More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3078 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_3078  cytochrome c oxidase, subunit II  100 
 
 		 260 aa  538  9.999999999999999e-153  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000302907  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1015  cytochrome c oxidase subunit II  57.14 
 
 		 314 aa  280  1e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0476756  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3150  cytochrome c oxidase, subunit II  54.7 
 
 		 340 aa  262  4e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1289  cytochrome c oxidase, subunit II  52.96 
 
 		 275 aa  253  2.0000000000000002e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.353123  normal  0.740937 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2670  cytochrome c oxidase, subunit II  52.87 
 
 		 265 aa  252  4.0000000000000004e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0983455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1801  cytochrome c oxidase subunit II  50.61 
 
 		 288 aa  251  6e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.191358 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0956  cytochrome c oxidase, subunit II  48.29 
 
 		 280 aa  249  3e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.137087 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1667  cytochrome c oxidase, subunit II  51.23 
 
 		 287 aa  249  4e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.23675 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3117  cytochrome c oxidase, subunit II  48.02 
 
 		 316 aa  241  6e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.762727  normal  0.80653 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1453  cytochrome c oxidase, subunit II  45 
 
 		 299 aa  226  4e-58  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0600133  normal  0.252589 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4128  cytochrome c oxidase subunit II  44.8 
 
 		 269 aa  222  4.9999999999999996e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3259  Cytochrome c oxidase subunit II  43.38 
 
 		 324 aa  219  3.9999999999999997e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0696554 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3141  cytochrome c oxidase, subunit II  43.28 
 
 		 324 aa  217  2e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2082  cytochrome c oxidase, subunit II  42.11 
 
 		 289 aa  216  2.9999999999999998e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3300  cytochrome c oxidase, subunit II  46.12 
 
 		 323 aa  215  5e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.86185  normal  0.446784 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3532  cytochrome c oxidase subunit II  45.31 
 
 		 323 aa  214  9.999999999999999e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.636307  decreased coverage  0.000170854 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15630  cytochrome c oxidase, subunit II  41.76 
 
 		 299 aa  213  1.9999999999999998e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.806307  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1885  cytochrome c oxidase, subunit II  43.39 
 
 		 288 aa  211  1e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.247552  hitchhiker  0.00527672 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2016  cytochrome c oxidase, subunit II  42.55 
 
 		 304 aa  209  3e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1367  cytochrome c oxidase, subunit II  42.8 
 
 		 311 aa  208  7e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1954  cytochrome c oxidase, subunit II  40.6 
 
 		 290 aa  207  2e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000330547 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16250  cytochrome c oxidase, subunit II  41.31 
 
 		 304 aa  205  6e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.178752  normal  0.538576 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2217  cytochrome c oxidase, subunit II  41.87 
 
 		 290 aa  201  8e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.120292  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14120  cytochrome c oxidase, subunit II  42.11 
 
 		 312 aa  197  2.0000000000000003e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3345  cytochrome c oxidase, subunit II  44.98 
 
 		 289 aa  196  3e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1537  cytochrome c oxidase subunit II  34.63 
 
 		 366 aa  187  1e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.162083  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12228  transmembrane cytochrome C oxidase subunit II ctaC  36 
 
 		 363 aa  181  8.000000000000001e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.272758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3255  cytochrome c oxidase subunit II  36.82 
 
 		 316 aa  180  2e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000163024  hitchhiker  0.0000318285 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3061  cytochrome c oxidase subunit II  34.32 
 
 		 398 aa  177  2e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.708633  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12220  cytochrome c oxidase, subunit II  36.25 
 
 		 286 aa  177  2e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0561533  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2949  cytochrome c oxidase, subunit II  34.83 
 
 		 344 aa  176  4e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3564  cytochrome c oxidase, subunit II  34.6 
 
 		 344 aa  171  1e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.205108  normal  0.039922 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3360  cytochrome c oxidase, subunit II  35.11 
 
 		 352 aa  171  1e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.773952  normal  0.0585586 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3309  cytochrome c oxidase, subunit II  35.11 
 
 		 352 aa  171  1e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49691  normal  0.220958 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3298  cytochrome c oxidase, subunit II  35.11 
 
 		 352 aa  171  1e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10630  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidases, subunit 2  38.49 
 
 		 315 aa  168  7e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.315267 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1824  cytochrome c oxidase subunit II  34.56 
 
 		 257 aa  160  2e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1038  cytochrome c oxidase, subunit II  32.53 
 
 		 388 aa  138  7.999999999999999e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3047  cytochrome c oxidase, subunit II  31.8 
 
 		 281 aa  137  2e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000013174  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0293  cytochrome c oxidase, subunit II  32.97 
 
 		 311 aa  137  2e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.142345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01290  cytochrome c oxidase, subunit II  30.83 
 
 		 374 aa  135  9e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.46157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0180  cytochrome c oxidase subunit II  30.43 
 
 		 366 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0036  cytochrome c oxidase, subunit II  32.58 
 
 		 378 aa  131  1.0000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2717  cytochrome c oxidase, subunit II  31.2 
 
 		 523 aa  130  1.0000000000000001e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.977219  normal  0.293993 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0879  cytochrome c oxidase, subunit II  34.55 
 
 		 373 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0062  cytochrome c oxidase, subunit II  31.84 
 
 		 374 aa  129  3e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0885746  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2263  cytochrome c oxidase, subunit II  34.78 
 
 		 367 aa  129  4.0000000000000003e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0175262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3558  cytochrome c oxidase subunit II  34.02 
 
 		 370 aa  127  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.22857 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0079  cytochrome c oxidase, subunit II  33.33 
 
 		 375 aa  126  3e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0119  cytochrome c oxidase, subunit II  33.8 
 
 		 375 aa  126  3e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4246  cytochrome c oxidase, subunit II  29.91 
 
 		 384 aa  126  3e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0183  cytochrome c oxidase, subunit II  29.88 
 
 		 377 aa  126  4.0000000000000003e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.000324421  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1777  cytochrome c oxidase, subunit II  30.67 
 
 		 377 aa  126  4.0000000000000003e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.302976  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0261  cytochrome c oxidase subunit II  29.3 
 
 		 422 aa  126  4.0000000000000003e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.814908 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0117  cytochrome c oxidase, subunit II  33.8 
 
 		 375 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0102376 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0103  cytochrome c oxidase, subunit II  33.33 
 
 		 375 aa  125  5e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.193198 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3782  cytochrome c oxidase, subunit II  28.69 
 
 		 512 aa  125  5e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0236  cytochrome c oxidase, subunit II  33.64 
 
 		 519 aa  125  7e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.717105  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01020  cytochrome c oxidase, subunit II  30.77 
 
 		 385 aa  125  7e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.24737  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2962  cytochrome c oxidase, subunit II  32.37 
 
 		 401 aa  125  8.000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2811  cytochrome c oxidase, subunit II  32.37 
 
 		 401 aa  125  8.000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0325  cytochrome c oxidase subunit II  30.34 
 
 		 382 aa  125  9e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0125401 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0310  cytochrome c oxidase, subunit II  29.23 
 
 		 320 aa  124  2e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0572725 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0122  cytochrome c oxidase, subunit II  32.87 
 
 		 375 aa  123  4e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.946881 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0258  cytochrome c oxidase, subunit II  29.91 
 
 		 528 aa  122  4e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3459  cytochrome c oxidase, subunit II  30.22 
 
 		 279 aa  122  5e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.927042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3517  cytochrome c oxidase, subunit II  31.22 
 
 		 511 aa  122  5e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3999  cytochrome c oxidase subunit II  31.49 
 
 		 524 aa  122  7e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04013  Cytochrome c oxidase, subunit II  28.81 
 
 		 387 aa  121  9e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.94805  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0314  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I:cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  29.7 
 
 		 421 aa  121  9e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.659537  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3263  cytochrome c oxidase, subunit II  30.22 
 
 		 279 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.571759  normal  0.256995 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3587  cytochrome c oxidase, subunit II  30.22 
 
 		 279 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.677515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3483  cytochrome c oxidase, subunit II  29.83 
 
 		 520 aa  119  6e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.243767 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4606  cytochrome c oxidase, subunit II  29.64 
 
 		 513 aa  118  7.999999999999999e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0178  cytochrome c oxidase, subunit II  29.06 
 
 		 513 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04019  cytochrome c oxidase, subunit II  31.31 
 
 		 308 aa  118  9.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0142  cytochrome c oxidase, subunit II  31.88 
 
 		 374 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3864  cytochrome c oxidase, subunit II  29.41 
 
 		 513 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0154  cytochrome c oxidase, subunit II  28.76 
 
 		 518 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4112  cytochrome c oxidase, subunit II  28.76 
 
 		 518 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3991  cytochrome c oxidase, subunit II  29.29 
 
 		 513 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0125  cytochrome c oxidase, subunit II  28.45 
 
 		 521 aa  116  3e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0198  cytochrome-c oxidase  29.18 
 
 		 524 aa  116  3e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4311  cytochrome c oxidase, subunit II  29 
 
 		 518 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.997623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1405  cytochrome-c oxidase  32.85 
 
 		 343 aa  116  3.9999999999999997e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0686645  normal  0.926821 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3791  cytochrome c oxidase, subunit II  29.29 
 
 		 513 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4506  cytochrome c oxidase, subunit II  31.1 
 
 		 304 aa  115  5e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.578189 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0456  cytochrome c oxidase, subunit II  27.04 
 
 		 532 aa  115  5e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3011  Cytochrome-c oxidase  29.23 
 
 		 380 aa  115  7.999999999999999e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.913445  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4180  cytochrome c oxidase, subunit II  28.57 
 
 		 518 aa  115  8.999999999999998e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6176  cytochrome c oxidase, subunit II  27.41 
 
 		 531 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.678657 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0426  cytochrome c oxidase, subunit II  25.93 
 
 		 525 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2858  cytochrome c oxidase, subunit II  27.04 
 
 		 532 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.760436 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2233  cytochrome c oxidase, subunit II  27.04 
 
 		 532 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.247804  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2847  cytochrome c oxidase, subunit II  27.04 
 
 		 532 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3892  cytochrome c oxidase subunit II  37.34 
 
 		 345 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.740774  normal  0.178097 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5244  cytochrome c oxidase, subunit II  30.77 
 
 		 326 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0788277  normal  0.868201 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1471  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I:cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  31.08 
 
 		 401 aa  113  3e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2860  cytochrome c oxidase, subunit II  30.43 
 
 		 389 aa  113  3e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.699909  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0237  cytochrome c oxidase, subunit II  28.81 
 
 		 418 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0206186 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>