More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3255 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3255  cytochrome c oxidase subunit II  100 
 
 		 316 aa  657    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000163024  hitchhiker  0.0000318285 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1367  cytochrome c oxidase, subunit II  52.12 
 
 		 311 aa  325  7e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10630  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidases, subunit 2  52.8 
 
 		 315 aa  293  4e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.315267 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3061  cytochrome c oxidase subunit II  42.42 
 
 		 398 aa  272  5.000000000000001e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.708633  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3309  cytochrome c oxidase, subunit II  41.55 
 
 		 352 aa  258  9e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49691  normal  0.220958 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3298  cytochrome c oxidase, subunit II  41.55 
 
 		 352 aa  258  9e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3360  cytochrome c oxidase, subunit II  41.55 
 
 		 352 aa  258  9e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.773952  normal  0.0585586 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2949  cytochrome c oxidase, subunit II  41.44 
 
 		 344 aa  255  6e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3564  cytochrome c oxidase, subunit II  40.8 
 
 		 344 aa  249  4e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.205108  normal  0.039922 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4128  cytochrome c oxidase subunit II  46.02 
 
 		 269 aa  246  4e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12228  transmembrane cytochrome C oxidase subunit II ctaC  41.62 
 
 		 363 aa  245  9e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.272758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3532  cytochrome c oxidase subunit II  46.31 
 
 		 323 aa  241  2e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.636307  decreased coverage  0.000170854 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3345  cytochrome c oxidase, subunit II  50.99 
 
 		 289 aa  239  2.9999999999999997e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3117  cytochrome c oxidase, subunit II  46.88 
 
 		 316 aa  239  5.999999999999999e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.762727  normal  0.80653 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3300  cytochrome c oxidase, subunit II  46.76 
 
 		 323 aa  238  6.999999999999999e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.86185  normal  0.446784 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1801  cytochrome c oxidase subunit II  44.35 
 
 		 288 aa  218  1e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.191358 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3259  Cytochrome c oxidase subunit II  36.97 
 
 		 324 aa  201  1.9999999999999998e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0696554 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1667  cytochrome c oxidase, subunit II  40.41 
 
 		 287 aa  196  4.0000000000000005e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.23675 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1289  cytochrome c oxidase, subunit II  41.22 
 
 		 275 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.353123  normal  0.740937 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15630  cytochrome c oxidase, subunit II  37.59 
 
 		 299 aa  189  5e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.806307  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0956  cytochrome c oxidase, subunit II  39.69 
 
 		 280 aa  186  4e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.137087 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1015  cytochrome c oxidase subunit II  41.13 
 
 		 314 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0476756  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3150  cytochrome c oxidase, subunit II  40.42 
 
 		 340 aa  183  3e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2670  cytochrome c oxidase, subunit II  41.91 
 
 		 265 aa  180  2.9999999999999997e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0983455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3078  cytochrome c oxidase, subunit II  36.82 
 
 		 260 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000302907  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16250  cytochrome c oxidase, subunit II  38.43 
 
 		 304 aa  179  7e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.178752  normal  0.538576 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2082  cytochrome c oxidase, subunit II  37.16 
 
 		 289 aa  177  2e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2016  cytochrome c oxidase, subunit II  38.46 
 
 		 304 aa  177  2e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3141  cytochrome c oxidase, subunit II  36.59 
 
 		 324 aa  175  9e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1954  cytochrome c oxidase, subunit II  35.45 
 
 		 290 aa  174  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000330547 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2217  cytochrome c oxidase, subunit II  38.2 
 
 		 290 aa  170  3e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.120292  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14120  cytochrome c oxidase, subunit II  38.01 
 
 		 312 aa  168  1e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1453  cytochrome c oxidase, subunit II  35.5 
 
 		 299 aa  167  2.9999999999999998e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0600133  normal  0.252589 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1885  cytochrome c oxidase, subunit II  36.36 
 
 		 288 aa  159  6e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.247552  hitchhiker  0.00527672 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12220  cytochrome c oxidase, subunit II  34.82 
 
 		 286 aa  148  1.0000000000000001e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0561533  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1537  cytochrome c oxidase subunit II  46.98 
 
 		 366 aa  148  1.0000000000000001e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.162083  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1824  cytochrome c oxidase subunit II  38.43 
 
 		 257 aa  144  1e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2962  cytochrome c oxidase, subunit II  28.8 
 
 		 401 aa  116  3.9999999999999997e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2811  cytochrome c oxidase, subunit II  28.8 
 
 		 401 aa  116  3.9999999999999997e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2717  cytochrome c oxidase, subunit II  25.96 
 
 		 523 aa  116  6e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.977219  normal  0.293993 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3999  cytochrome c oxidase subunit II  28.63 
 
 		 524 aa  112  6e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06272  cytochrome c oxidase, subunit II  28.06 
 
 		 405 aa  111  1.0000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01290  cytochrome c oxidase, subunit II  29.49 
 
 		 374 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.46157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3991  cytochrome c oxidase, subunit II  29.01 
 
 		 513 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3791  cytochrome c oxidase, subunit II  28.63 
 
 		 513 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0178  cytochrome c oxidase, subunit II  31.75 
 
 		 513 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3864  cytochrome c oxidase, subunit II  28.24 
 
 		 513 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4606  cytochrome c oxidase, subunit II  29.66 
 
 		 513 aa  108  1e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3517  cytochrome c oxidase, subunit II  29.74 
 
 		 511 aa  108  1e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0180  cytochrome c oxidase subunit II  29.15 
 
 		 366 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3047  cytochrome c oxidase, subunit II  29.17 
 
 		 281 aa  107  2e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000013174  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3782  cytochrome c oxidase, subunit II  29.31 
 
 		 512 aa  107  3e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4246  cytochrome c oxidase, subunit II  27.61 
 
 		 384 aa  107  4e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3483  cytochrome c oxidase, subunit II  28.57 
 
 		 520 aa  106  5e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.243767 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0119  cytochrome c oxidase, subunit II  27.94 
 
 		 375 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0236  cytochrome c oxidase, subunit II  29.17 
 
 		 519 aa  104  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.717105  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2406  cytochrome c oxidase, subunit II  28.52 
 
 		 377 aa  104  2e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0117  cytochrome c oxidase, subunit II  27.94 
 
 		 375 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0102376 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0407  cytochrome c oxidase, subunit II  30.3 
 
 		 435 aa  104  2e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0103  cytochrome c oxidase, subunit II  27.94 
 
 		 375 aa  102  6e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.193198 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0125  cytochrome c oxidase, subunit II  29.34 
 
 		 521 aa  102  7e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0154  cytochrome c oxidase, subunit II  28.76 
 
 		 518 aa  102  7e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0258  cytochrome c oxidase, subunit II  26.34 
 
 		 528 aa  102  7e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4311  cytochrome c oxidase, subunit II  28.76 
 
 		 518 aa  102  9e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.997623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4180  cytochrome c oxidase, subunit II  28.76 
 
 		 518 aa  101  1e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0122  cytochrome c oxidase, subunit II  28.08 
 
 		 375 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.946881 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0079  cytochrome c oxidase, subunit II  28.21 
 
 		 375 aa  102  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4112  cytochrome c oxidase, subunit II  28.76 
 
 		 518 aa  102  1e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0062  cytochrome c oxidase, subunit II  29.53 
 
 		 374 aa  100  3e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0885746  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0033  cytochrome c oxidase, subunit II  28.72 
 
 		 279 aa  100  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.979273  normal  0.511366 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3181  putative cytochrome C oxidase polypeptide II precursor  27.95 
 
 		 398 aa  99.8  6e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.8149  normal  0.584186 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1038  cytochrome c oxidase, subunit II  32.16 
 
 		 388 aa  99  9e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0036  cytochrome c oxidase, subunit II  27.92 
 
 		 378 aa  99  9e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0198  cytochrome-c oxidase  28.93 
 
 		 524 aa  98.6  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04019  cytochrome c oxidase, subunit II  29.06 
 
 		 308 aa  98.6  1e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04013  Cytochrome c oxidase, subunit II  27.42 
 
 		 387 aa  96.3  6e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.94805  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0879  cytochrome c oxidase, subunit II  29.44 
 
 		 373 aa  95.9  9e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4506  cytochrome c oxidase, subunit II  30.09 
 
 		 304 aa  95.1  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.578189 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0314  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I:cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  30.94 
 
 		 421 aa  94.4  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.659537  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0237  cytochrome c oxidase, subunit II  28.37 
 
 		 418 aa  94  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0206186 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0218  cytochrome c oxidase, subunit II  28.37 
 
 		 418 aa  94.4  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.468069  normal  0.633646 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1405  cytochrome-c oxidase  28.12 
 
 		 343 aa  93.6  4e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0686645  normal  0.926821 
 
 
-
 
NC_002978  WD0300  cytochrome c oxidase, subunit II  27.04 
 
 		 254 aa  92.8  7e-18  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001445  cytochrome c oxidase polypeptide II  27.48 
 
 		 356 aa  92.4  8e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.633895  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3459  cytochrome c oxidase, subunit II  28.63 
 
 		 279 aa  92.4  9e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.927042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0142  cytochrome c oxidase, subunit II  26.05 
 
 		 374 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2263  cytochrome c oxidase, subunit II  27.27 
 
 		 367 aa  91.3  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0175262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0544  cytochrome c oxidase, subunit II  27.51 
 
 		 544 aa  91.3  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.214831  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0628  cytochrome c oxidase, subunit II  32.09 
 
 		 351 aa  91.7  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.197881 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0261  cytochrome c oxidase subunit II  31.05 
 
 		 422 aa  90.9  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.814908 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0310  cytochrome c oxidase, subunit II  27.6 
 
 		 320 aa  91.3  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0572725 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0222  cytochrome c oxidase, subunit II  30.81 
 
 		 288 aa  90.5  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3263  cytochrome c oxidase, subunit II  28.63 
 
 		 279 aa  90.9  3e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.571759  normal  0.256995 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2641  cytochrome c oxidase subunit II  27.47 
 
 		 321 aa  90.5  3e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.398022  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0183  cytochrome c oxidase, subunit II  27 
 
 		 377 aa  90.5  3e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.000324421  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3587  cytochrome c oxidase, subunit II  28.63 
 
 		 279 aa  90.9  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.677515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0709  cytochrome c oxidase subunit II  26.89 
 
 		 355 aa  90.5  3e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.669005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0426  cytochrome c oxidase, subunit II  27.68 
 
 		 525 aa  90.5  4e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0156  cytochrome c oxidase, subunit II  33.2 
 
 		 232 aa  90.5  4e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1777  cytochrome c oxidase, subunit II  27.65 
 
 		 377 aa  89.7  5e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.302976  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>