More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_01285 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_01285  Cytochrome c oxidase, subunit II:Cytochrome c, class I  100 
 
 
359 aa  745    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1640  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  56.55 
 
 
396 aa  400  9.999999999999999e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.0000507027  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3471  cytochrome c oxidase subunit II  35.03 
 
 
370 aa  232  8.000000000000001e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0997711  normal  0.165063 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5670  cytochrome c oxidase subunit II  35.33 
 
 
373 aa  226  4e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2207  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 2  35.2 
 
 
347 aa  218  2e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350149  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0294  cytochrome c oxidase subunit II  35.01 
 
 
408 aa  213  5.999999999999999e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00251297  hitchhiker  0.000594912 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0523  cytochrome c oxidase subunit II  36.69 
 
 
353 aa  182  8.000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00550922  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3632  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I  33.82 
 
 
444 aa  162  9e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3955  cytochrome c oxidase subunit II  30.55 
 
 
391 aa  160  3e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.113374 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2474  cytochrome c oxidase, subunit II  31.33 
 
 
273 aa  155  1e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.850241  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4872  cytochrome c oxidase subunit II  30.74 
 
 
382 aa  154  2e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.780427  normal  0.052805 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3795  cytochrome c oxidase subunit II  30.74 
 
 
382 aa  154  2e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2345  cytochrome c oxidase subunit II  30.42 
 
 
271 aa  151  1e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.215159  normal  0.967701 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3898  cytochrome c oxidase subunit II  29.14 
 
 
285 aa  151  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2358  cytochrome c oxidase subunit II  31.09 
 
 
280 aa  150  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.382023  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0726  cytochrome c oxidase, subunit II  32.27 
 
 
388 aa  150  3e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.631169  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0254  cytochrome c oxidase subunit II  32.49 
 
 
269 aa  150  4e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00721127 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6209  cytochrome c oxidase, subunit II  31.97 
 
 
382 aa  150  4e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5936  cytochrome c oxidase subunit II  31.97 
 
 
382 aa  150  5e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5130  cytochrome c oxidase subunit II  30.03 
 
 
384 aa  148  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1564  cytochrome C oxidase polypeptide II  31 
 
 
384 aa  146  5e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7362  cytochrome c oxidase, subunit II  31.76 
 
 
394 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.674364 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2268  cytochrome c oxidase subunit II  30.6 
 
 
272 aa  140  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.130236  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2594  cytochrome c oxidase subunit II  30.6 
 
 
272 aa  140  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0132206  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2425  cytochrome c oxidase subunit II  32.28 
 
 
314 aa  138  1e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.408327 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0437  cytochrome c oxidase, subunit II  27.1 
 
 
267 aa  104  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0468935 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0608  cytochrome c oxidase subunit II  24.84 
 
 
276 aa  101  2e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2958  cytochrome c oxidase subunit II  27.6 
 
 
269 aa  100  5e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1903  cytochrome c oxidase, subunit II  26.44 
 
 
344 aa  99.8  7e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04431  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  27.05 
 
 
291 aa  94  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1779  cytochrome c oxidase, subunit II  23.92 
 
 
339 aa  93.2  6e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05011  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  25.83 
 
 
267 aa  92  1e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2602  cytochrome c oxidase subunit II  24.37 
 
 
315 aa  91.7  2e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.405519 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04701  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  26.14 
 
 
267 aa  89.7  7e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0445  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  26.14 
 
 
267 aa  89.4  9e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2862  cytochrome c oxidase subunit II  25.35 
 
 
272 aa  89  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0315403 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4435  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I:cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  26.95 
 
 
316 aa  88.6  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0428074  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06421  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  25.8 
 
 
274 aa  87.4  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0878998 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2419  cytochrome c oxidase, subunit II  25.52 
 
 
358 aa  87.4  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0372558  normal  0.514395 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3989  cytochrome c oxidase, subunit II  25.35 
 
 
330 aa  86.3  7e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4071  cytochrome c oxidase, subunit II  22.26 
 
 
328 aa  84  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0446  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  22.69 
 
 
324 aa  82.8  0.000000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.112901 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3958  cytochrome c oxidase, subunit II  21.39 
 
 
336 aa  82  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0293  cytochrome c oxidase, subunit II  23.96 
 
 
311 aa  82.4  0.00000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.142345  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1600  cytochrome c oxidase, subunit II  21.38 
 
 
337 aa  81.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.884566  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1676  cytochrome c oxidase, subunit II  21.72 
 
 
337 aa  81.6  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06272  cytochrome c oxidase, subunit II  24.61 
 
 
405 aa  81.6  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1522  cytochrome c oxidase, subunit II  24.81 
 
 
330 aa  80.9  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0310  cytochrome c oxidase, subunit II  24.62 
 
 
320 aa  80.5  0.00000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0572725 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0567  cytochrome c oxidase, subunit II  23.17 
 
 
320 aa  80.1  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0584  cytochrome c oxidase, subunit II  23.17 
 
 
320 aa  80.1  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1777  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  24.17 
 
 
270 aa  79.7  0.00000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2641  cytochrome c oxidase subunit II  21.3 
 
 
321 aa  79.7  0.00000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.398022  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05001  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  23.84 
 
 
270 aa  79.3  0.00000000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.715952  normal  0.110072 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2275  cytochrome c oxidase, subunit II  22.55 
 
 
337 aa  79  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.869151  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0122  cytochrome c oxidase, subunit II  21.28 
 
 
375 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.946881 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0879  cytochrome c oxidase, subunit II  25.45 
 
 
373 aa  77.8  0.0000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1826  cytochrome c oxidase, subunit II, putative  22.51 
 
 
408 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.086817  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2996  cytochrome c oxidase, subunit II  20.74 
 
 
329 aa  77.4  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.941612  hitchhiker  0.00487692 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1211  Cytochrome-c oxidase  25.5 
 
 
351 aa  76.6  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.553445  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2858  cytochrome c oxidase, subunit II  23.31 
 
 
532 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.760436 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2847  cytochrome c oxidase, subunit II  23.31 
 
 
532 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2233  cytochrome c oxidase, subunit II  23.31 
 
 
532 aa  76.3  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.247804  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0103  cytochrome c oxidase, subunit II  21.8 
 
 
375 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.193198 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0709  cytochrome c oxidase subunit II  25 
 
 
355 aa  75.9  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.669005  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5948  cytochrome c oxidase, subunit II  23.47 
 
 
318 aa  75.9  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0533  cytochrome c oxidase, subunit II  24.81 
 
 
405 aa  75.5  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.251737 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6176  cytochrome c oxidase, subunit II  23.31 
 
 
531 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.678657 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0119  cytochrome c oxidase, subunit II  21.11 
 
 
375 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0117  cytochrome c oxidase, subunit II  20.83 
 
 
375 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0102376 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0528  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  20.72 
 
 
355 aa  75.1  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0258  cytochrome c oxidase, subunit II  25.91 
 
 
528 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1453  cytochrome c oxidase, subunit II  27.03 
 
 
299 aa  73.9  0.000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0600133  normal  0.252589 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2336  cytochrome c oxidase, subunit II  21.8 
 
 
304 aa  73.9  0.000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.273176  normal  0.955931 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0456  cytochrome c oxidase, subunit II  24.09 
 
 
532 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0414  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  22.39 
 
 
311 aa  73.6  0.000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0236  cytochrome c oxidase, subunit II  22.01 
 
 
519 aa  73.2  0.000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.717105  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1588  cytochrome c oxidase, subunit II  22.14 
 
 
342 aa  73.2  0.000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3573  cytochrome c oxidase subunit II  27.4 
 
 
360 aa  73.2  0.000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1422  cytochrome c oxidase, subunit II  23.31 
 
 
517 aa  72.8  0.000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05081  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  24.4 
 
 
267 aa  72.8  0.000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.189517  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2849  cytochrome c oxidase, subunit II  23.31 
 
 
517 aa  72.8  0.000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0170  cytochrome c oxidase, subunit II  23.31 
 
 
517 aa  72.8  0.000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.32275  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3197  cytochrome c oxidase, subunit II  23.31 
 
 
525 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0672  cytochrome c oxidase, subunit II  23.31 
 
 
525 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.275557  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0489  cytochrome c oxidase, subunit II  23.31 
 
 
525 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0426  cytochrome c oxidase, subunit II  23.31 
 
 
525 aa  72  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0507  cytochrome c oxidase, subunit II  23.31 
 
 
525 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4180  cytochrome c oxidase, subunit II  20.5 
 
 
314 aa  72.8  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.548982  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1380  cytochrome c oxidase, subunit II  23.19 
 
 
389 aa  72.4  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.459391  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2962  cytochrome c oxidase, subunit II  23.19 
 
 
401 aa  72  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2811  cytochrome c oxidase, subunit II  23.19 
 
 
401 aa  72  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1754  cytochrome c oxidase subunit II  22.15 
 
 
275 aa  71.6  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.636353  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0981  cytochrome c oxidase subunit II  24.47 
 
 
311 aa  71.2  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0740961  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1940  cytochrome c oxidase, subunit II  22.52 
 
 
385 aa  72  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0684443  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0222  cytochrome c oxidase, subunit II  21.99 
 
 
362 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0145699  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0544  cytochrome c oxidase, subunit II  22.59 
 
 
544 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.214831  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6886  cytochrome c oxidase, subunit II  30.95 
 
 
313 aa  71.2  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2902  cytochrome c oxidase, subunit II  23.31 
 
 
535 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12631  cytochrome c oxidase subunit II  25.35 
 
 
311 aa  70.9  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>