  97.4  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1348  cytochrome c, monohaem  25.75 
 
 		 426 aa  97.4  4e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.195405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2847  cytochrome c oxidase, subunit II  28.03 
 
 		 532 aa  97.1  5e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5948  cytochrome c oxidase, subunit II  28.29 
 
 		 318 aa  97.1  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1380  cytochrome c oxidase, subunit II  30.83 
 
 		 389 aa  97.1  5e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.459391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2858  cytochrome c oxidase, subunit II  28.03 
 
 		 532 aa  97.1  5e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.760436 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1903  cytochrome c oxidase, subunit II  29.11 
 
 		 344 aa  96.7  6e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2233  cytochrome c oxidase, subunit II  28.03 
 
 		 532 aa  96.7  6e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.247804  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1538  cytochrome c oxidase, subunit II  24.15 
 
 		 399 aa  96.3  7e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0456  cytochrome c oxidase, subunit II  29.29 
 
 		 532 aa  96.3  7e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3818  cytochrome c oxidase, subunit II  26.62 
 
 		 388 aa  96.3  8e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.198752 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3907  cytochrome c oxidase, subunit II  28.69 
 
 		 390 aa  95.5  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6176  cytochrome c oxidase, subunit II  28.03 
 
 		 531 aa  95.9  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.678657 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1940  cytochrome c oxidase, subunit II  27.59 
 
 		 385 aa  95.5  1e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0684443  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0426  cytochrome c oxidase, subunit II  29.46 
 
 		 525 aa  95.5  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2641  cytochrome c oxidase subunit II  23.91 
 
 		 321 aa  95.5  1e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.398022  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2862  cytochrome c oxidase subunit II  29.92 
 
 		 272 aa  94.7  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0315403 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1676  cytochrome c oxidase, subunit II  29.91 
 
 		 337 aa  94.7  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2764  cytochrome c oxidase, subunit II  28.57 
 
 		 535 aa  94.7  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.802533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2529  caa3-type cytochrome c oxidase, subunit II  26.61 
 
 		 318 aa  94.4  3e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.176117  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1600  cytochrome c oxidase, subunit II  29.49 
 
 		 337 aa  94.4  3e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.884566  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2902  cytochrome c oxidase, subunit II  28.57 
 
 		 535 aa  94.4  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2263  cytochrome c oxidase, subunit II  25.74 
 
 		 367 aa  94.4  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0175262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0252  cytochrome c oxidase, subunit II  25.85 
 
 		 302 aa  94  4e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.433496  normal  0.0258846 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4392  cytochrome c oxidase, subunit II  30.04 
 
 		 392 aa  94  4e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4180  cytochrome c oxidase, subunit II  25.7 
 
 		 314 aa  94  4e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.548982  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0222  cytochrome c oxidase, subunit II  27.49 
 
 		 362 aa  93.2  6e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0145699  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1645  cytochrome c oxidase, subunit II  26.23 
 
 		 385 aa  93.2  7e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.856042  normal  0.904416 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3197  cytochrome c oxidase, subunit II  29.05 
 
 		 525 aa  92.8  9e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1422  cytochrome c oxidase, subunit II  29.05 
 
 		 517 aa  92.8  9e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0672  cytochrome c oxidase, subunit II  29.05 
 
 		 525 aa  92.8  9e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.275557  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2849  cytochrome c oxidase, subunit II  29.05 
 
 		 517 aa  92.8  9e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0170  cytochrome c oxidase, subunit II  29.05 
 
 		 517 aa  92.8  9e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.32275  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0489  cytochrome c oxidase, subunit II  29.05 
 
 		 525 aa  92.8  9e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0507  cytochrome c oxidase, subunit II  29.05 
 
 		 525 aa  92.8  9e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0528  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  25.08 
 
 		 355 aa  92.4  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3537  cytochrome c oxidase, subunit II  25 
 
 		 389 aa  92  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0700115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2860  cytochrome c oxidase, subunit II  24.4 
 
 		 389 aa  92.4  1e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.699909  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3181  putative cytochrome C oxidase polypeptide II precursor  27.68 
 
 		 398 aa  92.4  1e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.8149  normal  0.584186 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1777  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  26.95 
 
 		 270 aa  91.3  2e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3558  cytochrome c oxidase subunit II  25.11 
 
 		 370 aa  91.3  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.22857 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0803  cytochrome c oxidase, subunit II  26.77 
 
 		 350 aa  91.3  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.192306  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1245  cytochrome c oxidase, subunit II  27.93 
 
 		 400 aa  91.7  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.731852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2275  cytochrome c oxidase, subunit II  28.76 
 
 		 337 aa  90.9  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.869151  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2996  cytochrome c oxidase, subunit II  25.41 
 
 		 329 aa  91.3  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.941612  hitchhiker  0.00487692 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0229  cytochrome c oxidase, subunit II  27.35 
 
 		 316 aa  90.5  4e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0502681  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0855  cytochrome c oxidase, subunit II  26.77 
 
 		 350 aa  90.9  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0851  cytochrome c oxidase, subunit II  26.77 
 
 		 350 aa  90.9  4e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0544  cytochrome c oxidase, subunit II  28.67 
 
 		 544 aa  90.1  5e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.214831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05001  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  26.56 
 
 		 270 aa  89.7  7e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.715952  normal  0.110072 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0276  cytochrome c oxidase, subunit II  28.69 
 
 		 557 aa  89.4  9e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0045  cytochrome c oxidase, subunit II  25.42 
 
 		 300 aa  88.2  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00101143 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0608  cytochrome c oxidase subunit II  24.19 
 
 		 276 aa  88.2  2e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0024  cytochrome c oxidase, subunit II  28.35 
 
 		 362 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.901821 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0261  cytochrome c oxidase subunit II  27.71 
 
 		 422 aa  88.2  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.814908 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0166  cytochrome c oxidase, subunit II  28.35 
 
 		 362 aa  87  4e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.129501  normal  0.0168942 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4171  putative cytochrome c oxidase  26.51 
 
 		 538 aa  87  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.82291  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>