More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0785 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_0785  cytochrome c oxidase, subunit II  100 
 
 
258 aa  523  1e-147  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.358332  normal  0.86718 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0264  cytochrome c oxidase, subunit II  57.34 
 
 
343 aa  243  3e-63  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.138079  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2249  cytochrome c oxidase, subunit II  52.53 
 
 
329 aa  199  5e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0229  cytochrome c oxidase, subunit II  39.86 
 
 
316 aa  108  6e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0502681  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0414  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  27.1 
 
 
311 aa  99  6e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4180  cytochrome c oxidase, subunit II  30.97 
 
 
314 aa  98.2  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.548982  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1522  cytochrome c oxidase, subunit II  30.77 
 
 
330 aa  98.2  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2489  cytochrome c oxidase, subunit II  28.57 
 
 
243 aa  97.4  2e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.500427  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1826  cytochrome c oxidase, subunit II, putative  27.06 
 
 
408 aa  95.9  5e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.086817  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1538  cytochrome c oxidase, subunit II  27.43 
 
 
399 aa  95.9  6e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0803  cytochrome c oxidase, subunit II  28.95 
 
 
350 aa  95.5  8e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.192306  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0848  cytochrome c oxidase subunit II  32.5 
 
 
351 aa  94.7  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1405  cytochrome-c oxidase  26.27 
 
 
343 aa  93.6  3e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0686645  normal  0.926821 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1211  Cytochrome-c oxidase  34.68 
 
 
351 aa  92.8  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.553445  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0828  cytochrome c oxidase, subunit II  35.71 
 
 
321 aa  92.8  5e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.304556 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0855  cytochrome c oxidase, subunit II  27 
 
 
350 aa  92.4  6e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1754  cytochrome c oxidase subunit II  27.8 
 
 
275 aa  92.4  6e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.636353  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0851  cytochrome c oxidase, subunit II  27 
 
 
350 aa  92.4  6e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2072  cytochrome c oxidase, subunit II  30.43 
 
 
425 aa  91.3  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.54281 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0528  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  31.16 
 
 
355 aa  90.9  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2996  cytochrome c oxidase, subunit II  27.23 
 
 
329 aa  90.9  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.941612  hitchhiker  0.00487692 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5948  cytochrome c oxidase, subunit II  25.28 
 
 
318 aa  89.4  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0222  cytochrome c oxidase, subunit II  27.5 
 
 
362 aa  89.4  6e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0145699  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6229  cytochrome c oxidase, subunit II  34.85 
 
 
359 aa  89  7e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.24435  normal  0.0456922 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4435  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I:cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  33.85 
 
 
316 aa  89  7e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0428074  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2529  caa3-type cytochrome c oxidase, subunit II  27.9 
 
 
318 aa  89  8e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.176117  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0628  cytochrome c oxidase, subunit II  26.29 
 
 
351 aa  88.6  9e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.197881 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1874  cytochrome c oxidase, subunit II  37.88 
 
 
256 aa  88.6  9e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3958  cytochrome c oxidase, subunit II  30.15 
 
 
336 aa  87.8  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0608  cytochrome c oxidase subunit II  25.91 
 
 
276 aa  87.8  1e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0446  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  29.71 
 
 
324 aa  87.4  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.112901 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1244  cytochrome c oxidase, subunit II  31.47 
 
 
211 aa  87.4  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0252  cytochrome c oxidase, subunit II  27.59 
 
 
302 aa  87.4  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.433496  normal  0.0258846 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2706  cytochrome c oxidase, subunit II  35.9 
 
 
389 aa  87.4  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.363999 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0024  cytochrome c oxidase, subunit II  25.64 
 
 
362 aa  86.7  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.901821 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1588  cytochrome c oxidase, subunit II  32.86 
 
 
342 aa  86.3  5e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1348  cytochrome c, monohaem  27.31 
 
 
426 aa  85.5  7e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.195405  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6886  cytochrome c oxidase, subunit II  28.19 
 
 
313 aa  84.7  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0771  cytochrome c oxidase, subunit II  28.75 
 
 
381 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0315373  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3892  cytochrome c oxidase subunit II  34.42 
 
 
345 aa  85.1  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.740774  normal  0.178097 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0945  cytochrome oxidase subunit II  28.75 
 
 
372 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.891376  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0783  cytochrome c oxidase, subunit II  28.75 
 
 
372 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1779  cytochrome c oxidase, subunit II  27.85 
 
 
339 aa  84  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0222  cytochrome c oxidase, subunit II  30.3 
 
 
288 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1903  cytochrome c oxidase, subunit II  32.89 
 
 
344 aa  83.6  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0166  cytochrome c oxidase, subunit II  31.01 
 
 
362 aa  83.6  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.129501  normal  0.0168942 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2602  cytochrome c oxidase subunit II  32.2 
 
 
315 aa  83.2  0.000000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.405519 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2797  cytochrome c oxidase, subunit II  25.53 
 
 
249 aa  82.4  0.000000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5817  cytochrome c oxidase, subunit II  34.09 
 
 
310 aa  82  0.000000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.156146  hitchhiker  0.00847969 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0761  cytochrome c oxidase subunit II  33.11 
 
 
146 aa  81.3  0.00000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.254887  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2641  cytochrome c oxidase subunit II  32.5 
 
 
321 aa  81.3  0.00000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.398022  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6354  cytochrome c oxidase subunit II  27.6 
 
 
334 aa  81.3  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0741  cytochrome c oxidase, subunit II  24.24 
 
 
287 aa  81.3  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1645  cytochrome c oxidase, subunit II  23.31 
 
 
385 aa  81.3  0.00000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.856042  normal  0.904416 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0621  cytochrome c oxidase, subunit II  29.89 
 
 
255 aa  80.5  0.00000000000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  decreased coverage  0.0000000345466  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0584  cytochrome c oxidase, subunit II  30.77 
 
 
320 aa  80.1  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0567  cytochrome c oxidase, subunit II  30.77 
 
 
320 aa  80.1  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2026  cytochrome c oxidase, subunit II  25.99 
 
 
346 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000905775 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1910  cytochrome c oxidase, subunit II  24.3 
 
 
334 aa  79.7  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06421  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  25.6 
 
 
274 aa  79.7  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0878998 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05081  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  31.5 
 
 
267 aa  79.7  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.189517  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1944  cytochrome c oxidase, subunit II  39.42 
 
 
149 aa  79.3  0.00000000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0300  cytochrome c oxidase, subunit II  29.31 
 
 
254 aa  79.7  0.00000000000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2962  cytochrome c oxidase, subunit II  24.59 
 
 
401 aa  79.3  0.00000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2811  cytochrome c oxidase, subunit II  24.59 
 
 
401 aa  79.3  0.00000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4506  cytochrome c oxidase, subunit II  23.29 
 
 
304 aa  79  0.00000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.578189 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3573  cytochrome c oxidase subunit II  29.01 
 
 
360 aa  78.2  0.0000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1471  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I:cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  23.14 
 
 
401 aa  78.2  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0533  cytochrome c oxidase, subunit II  27.4 
 
 
405 aa  77.8  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.251737 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0045  cytochrome c oxidase, subunit II  26.36 
 
 
300 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00101143 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0983  cytochrome c oxidase, subunit II  30.47 
 
 
356 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1940  cytochrome c oxidase, subunit II  27.51 
 
 
385 aa  78.2  0.0000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0684443  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0033  cytochrome c oxidase, subunit II  23.79 
 
 
279 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.979273  normal  0.511366 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0828  cytochrome c oxidase, subunit II  27.87 
 
 
279 aa  77.4  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.289421  normal  0.503108 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0104  cytochrome c oxidase subunit II  25.2 
 
 
359 aa  77.8  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.100023  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2266  cytochrome c, monohaem  30.33 
 
 
336 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.380948  normal  0.0167103 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0320  cytochrome c oxidase, subunit II  33.1 
 
 
147 aa  77.8  0.0000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2234  cytochrome-c oxidase  28.42 
 
 
292 aa  77.8  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00748725 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4588  cytochrome-c oxidase  25.4 
 
 
284 aa  76.6  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.780842  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0899  cytochrome c oxidase, subunit II  26.18 
 
 
285 aa  76.6  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.20634  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4071  cytochrome c oxidase, subunit II  30.94 
 
 
328 aa  77  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0709  cytochrome c oxidase subunit II  24.45 
 
 
355 aa  76.6  0.0000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.669005  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4392  cytochrome c oxidase, subunit II  23.3 
 
 
392 aa  76.3  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1855  cytochrome c oxidase, subunit II  29.37 
 
 
356 aa  76.3  0.0000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01020  cytochrome c oxidase, subunit II  27.43 
 
 
385 aa  75.9  0.0000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.24737  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1449  cytochrome c oxidase, subunit II  25.42 
 
 
346 aa  75.9  0.0000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.015711 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0079  putative cytochrome c oxidase subunit II  24.86 
 
 
342 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.917681  hitchhiker  0.00234837 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0294  cytochrome c oxidase subunit II  23.17 
 
 
408 aa  75.5  0.0000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00251297  hitchhiker  0.000594912 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0814  cytochrome-c oxidase  25.67 
 
 
284 aa  75.5  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.278116  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0669  cytochrome c oxidase subunit II  25.43 
 
 
279 aa  74.7  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.12333  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0544  cytochrome c oxidase, subunit II  28.11 
 
 
544 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.214831  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2717  cytochrome c oxidase, subunit II  23.75 
 
 
523 aa  75.1  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.977219  normal  0.293993 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4171  putative cytochrome c oxidase  24.11 
 
 
538 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.82291  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0237  cytochrome c oxidase, subunit II  25.95 
 
 
418 aa  74.7  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0206186 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0218  cytochrome c oxidase, subunit II  25.95 
 
 
418 aa  75.1  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.468069  normal  0.633646 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1038  cytochrome c oxidase, subunit II  21.92 
 
 
329 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0922258 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0260  cytochrome c oxidase, subunit II  26.04 
 
 
288 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.150091  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04701  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  24.19 
 
 
267 aa  74.3  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0445  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  22.45 
 
 
267 aa  73.9  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05001  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  22.8 
 
 
270 aa  73.9  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.715952  normal  0.110072 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>