84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1936 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1936  cytochrome c oxidase subunit II  100 
 
 		 243 aa  498  1e-140  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.244228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2971  cytochrome c oxidase, subunit II  39.81 
 
 		 176 aa  75.5  0.0000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000000297195  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0186  cytochrome c oxidase subunit II  50 
 
 		 172 aa  75.5  0.0000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.721142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2712  cytochrome c oxidase, subunit II  35.92 
 
 		 180 aa  64.7  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.925486  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0480  cytochrome c oxidase, subunit II  39 
 
 		 203 aa  61.2  0.00000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.671352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1358  cytochrome c oxidase, subunit II  29.79 
 
 		 185 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0320  cytochrome c oxidase, subunit II  37.5 
 
 		 147 aa  57.8  0.0000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0229  cytochrome c oxidase, subunit II  37.14 
 
 		 316 aa  57.8  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0502681  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2667  cytochrome c oxidase, subunit II  31.19 
 
 		 175 aa  58.5  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00000731969  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1352  cytochrome c oxidase, subunit II  29.26 
 
 		 185 aa  57  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1491  cytochrome c oxidase, subunit II  29.26 
 
 		 190 aa  57  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.403979  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2875  hypothetical protein  42.65 
 
 		 165 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.902113  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5762  cytochrome c oxidase subunit II  44.12 
 
 		 195 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.336691  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1899  cytochrome c oxidase subunit II  29.32 
 
 		 156 aa  54.3  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.71816  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2967  cytochrome c oxidase subunit II  36.47 
 
 		 162 aa  53.5  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000376263 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0761  cytochrome c oxidase subunit II  36.46 
 
 		 146 aa  53.5  0.000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.254887  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0464  cytochrome c oxidase subunit II  40.26 
 
 		 266 aa  52.4  0.000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0414  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  26.23 
 
 		 311 aa  52.4  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1826  cytochrome c oxidase subunit II  34.18 
 
 		 160 aa  51.6  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00813215  normal  0.126007 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1574  cytochrome c oxidase subunit II  34.18 
 
 		 168 aa  50.8  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0016  cytochrome c oxidase, subunit II  37.18 
 
 		 186 aa  50.4  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2385  cytochrome c oxidase subunit II  26.46 
 
 		 156 aa  50.4  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1402  cytochrome c oxidase, subunit II  41.18 
 
 		 162 aa  50.1  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.290296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0933  cytochrome c oxidase, subunit II  35.44 
 
 		 168 aa  50.4  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2397  cytochrome c oxidase, subunit II  40 
 
 		 177 aa  49.3  0.00005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1522  cytochrome c oxidase, subunit II  33.33 
 
 		 330 aa  49.7  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3849  cytochrome c oxidase, subunit II  26.4 
 
 		 235 aa  49.7  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.26025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0803  cytochrome c oxidase, subunit II  32.48 
 
 		 350 aa  48.9  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.192306  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1565  cytochrome c oxidase subunit II  29.13 
 
 		 155 aa  48.5  0.00009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2706  cytochrome c oxidase, subunit II  31.73 
 
 		 389 aa  48.5  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.363999 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2862  cytochrome c oxidase subunit II  25 
 
 		 272 aa  48.5  0.00009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0315403 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0623  cytochrome c oxidase subunit II  35.87 
 
 		 190 aa  48.1  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.320942 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4792  cytochrome c oxidase, subunit II  30.91 
 
 		 354 aa  48.1  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0280165  normal  0.517537 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0851  cytochrome c oxidase, subunit II  32.48 
 
 		 350 aa  48.1  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0855  cytochrome c oxidase, subunit II  32.48 
 
 		 350 aa  48.1  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0848  cytochrome c oxidase subunit II  32.2 
 
 		 351 aa  47  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4077  putative cytochrome c oxidase subunit II  35.87 
 
 		 190 aa  47.4  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.357197 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0156  cytochrome c oxidase, subunit II  29.36 
 
 		 232 aa  47.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0104  cytochrome c oxidase subunit II  30.43 
 
 		 359 aa  47.8  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.100023  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0348  cytochrome c oxidase subunit II  36.96 
 
 		 190 aa  47.4  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3802  cytochrome c oxidase subunit II  26.98 
 
 		 262 aa  46.6  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2792  cytochrome c oxidase, subunit II  29.79 
 
 		 330 aa  45.8  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.625738  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4760  cytochrome c oxidase subunit II  33.33 
 
 		 327 aa  45.8  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.723293  normal  0.0836993 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1588  cytochrome c oxidase, subunit II  30.69 
 
 		 342 aa  45.8  0.0007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3756  cytochrome c oxidase subunit II  41.18 
 
 		 300 aa  45.4  0.0008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1855  cytochrome c oxidase, subunit II  24.8 
 
 		 356 aa  44.7  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2313  cytochrome c oxidase, subunit II  30.77 
 
 		 244 aa  44.7  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.210732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8116  cytochrome c oxidase subunit II  34.69 
 
 		 187 aa  45.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.105438  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2412  cytochrome c oxidase subunit II  39.24 
 
 		 171 aa  44.7  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1993  cytochrome c oxidase, subunit II  30.69 
 
 		 314 aa  45.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0975891  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2991  cytochrome c oxidase, subunit II  27.62 
 
 		 338 aa  44.3  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.336386  normal  0.0255364 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2748  cytochrome c oxidase subunit II  26.06 
 
 		 254 aa  43.9  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000027283  hitchhiker  0.000000791223 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3150  cytochrome c oxidase, aa3-type, subunit II  26.06 
 
 		 254 aa  43.9  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1348  cytochrome c, monohaem  37.25 
 
 		 426 aa  43.9  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.195405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2646  cytochrome c oxidase subunit II  25.41 
 
 		 349 aa  44.3  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0991495  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3668  cytochrome-c oxidase  28.33 
 
 		 378 aa  44.3  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.253259  normal  0.882679 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0024  cytochrome c oxidase, subunit II  30.77 
 
 		 362 aa  43.5  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.901821 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0222  cytochrome c oxidase, subunit II  31.37 
 
 		 362 aa  43.5  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0145699  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0166  cytochrome c oxidase, subunit II  31.37 
 
 		 362 aa  43.5  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.129501  normal  0.0168942 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1708  cytochrome c oxidase subunit II  37.37 
 
 		 320 aa  43.5  0.003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1622  cytochrome c oxidase, subunit II  31.34 
 
 		 196 aa  43.5  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.330918  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5826  cytochrome c oxidase, subunit II  30.69 
 
 		 330 aa  43.1  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4046  cytochrome c oxidase, subunit II  24.59 
 
 		 349 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3991  cytochrome c oxidase, subunit II  24.59 
 
 		 349 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3856  cytochrome c oxidase subunit II  24.59 
 
 		 349 aa  42.7  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.15254  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3704  cytochrome c oxidase, subunit II  24.59 
 
 		 349 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.136015  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3687  cytochrome c oxidase, subunit II  24.59 
 
 		 349 aa  42.7  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2529  caa3-type cytochrome c oxidase, subunit II  33.02 
 
 		 318 aa  42.7  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.176117  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4154  cytochrome c oxidase subunit II  24.59 
 
 		 349 aa  42.7  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3959  cytochrome c oxidase, subunit II  24.59 
 
 		 349 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1193  cytochrome c oxidase, subunit II  24.59 
 
 		 349 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4062  cytochrome c oxidase, subunit II  24.59 
 
 		 349 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3770  cytochrome c oxidase subunit II  23.74 
 
 		 349 aa  42.7  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2275  cytochrome c oxidase, subunit II  25.69 
 
 		 337 aa  42.7  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.869151  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1801  cytochrome c oxidase subunit II  28.99 
 
 		 288 aa  42.4  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.191358 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0045  cytochrome c oxidase, subunit II  30.39 
 
 		 300 aa  42.4  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00101143 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0167  putative cytochrome c oxidase subunit II  27.93 
 
 		 371 aa  42.4  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.26265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2072  cytochrome c oxidase, subunit II  26.85 
 
 		 425 aa  42.4  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.54281 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0697  cytochrome c oxidase, subunit II  24.78 
 
 		 322 aa  42  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2263  cytochrome c oxidase, subunit II  28.28 
 
 		 367 aa  42  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0175262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0828  cytochrome c oxidase, subunit II  30.39 
 
 		 321 aa  42.4  0.008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.304556 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1950  cytochrome c oxidase, subunit II  26.37 
 
 		 158 aa  42.4  0.008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4128  cytochrome c oxidase subunit II  30.47 
 
 		 269 aa  42  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2021  cytochrome c oxidase subunit II  34.18 
 
 		 160 aa  41.6  0.01  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.388315  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>