More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1565 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_1565  cytochrome c oxidase subunit II  100 
 
 
155 aa  320  6e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1574  cytochrome c oxidase subunit II  46.36 
 
 
168 aa  156  1e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226069  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0933  cytochrome c oxidase, subunit II  45.7 
 
 
168 aa  155  3e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0464  cytochrome c oxidase subunit II  42.58 
 
 
266 aa  149  1e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2967  cytochrome c oxidase subunit II  44.16 
 
 
162 aa  144  3e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000376263 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2385  cytochrome c oxidase subunit II  44.16 
 
 
156 aa  140  6e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1899  cytochrome c oxidase subunit II  46.45 
 
 
156 aa  140  8e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.71816  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3802  cytochrome c oxidase subunit II  39.35 
 
 
262 aa  137  6e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3756  cytochrome c oxidase subunit II  39.35 
 
 
300 aa  133  9e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1950  cytochrome c oxidase, subunit II  38.85 
 
 
158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1826  cytochrome c oxidase subunit II  41.83 
 
 
160 aa  123  8.000000000000001e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00813215  normal  0.126007 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2021  cytochrome c oxidase subunit II  39.22 
 
 
160 aa  123  9e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.388315  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2412  cytochrome c oxidase subunit II  36.77 
 
 
171 aa  123  1e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0016  cytochrome c oxidase, subunit II  32.5 
 
 
186 aa  110  7.000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3373  cytochrome c oxidase subunit II  35.85 
 
 
172 aa  103  9e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.208365  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2397  cytochrome c oxidase, subunit II  32.28 
 
 
177 aa  100  1e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1358  cytochrome c oxidase, subunit II  34.67 
 
 
185 aa  96.3  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1491  cytochrome c oxidase, subunit II  34.67 
 
 
190 aa  95.9  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.403979  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2875  hypothetical protein  36.3 
 
 
165 aa  95.5  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.902113  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1352  cytochrome c oxidase, subunit II  34.67 
 
 
185 aa  95.9  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8116  cytochrome c oxidase subunit II  32.67 
 
 
187 aa  91.7  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.105438  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1402  cytochrome c oxidase, subunit II  34.03 
 
 
162 aa  90.5  7e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.290296  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5762  cytochrome c oxidase subunit II  32 
 
 
195 aa  90.1  9e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.336691  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4077  putative cytochrome c oxidase subunit II  30.67 
 
 
190 aa  89.4  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.357197 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0623  cytochrome c oxidase subunit II  30 
 
 
190 aa  87.4  6e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.320942 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0348  cytochrome c oxidase subunit II  28.57 
 
 
190 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1522  cytochrome c oxidase, subunit II  36.84 
 
 
330 aa  75.5  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0848  cytochrome c oxidase subunit II  35.35 
 
 
351 aa  72.8  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0229  cytochrome c oxidase, subunit II  34 
 
 
316 aa  72.4  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0502681  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2345  cytochrome c oxidase subunit II  30.25 
 
 
271 aa  69.7  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.215159  normal  0.967701 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0851  cytochrome c oxidase, subunit II  33.65 
 
 
350 aa  69.3  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0855  cytochrome c oxidase, subunit II  33.65 
 
 
350 aa  69.3  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2862  cytochrome c oxidase subunit II  43.24 
 
 
272 aa  68.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0315403 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0803  cytochrome c oxidase, subunit II  33.65 
 
 
350 aa  68.9  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.192306  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1588  cytochrome c oxidase, subunit II  33.01 
 
 
342 aa  68.9  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1244  cytochrome c oxidase, subunit II  34.38 
 
 
211 aa  68.2  0.00000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0414  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  41.89 
 
 
311 aa  67  0.00000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0166  cytochrome c oxidase, subunit II  33.65 
 
 
362 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.129501  normal  0.0168942 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1767  cytochrome c oxidase, subunit II  41.89 
 
 
352 aa  66.2  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.204958  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3795  cytochrome c oxidase subunit II  32.35 
 
 
382 aa  67  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3955  cytochrome c oxidase subunit II  28 
 
 
391 aa  66.2  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.113374 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4872  cytochrome c oxidase subunit II  32.35 
 
 
382 aa  67  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.780427  normal  0.052805 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2474  cytochrome c oxidase, subunit II  29.27 
 
 
273 aa  66.6  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.850241  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0222  cytochrome c oxidase, subunit II  33.65 
 
 
362 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0145699  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06421  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  43.24 
 
 
274 aa  65.9  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0878998 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6229  cytochrome c oxidase, subunit II  31.31 
 
 
359 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.24435  normal  0.0456922 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2706  cytochrome c oxidase, subunit II  37.14 
 
 
389 aa  66.2  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.363999 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5936  cytochrome c oxidase subunit II  28.81 
 
 
382 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6209  cytochrome c oxidase, subunit II  28.81 
 
 
382 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0024  cytochrome c oxidase, subunit II  29.25 
 
 
362 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.901821 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2594  cytochrome c oxidase subunit II  27.64 
 
 
272 aa  64.3  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0132206  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5130  cytochrome c oxidase subunit II  30.51 
 
 
384 aa  64.7  0.0000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0186  cytochrome c oxidase subunit II  34.44 
 
 
172 aa  64.3  0.0000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.721142  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2275  cytochrome c oxidase, subunit II  32 
 
 
337 aa  63.9  0.0000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.869151  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3632  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I  25.4 
 
 
444 aa  63.5  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3898  cytochrome c oxidase subunit II  25.62 
 
 
285 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4180  cytochrome c oxidase, subunit II  28.28 
 
 
314 aa  63.5  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.548982  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2268  cytochrome c oxidase subunit II  27.27 
 
 
272 aa  62.4  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.130236  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2425  cytochrome c oxidase subunit II  27.42 
 
 
314 aa  62.8  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.408327 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7362  cytochrome c oxidase, subunit II  30.39 
 
 
394 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.674364 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1600  cytochrome c oxidase, subunit II  30 
 
 
337 aa  61.6  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.884566  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4435  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I:cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  35.62 
 
 
316 aa  61.6  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0428074  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1676  cytochrome c oxidase, subunit II  30 
 
 
337 aa  61.6  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3573  cytochrome c oxidase subunit II  37.84 
 
 
360 aa  61.6  0.000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1874  cytochrome c oxidase, subunit II  31.52 
 
 
256 aa  60.8  0.000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1826  cytochrome c oxidase, subunit II, putative  30.61 
 
 
408 aa  60.8  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.086817  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2489  cytochrome c oxidase, subunit II  34.26 
 
 
243 aa  60.8  0.000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.500427  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6886  cytochrome c oxidase, subunit II  35.14 
 
 
313 aa  60.8  0.000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2641  cytochrome c oxidase subunit II  36.17 
 
 
321 aa  60.5  0.000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.398022  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2358  cytochrome c oxidase subunit II  26.4 
 
 
280 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.382023  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0446  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  39.73 
 
 
324 aa  60.1  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.112901 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2996  cytochrome c oxidase, subunit II  33.72 
 
 
329 aa  59.7  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.941612  hitchhiker  0.00487692 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1564  cytochrome C oxidase polypeptide II  29.41 
 
 
384 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0162  cytochrome c oxidase subunit II  35.05 
 
 
179 aa  58.9  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1211  Cytochrome-c oxidase  36.49 
 
 
351 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.553445  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0533  cytochrome c oxidase, subunit II  35.71 
 
 
405 aa  58.2  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.251737 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1348  cytochrome c, monohaem  39.06 
 
 
426 aa  58.2  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.195405  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0726  cytochrome c oxidase, subunit II  32 
 
 
388 aa  58.2  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.631169  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3989  cytochrome c oxidase, subunit II  29.59 
 
 
330 aa  57.8  0.00000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5948  cytochrome c oxidase, subunit II  28.28 
 
 
318 aa  57.8  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0528  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  35.14 
 
 
355 aa  57.4  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5826  cytochrome c oxidase, subunit II  31.68 
 
 
330 aa  56.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1777  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  37.84 
 
 
270 aa  56.6  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05001  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  37.84 
 
 
270 aa  56.6  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.715952  normal  0.110072 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2030  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  28.37 
 
 
390 aa  56.2  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.463087  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05011  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  39.24 
 
 
267 aa  56.2  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2797  cytochrome c oxidase, subunit II  32.86 
 
 
249 aa  55.8  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1754  cytochrome c oxidase subunit II  33.78 
 
 
275 aa  56.2  0.0000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.636353  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0445  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  39.24 
 
 
267 aa  55.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04701  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  39.24 
 
 
267 aa  56.2  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3540  cytochrome c oxidase, subunit II  31.63 
 
 
311 aa  55.8  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5817  cytochrome c oxidase, subunit II  34.72 
 
 
310 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.156146  hitchhiker  0.00847969 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2602  cytochrome c oxidase subunit II  35.14 
 
 
315 aa  55.1  0.0000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.405519 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05081  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  39.24 
 
 
267 aa  55.1  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.189517  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2712  cytochrome c oxidase, subunit II  35.29 
 
 
180 aa  55.1  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.925486  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0599  cytochrome c oxidase subunit II  36.36 
 
 
124 aa  55.1  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.632482 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0222  cytochrome c oxidase, subunit II  31.18 
 
 
288 aa  55.1  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0828  cytochrome c oxidase, subunit II  31.94 
 
 
321 aa  54.7  0.0000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.304556 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1993  cytochrome c oxidase, subunit II  34.67 
 
 
314 aa  54.7  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0975891  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2958  cytochrome c oxidase subunit II  28.77 
 
 
269 aa  54.7  0.0000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>