19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1622 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1622  cytochrome c oxidase, subunit II  100 
 
 		 196 aa  401  1e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.330918  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0103  hypothetical protein  48.7 
 
 		 197 aa  189  2.9999999999999997e-47  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2971  cytochrome c oxidase, subunit II  33.08 
 
 		 176 aa  68.9  0.00000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000000297195  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0186  cytochrome c oxidase subunit II  35.29 
 
 		 172 aa  63.9  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.721142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2712  cytochrome c oxidase, subunit II  28.48 
 
 		 180 aa  58.2  0.00000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.925486  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2667  cytochrome c oxidase, subunit II  34.12 
 
 		 175 aa  56.6  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00000731969  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2385  cytochrome c oxidase subunit II  31.25 
 
 		 156 aa  47.4  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1899  cytochrome c oxidase subunit II  32.65 
 
 		 156 aa  47.4  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.71816  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0933  cytochrome c oxidase, subunit II  29.59 
 
 		 168 aa  46.6  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0464  cytochrome c oxidase subunit II  31.58 
 
 		 266 aa  46.6  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1565  cytochrome c oxidase subunit II  28.4 
 
 		 155 aa  46.6  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1574  cytochrome c oxidase subunit II  26.17 
 
 		 168 aa  45.8  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1936  cytochrome c oxidase subunit II  31.34 
 
 		 243 aa  43.5  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.244228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2967  cytochrome c oxidase subunit II  26.25 
 
 		 162 aa  43.1  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000376263 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01475  chain II protein of putative cytochrome c oxidase  22.81 
 
 		 234 aa  42.7  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3825  cytochrome c oxidase, subunit II  33.82 
 
 		 189 aa  42.7  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.495822 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0016  cytochrome c oxidase, subunit II  28.16 
 
 		 186 aa  43.1  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3668  cytochrome-c oxidase  33.85 
 
 		 378 aa  42.4  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.253259  normal  0.882679 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3098  QoxB, quinol oxidase subunit II  33.82 
 
 		 261 aa  42  0.007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>