More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3564 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_3564  cytochrome c oxidase, subunit II  100 
 
 		 344 aa  714    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.205108  normal  0.039922 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2949  cytochrome c oxidase, subunit II  86.92 
 
 		 344 aa  610  1e-173  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3309  cytochrome c oxidase, subunit II  75.36 
 
 		 352 aa  551  1e-156  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49691  normal  0.220958 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3360  cytochrome c oxidase, subunit II  75.36 
 
 		 352 aa  551  1e-156  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.773952  normal  0.0585586 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3298  cytochrome c oxidase, subunit II  75.36 
 
 		 352 aa  551  1e-156  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12228  transmembrane cytochrome C oxidase subunit II ctaC  75.89 
 
 		 363 aa  535  1e-151  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.272758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3061  cytochrome c oxidase subunit II  54.73 
 
 		 398 aa  372  1e-102  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.708633  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1537  cytochrome c oxidase subunit II  50 
 
 		 366 aa  343  2e-93  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.162083  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1367  cytochrome c oxidase, subunit II  45.29 
 
 		 311 aa  293  3e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3255  cytochrome c oxidase subunit II  40.17 
 
 		 316 aa  260  2e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000163024  hitchhiker  0.0000318285 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4128  cytochrome c oxidase subunit II  43.91 
 
 		 269 aa  256  4e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3345  cytochrome c oxidase, subunit II  44.82 
 
 		 289 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10630  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidases, subunit 2  43.38 
 
 		 315 aa  248  9e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.315267 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3532  cytochrome c oxidase subunit II  42.36 
 
 		 323 aa  245  6.999999999999999e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.636307  decreased coverage  0.000170854 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3300  cytochrome c oxidase, subunit II  41.67 
 
 		 323 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.86185  normal  0.446784 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1289  cytochrome c oxidase, subunit II  34.8 
 
 		 275 aa  181  2e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.353123  normal  0.740937 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1667  cytochrome c oxidase, subunit II  32.3 
 
 		 287 aa  176  6e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.23675 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1801  cytochrome c oxidase subunit II  34.45 
 
 		 288 aa  175  9.999999999999999e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.191358 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3078  cytochrome c oxidase, subunit II  34.09 
 
 		 260 aa  172  5.999999999999999e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000302907  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2670  cytochrome c oxidase, subunit II  33.91 
 
 		 265 aa  172  7.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0983455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3117  cytochrome c oxidase, subunit II  33.67 
 
 		 316 aa  169  6e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.762727  normal  0.80653 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1015  cytochrome c oxidase subunit II  33.56 
 
 		 314 aa  169  7e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0476756  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3150  cytochrome c oxidase, subunit II  35.51 
 
 		 340 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3259  Cytochrome c oxidase subunit II  31.43 
 
 		 324 aa  165  1.0000000000000001e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0696554 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2016  cytochrome c oxidase, subunit II  31.09 
 
 		 304 aa  161  2e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0956  cytochrome c oxidase, subunit II  32.53 
 
 		 280 aa  160  3e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.137087 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2082  cytochrome c oxidase, subunit II  31.9 
 
 		 289 aa  160  4e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2217  cytochrome c oxidase, subunit II  34.05 
 
 		 290 aa  155  8e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.120292  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1954  cytochrome c oxidase, subunit II  31.73 
 
 		 290 aa  155  1e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000330547 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16250  cytochrome c oxidase, subunit II  30.13 
 
 		 304 aa  153  5e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.178752  normal  0.538576 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15630  cytochrome c oxidase, subunit II  28.89 
 
 		 299 aa  151  1e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.806307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1453  cytochrome c oxidase, subunit II  29.8 
 
 		 299 aa  147  2.0000000000000003e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0600133  normal  0.252589 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3141  cytochrome c oxidase, subunit II  32.17 
 
 		 324 aa  147  3e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1885  cytochrome c oxidase, subunit II  31.03 
 
 		 288 aa  143  4e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.247552  hitchhiker  0.00527672 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12220  cytochrome c oxidase, subunit II  30.25 
 
 		 286 aa  141  9.999999999999999e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0561533  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14120  cytochrome c oxidase, subunit II  28.52 
 
 		 312 aa  134  1.9999999999999998e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1824  cytochrome c oxidase subunit II  28.97 
 
 		 257 aa  126  4.0000000000000003e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0293  cytochrome c oxidase, subunit II  31.41 
 
 		 311 aa  117  3e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.142345  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0879  cytochrome c oxidase, subunit II  29.37 
 
 		 373 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3047  cytochrome c oxidase, subunit II  28.95 
 
 		 281 aa  113  4.0000000000000004e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000013174  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0236  cytochrome c oxidase, subunit II  28.72 
 
 		 519 aa  110  4.0000000000000004e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.717105  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0036  cytochrome c oxidase, subunit II  27.52 
 
 		 378 aa  109  6e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01290  cytochrome c oxidase, subunit II  27.88 
 
 		 374 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.46157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4246  cytochrome c oxidase, subunit II  27.69 
 
 		 384 aa  106  4e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0079  cytochrome c oxidase, subunit II  27.78 
 
 		 375 aa  106  5e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2717  cytochrome c oxidase, subunit II  27.43 
 
 		 523 aa  106  5e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.977219  normal  0.293993 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0103  cytochrome c oxidase, subunit II  28.06 
 
 		 375 aa  106  6e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.193198 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0117  cytochrome c oxidase, subunit II  28.06 
 
 		 375 aa  106  6e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0102376 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0180  cytochrome c oxidase subunit II  28.46 
 
 		 366 aa  106  6e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04013  Cytochrome c oxidase, subunit II  27.65 
 
 		 387 aa  105  1e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.94805  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0119  cytochrome c oxidase, subunit II  27.09 
 
 		 375 aa  104  3e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3818  cytochrome c oxidase, subunit II  27.76 
 
 		 388 aa  102  1e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.198752 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0310  cytochrome c oxidase, subunit II  30.37 
 
 		 320 aa  102  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0572725 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01020  cytochrome c oxidase, subunit II  30.4 
 
 		 385 aa  102  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.24737  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0122  cytochrome c oxidase, subunit II  27.27 
 
 		 375 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.946881 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2962  cytochrome c oxidase, subunit II  26.32 
 
 		 401 aa  98.6  1e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2811  cytochrome c oxidase, subunit II  26.32 
 
 		 401 aa  98.6  1e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2406  cytochrome c oxidase, subunit II  24.82 
 
 		 377 aa  99  1e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0062  cytochrome c oxidase, subunit II  27.2 
 
 		 374 aa  98.2  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0885746  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1038  cytochrome c oxidase, subunit II  26.53 
 
 		 388 aa  98.2  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04019  cytochrome c oxidase, subunit II  26.84 
 
 		 308 aa  98.2  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0142  cytochrome c oxidase, subunit II  27.64 
 
 		 374 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3782  cytochrome c oxidase, subunit II  27.09 
 
 		 512 aa  96.7  6e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3999  cytochrome c oxidase subunit II  27.88 
 
 		 524 aa  95.9  9e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1380  cytochrome c oxidase, subunit II  27.69 
 
 		 389 aa  95.1  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.459391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3517  cytochrome c oxidase, subunit II  27.49 
 
 		 511 aa  95.5  1e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3864  cytochrome c oxidase, subunit II  27.09 
 
 		 513 aa  94.7  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06272  cytochrome c oxidase, subunit II  25.42 
 
 		 405 aa  94.4  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0183  cytochrome c oxidase, subunit II  26.95 
 
 		 377 aa  94  3e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.000324421  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0178  cytochrome c oxidase, subunit II  27.95 
 
 		 513 aa  94  3e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4606  cytochrome c oxidase, subunit II  27.09 
 
 		 513 aa  94  4e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1777  cytochrome c oxidase, subunit II  26.56 
 
 		 377 aa  94  4e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.302976  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0614  cytochrome-c oxidase  26.74 
 
 		 303 aa  94  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.840942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3483  cytochrome c oxidase, subunit II  27.24 
 
 		 520 aa  93.2  6e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.243767 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3991  cytochrome c oxidase, subunit II  26.59 
 
 		 513 aa  92.8  8e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0474  cytochrome-c oxidase  26.94 
 
 		 303 aa  92  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4392  cytochrome c oxidase, subunit II  26.3 
 
 		 392 aa  92  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0258  cytochrome c oxidase, subunit II  25.68 
 
 		 528 aa  92  1e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0544  cytochrome c oxidase, subunit II  26.67 
 
 		 544 aa  91.7  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.214831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2860  cytochrome c oxidase, subunit II  27.44 
 
 		 389 aa  91.7  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.699909  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1674  cytochrome c oxidase, subunit II  26.12 
 
 		 380 aa  91.7  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3791  cytochrome c oxidase, subunit II  26.19 
 
 		 513 aa  91.7  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0314  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I:cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  26.19 
 
 		 421 aa  90.9  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.659537  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1826  cytochrome c oxidase polypeptide II precursor (cytochrome AA3 subunit 2)  26.57 
 
 		 303 aa  90.9  3e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.308898  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1245  cytochrome c oxidase, subunit II  27.42 
 
 		 400 aa  90.9  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.731852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0154  cytochrome c oxidase, subunit II  25.6 
 
 		 518 aa  90.1  5e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4171  putative cytochrome c oxidase  26.53 
 
 		 538 aa  90.1  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.82291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3537  cytochrome c oxidase, subunit II  27.07 
 
 		 389 aa  89.7  7e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0700115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1940  cytochrome c oxidase, subunit II  25.59 
 
 		 385 aa  89.4  8e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0684443  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3181  putative cytochrome C oxidase polypeptide II precursor  26.8 
 
 		 398 aa  89.4  9e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.8149  normal  0.584186 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4112  cytochrome c oxidase, subunit II  25.6 
 
 		 518 aa  88.6  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0658  cytochrome C oxidase subunit II transmembrane region  25.23 
 
 		 279 aa  88.6  1e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.508316  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0325  cytochrome c oxidase subunit II  28 
 
 		 382 aa  89  1e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0125401 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1140  cytochrome c oxidase subunit II  27.68 
 
 		 270 aa  88.6  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4311  cytochrome c oxidase, subunit II  25.81 
 
 		 518 aa  89  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.997623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0456  cytochrome c oxidase, subunit II  27.38 
 
 		 532 aa  89  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4180  cytochrome c oxidase, subunit II  25.81 
 
 		 518 aa  88.2  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6176  cytochrome c oxidase, subunit II  26.85 
 
 		 531 aa  87.4  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.678657 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1645  cytochrome c oxidase, subunit II  27.34 
 
 		 385 aa  87.8  3e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.856042  normal  0.904416 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2847  cytochrome c oxidase, subunit II  26.85 
 
 		 532 aa  87  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>