129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0162 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0162  cytochrome c oxidase subunit II  100 
 
 		 179 aa  374  1e-103  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2412  cytochrome c oxidase subunit II  31.06 
 
 		 171 aa  71.2  0.000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3373  cytochrome c oxidase subunit II  37.36 
 
 		 172 aa  70.5  0.00000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.208365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0016  cytochrome c oxidase, subunit II  28.4 
 
 		 186 aa  70.9  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1826  cytochrome c oxidase subunit II  31.29 
 
 		 160 aa  70.9  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00813215  normal  0.126007 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3802  cytochrome c oxidase subunit II  34.62 
 
 		 262 aa  70.1  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2385  cytochrome c oxidase subunit II  29.56 
 
 		 156 aa  66.6  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0320  cytochrome c oxidase, subunit II  43.04 
 
 		 147 aa  66.6  0.0000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3756  cytochrome c oxidase subunit II  27.44 
 
 		 300 aa  65.5  0.0000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2712  cytochrome c oxidase, subunit II  39.51 
 
 		 180 aa  64.3  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.925486  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2967  cytochrome c oxidase subunit II  32.03 
 
 		 162 aa  63.5  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000376263 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1899  cytochrome c oxidase subunit II  28.22 
 
 		 156 aa  63.5  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.71816  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2021  cytochrome c oxidase subunit II  33.7 
 
 		 160 aa  63.2  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.388315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0464  cytochrome c oxidase subunit II  30.77 
 
 		 266 aa  60.8  0.000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0186  cytochrome c oxidase subunit II  35.06 
 
 		 172 aa  60.5  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.721142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1944  cytochrome c oxidase, subunit II  35.06 
 
 		 149 aa  59.7  0.00000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0761  cytochrome c oxidase subunit II  41.56 
 
 		 146 aa  59.3  0.00000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.254887  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1565  cytochrome c oxidase subunit II  35.05 
 
 		 155 aa  58.9  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8116  cytochrome c oxidase subunit II  26.92 
 
 		 187 aa  57.8  0.00000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.105438  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2397  cytochrome c oxidase, subunit II  25.64 
 
 		 177 aa  57.4  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1950  cytochrome c oxidase, subunit II  38.75 
 
 		 158 aa  57  0.0000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0933  cytochrome c oxidase, subunit II  25.79 
 
 		 168 aa  56.2  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5762  cytochrome c oxidase subunit II  28.48 
 
 		 195 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.336691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1574  cytochrome c oxidase subunit II  24.53 
 
 		 168 aa  55.1  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2667  cytochrome c oxidase, subunit II  43.55 
 
 		 175 aa  53.1  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00000731969  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4077  putative cytochrome c oxidase subunit II  31.76 
 
 		 190 aa  53.1  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.357197 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0623  cytochrome c oxidase subunit II  27.22 
 
 		 190 aa  53.1  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.320942 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2797  cytochrome c oxidase, subunit II  37.66 
 
 		 249 aa  52.4  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0599  cytochrome c oxidase subunit II  37.93 
 
 		 124 aa  52  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.632482 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2358  cytochrome c oxidase subunit II  31.3 
 
 		 280 aa  52.4  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.382023  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3898  cytochrome c oxidase subunit II  31.3 
 
 		 285 aa  52.4  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1491  cytochrome c oxidase, subunit II  26.28 
 
 		 190 aa  51.6  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.403979  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1352  cytochrome c oxidase, subunit II  26.28 
 
 		 185 aa  51.6  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2971  cytochrome c oxidase, subunit II  38.67 
 
 		 176 aa  51.6  0.000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000000297195  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1358  cytochrome c oxidase, subunit II  26.28 
 
 		 185 aa  51.2  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0293  cytochrome c oxidase, subunit II  34.31 
 
 		 311 aa  50.8  0.000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.142345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0726  cytochrome c oxidase, subunit II  32.03 
 
 		 388 aa  50.8  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.631169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0414  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  37.5 
 
 		 311 aa  50.4  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02212  putative cytochrome C oxidase polypeptide II oxidoreductase protein  29.67 
 
 		 125 aa  48.9  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2425  cytochrome c oxidase subunit II  32.32 
 
 		 314 aa  48.1  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.408327 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2594  cytochrome c oxidase subunit II  28.57 
 
 		 272 aa  47.8  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0132206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1402  cytochrome c oxidase, subunit II  32.94 
 
 		 162 aa  47.8  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.290296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0348  cytochrome c oxidase subunit II  25.64 
 
 		 190 aa  47.8  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1874  cytochrome c oxidase, subunit II  37.66 
 
 		 256 aa  47.4  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2313  cytochrome c oxidase, subunit II  32.47 
 
 		 244 aa  47  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.210732  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2345  cytochrome c oxidase subunit II  31.03 
 
 		 271 aa  47.8  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.215159  normal  0.967701 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0437  cytochrome c oxidase, subunit II  30.61 
 
 		 267 aa  47.4  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0468935 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6209  cytochrome c oxidase, subunit II  30.17 
 
 		 382 aa  47.4  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5936  cytochrome c oxidase subunit II  30.17 
 
 		 382 aa  47.4  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2175  cytochrome c oxidase family protein  29.67 
 
 		 141 aa  46.6  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.381678  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0803  cytochrome c oxidase, subunit II  31.68 
 
 		 350 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.192306  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4180  cytochrome c oxidase, subunit II  39.71 
 
 		 314 aa  46.2  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.548982  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0062  cytochrome c oxidase, subunit II  36.11 
 
 		 374 aa  46.2  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0885746  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2706  cytochrome c oxidase, subunit II  36 
 
 		 389 aa  47  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.363999 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0848  cytochrome c oxidase subunit II  34.25 
 
 		 351 aa  46.6  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0851  cytochrome c oxidase, subunit II  34.67 
 
 		 350 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2268  cytochrome c oxidase subunit II  28.03 
 
 		 272 aa  47  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.130236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0855  cytochrome c oxidase, subunit II  34.67 
 
 		 350 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1408  cytochrome c oxidase family protein  29.67 
 
 		 141 aa  46.2  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0216619  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2422  cytochrome c oxidase family protein  29.67 
 
 		 141 aa  46.2  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0167  putative cytochrome c oxidase subunit II  34.25 
 
 		 371 aa  45.8  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.26265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1899  cytochrome c oxidase family protein  29.67 
 
 		 141 aa  46.2  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3408  cytochrome c oxidase family protein  29.67 
 
 		 141 aa  46.2  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.181168  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2257  putative cytochrome c oxidase subunit  29.67 
 
 		 141 aa  46.2  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0923001  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2296  putative cytochrome c oxidase subunit  29.67 
 
 		 141 aa  46.2  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.375881  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1172  cytochrome c oxidase family protein  29.67 
 
 		 141 aa  46.2  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0182872  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2167  cytochrome c oxidase, subunit II  34.72 
 
 		 316 aa  45.8  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.238577  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1244  cytochrome c oxidase, subunit II  39.19 
 
 		 211 aa  45.1  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0252  cytochrome c oxidase, subunit II  34.85 
 
 		 302 aa  45.1  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.433496  normal  0.0258846 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1928  nitrous-oxide reductase  37.35 
 
 		 673 aa  45.1  0.0005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3795  cytochrome c oxidase subunit II  28.71 
 
 		 382 aa  45.1  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2474  cytochrome c oxidase, subunit II  34.18 
 
 		 273 aa  45.1  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.850241  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4872  cytochrome c oxidase subunit II  28.71 
 
 		 382 aa  45.1  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.780427  normal  0.052805 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1038  cytochrome c oxidase, subunit II  36.11 
 
 		 388 aa  45.1  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4253  cytochrome c oxidase, subunit II  29.89 
 
 		 124 aa  44.7  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3632  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I  28.71 
 
 		 444 aa  44.7  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0254  cytochrome c oxidase subunit II  29.91 
 
 		 269 aa  44.7  0.0008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00721127 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7362  cytochrome c oxidase, subunit II  29.31 
 
 		 394 aa  43.9  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.674364 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0156  cytochrome c oxidase, subunit II  35.53 
 
 		 232 aa  43.9  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1348  cytochrome c, monohaem  29.17 
 
 		 426 aa  43.9  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.195405  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5826  cytochrome c oxidase, subunit II  32.43 
 
 		 330 aa  44.3  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5817  cytochrome c oxidase, subunit II  34.72 
 
 		 310 aa  43.9  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.156146  hitchhiker  0.00847969 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4792  cytochrome c oxidase, subunit II  32.47 
 
 		 354 aa  43.9  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0280165  normal  0.517537 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1564  cytochrome C oxidase polypeptide II  35.29 
 
 		 384 aa  43.1  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2958  cytochrome c oxidase subunit II  35.62 
 
 		 269 aa  43.5  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001445  cytochrome c oxidase polypeptide II  36.11 
 
 		 356 aa  43.5  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.633895  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0563  cytochrome c oxidase subunit II  41.54 
 
 		 394 aa  43.5  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0183  cytochrome c oxidase subunit II  31.17 
 
 		 143 aa  43.5  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.13824 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0222  cytochrome c oxidase, subunit II  36.49 
 
 		 362 aa  43.5  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0145699  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1618  cytochrome c oxidase subunit II  27.47 
 
 		 125 aa  43.1  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.464579 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0024  cytochrome c oxidase, subunit II  36.49 
 
 		 362 aa  43.1  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.901821 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0166  cytochrome c oxidase, subunit II  36.49 
 
 		 362 aa  43.1  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.129501  normal  0.0168942 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1522  cytochrome c oxidase, subunit II  36.76 
 
 		 330 aa  43.1  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1211  Cytochrome-c oxidase  27.33 
 
 		 351 aa  43.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.553445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2875  hypothetical protein  26.72 
 
 		 165 aa  42.7  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.902113  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0244  nitrous-oxide reductase  27.47 
 
 		 647 aa  42.7  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.677359  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3573  cytochrome c oxidase subunit II  35.62 
 
 		 360 aa  42.7  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2991  cytochrome c oxidase, subunit II  36.49 
 
 		 338 aa  42.7  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.336386  normal  0.0255364 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3540  cytochrome c oxidase, subunit II  34.21 
 
 		 311 aa  42.7  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04013  Cytochrome c oxidase, subunit II  32.5 
 
 		 387 aa  42.7  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.94805  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>