246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_1358 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_1491  cytochrome c oxidase, subunit II  99.46 
 
 		 190 aa  384  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.403979  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1352  cytochrome c oxidase, subunit II  99.46 
 
 		 185 aa  384  1e-106  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1358  cytochrome c oxidase, subunit II  100 
 
 		 185 aa  386  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2875  hypothetical protein  96.36 
 
 		 165 aa  337  8e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.902113  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5762  cytochrome c oxidase subunit II  77.47 
 
 		 195 aa  311  3.9999999999999997e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.336691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1402  cytochrome c oxidase, subunit II  75.93 
 
 		 162 aa  276  1e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.290296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4077  putative cytochrome c oxidase subunit II  69.27 
 
 		 190 aa  274  6e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.357197 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0623  cytochrome c oxidase subunit II  68.72 
 
 		 190 aa  272  3e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.320942 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0348  cytochrome c oxidase subunit II  65.57 
 
 		 190 aa  268  2.9999999999999997e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8116  cytochrome c oxidase subunit II  61.2 
 
 		 187 aa  253  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.105438  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2397  cytochrome c oxidase, subunit II  39.64 
 
 		 177 aa  137  7e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2385  cytochrome c oxidase subunit II  37.01 
 
 		 156 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1899  cytochrome c oxidase subunit II  32.47 
 
 		 156 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.71816  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3756  cytochrome c oxidase subunit II  34.18 
 
 		 300 aa  102  3e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2412  cytochrome c oxidase subunit II  33.54 
 
 		 171 aa  102  3e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3373  cytochrome c oxidase subunit II  37.28 
 
 		 172 aa  99.8  2e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.208365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1574  cytochrome c oxidase subunit II  34.42 
 
 		 168 aa  97.8  9e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226069  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1565  cytochrome c oxidase subunit II  34.67 
 
 		 155 aa  96.3  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0933  cytochrome c oxidase, subunit II  34.16 
 
 		 168 aa  93.6  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0016  cytochrome c oxidase, subunit II  46.39 
 
 		 186 aa  94  1e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0464  cytochrome c oxidase subunit II  33.54 
 
 		 266 aa  93.2  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1950  cytochrome c oxidase, subunit II  33.96 
 
 		 158 aa  93.6  2e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3802  cytochrome c oxidase subunit II  32.91 
 
 		 262 aa  91.7  5e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2967  cytochrome c oxidase subunit II  29.56 
 
 		 162 aa  87.8  9e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000376263 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2021  cytochrome c oxidase subunit II  28.3 
 
 		 160 aa  77.4  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.388315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1826  cytochrome c oxidase subunit II  28.21 
 
 		 160 aa  75.5  0.0000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00813215  normal  0.126007 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1874  cytochrome c oxidase, subunit II  33.33 
 
 		 256 aa  64.3  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0229  cytochrome c oxidase, subunit II  39.76 
 
 		 316 aa  63.5  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0502681  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0186  cytochrome c oxidase subunit II  33.98 
 
 		 172 aa  62.8  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.721142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3117  cytochrome c oxidase, subunit II  25.93 
 
 		 316 aa  61.2  0.000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.762727  normal  0.80653 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2670  cytochrome c oxidase, subunit II  35.29 
 
 		 265 aa  59.3  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0983455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1936  cytochrome c oxidase subunit II  29.79 
 
 		 243 aa  58.9  0.00000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.244228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0533  cytochrome c oxidase, subunit II  29.46 
 
 		 405 aa  57.8  0.00000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.251737 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2971  cytochrome c oxidase, subunit II  34.74 
 
 		 176 aa  57  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000000297195  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1588  cytochrome c oxidase, subunit II  28.7 
 
 		 342 aa  57.4  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2667  cytochrome c oxidase, subunit II  35.56 
 
 		 175 aa  56.6  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00000731969  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2712  cytochrome c oxidase, subunit II  32.22 
 
 		 180 aa  55.5  0.0000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.925486  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2016  cytochrome c oxidase, subunit II  32.26 
 
 		 304 aa  55.5  0.0000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02212  putative cytochrome C oxidase polypeptide II oxidoreductase protein  32.94 
 
 		 125 aa  55.5  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0414  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  28.97 
 
 		 311 aa  55.5  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0252  cytochrome c oxidase, subunit II  31.87 
 
 		 302 aa  55.1  0.0000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.433496  normal  0.0258846 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0803  cytochrome c oxidase, subunit II  32.61 
 
 		 350 aa  55.1  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.192306  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1522  cytochrome c oxidase, subunit II  27.08 
 
 		 330 aa  54.7  0.0000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0851  cytochrome c oxidase, subunit II  32.61 
 
 		 350 aa  54.7  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0320  cytochrome c oxidase, subunit II  26.85 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0855  cytochrome c oxidase, subunit II  32.61 
 
 		 350 aa  54.7  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3078  cytochrome c oxidase, subunit II  32.58 
 
 		 260 aa  54.3  0.0000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000302907  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1801  cytochrome c oxidase subunit II  33.64 
 
 		 288 aa  53.9  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.191358 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0264  cytochrome c oxidase, subunit II  31.18 
 
 		 343 aa  54.3  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.138079  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2249  cytochrome c oxidase, subunit II  27.83 
 
 		 329 aa  54.3  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2797  cytochrome c oxidase, subunit II  23.64 
 
 		 249 aa  54.3  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4253  cytochrome c oxidase, subunit II  32.56 
 
 		 124 aa  53.1  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2263  cytochrome c oxidase, subunit II  26.96 
 
 		 367 aa  53.5  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0175262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0036  cytochrome c oxidase, subunit II  32.22 
 
 		 378 aa  53.5  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0156  cytochrome c oxidase, subunit II  34.69 
 
 		 232 aa  52.8  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0956  cytochrome c oxidase, subunit II  28.57 
 
 		 280 aa  52.8  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.137087 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3483  cytochrome c oxidase, subunit II  31.82 
 
 		 520 aa  52.4  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.243767 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2082  cytochrome c oxidase, subunit II  27.74 
 
 		 289 aa  52.8  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0222  cytochrome c oxidase, subunit II  30.25 
 
 		 288 aa  52.4  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4606  cytochrome c oxidase, subunit II  32.91 
 
 		 513 aa  52.4  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3558  cytochrome c oxidase subunit II  23.5 
 
 		 370 aa  52.4  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.22857 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4435  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I:cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  29.46 
 
 		 316 aa  52  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0428074  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0848  cytochrome c oxidase subunit II  32.94 
 
 		 351 aa  52  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2706  cytochrome c oxidase, subunit II  30.43 
 
 		 389 aa  52  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.363999 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3955  cytochrome c oxidase subunit II  28.74 
 
 		 391 aa  52  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.113374 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2962  cytochrome c oxidase, subunit II  29.55 
 
 		 401 aa  51.6  0.000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2811  cytochrome c oxidase, subunit II  29.55 
 
 		 401 aa  51.6  0.000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2167  cytochrome c oxidase, subunit II  27.91 
 
 		 316 aa  51.6  0.000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.238577  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01290  cytochrome c oxidase, subunit II  34.04 
 
 		 374 aa  51.6  0.000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.46157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0162  cytochrome c oxidase subunit II  26.28 
 
 		 179 aa  51.2  0.000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06421  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  31.9 
 
 		 274 aa  51.2  0.000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0878998 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0180  cytochrome c oxidase subunit II  34.04 
 
 		 366 aa  51.6  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3782  cytochrome c oxidase, subunit II  34.18 
 
 		 512 aa  51.2  0.000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0258  cytochrome c oxidase, subunit II  29.41 
 
 		 528 aa  51.2  0.000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1708  cytochrome c oxidase subunit II  31.71 
 
 		 320 aa  51.2  0.000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2991  cytochrome c oxidase, subunit II  30 
 
 		 338 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.336386  normal  0.0255364 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11170  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit II  27.78 
 
 		 315 aa  50.4  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.761021  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0709  cytochrome c oxidase subunit II  28 
 
 		 355 aa  50.8  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.669005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0198  cytochrome-c oxidase  28.45 
 
 		 524 aa  50.8  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14120  cytochrome c oxidase, subunit II  30.23 
 
 		 312 aa  50.4  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0599  cytochrome c oxidase subunit II  30.86 
 
 		 124 aa  50.4  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.632482 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0828  cytochrome c oxidase, subunit II  28.44 
 
 		 321 aa  50.8  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.304556 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1348  cytochrome c, monohaem  36.36 
 
 		 426 aa  50.8  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.195405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0125  cytochrome c oxidase, subunit II  31.25 
 
 		 521 aa  50.8  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0761  cytochrome c oxidase subunit II  29.7 
 
 		 146 aa  50.1  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.254887  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0300  cytochrome c oxidase, subunit II  22.17 
 
 		 254 aa  49.7  0.00002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01475  chain II protein of putative cytochrome c oxidase  35.8 
 
 		 234 aa  49.7  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1754  cytochrome c oxidase subunit II  29.91 
 
 		 275 aa  50.1  0.00002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.636353  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3999  cytochrome c oxidase subunit II  27.12 
 
 		 524 aa  49.7  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4180  cytochrome c oxidase, subunit II  27.73 
 
 		 314 aa  50.1  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.548982  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3573  cytochrome c oxidase subunit II  29.73 
 
 		 360 aa  50.1  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0294  cytochrome c oxidase subunit II  25.93 
 
 		 408 aa  49.3  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00251297  hitchhiker  0.000594912 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0079  cytochrome c oxidase, subunit II  29.51 
 
 		 375 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1674  cytochrome c oxidase, subunit II  27.96 
 
 		 380 aa  49.3  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1449  cytochrome c oxidase, subunit II  25.58 
 
 		 346 aa  49.3  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.015711 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1289  cytochrome c oxidase, subunit II  35.96 
 
 		 275 aa  49.3  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.353123  normal  0.740937 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001445  cytochrome c oxidase polypeptide II  30.11 
 
 		 356 aa  49.7  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.633895  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2489  cytochrome c oxidase, subunit II  27.59 
 
 		 243 aa  49.7  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.500427  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3517  cytochrome c oxidase, subunit II  30.68 
 
 		 511 aa  48.9  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1453  cytochrome c oxidase, subunit II  34.18 
 
 		 299 aa  48.9  0.00004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0600133  normal  0.252589 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>