250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A2667 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007614  Nmul_A2667  cytochrome c oxidase, subunit II  100 
 
 		 175 aa  369  1e-102  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00000731969  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0186  cytochrome c oxidase subunit II  43.1 
 
 		 172 aa  157  6e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.721142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2971  cytochrome c oxidase, subunit II  44.51 
 
 		 176 aa  153  1e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000000297195  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2712  cytochrome c oxidase, subunit II  44.38 
 
 		 180 aa  146  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.925486  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2275  cytochrome c oxidase, subunit II  27.84 
 
 		 337 aa  68.9  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.869151  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1676  cytochrome c oxidase, subunit II  27.27 
 
 		 337 aa  67.8  0.00000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1600  cytochrome c oxidase, subunit II  26.7 
 
 		 337 aa  67  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.884566  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6354  cytochrome c oxidase subunit II  26.44 
 
 		 334 aa  63.5  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2991  cytochrome c oxidase, subunit II  26.37 
 
 		 338 aa  63.9  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.336386  normal  0.0255364 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2385  cytochrome c oxidase subunit II  47.06 
 
 		 156 aa  63.2  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1292  cytochrome c oxidase, subunit II  32.82 
 
 		 354 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.493898  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01475  chain II protein of putative cytochrome c oxidase  32.46 
 
 		 234 aa  62  0.000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0222  cytochrome c oxidase, subunit II  28.16 
 
 		 288 aa  61.6  0.000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1899  cytochrome c oxidase subunit II  31.13 
 
 		 156 aa  62  0.000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.71816  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6539  cytochrome c, monohaem  32.06 
 
 		 434 aa  61.2  0.000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.537411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0016  cytochrome c oxidase, subunit II  38.67 
 
 		 186 aa  61.2  0.000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0222  cytochrome c oxidase, subunit II  29.78 
 
 		 362 aa  60.8  0.000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0145699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2266  cytochrome c, monohaem  34.69 
 
 		 336 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.380948  normal  0.0167103 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0229  cytochrome c oxidase, subunit II  35.35 
 
 		 316 aa  60.8  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0502681  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2347  cytochrome c oxidase, subunit II  30.39 
 
 		 334 aa  59.7  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0156  cytochrome c oxidase, subunit II  32.29 
 
 		 232 aa  60.1  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1449  cytochrome c oxidase, subunit II  27.17 
 
 		 346 aa  59.7  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.015711 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0096  cytochrome c oxidase, subunit II  30.61 
 
 		 334 aa  59.3  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.296292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3078  cytochrome c oxidase, subunit II  27.27 
 
 		 260 aa  58.9  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000302907  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3849  cytochrome c oxidase, subunit II  32 
 
 		 235 aa  58.9  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.26025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0252  cytochrome c oxidase, subunit II  28.98 
 
 		 302 aa  58.5  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.433496  normal  0.0258846 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11170  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit II  31 
 
 		 315 aa  58.5  0.00000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.761021  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1936  cytochrome c oxidase subunit II  31.19 
 
 		 243 aa  58.5  0.00000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.244228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0803  cytochrome c oxidase, subunit II  28.36 
 
 		 350 aa  58.2  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.192306  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0079  putative cytochrome c oxidase subunit II  29.32 
 
 		 342 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.917681  hitchhiker  0.00234837 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0480  cytochrome c oxidase, subunit II  37.11 
 
 		 203 aa  58.2  0.00000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.671352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0414  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  28.4 
 
 		 311 aa  57.8  0.00000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0024  cytochrome c oxidase, subunit II  31.14 
 
 		 362 aa  57.8  0.00000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.901821 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5491  cytochrome c oxidase, subunit II  29.23 
 
 		 355 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8116  cytochrome c oxidase subunit II  40.54 
 
 		 187 aa  57  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.105438  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0828  cytochrome c oxidase, subunit II  25.27 
 
 		 321 aa  57.4  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.304556 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2875  hypothetical protein  34.44 
 
 		 165 aa  57  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.902113  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0183  cytochrome c oxidase subunit II  30.53 
 
 		 143 aa  57.4  0.0000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.13824 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6572  cytochrome c, monohaem  30 
 
 		 352 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.381109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1491  cytochrome c oxidase, subunit II  35.56 
 
 		 190 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.403979  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0851  cytochrome c oxidase, subunit II  28.36 
 
 		 350 aa  56.6  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2529  caa3-type cytochrome c oxidase, subunit II  37.84 
 
 		 318 aa  56.2  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.176117  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2026  cytochrome c oxidase, subunit II  30.16 
 
 		 346 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000905775 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6229  cytochrome c oxidase, subunit II  33.33 
 
 		 359 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.24435  normal  0.0456922 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14120  cytochrome c oxidase, subunit II  23.98 
 
 		 312 aa  56.2  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2797  cytochrome c oxidase, subunit II  40.85 
 
 		 249 aa  56.6  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0855  cytochrome c oxidase, subunit II  28.36 
 
 		 350 aa  56.6  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6286  cytochrome c oxidase, subunit II  30 
 
 		 352 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.257472  normal  0.0263748 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1622  cytochrome c oxidase, subunit II  34.12 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.330918  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1358  cytochrome c oxidase, subunit II  35.56 
 
 		 185 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1950  cytochrome c oxidase, subunit II  32.63 
 
 		 158 aa  56.6  0.0000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1352  cytochrome c oxidase, subunit II  35.56 
 
 		 185 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5948  cytochrome c oxidase, subunit II  29.14 
 
 		 318 aa  55.5  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1538  cytochrome c oxidase, subunit II  26.39 
 
 		 399 aa  55.8  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0848  cytochrome c oxidase subunit II  29.1 
 
 		 351 aa  55.8  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2996  cytochrome c oxidase, subunit II  27.93 
 
 		 329 aa  55.8  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.941612  hitchhiker  0.00487692 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1944  cytochrome c oxidase, subunit II  28.57 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2082  cytochrome c oxidase, subunit II  24.38 
 
 		 289 aa  55.5  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5762  cytochrome c oxidase subunit II  37.84 
 
 		 195 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.336691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0783  cytochrome c oxidase, subunit II  29.84 
 
 		 372 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2183  putative cytochrome c oxidase polypeptide II precursor  30.84 
 
 		 338 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0732382 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2021  cytochrome c oxidase subunit II  36 
 
 		 160 aa  55.5  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.388315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0945  cytochrome oxidase subunit II  29.84 
 
 		 372 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.891376  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3892  cytochrome c oxidase subunit II  32.04 
 
 		 345 aa  55.1  0.0000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.740774  normal  0.178097 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0771  cytochrome c oxidase, subunit II  29.84 
 
 		 381 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0315373  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5502  cytochrome c oxidase, subunit II  29.32 
 
 		 370 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.535121  normal  0.0572426 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0166  cytochrome c oxidase, subunit II  28.99 
 
 		 362 aa  54.7  0.0000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.129501  normal  0.0168942 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2706  cytochrome c oxidase, subunit II  34.34 
 
 		 389 aa  54.3  0.0000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.363999 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1565  cytochrome c oxidase subunit II  29.25 
 
 		 155 aa  53.9  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4128  cytochrome c oxidase subunit II  25.71 
 
 		 269 aa  53.9  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0533  cytochrome c oxidase, subunit II  32.65 
 
 		 405 aa  53.5  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.251737 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1826  cytochrome c oxidase subunit II  34.29 
 
 		 160 aa  53.9  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00813215  normal  0.126007 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0320  cytochrome c oxidase, subunit II  24.82 
 
 		 147 aa  53.9  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2313  cytochrome c oxidase, subunit II  34.78 
 
 		 244 aa  52.8  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.210732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3540  cytochrome c oxidase, subunit II  23.56 
 
 		 311 aa  53.5  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1402  cytochrome c oxidase, subunit II  36.49 
 
 		 162 aa  53.1  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.290296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1826  cytochrome c oxidase, subunit II, putative  31.63 
 
 		 408 aa  53.1  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.086817  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0162  cytochrome c oxidase subunit II  43.55 
 
 		 179 aa  53.1  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3011  Cytochrome-c oxidase  26.04 
 
 		 380 aa  52.4  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.913445  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1993  cytochrome c oxidase, subunit II  31.07 
 
 		 314 aa  52.4  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0975891  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2217  cytochrome c oxidase, subunit II  22.89 
 
 		 290 aa  52.4  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.120292  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0046  cytochrome c oxidase, subunit II  26.29 
 
 		 301 aa  52.4  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0785  cytochrome c oxidase, subunit II  28.85 
 
 		 258 aa  52  0.000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.358332  normal  0.86718 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4435  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I:cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  27.93 
 
 		 316 aa  52  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0428074  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0464  cytochrome c oxidase subunit II  30 
 
 		 266 aa  52.4  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6146  cytochrome c oxidase, subunit II  27.48 
 
 		 353 aa  51.6  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.870856  normal  0.304247 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0956  cytochrome c oxidase, subunit II  22.16 
 
 		 280 aa  51.6  0.000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.137087 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4180  cytochrome c oxidase, subunit II  27.01 
 
 		 314 aa  51.6  0.000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.548982  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0460  cytochrome c oxidase, subunit II  27.68 
 
 		 353 aa  51.2  0.000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.354816  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2249  cytochrome c oxidase, subunit II  30.83 
 
 		 329 aa  51.2  0.000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1954  cytochrome c oxidase, subunit II  22 
 
 		 290 aa  51.2  0.000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000330547 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1588  cytochrome c oxidase, subunit II  27.37 
 
 		 342 aa  50.8  0.000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2967  cytochrome c oxidase subunit II  30.68 
 
 		 162 aa  50.8  0.000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000376263 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5817  cytochrome c oxidase, subunit II  32.32 
 
 		 310 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.156146  hitchhiker  0.00847969 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4760  cytochrome c oxidase subunit II  34.02 
 
 		 327 aa  50.8  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.723293  normal  0.0836993 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4077  putative cytochrome c oxidase subunit II  32.43 
 
 		 190 aa  50.8  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.357197 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0563  cytochrome c oxidase subunit II  29.41 
 
 		 394 aa  50.4  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2263  cytochrome c oxidase, subunit II  27.14 
 
 		 367 aa  50.4  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0175262  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2345  cytochrome c oxidase subunit II  36.62 
 
 		 271 aa  50.8  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.215159  normal  0.967701 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06421  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  36.62 
 
 		 274 aa  50.8  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0878998 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>