More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_2021 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_2021  cytochrome c oxidase subunit II  100 
 
 		 160 aa  327  5.0000000000000004e-89  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.388315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1826  cytochrome c oxidase subunit II  62.89 
 
 		 160 aa  215  2e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00813215  normal  0.126007 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0464  cytochrome c oxidase subunit II  43.14 
 
 		 266 aa  123  9e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1565  cytochrome c oxidase subunit II  39.22 
 
 		 155 aa  123  1e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1899  cytochrome c oxidase subunit II  38.82 
 
 		 156 aa  118  3e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.71816  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3802  cytochrome c oxidase subunit II  41.83 
 
 		 262 aa  118  3e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2385  cytochrome c oxidase subunit II  38.31 
 
 		 156 aa  115  3e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2412  cytochrome c oxidase subunit II  41.83 
 
 		 171 aa  113  1.0000000000000001e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3756  cytochrome c oxidase subunit II  39.47 
 
 		 300 aa  112  2.0000000000000002e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1574  cytochrome c oxidase subunit II  37.58 
 
 		 168 aa  112  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0016  cytochrome c oxidase, subunit II  39.64 
 
 		 186 aa  111  4.0000000000000004e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0933  cytochrome c oxidase, subunit II  36.91 
 
 		 168 aa  111  5e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2967  cytochrome c oxidase subunit II  35.19 
 
 		 162 aa  109  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000376263 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2397  cytochrome c oxidase, subunit II  33.33 
 
 		 177 aa  98.2  4e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3373  cytochrome c oxidase subunit II  35.19 
 
 		 172 aa  93.6  9e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.208365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5762  cytochrome c oxidase subunit II  30.43 
 
 		 195 aa  89.4  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.336691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1950  cytochrome c oxidase, subunit II  30.92 
 
 		 158 aa  81.6  0.000000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8116  cytochrome c oxidase subunit II  30.67 
 
 		 187 aa  80.1  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.105438  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1491  cytochrome c oxidase, subunit II  28.3 
 
 		 190 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.403979  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4077  putative cytochrome c oxidase subunit II  29.11 
 
 		 190 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.357197 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1352  cytochrome c oxidase, subunit II  28.3 
 
 		 185 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0348  cytochrome c oxidase subunit II  29.19 
 
 		 190 aa  78.2  0.00000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1358  cytochrome c oxidase, subunit II  28.3 
 
 		 185 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0623  cytochrome c oxidase subunit II  28.48 
 
 		 190 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.320942 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4435  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I:cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  45.21 
 
 		 316 aa  71.6  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0428074  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0209  Nitrous-oxide reductase  33.98 
 
 		 632 aa  69.7  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0848  cytochrome c oxidase subunit II  38.64 
 
 		 351 aa  68.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2875  hypothetical protein  27.78 
 
 		 165 aa  68.2  0.00000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.902113  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02212  putative cytochrome C oxidase polypeptide II oxidoreductase protein  32.22 
 
 		 125 aa  67  0.00000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06421  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  33.58 
 
 		 274 aa  66.2  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0878998 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0222  cytochrome c oxidase, subunit II  37.33 
 
 		 362 aa  65.5  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0145699  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0166  cytochrome c oxidase, subunit II  37.33 
 
 		 362 aa  65.1  0.0000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.129501  normal  0.0168942 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2489  cytochrome c oxidase, subunit II  29.17 
 
 		 243 aa  65.1  0.0000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.500427  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0024  cytochrome c oxidase, subunit II  37.33 
 
 		 362 aa  65.1  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.901821 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6229  cytochrome c oxidase, subunit II  34.67 
 
 		 359 aa  64.7  0.0000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.24435  normal  0.0456922 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0186  cytochrome c oxidase subunit II  36.25 
 
 		 172 aa  64.7  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.721142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1600  cytochrome c oxidase, subunit II  26.39 
 
 		 337 aa  64.3  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.884566  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1676  cytochrome c oxidase, subunit II  26.39 
 
 		 337 aa  64.3  0.0000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0851  cytochrome c oxidase, subunit II  38.89 
 
 		 350 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1402  cytochrome c oxidase, subunit II  26.06 
 
 		 162 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.290296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0803  cytochrome c oxidase, subunit II  38.89 
 
 		 350 aa  63.9  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.192306  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0855  cytochrome c oxidase, subunit II  38.89 
 
 		 350 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2012  Nitrous-oxide reductase  32 
 
 		 663 aa  63.9  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0162  cytochrome c oxidase subunit II  33.7 
 
 		 179 aa  63.2  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1777  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  28.03 
 
 		 270 aa  62.4  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05001  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  28.03 
 
 		 270 aa  62.4  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.715952  normal  0.110072 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1298  nitrous-oxide reductase  31.37 
 
 		 865 aa  62.4  0.000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.0000502464  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1588  cytochrome c oxidase, subunit II  33.33 
 
 		 342 aa  62.8  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6886  cytochrome c oxidase, subunit II  36.99 
 
 		 313 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1874  cytochrome c oxidase, subunit II  27.89 
 
 		 256 aa  62  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1767  cytochrome c oxidase, subunit II  39.47 
 
 		 352 aa  62  0.000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.204958  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1770  nitrous-oxide reductase NosZ  32.35 
 
 		 864 aa  61.6  0.000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2275  cytochrome c oxidase, subunit II  25 
 
 		 337 aa  62  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.869151  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04701  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  29.68 
 
 		 267 aa  61.6  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0414  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  39.73 
 
 		 311 aa  61.6  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0096  cytochrome c oxidase, subunit II  38.67 
 
 		 334 aa  61.6  0.000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.296292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0229  cytochrome c oxidase, subunit II  36.99 
 
 		 316 aa  60.8  0.000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0502681  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2712  cytochrome c oxidase, subunit II  33.7 
 
 		 180 aa  61.2  0.000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.925486  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2797  cytochrome c oxidase, subunit II  26.28 
 
 		 249 aa  60.8  0.000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05011  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  36.27 
 
 		 267 aa  60.8  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1522  cytochrome c oxidase, subunit II  37.5 
 
 		 330 aa  60.8  0.000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0445  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  39.33 
 
 		 267 aa  60.8  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2706  cytochrome c oxidase, subunit II  37.84 
 
 		 389 aa  60.8  0.000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.363999 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2345  cytochrome c oxidase subunit II  36.49 
 
 		 271 aa  60.5  0.000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.215159  normal  0.967701 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2594  cytochrome c oxidase subunit II  37.33 
 
 		 272 aa  59.7  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0132206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05081  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  39.33 
 
 		 267 aa  59.7  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.189517  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2602  cytochrome c oxidase subunit II  37.84 
 
 		 315 aa  60.1  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.405519 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1754  cytochrome c oxidase subunit II  35.42 
 
 		 275 aa  59.7  0.00000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.636353  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2991  cytochrome c oxidase, subunit II  37.33 
 
 		 338 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.336386  normal  0.0255364 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4180  cytochrome c oxidase, subunit II  35.62 
 
 		 314 aa  59.3  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.548982  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5948  cytochrome c oxidase, subunit II  34.25 
 
 		 318 aa  58.9  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04431  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  36.46 
 
 		 291 aa  58.9  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2641  cytochrome c oxidase subunit II  29.63 
 
 		 321 aa  58.2  0.00000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.398022  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0446  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  31.19 
 
 		 324 aa  58.2  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.112901 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1993  cytochrome c oxidase, subunit II  38.67 
 
 		 314 aa  58.2  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0975891  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5817  cytochrome c oxidase, subunit II  36.11 
 
 		 310 aa  58.5  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.156146  hitchhiker  0.00847969 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4792  cytochrome c oxidase, subunit II  34.43 
 
 		 354 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0280165  normal  0.517537 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0828  cytochrome c oxidase, subunit II  30.56 
 
 		 321 aa  58.2  0.00000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.304556 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3078  nitrous-oxide reductase  30.48 
 
 		 631 aa  58.2  0.00000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1705  cytochrome c, monohaem  31.3 
 
 		 324 aa  57.8  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.829367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2996  cytochrome c oxidase, subunit II  33.78 
 
 		 329 aa  57.8  0.00000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.941612  hitchhiker  0.00487692 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5936  cytochrome c oxidase subunit II  36.84 
 
 		 382 aa  57.8  0.00000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6209  cytochrome c oxidase, subunit II  36.84 
 
 		 382 aa  57.8  0.00000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1244  cytochrome c oxidase, subunit II  33.33 
 
 		 211 aa  57.4  0.00000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2425  cytochrome c oxidase subunit II  35.14 
 
 		 314 aa  57.4  0.00000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.408327 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2862  cytochrome c oxidase subunit II  34.25 
 
 		 272 aa  56.6  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0315403 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1729  methyl-accepting chemotaxis protein  29.46 
 
 		 862 aa  56.6  0.0000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.371209  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3898  cytochrome c oxidase subunit II  33.78 
 
 		 285 aa  57  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2406  cytochrome c oxidase, subunit II  43.42 
 
 		 377 aa  57  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0252  cytochrome c oxidase, subunit II  33.75 
 
 		 302 aa  56.6  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.433496  normal  0.0258846 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4872  cytochrome c oxidase subunit II  36 
 
 		 382 aa  56.6  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.780427  normal  0.052805 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0528  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  36.49 
 
 		 355 aa  55.8  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0608  cytochrome c oxidase subunit II  33.33 
 
 		 276 aa  56.2  0.0000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1826  cytochrome c oxidase, subunit II, putative  36.11 
 
 		 408 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.086817  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2268  cytochrome c oxidase subunit II  36 
 
 		 272 aa  56.6  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.130236  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5130  cytochrome c oxidase subunit II  26.96 
 
 		 384 aa  56.2  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0167  putative cytochrome c oxidase subunit II  31.09 
 
 		 371 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.26265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0599  cytochrome c oxidase subunit II  32.14 
 
 		 124 aa  56.2  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.632482 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1944  cytochrome c oxidase, subunit II  31.97 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2347  cytochrome c oxidase, subunit II  37.33 
 
 		 334 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>