277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_3373 on replicon NC_013201
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013201  Hmuk_3373  cytochrome c oxidase subunit II  100 
 
 		 172 aa  353  6.999999999999999e-97  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.208365  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3802  cytochrome c oxidase subunit II  51.52 
 
 		 262 aa  177  5.999999999999999e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0464  cytochrome c oxidase subunit II  52.38 
 
 		 266 aa  177  8e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3756  cytochrome c oxidase subunit II  51.76 
 
 		 300 aa  177  9e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2412  cytochrome c oxidase subunit II  49.11 
 
 		 171 aa  166  1e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2385  cytochrome c oxidase subunit II  39.16 
 
 		 156 aa  119  3e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1899  cytochrome c oxidase subunit II  39.16 
 
 		 156 aa  117  7e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.71816  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2967  cytochrome c oxidase subunit II  42.07 
 
 		 162 aa  114  5e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000376263 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1574  cytochrome c oxidase subunit II  41.14 
 
 		 168 aa  113  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0933  cytochrome c oxidase, subunit II  40.51 
 
 		 168 aa  111  5e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0016  cytochrome c oxidase, subunit II  36.48 
 
 		 186 aa  105  3e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1565  cytochrome c oxidase subunit II  35.85 
 
 		 155 aa  103  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1358  cytochrome c oxidase, subunit II  37.28 
 
 		 185 aa  99.8  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1491  cytochrome c oxidase, subunit II  36.69 
 
 		 190 aa  98.2  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.403979  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5762  cytochrome c oxidase subunit II  36.53 
 
 		 195 aa  98.2  5e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.336691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1352  cytochrome c oxidase, subunit II  36.69 
 
 		 185 aa  97.8  6e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1826  cytochrome c oxidase subunit II  36.25 
 
 		 160 aa  97.4  8e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00813215  normal  0.126007 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4077  putative cytochrome c oxidase subunit II  34.12 
 
 		 190 aa  95.1  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.357197 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2021  cytochrome c oxidase subunit II  35.19 
 
 		 160 aa  93.6  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.388315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0623  cytochrome c oxidase subunit II  33.53 
 
 		 190 aa  93.6  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.320942 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1950  cytochrome c oxidase, subunit II  34.39 
 
 		 158 aa  89.4  3e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0348  cytochrome c oxidase subunit II  31.76 
 
 		 190 aa  88.6  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2397  cytochrome c oxidase, subunit II  33.14 
 
 		 177 aa  87.4  8e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1402  cytochrome c oxidase, subunit II  39.42 
 
 		 162 aa  86.3  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.290296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2875  hypothetical protein  36.13 
 
 		 165 aa  85.5  4e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.902113  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8116  cytochrome c oxidase subunit II  45 
 
 		 187 aa  84  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.105438  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0803  cytochrome c oxidase, subunit II  34.86 
 
 		 350 aa  79  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.192306  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2797  cytochrome c oxidase, subunit II  30.9 
 
 		 249 aa  76.3  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0851  cytochrome c oxidase, subunit II  33.94 
 
 		 350 aa  75.5  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0855  cytochrome c oxidase, subunit II  33.94 
 
 		 350 aa  75.5  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0848  cytochrome c oxidase subunit II  33.01 
 
 		 351 aa  73.6  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0162  cytochrome c oxidase subunit II  37.36 
 
 		 179 aa  70.5  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2706  cytochrome c oxidase, subunit II  32.35 
 
 		 389 aa  68.2  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.363999 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1874  cytochrome c oxidase, subunit II  35.71 
 
 		 256 aa  65.5  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0599  cytochrome c oxidase subunit II  32.58 
 
 		 124 aa  64.7  0.0000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.632482 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0414  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  35 
 
 		 311 aa  63.5  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2489  cytochrome c oxidase, subunit II  27.01 
 
 		 243 aa  63.2  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.500427  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0252  cytochrome c oxidase, subunit II  34.41 
 
 		 302 aa  62.8  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.433496  normal  0.0258846 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1348  cytochrome c, monohaem  37.35 
 
 		 426 aa  62.4  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.195405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0046  cytochrome c oxidase, subunit II  34.62 
 
 		 301 aa  62.4  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2862  cytochrome c oxidase subunit II  33.73 
 
 		 272 aa  62  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0315403 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1826  cytochrome c oxidase, subunit II, putative  35 
 
 		 408 aa  61.2  0.000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.086817  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4435  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I:cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  34.62 
 
 		 316 aa  59.7  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0428074  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0229  cytochrome c oxidase, subunit II  34.44 
 
 		 316 aa  59.7  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0502681  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0045  cytochrome c oxidase, subunit II  39.47 
 
 		 300 aa  59.7  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00101143 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2249  cytochrome c oxidase, subunit II  37.5 
 
 		 329 aa  59.7  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2167  cytochrome c oxidase, subunit II  32.14 
 
 		 316 aa  59.7  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.238577  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0222  cytochrome c oxidase, subunit II  34.94 
 
 		 288 aa  59.3  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0533  cytochrome c oxidase, subunit II  35.06 
 
 		 405 aa  58.5  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.251737 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2313  cytochrome c oxidase, subunit II  34.62 
 
 		 244 aa  58.5  0.00000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.210732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1522  cytochrome c oxidase, subunit II  27.78 
 
 		 330 aa  58.2  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1449  cytochrome c oxidase, subunit II  31.52 
 
 		 346 aa  58.2  0.00000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.015711 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0186  cytochrome c oxidase subunit II  39.71 
 
 		 172 aa  57  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.721142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0320  cytochrome c oxidase, subunit II  34.72 
 
 		 147 aa  56.6  0.0000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2712  cytochrome c oxidase, subunit II  37.68 
 
 		 180 aa  56.2  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.925486  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0437  cytochrome c oxidase, subunit II  33.77 
 
 		 267 aa  56.2  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0468935 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0563  cytochrome c oxidase subunit II  35.44 
 
 		 394 aa  55.5  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2406  cytochrome c oxidase, subunit II  28.32 
 
 		 377 aa  55.8  0.0000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2345  cytochrome c oxidase subunit II  32.22 
 
 		 271 aa  55.5  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.215159  normal  0.967701 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1903  cytochrome c oxidase, subunit II  28.93 
 
 		 344 aa  55.1  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1538  cytochrome c oxidase, subunit II  31.33 
 
 		 399 aa  54.7  0.0000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1244  cytochrome c oxidase, subunit II  30 
 
 		 211 aa  54.7  0.0000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01475  chain II protein of putative cytochrome c oxidase  36.23 
 
 		 234 aa  54.7  0.0000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0761  cytochrome c oxidase subunit II  36.36 
 
 		 146 aa  54.7  0.0000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.254887  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02212  putative cytochrome C oxidase polypeptide II oxidoreductase protein  30.85 
 
 		 125 aa  54.7  0.0000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2175  cytochrome c oxidase family protein  31.46 
 
 		 141 aa  54.3  0.0000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.381678  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1172  cytochrome c oxidase family protein  31.46 
 
 		 141 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0182872  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1408  cytochrome c oxidase family protein  31.46 
 
 		 141 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0216619  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1899  cytochrome c oxidase family protein  31.46 
 
 		 141 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3558  cytochrome c oxidase subunit II  33.33 
 
 		 370 aa  53.9  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.22857 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2529  caa3-type cytochrome c oxidase, subunit II  32.97 
 
 		 318 aa  53.9  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.176117  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06421  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  30.38 
 
 		 274 aa  53.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0878998 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0180  cytochrome c oxidase subunit II  27.97 
 
 		 366 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5502  cytochrome c oxidase, subunit II  30.34 
 
 		 370 aa  53.9  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.535121  normal  0.0572426 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1618  cytochrome c oxidase subunit II  30.34 
 
 		 125 aa  53.9  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.464579 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01290  cytochrome c oxidase, subunit II  31.33 
 
 		 374 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.46157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3408  cytochrome c oxidase family protein  31.46 
 
 		 141 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.181168  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2296  putative cytochrome c oxidase subunit  31.46 
 
 		 141 aa  53.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.375881  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0264  cytochrome c oxidase, subunit II  34.94 
 
 		 343 aa  52.8  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.138079  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2422  cytochrome c oxidase family protein  31.46 
 
 		 141 aa  53.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2257  putative cytochrome c oxidase subunit  31.46 
 
 		 141 aa  53.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0923001  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6146  cytochrome c oxidase, subunit II  31.33 
 
 		 353 aa  52.8  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.870856  normal  0.304247 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0156  cytochrome c oxidase, subunit II  30 
 
 		 232 aa  52.8  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1944  cytochrome c oxidase, subunit II  33.77 
 
 		 149 aa  52.4  0.000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0294  cytochrome c oxidase subunit II  28.42 
 
 		 408 aa  52  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00251297  hitchhiker  0.000594912 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2263  cytochrome c oxidase, subunit II  32.89 
 
 		 367 aa  52  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0175262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1754  cytochrome c oxidase subunit II  31.94 
 
 		 275 aa  52  0.000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.636353  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6539  cytochrome c, monohaem  31.33 
 
 		 434 aa  52  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.537411  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0785  cytochrome c oxidase, subunit II  33.68 
 
 		 258 aa  51.6  0.000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.358332  normal  0.86718 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04701  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  31.25 
 
 		 267 aa  51.6  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05011  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  31.25 
 
 		 267 aa  51.6  0.000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1038  cytochrome c oxidase, subunit II  29.07 
 
 		 388 aa  51.6  0.000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0584  cytochrome c oxidase, subunit II  33.33 
 
 		 320 aa  51.2  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2971  cytochrome c oxidase, subunit II  32 
 
 		 176 aa  51.6  0.000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000000297195  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2670  cytochrome c oxidase, subunit II  30.38 
 
 		 265 aa  51.2  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0983455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0567  cytochrome c oxidase, subunit II  33.33 
 
 		 320 aa  51.2  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6229  cytochrome c oxidase, subunit II  28.24 
 
 		 359 aa  51.6  0.000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.24435  normal  0.0456922 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0024  cytochrome c oxidase, subunit II  24.79 
 
 		 362 aa  51.2  0.000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.901821 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2072  cytochrome c oxidase, subunit II  29.21 
 
 		 425 aa  50.8  0.000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.54281 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1292  cytochrome c oxidase, subunit II  30.12 
 
 		 354 aa  51.2  0.000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.493898  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>