More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS02212 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003296  RS02212  putative cytochrome C oxidase polypeptide II oxidoreductase protein  100 
 
 
125 aa  252  1.0000000000000001e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1618  cytochrome c oxidase subunit II  56.1 
 
 
125 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.464579 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1408  cytochrome c oxidase family protein  65.17 
 
 
141 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0216619  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2257  putative cytochrome c oxidase subunit  65.17 
 
 
141 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0923001  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3408  cytochrome c oxidase family protein  65.17 
 
 
141 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.181168  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1172  cytochrome c oxidase family protein  65.17 
 
 
141 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0182872  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2422  cytochrome c oxidase family protein  65.17 
 
 
141 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1899  cytochrome c oxidase family protein  65.17 
 
 
141 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2296  putative cytochrome c oxidase subunit  65.17 
 
 
141 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.375881  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2175  cytochrome c oxidase family protein  64.04 
 
 
141 aa  116  7.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.381678  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0599  cytochrome c oxidase subunit II  53.33 
 
 
124 aa  109  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.632482 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4253  cytochrome c oxidase, subunit II  47.78 
 
 
124 aa  99.4  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0414  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  34.74 
 
 
311 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2345  cytochrome c oxidase subunit II  41.67 
 
 
271 aa  70.1  0.000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.215159  normal  0.967701 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2967  cytochrome c oxidase subunit II  36.47 
 
 
162 aa  69.3  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000376263 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2268  cytochrome c oxidase subunit II  47.14 
 
 
272 aa  68.2  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.130236  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2425  cytochrome c oxidase subunit II  47.14 
 
 
314 aa  67.4  0.00000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.408327 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2021  cytochrome c oxidase subunit II  32.22 
 
 
160 aa  67.4  0.00000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.388315  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1676  cytochrome c oxidase, subunit II  34 
 
 
337 aa  67  0.00000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1600  cytochrome c oxidase, subunit II  34 
 
 
337 aa  67  0.00000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.884566  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1574  cytochrome c oxidase subunit II  38.82 
 
 
168 aa  66.2  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226069  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2594  cytochrome c oxidase subunit II  45.71 
 
 
272 aa  66.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0132206  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5817  cytochrome c oxidase, subunit II  34.74 
 
 
310 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.156146  hitchhiker  0.00847969 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5130  cytochrome c oxidase subunit II  39.19 
 
 
384 aa  65.9  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2412  cytochrome c oxidase subunit II  34.78 
 
 
171 aa  66.2  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0252  cytochrome c oxidase, subunit II  32.95 
 
 
302 aa  65.5  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.433496  normal  0.0258846 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2275  cytochrome c oxidase, subunit II  34 
 
 
337 aa  65.1  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.869151  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0884  cytochrome c oxidase, subunit II  35.23 
 
 
120 aa  65.1  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.555731  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0933  cytochrome c oxidase, subunit II  35.29 
 
 
168 aa  64.7  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2385  cytochrome c oxidase subunit II  31.58 
 
 
156 aa  64.3  0.0000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0254  cytochrome c oxidase subunit II  41.1 
 
 
269 aa  64.3  0.0000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00721127 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0222  cytochrome c oxidase, subunit II  33.33 
 
 
288 aa  63.2  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4435  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I:cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  32.63 
 
 
316 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0428074  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0320  cytochrome c oxidase, subunit II  27.34 
 
 
147 aa  63.2  0.000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0828  cytochrome c oxidase, subunit II  41.79 
 
 
321 aa  62.4  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.304556 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6886  cytochrome c oxidase, subunit II  41.79 
 
 
313 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1950  cytochrome c oxidase, subunit II  33.73 
 
 
158 aa  62  0.000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5948  cytochrome c oxidase, subunit II  37.88 
 
 
318 aa  61.6  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1903  cytochrome c oxidase, subunit II  31.31 
 
 
344 aa  61.2  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2474  cytochrome c oxidase, subunit II  41.54 
 
 
273 aa  61.6  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.850241  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3632  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I  41.1 
 
 
444 aa  61.2  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3955  cytochrome c oxidase subunit II  39.73 
 
 
391 aa  60.8  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.113374 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8116  cytochrome c oxidase subunit II  29.59 
 
 
187 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.105438  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0608  cytochrome c oxidase subunit II  28.46 
 
 
276 aa  60.5  0.000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0464  cytochrome c oxidase subunit II  29.07 
 
 
266 aa  60.5  0.000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2706  cytochrome c oxidase, subunit II  37.31 
 
 
389 aa  60.5  0.000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.363999 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1899  cytochrome c oxidase subunit II  30.53 
 
 
156 aa  60.1  0.000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.71816  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12220  cytochrome c oxidase, subunit II  40.91 
 
 
286 aa  59.7  0.00000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0561533  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1588  cytochrome c oxidase, subunit II  36.92 
 
 
342 aa  60.1  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3898  cytochrome c oxidase subunit II  38.57 
 
 
285 aa  59.3  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2862  cytochrome c oxidase subunit II  34.12 
 
 
272 aa  60.1  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0315403 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6229  cytochrome c oxidase, subunit II  40 
 
 
359 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.24435  normal  0.0456922 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2996  cytochrome c oxidase, subunit II  34.25 
 
 
329 aa  59.7  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.941612  hitchhiker  0.00487692 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2012  Nitrous-oxide reductase  31.11 
 
 
663 aa  59.7  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1826  cytochrome c oxidase subunit II  29.89 
 
 
160 aa  58.9  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00813215  normal  0.126007 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6354  cytochrome c oxidase subunit II  37.04 
 
 
334 aa  59.3  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2602  cytochrome c oxidase subunit II  34.29 
 
 
315 aa  59.3  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.405519 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04431  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  32.63 
 
 
291 aa  58.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1944  cytochrome c oxidase, subunit II  28 
 
 
149 aa  58.9  0.00000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0183  cytochrome c oxidase subunit II  27.05 
 
 
143 aa  58.9  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.13824 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5762  cytochrome c oxidase subunit II  31.63 
 
 
195 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.336691  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0016  cytochrome c oxidase, subunit II  31.71 
 
 
186 aa  58.5  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3795  cytochrome c oxidase subunit II  36.36 
 
 
382 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0096  cytochrome c oxidase, subunit II  31.71 
 
 
334 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.296292  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4872  cytochrome c oxidase subunit II  36.36 
 
 
382 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.780427  normal  0.052805 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0848  cytochrome c oxidase subunit II  33.78 
 
 
351 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5936  cytochrome c oxidase subunit II  36.99 
 
 
382 aa  57.8  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0726  cytochrome c oxidase, subunit II  38.36 
 
 
388 aa  57.8  0.00000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.631169  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6209  cytochrome c oxidase, subunit II  36.99 
 
 
382 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2358  cytochrome c oxidase subunit II  37.14 
 
 
280 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.382023  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1564  cytochrome C oxidase polypeptide II  38.96 
 
 
384 aa  57.4  0.00000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0166  cytochrome c oxidase, subunit II  37.31 
 
 
362 aa  57.4  0.00000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.129501  normal  0.0168942 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0024  cytochrome c oxidase, subunit II  37.31 
 
 
362 aa  57.4  0.00000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.901821 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0222  cytochrome c oxidase, subunit II  37.31 
 
 
362 aa  57.4  0.00000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0145699  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0761  cytochrome c oxidase subunit II  28.41 
 
 
146 aa  57  0.00000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.254887  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0186  cytochrome c oxidase subunit II  32.65 
 
 
172 aa  56.6  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.721142  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7362  cytochrome c oxidase, subunit II  35.62 
 
 
394 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.674364 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3756  cytochrome c oxidase subunit II  29.35 
 
 
300 aa  56.6  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0046  cytochrome c oxidase, subunit II  31.03 
 
 
301 aa  56.2  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1491  cytochrome c oxidase, subunit II  32.94 
 
 
190 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.403979  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1244  cytochrome c oxidase, subunit II  31.51 
 
 
211 aa  55.5  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1826  cytochrome c oxidase, subunit II, putative  31.91 
 
 
408 aa  56.2  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.086817  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1352  cytochrome c oxidase, subunit II  32.94 
 
 
185 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1358  cytochrome c oxidase, subunit II  32.94 
 
 
185 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2991  cytochrome c oxidase, subunit II  36.59 
 
 
338 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.336386  normal  0.0255364 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1754  cytochrome c oxidase subunit II  30.93 
 
 
275 aa  55.1  0.0000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.636353  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1874  cytochrome c oxidase, subunit II  28.87 
 
 
256 aa  55.1  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3373  cytochrome c oxidase subunit II  30.85 
 
 
172 aa  55.1  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.208365  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3802  cytochrome c oxidase subunit II  29.35 
 
 
262 aa  55.1  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1801  cytochrome c oxidase subunit II  40.91 
 
 
288 aa  54.7  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.191358 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0855  cytochrome c oxidase, subunit II  28.42 
 
 
350 aa  54.7  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0803  cytochrome c oxidase, subunit II  32.43 
 
 
350 aa  54.7  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.192306  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0851  cytochrome c oxidase, subunit II  28.42 
 
 
350 aa  54.7  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1211  Cytochrome-c oxidase  28.57 
 
 
351 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.553445  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0209  Nitrous-oxide reductase  30.86 
 
 
632 aa  54.7  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05011  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  28.42 
 
 
267 aa  54.3  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1298  nitrous-oxide reductase  32.97 
 
 
865 aa  54.3  0.0000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.0000502464  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04701  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  28.42 
 
 
267 aa  54.3  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4180  cytochrome c oxidase, subunit II  26.17 
 
 
314 aa  54.3  0.0000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.548982  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3892  cytochrome c oxidase subunit II  35.29 
 
 
345 aa  54.7  0.0000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.740774  normal  0.178097 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>