More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1826 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_1826  cytochrome c oxidase subunit II  100 
 
 
160 aa  332  1e-90  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00813215  normal  0.126007 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2021  cytochrome c oxidase subunit II  62.89 
 
 
160 aa  215  2e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.388315  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0464  cytochrome c oxidase subunit II  44.23 
 
 
266 aa  124  5e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1565  cytochrome c oxidase subunit II  41.83 
 
 
155 aa  123  9e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3802  cytochrome c oxidase subunit II  41.03 
 
 
262 aa  121  4e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0016  cytochrome c oxidase, subunit II  38.95 
 
 
186 aa  119  1.9999999999999998e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3756  cytochrome c oxidase subunit II  41.29 
 
 
300 aa  117  4.9999999999999996e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0933  cytochrome c oxidase, subunit II  39.74 
 
 
168 aa  117  7.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1899  cytochrome c oxidase subunit II  38.16 
 
 
156 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.71816  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1574  cytochrome c oxidase subunit II  36.48 
 
 
168 aa  114  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226069  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2385  cytochrome c oxidase subunit II  38.16 
 
 
156 aa  114  6e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2967  cytochrome c oxidase subunit II  36.02 
 
 
162 aa  110  6e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000376263 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2412  cytochrome c oxidase subunit II  40.13 
 
 
171 aa  107  5e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2397  cytochrome c oxidase, subunit II  35.03 
 
 
177 aa  105  3e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3373  cytochrome c oxidase subunit II  36.25 
 
 
172 aa  97.4  7e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.208365  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0348  cytochrome c oxidase subunit II  30.77 
 
 
190 aa  87.8  5e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5762  cytochrome c oxidase subunit II  32.26 
 
 
195 aa  85.1  4e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.336691  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8116  cytochrome c oxidase subunit II  32.75 
 
 
187 aa  84  7e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.105438  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4077  putative cytochrome c oxidase subunit II  29.41 
 
 
190 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.357197 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1950  cytochrome c oxidase, subunit II  30.97 
 
 
158 aa  79.3  0.00000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0623  cytochrome c oxidase subunit II  28.76 
 
 
190 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.320942 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1491  cytochrome c oxidase, subunit II  28.21 
 
 
190 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.403979  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1352  cytochrome c oxidase, subunit II  28.21 
 
 
185 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1358  cytochrome c oxidase, subunit II  28.21 
 
 
185 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06421  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  36.36 
 
 
274 aa  72.8  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0878998 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1600  cytochrome c oxidase, subunit II  26.17 
 
 
337 aa  71.6  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.884566  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1676  cytochrome c oxidase, subunit II  26.17 
 
 
337 aa  71.6  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0848  cytochrome c oxidase subunit II  36.67 
 
 
351 aa  71.2  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2275  cytochrome c oxidase, subunit II  26 
 
 
337 aa  71.6  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.869151  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0162  cytochrome c oxidase subunit II  31.29 
 
 
179 aa  70.9  0.000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0803  cytochrome c oxidase, subunit II  40.54 
 
 
350 aa  70.9  0.000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.192306  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0855  cytochrome c oxidase, subunit II  40.54 
 
 
350 aa  70.1  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0851  cytochrome c oxidase, subunit II  40.54 
 
 
350 aa  70.1  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0186  cytochrome c oxidase subunit II  37.18 
 
 
172 aa  69.7  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.721142  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0229  cytochrome c oxidase, subunit II  40 
 
 
316 aa  68.9  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0502681  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2875  hypothetical protein  28.26 
 
 
165 aa  67  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.902113  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2706  cytochrome c oxidase, subunit II  31.47 
 
 
389 aa  66.2  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.363999 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05001  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  30.13 
 
 
270 aa  65.9  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.715952  normal  0.110072 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1777  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  30.13 
 
 
270 aa  65.5  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2345  cytochrome c oxidase subunit II  37.97 
 
 
271 aa  65.1  0.0000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.215159  normal  0.967701 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1754  cytochrome c oxidase subunit II  34.74 
 
 
275 aa  65.1  0.0000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.636353  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1522  cytochrome c oxidase, subunit II  35.11 
 
 
330 aa  64.7  0.0000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1874  cytochrome c oxidase, subunit II  27.89 
 
 
256 aa  64.3  0.0000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0599  cytochrome c oxidase subunit II  33.68 
 
 
124 aa  63.9  0.0000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.632482 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0209  Nitrous-oxide reductase  31.73 
 
 
632 aa  63.9  0.0000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1402  cytochrome c oxidase, subunit II  30.77 
 
 
162 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.290296  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2958  cytochrome c oxidase subunit II  37.5 
 
 
269 aa  63.5  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2712  cytochrome c oxidase, subunit II  34.67 
 
 
180 aa  63.5  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.925486  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1588  cytochrome c oxidase, subunit II  35.56 
 
 
342 aa  63.2  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0414  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  28.67 
 
 
311 aa  62.8  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0437  cytochrome c oxidase, subunit II  37.84 
 
 
267 aa  62.4  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0468935 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1826  cytochrome c oxidase, subunit II, putative  40 
 
 
408 aa  62  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.086817  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0183  cytochrome c oxidase subunit II  40 
 
 
143 aa  62  0.000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.13824 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05011  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  38.64 
 
 
267 aa  61.6  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04701  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  38.64 
 
 
267 aa  61.6  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1767  cytochrome c oxidase, subunit II  38.16 
 
 
352 aa  61.6  0.000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.204958  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2971  cytochrome c oxidase, subunit II  41.67 
 
 
176 aa  61.6  0.000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000000297195  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0445  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  38.64 
 
 
267 aa  61.6  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2641  cytochrome c oxidase subunit II  31.03 
 
 
321 aa  61.6  0.000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.398022  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04431  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  30.86 
 
 
291 aa  62  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3958  cytochrome c oxidase, subunit II  29.32 
 
 
336 aa  62  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4435  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I:cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  37.33 
 
 
316 aa  61.6  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0428074  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0608  cytochrome c oxidase subunit II  34.74 
 
 
276 aa  61.2  0.000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2602  cytochrome c oxidase subunit II  37.84 
 
 
315 aa  61.2  0.000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.405519 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05081  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  38.64 
 
 
267 aa  60.8  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.189517  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1211  Cytochrome-c oxidase  36.49 
 
 
351 aa  60.5  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.553445  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0252  cytochrome c oxidase, subunit II  33.73 
 
 
302 aa  60.5  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.433496  normal  0.0258846 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3078  nitrous-oxide reductase  30.77 
 
 
631 aa  59.7  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0446  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  31.48 
 
 
324 aa  59.3  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.112901 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1944  cytochrome c oxidase, subunit II  39.73 
 
 
149 aa  59.3  0.00000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3573  cytochrome c oxidase subunit II  34.18 
 
 
360 aa  59.7  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02212  putative cytochrome C oxidase polypeptide II oxidoreductase protein  29.89 
 
 
125 aa  58.9  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0024  cytochrome c oxidase, subunit II  30.28 
 
 
362 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.901821 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1348  cytochrome c, monohaem  38.75 
 
 
426 aa  58.5  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.195405  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0533  cytochrome c oxidase, subunit II  39.71 
 
 
405 aa  58.5  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.251737 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2406  cytochrome c oxidase, subunit II  42.42 
 
 
377 aa  58.2  0.00000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5130  cytochrome c oxidase subunit II  32.43 
 
 
384 aa  58.2  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0584  cytochrome c oxidase, subunit II  36.71 
 
 
320 aa  58.2  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0567  cytochrome c oxidase, subunit II  36.71 
 
 
320 aa  58.2  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5936  cytochrome c oxidase subunit II  34.67 
 
 
382 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6209  cytochrome c oxidase, subunit II  34.67 
 
 
382 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4872  cytochrome c oxidase subunit II  33.78 
 
 
382 aa  57.8  0.00000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.780427  normal  0.052805 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3795  cytochrome c oxidase subunit II  33.78 
 
 
382 aa  57.8  0.00000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0046  cytochrome c oxidase, subunit II  38.57 
 
 
301 aa  57.4  0.00000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1461  Nitrous-oxide reductase  31.78 
 
 
620 aa  57.4  0.00000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0222  cytochrome c oxidase, subunit II  31.58 
 
 
362 aa  57.4  0.00000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0145699  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1556  Nitrous-oxide reductase  31.78 
 
 
620 aa  57.4  0.00000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.298548  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2351  nitrous-oxide reductase  31.73 
 
 
645 aa  57  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3898  cytochrome c oxidase subunit II  32.43 
 
 
285 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1993  cytochrome c oxidase, subunit II  36.49 
 
 
314 aa  57  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0975891  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1538  cytochrome c oxidase, subunit II  32.26 
 
 
399 aa  56.6  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0528  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  33.75 
 
 
355 aa  57  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0045  cytochrome c oxidase, subunit II  37.84 
 
 
300 aa  57  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00101143 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0166  cytochrome c oxidase, subunit II  31.58 
 
 
362 aa  57  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.129501  normal  0.0168942 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3199  nitrous-oxide reductase  33.66 
 
 
650 aa  57  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.324425  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2358  cytochrome c oxidase subunit II  32.43 
 
 
280 aa  57  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.382023  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2489  cytochrome c oxidase, subunit II  31.31 
 
 
243 aa  57  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.500427  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2266  cytochrome c, monohaem  31.52 
 
 
336 aa  57  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.380948  normal  0.0167103 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0156  cytochrome c oxidase, subunit II  34.33 
 
 
232 aa  56.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2862  cytochrome c oxidase subunit II  34.67 
 
 
272 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0315403 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>