More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1708 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1708  cytochrome c oxidase subunit II  100 
 
 		 320 aa  659    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1903  cytochrome c oxidase, subunit II  30.56 
 
 		 344 aa  100  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4071  cytochrome c oxidase, subunit II  29.8 
 
 		 328 aa  95.5  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0445  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  30.2 
 
 		 267 aa  94.4  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05011  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  30.69 
 
 		 267 aa  93.2  5e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0584  cytochrome c oxidase, subunit II  29.77 
 
 		 320 aa  92  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04701  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  30.2 
 
 		 267 aa  92  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0567  cytochrome c oxidase, subunit II  29.77 
 
 		 320 aa  92  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06421  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  28.34 
 
 		 274 aa  90.5  4e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0878998 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05001  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  26.61 
 
 		 270 aa  89.4  7e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.715952  normal  0.110072 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0528  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  27.17 
 
 		 355 aa  88.2  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1777  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  25.81 
 
 		 270 aa  87  3e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2641  cytochrome c oxidase subunit II  28.73 
 
 		 321 aa  86.7  5e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.398022  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0608  cytochrome c oxidase subunit II  27.04 
 
 		 276 aa  85.9  7e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0446  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  27.16 
 
 		 324 aa  83.2  0.000000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.112901 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05081  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  28.24 
 
 		 267 aa  82.4  0.000000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.189517  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0414  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  26.36 
 
 		 311 aa  82.4  0.000000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1754  cytochrome c oxidase subunit II  28.5 
 
 		 275 aa  82.4  0.000000000000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.636353  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2489  cytochrome c oxidase, subunit II  28.3 
 
 		 243 aa  82  0.00000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.500427  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1855  cytochrome c oxidase, subunit II  30.88 
 
 		 356 aa  82  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04431  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  26.56 
 
 		 291 aa  81.3  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3958  cytochrome c oxidase, subunit II  26.26 
 
 		 336 aa  80.5  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3483  cytochrome c oxidase, subunit II  28.1 
 
 		 520 aa  80.5  0.00000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.243767 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4606  cytochrome c oxidase, subunit II  28.24 
 
 		 513 aa  79.7  0.00000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3991  cytochrome c oxidase, subunit II  27.86 
 
 		 513 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0154  cytochrome c oxidase, subunit II  27.69 
 
 		 518 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4112  cytochrome c oxidase, subunit II  28.08 
 
 		 518 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1779  cytochrome c oxidase, subunit II  24.8 
 
 		 339 aa  77.4  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3791  cytochrome c oxidase, subunit II  26.72 
 
 		 513 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3864  cytochrome c oxidase, subunit II  27.48 
 
 		 513 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0983  cytochrome c oxidase, subunit II  28.92 
 
 		 356 aa  77  0.0000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4180  cytochrome c oxidase, subunit II  28.02 
 
 		 518 aa  77  0.0000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4311  cytochrome c oxidase, subunit II  28.02 
 
 		 518 aa  76.6  0.0000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.997623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1826  cytochrome c oxidase, subunit II, putative  26.7 
 
 		 408 aa  76.3  0.0000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.086817  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1538  cytochrome c oxidase, subunit II  24.43 
 
 		 399 aa  75.9  0.0000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2266  cytochrome c, monohaem  35.85 
 
 		 336 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.380948  normal  0.0167103 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0236  cytochrome c oxidase, subunit II  24.21 
 
 		 519 aa  74.3  0.000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.717105  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2797  cytochrome c oxidase, subunit II  27.75 
 
 		 249 aa  73.9  0.000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3150  cytochrome c oxidase, aa3-type, subunit II  33.61 
 
 		 254 aa  73.9  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2748  cytochrome c oxidase subunit II  33.61 
 
 		 254 aa  73.9  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000027283  hitchhiker  0.000000791223 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3849  cytochrome c oxidase, subunit II  37.07 
 
 		 235 aa  73.2  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.26025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04019  cytochrome c oxidase, subunit II  27.42 
 
 		 308 aa  73.2  0.000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0785  cytochrome c oxidase, subunit II  35.48 
 
 		 258 aa  73.2  0.000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.358332  normal  0.86718 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3573  cytochrome c oxidase subunit II  23.3 
 
 		 360 aa  72.8  0.000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0156  cytochrome c oxidase, subunit II  41.12 
 
 		 232 aa  72.8  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2962  cytochrome c oxidase, subunit II  29.38 
 
 		 401 aa  71.2  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2811  cytochrome c oxidase, subunit II  29.38 
 
 		 401 aa  71.2  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01475  chain II protein of putative cytochrome c oxidase  34.91 
 
 		 234 aa  71.2  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2602  cytochrome c oxidase subunit II  28.33 
 
 		 315 aa  71.2  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.405519 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0178  cytochrome c oxidase, subunit II  26.58 
 
 		 513 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3517  cytochrome c oxidase, subunit II  26.78 
 
 		 511 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3999  cytochrome c oxidase subunit II  26.45 
 
 		 524 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0125  cytochrome c oxidase, subunit II  28.07 
 
 		 521 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3770  cytochrome c oxidase subunit II  26.58 
 
 		 349 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3139  cytochrome c oxidase subunit II  25.53 
 
 		 316 aa  69.3  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2670  cytochrome c oxidase, subunit II  32.58 
 
 		 265 aa  69.3  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0983455  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3991  cytochrome c oxidase, subunit II  26.16 
 
 		 349 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3856  cytochrome c oxidase subunit II  26.16 
 
 		 349 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.15254  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3687  cytochrome c oxidase, subunit II  26.16 
 
 		 349 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3704  cytochrome c oxidase, subunit II  26.16 
 
 		 349 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.136015  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4154  cytochrome c oxidase subunit II  26.16 
 
 		 349 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1193  cytochrome c oxidase, subunit II  26.16 
 
 		 349 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4062  cytochrome c oxidase, subunit II  26.16 
 
 		 349 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3959  cytochrome c oxidase, subunit II  26.16 
 
 		 349 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3782  cytochrome c oxidase, subunit II  25.75 
 
 		 512 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4046  cytochrome c oxidase, subunit II  26.16 
 
 		 349 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0180  cytochrome c oxidase subunit II  27.17 
 
 		 366 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2263  cytochrome c oxidase, subunit II  26.44 
 
 		 367 aa  67.8  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0175262  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0045  cytochrome c oxidase, subunit II  26.75 
 
 		 300 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00101143 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2646  cytochrome c oxidase subunit II  24.36 
 
 		 349 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0991495  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3558  cytochrome c oxidase subunit II  27.78 
 
 		 370 aa  68.2  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.22857 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01290  cytochrome c oxidase, subunit II  25.91 
 
 		 374 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.46157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2406  cytochrome c oxidase, subunit II  25.95 
 
 		 377 aa  67  0.0000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1348  cytochrome c, monohaem  28.78 
 
 		 426 aa  67  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.195405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0981  cytochrome c oxidase subunit II  28.89 
 
 		 311 aa  67  0.0000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0740961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0533  cytochrome c oxidase, subunit II  23.48 
 
 		 405 aa  67  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.251737 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3892  cytochrome c oxidase subunit II  27.4 
 
 		 345 aa  66.6  0.0000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.740774  normal  0.178097 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0310  cytochrome c oxidase, subunit II  28.86 
 
 		 320 aa  66.6  0.0000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0572725 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3309  cytochrome c oxidase, subunit II  24.92 
 
 		 352 aa  66.2  0.0000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49691  normal  0.220958 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3360  cytochrome c oxidase, subunit II  24.92 
 
 		 352 aa  66.2  0.0000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.773952  normal  0.0585586 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3298  cytochrome c oxidase, subunit II  24.92 
 
 		 352 aa  66.2  0.0000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0258  cytochrome c oxidase, subunit II  25.3 
 
 		 528 aa  66.6  0.0000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11170  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit II  33.02 
 
 		 315 aa  66.2  0.0000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.761021  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3011  Cytochrome-c oxidase  26.95 
 
 		 380 aa  66.2  0.0000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.913445  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0079  cytochrome c oxidase, subunit II  27.56 
 
 		 375 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0122  cytochrome c oxidase, subunit II  25.18 
 
 		 375 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.946881 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2529  caa3-type cytochrome c oxidase, subunit II  33.06 
 
 		 318 aa  65.5  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.176117  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0119  cytochrome c oxidase, subunit II  24.82 
 
 		 375 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0300  cytochrome c oxidase, subunit II  25.3 
 
 		 254 aa  65.1  0.000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3564  cytochrome c oxidase, subunit II  31.09 
 
 		 344 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.205108  normal  0.039922 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0709  cytochrome c oxidase subunit II  29.26 
 
 		 355 aa  64.7  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.669005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0198  cytochrome-c oxidase  25.32 
 
 		 524 aa  64.7  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0103  cytochrome c oxidase, subunit II  25.18 
 
 		 375 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.193198 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1211  Cytochrome-c oxidase  34.17 
 
 		 351 aa  63.5  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.553445  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0222  cytochrome c oxidase, subunit II  25.38 
 
 		 288 aa  63.5  0.000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0117  cytochrome c oxidase, subunit II  24.82 
 
 		 375 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0102376 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3150  cytochrome c oxidase, subunit II  40.96 
 
 		 340 aa  63.2  0.000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0179  cytochrome c oxidase, subunit II  27.83 
 
 		 298 aa  62.8  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4128  cytochrome c oxidase subunit II  29.45 
 
 		 269 aa  62.4  0.000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0621  cytochrome c oxidase, subunit II  31.34 
 
 		 255 aa  62.4  0.000000009  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  decreased coverage  0.0000000345466  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>