More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5670 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_5670  cytochrome c oxidase subunit II  100 
 
 
373 aa  773    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3471  cytochrome c oxidase subunit II  61.52 
 
 
370 aa  483  1e-135  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0997711  normal  0.165063 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2207  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 2  50.3 
 
 
347 aa  347  2e-94  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350149  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0294  cytochrome c oxidase subunit II  37.99 
 
 
408 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00251297  hitchhiker  0.000594912 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0523  cytochrome c oxidase subunit II  42.95 
 
 
353 aa  248  1e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00550922  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01285  Cytochrome c oxidase, subunit II:Cytochrome c, class I  35.33 
 
 
359 aa  226  3e-58  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1640  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  31.78 
 
 
396 aa  181  2e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.0000507027  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3795  cytochrome c oxidase subunit II  32.98 
 
 
382 aa  159  8e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4872  cytochrome c oxidase subunit II  32.98 
 
 
382 aa  159  8e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.780427  normal  0.052805 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0726  cytochrome c oxidase, subunit II  33.33 
 
 
388 aa  158  1e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.631169  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3955  cytochrome c oxidase subunit II  32.35 
 
 
391 aa  157  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.113374 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1564  cytochrome C oxidase polypeptide II  34.75 
 
 
384 aa  155  9e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3632  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I  32.79 
 
 
444 aa  154  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2594  cytochrome c oxidase subunit II  35.89 
 
 
272 aa  153  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0132206  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2358  cytochrome c oxidase subunit II  33.99 
 
 
280 aa  153  4e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.382023  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2474  cytochrome c oxidase, subunit II  37.93 
 
 
273 aa  152  7e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.850241  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5130  cytochrome c oxidase subunit II  37.07 
 
 
384 aa  150  4e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7362  cytochrome c oxidase, subunit II  33.62 
 
 
394 aa  149  8e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.674364 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2268  cytochrome c oxidase subunit II  35.08 
 
 
272 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.130236  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5936  cytochrome c oxidase subunit II  33.05 
 
 
382 aa  146  6e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3898  cytochrome c oxidase subunit II  35.47 
 
 
285 aa  145  1e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6209  cytochrome c oxidase, subunit II  32.63 
 
 
382 aa  145  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2425  cytochrome c oxidase subunit II  33.2 
 
 
314 aa  142  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.408327 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0254  cytochrome c oxidase subunit II  31.11 
 
 
269 aa  139  7.999999999999999e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00721127 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2345  cytochrome c oxidase subunit II  33.21 
 
 
271 aa  132  1.0000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.215159  normal  0.967701 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2958  cytochrome c oxidase subunit II  31.5 
 
 
269 aa  122  8e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0437  cytochrome c oxidase, subunit II  31.05 
 
 
267 aa  118  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0468935 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1826  cytochrome c oxidase, subunit II, putative  28.1 
 
 
408 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.086817  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0584  cytochrome c oxidase, subunit II  25.16 
 
 
320 aa  109  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0567  cytochrome c oxidase, subunit II  25.16 
 
 
320 aa  109  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3958  cytochrome c oxidase, subunit II  25.71 
 
 
336 aa  107  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1779  cytochrome c oxidase, subunit II  25.94 
 
 
339 aa  104  3e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0446  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  26.35 
 
 
324 aa  102  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.112901 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4071  cytochrome c oxidase, subunit II  24.44 
 
 
328 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2641  cytochrome c oxidase subunit II  25.61 
 
 
321 aa  102  2e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.398022  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2862  cytochrome c oxidase subunit II  31.1 
 
 
272 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0315403 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2419  cytochrome c oxidase, subunit II  26.18 
 
 
358 aa  100  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0372558  normal  0.514395 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0533  cytochrome c oxidase, subunit II  25.83 
 
 
405 aa  100  4e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.251737 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0848  cytochrome c oxidase subunit II  30.04 
 
 
351 aa  99.8  7e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1538  cytochrome c oxidase, subunit II  27.31 
 
 
399 aa  97.8  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1674  cytochrome c oxidase, subunit II  24.37 
 
 
380 aa  98.2  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5948  cytochrome c oxidase, subunit II  27.82 
 
 
318 aa  97.4  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0033  cytochrome c oxidase, subunit II  28.76 
 
 
279 aa  97.1  4e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.979273  normal  0.511366 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1348  cytochrome c, monohaem  27.12 
 
 
426 aa  97.1  5e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.195405  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2529  caa3-type cytochrome c oxidase, subunit II  27.12 
 
 
318 aa  96.7  6e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.176117  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3818  cytochrome c oxidase, subunit II  24.91 
 
 
388 aa  96.3  7e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.198752 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0414  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  24.8 
 
 
311 aa  96.3  8e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1680  cytochrome c oxidase, subunit II  25.56 
 
 
402 aa  95.5  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.450721  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0260  cytochrome c oxidase, subunit II  29.53 
 
 
288 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.150091  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2602  cytochrome c oxidase subunit II  26.62 
 
 
315 aa  95.1  2e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.405519 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1380  cytochrome c oxidase, subunit II  26.77 
 
 
389 aa  94.7  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.459391  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1588  cytochrome c oxidase, subunit II  27.87 
 
 
342 aa  94.7  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0426  cytochrome c oxidase, subunit II  28.22 
 
 
525 aa  94  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0222  cytochrome c oxidase, subunit II  27.57 
 
 
362 aa  94  4e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0145699  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4392  cytochrome c oxidase, subunit II  26.88 
 
 
392 aa  93.2  6e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1600  cytochrome c oxidase, subunit II  28.85 
 
 
337 aa  93.2  7e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.884566  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3989  cytochrome c oxidase, subunit II  27.46 
 
 
330 aa  93.2  7e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1676  cytochrome c oxidase, subunit II  27.67 
 
 
337 aa  93.2  7e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2349  cytochrome c oxidase, subunit II  30.05 
 
 
285 aa  92.8  9e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.159121  normal  0.911923 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0608  cytochrome c oxidase subunit II  23.94 
 
 
276 aa  92.4  1e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0803  cytochrome c oxidase, subunit II  28.69 
 
 
350 aa  92.4  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.192306  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4180  cytochrome c oxidase, subunit II  27.31 
 
 
314 aa  92  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.548982  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1522  cytochrome c oxidase, subunit II  25.6 
 
 
330 aa  92.4  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1903  cytochrome c oxidase, subunit II  28.39 
 
 
344 aa  92.8  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2849  cytochrome c oxidase, subunit II  27.8 
 
 
517 aa  91.7  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0507  cytochrome c oxidase, subunit II  27.8 
 
 
525 aa  91.7  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3197  cytochrome c oxidase, subunit II  27.8 
 
 
525 aa  91.7  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0672  cytochrome c oxidase, subunit II  27.8 
 
 
525 aa  91.7  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.275557  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0489  cytochrome c oxidase, subunit II  27.8 
 
 
525 aa  91.7  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0855  cytochrome c oxidase, subunit II  28.69 
 
 
350 aa  91.7  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1422  cytochrome c oxidase, subunit II  27.8 
 
 
517 aa  91.7  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0851  cytochrome c oxidase, subunit II  28.69 
 
 
350 aa  91.7  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0170  cytochrome c oxidase, subunit II  27.8 
 
 
517 aa  91.7  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.32275  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2847  cytochrome c oxidase, subunit II  26.78 
 
 
532 aa  90.5  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2858  cytochrome c oxidase, subunit II  26.78 
 
 
532 aa  90.9  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.760436 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6176  cytochrome c oxidase, subunit II  28.1 
 
 
531 aa  90.1  5e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.678657 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2275  cytochrome c oxidase, subunit II  24.65 
 
 
337 aa  90.1  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.869151  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2233  cytochrome c oxidase, subunit II  26.78 
 
 
532 aa  90.1  5e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.247804  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3907  cytochrome c oxidase, subunit II  27.71 
 
 
390 aa  89  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3263  cytochrome c oxidase, subunit II  27.78 
 
 
279 aa  89  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.571759  normal  0.256995 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0276  cytochrome c oxidase, subunit II  26.69 
 
 
557 aa  89.4  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3587  cytochrome c oxidase, subunit II  27.78 
 
 
279 aa  89  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.677515  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0544  cytochrome c oxidase, subunit II  27.13 
 
 
544 aa  88.6  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.214831  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3459  cytochrome c oxidase, subunit II  26.92 
 
 
279 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.927042  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0252  cytochrome c oxidase, subunit II  28.51 
 
 
302 aa  88.6  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.433496  normal  0.0258846 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0456  cytochrome c oxidase, subunit II  27.5 
 
 
532 aa  88.6  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0222  cytochrome c oxidase, subunit II  27.81 
 
 
288 aa  87.4  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3540  cytochrome c oxidase, subunit II  26.56 
 
 
311 aa  87  4e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0879  cytochrome c oxidase, subunit II  30 
 
 
373 aa  87  5e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2406  cytochrome c oxidase, subunit II  23.76 
 
 
377 aa  87  5e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2263  cytochrome c oxidase, subunit II  26.83 
 
 
367 aa  87  5e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0175262  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0036  cytochrome c oxidase, subunit II  26.69 
 
 
378 aa  86.7  6e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4171  putative cytochrome c oxidase  26.72 
 
 
538 aa  86.7  6e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.82291  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2764  cytochrome c oxidase, subunit II  27.43 
 
 
535 aa  86.7  6e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.802533  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2902  cytochrome c oxidase, subunit II  27.43 
 
 
535 aa  86.7  6e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1777  cytochrome c oxidase, subunit II  25 
 
 
377 aa  86.3  9e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.302976  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0183  cytochrome c oxidase, subunit II  25.41 
 
 
377 aa  85.9  0.000000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.000324421  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0229  cytochrome c oxidase, subunit II  25.71 
 
 
316 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0502681  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0261  cytochrome c oxidase subunit II  26.98 
 
 
422 aa  85.1  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.814908 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3537  cytochrome c oxidase, subunit II  25.85 
 
 
389 aa  84.7  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0700115  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>