More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_1899 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_1899  cytochrome c oxidase subunit II  100 
 
 		 156 aa  323  5e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.71816  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2385  cytochrome c oxidase subunit II  83.33 
 
 		 156 aa  281  3.0000000000000004e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0933  cytochrome c oxidase, subunit II  46.36 
 
 		 168 aa  154  5.0000000000000005e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1574  cytochrome c oxidase subunit II  45.7 
 
 		 168 aa  152  2e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226069  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0464  cytochrome c oxidase subunit II  41.67 
 
 		 266 aa  142  3e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1565  cytochrome c oxidase subunit II  46.45 
 
 		 155 aa  140  8e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2412  cytochrome c oxidase subunit II  45.57 
 
 		 171 aa  137  7e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2967  cytochrome c oxidase subunit II  43.23 
 
 		 162 aa  136  1e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000376263 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3802  cytochrome c oxidase subunit II  38.51 
 
 		 262 aa  134  4e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3756  cytochrome c oxidase subunit II  38.89 
 
 		 300 aa  132  1.9999999999999998e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0016  cytochrome c oxidase, subunit II  40.85 
 
 		 186 aa  126  1.0000000000000001e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5762  cytochrome c oxidase subunit II  37.01 
 
 		 195 aa  123  8.000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.336691  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2021  cytochrome c oxidase subunit II  38.82 
 
 		 160 aa  118  3e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.388315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3373  cytochrome c oxidase subunit II  39.16 
 
 		 172 aa  117  4.9999999999999996e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.208365  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1826  cytochrome c oxidase subunit II  38.16 
 
 		 160 aa  116  9.999999999999999e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00813215  normal  0.126007 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2397  cytochrome c oxidase, subunit II  33.96 
 
 		 177 aa  115  3e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4077  putative cytochrome c oxidase subunit II  33.77 
 
 		 190 aa  115  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.357197 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0623  cytochrome c oxidase subunit II  33.77 
 
 		 190 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.320942 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1352  cytochrome c oxidase, subunit II  32.47 
 
 		 185 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1491  cytochrome c oxidase, subunit II  32.47 
 
 		 190 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.403979  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1358  cytochrome c oxidase, subunit II  32.47 
 
 		 185 aa  112  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0348  cytochrome c oxidase subunit II  33.77 
 
 		 190 aa  110  6e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1402  cytochrome c oxidase, subunit II  37.5 
 
 		 162 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.290296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1950  cytochrome c oxidase, subunit II  35.48 
 
 		 158 aa  105  3e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2875  hypothetical protein  32.19 
 
 		 165 aa  103  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.902113  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8116  cytochrome c oxidase subunit II  32.28 
 
 		 187 aa  99  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.105438  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2971  cytochrome c oxidase, subunit II  30.52 
 
 		 176 aa  74.3  0.0000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000000297195  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0186  cytochrome c oxidase subunit II  36.96 
 
 		 172 aa  74.3  0.0000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.721142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2712  cytochrome c oxidase, subunit II  40.48 
 
 		 180 aa  74.3  0.0000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.925486  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2489  cytochrome c oxidase, subunit II  32.19 
 
 		 243 aa  70.1  0.00000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.500427  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1874  cytochrome c oxidase, subunit II  34.93 
 
 		 256 aa  68.6  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4435  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I:cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  41.33 
 
 		 316 aa  67  0.00000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0428074  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1522  cytochrome c oxidase, subunit II  40.28 
 
 		 330 aa  66.6  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0599  cytochrome c oxidase subunit II  35.44 
 
 		 124 aa  67  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.632482 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0229  cytochrome c oxidase, subunit II  39.47 
 
 		 316 aa  65.9  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0502681  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2012  Nitrous-oxide reductase  29.2 
 
 		 663 aa  64.7  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2706  cytochrome c oxidase, subunit II  36.05 
 
 		 389 aa  64.7  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.363999 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2263  cytochrome c oxidase, subunit II  41.03 
 
 		 367 aa  64.3  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0175262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1944  cytochrome c oxidase, subunit II  36.36 
 
 		 149 aa  64.3  0.0000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0848  cytochrome c oxidase subunit II  38.1 
 
 		 351 aa  63.9  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0803  cytochrome c oxidase, subunit II  28.47 
 
 		 350 aa  63.5  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.192306  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0156  cytochrome c oxidase, subunit II  34.18 
 
 		 232 aa  63.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0162  cytochrome c oxidase subunit II  28.22 
 
 		 179 aa  63.5  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0851  cytochrome c oxidase, subunit II  28.47 
 
 		 350 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3558  cytochrome c oxidase subunit II  41.03 
 
 		 370 aa  62.8  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.22857 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0320  cytochrome c oxidase, subunit II  39.47 
 
 		 147 aa  62.8  0.000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1588  cytochrome c oxidase, subunit II  40.28 
 
 		 342 aa  62.4  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0855  cytochrome c oxidase, subunit II  28.47 
 
 		 350 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3632  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I  26.47 
 
 		 444 aa  62  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2797  cytochrome c oxidase, subunit II  25.61 
 
 		 249 aa  61.6  0.000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2667  cytochrome c oxidase, subunit II  31.13 
 
 		 175 aa  62  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00000731969  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0828  cytochrome c oxidase, subunit II  34.21 
 
 		 321 aa  61.6  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.304556 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0046  cytochrome c oxidase, subunit II  35.14 
 
 		 301 aa  61.6  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0254  cytochrome c oxidase subunit II  34.21 
 
 		 269 aa  60.8  0.000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00721127 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2862  cytochrome c oxidase subunit II  39.24 
 
 		 272 aa  60.8  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0315403 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1618  cytochrome c oxidase subunit II  37.97 
 
 		 125 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.464579 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0761  cytochrome c oxidase subunit II  34.62 
 
 		 146 aa  60.5  0.000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.254887  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02212  putative cytochrome C oxidase polypeptide II oxidoreductase protein  30.53 
 
 		 125 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1244  cytochrome c oxidase, subunit II  32.89 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2345  cytochrome c oxidase subunit II  35.14 
 
 		 271 aa  60.1  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.215159  normal  0.967701 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4180  cytochrome c oxidase, subunit II  38.67 
 
 		 314 aa  60.1  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.548982  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0533  cytochrome c oxidase, subunit II  40.28 
 
 		 405 aa  59.3  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.251737 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0244  nitrous-oxide reductase  32.22 
 
 		 647 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.677359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1556  Nitrous-oxide reductase  31.68 
 
 		 620 aa  58.9  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.298548  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2313  cytochrome c oxidase, subunit II  41.18 
 
 		 244 aa  58.5  0.00000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.210732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6008  nitrous-oxide reductase  31.91 
 
 		 639 aa  58.9  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.180938  normal  0.0225703 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1461  Nitrous-oxide reductase  31.68 
 
 		 620 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2958  cytochrome c oxidase subunit II  36 
 
 		 269 aa  58.5  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3892  cytochrome c oxidase subunit II  37.33 
 
 		 345 aa  58.5  0.00000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.740774  normal  0.178097 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5826  cytochrome c oxidase, subunit II  40.85 
 
 		 330 aa  57.8  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4253  cytochrome c oxidase, subunit II  29.89 
 
 		 124 aa  57.8  0.00000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0414  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  35.71 
 
 		 311 aa  57.8  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0222  cytochrome c oxidase, subunit II  33.77 
 
 		 288 aa  57.4  0.00000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5936  cytochrome c oxidase subunit II  28.93 
 
 		 382 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6209  cytochrome c oxidase, subunit II  28.93 
 
 		 382 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0045  cytochrome c oxidase, subunit II  35.29 
 
 		 300 aa  57  0.00000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00101143 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1172  cytochrome c oxidase family protein  30.49 
 
 		 141 aa  57  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0182872  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3408  cytochrome c oxidase family protein  30.49 
 
 		 141 aa  57  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.181168  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1408  cytochrome c oxidase family protein  30.49 
 
 		 141 aa  57  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0216619  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2257  putative cytochrome c oxidase subunit  30.49 
 
 		 141 aa  57  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0923001  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2422  cytochrome c oxidase family protein  30.49 
 
 		 141 aa  57  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1767  cytochrome c oxidase, subunit II  28.21 
 
 		 352 aa  56.6  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.204958  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0252  cytochrome c oxidase, subunit II  36.36 
 
 		 302 aa  56.2  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.433496  normal  0.0258846 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1899  cytochrome c oxidase family protein  30.49 
 
 		 141 aa  57  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4346  nitrous-oxide reductase  28 
 
 		 638 aa  56.6  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0394445  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2175  cytochrome c oxidase family protein  30.49 
 
 		 141 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.381678  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2402  nitrous-oxide reductase  30.69 
 
 		 620 aa  56.2  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00162507  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2296  putative cytochrome c oxidase subunit  30.49 
 
 		 141 aa  57  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.375881  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2861  nitrous-oxide reductase  28.12 
 
 		 645 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.7379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04701  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  36.04 
 
 		 267 aa  55.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2266  cytochrome c, monohaem  38.89 
 
 		 336 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.380948  normal  0.0167103 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0167  putative cytochrome c oxidase subunit II  26.71 
 
 		 371 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.26265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3955  cytochrome c oxidase subunit II  30.43 
 
 		 391 aa  56.2  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.113374 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3078  cytochrome c oxidase, subunit II  37.97 
 
 		 260 aa  56.2  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000302907  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1705  cytochrome c, monohaem  25 
 
 		 324 aa  55.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.829367  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0166  cytochrome c oxidase, subunit II  34.21 
 
 		 362 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.129501  normal  0.0168942 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0222  cytochrome c oxidase, subunit II  34.21 
 
 		 362 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0145699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05011  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  36.04 
 
 		 267 aa  55.5  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7362  cytochrome c oxidase, subunit II  25.88 
 
 		 394 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.674364 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0445  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  34.15 
 
 		 267 aa  55.5  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>