285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0599 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_0599  cytochrome c oxidase subunit II  100 
 
 		 124 aa  251  3e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.632482 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4253  cytochrome c oxidase, subunit II  58.95 
 
 		 124 aa  123  8.000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1408  cytochrome c oxidase family protein  59.38 
 
 		 141 aa  123  1e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0216619  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2422  cytochrome c oxidase family protein  59.38 
 
 		 141 aa  123  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2257  putative cytochrome c oxidase subunit  59.38 
 
 		 141 aa  123  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0923001  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2296  putative cytochrome c oxidase subunit  59.38 
 
 		 141 aa  123  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.375881  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1172  cytochrome c oxidase family protein  59.38 
 
 		 141 aa  123  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0182872  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1899  cytochrome c oxidase family protein  59.38 
 
 		 141 aa  123  1e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3408  cytochrome c oxidase family protein  59.38 
 
 		 141 aa  123  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.181168  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2175  cytochrome c oxidase family protein  58.7 
 
 		 141 aa  118  3e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.381678  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1618  cytochrome c oxidase subunit II  50.93 
 
 		 125 aa  116  7.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.464579 
 
 
-
 
NC_003296  RS02212  putative cytochrome C oxidase polypeptide II oxidoreductase protein  50.53 
 
 		 125 aa  110  7.000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2967  cytochrome c oxidase subunit II  39.29 
 
 		 162 aa  69.3  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000376263 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2412  cytochrome c oxidase subunit II  34.31 
 
 		 171 aa  68.2  0.00000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1899  cytochrome c oxidase subunit II  35.44 
 
 		 156 aa  67.4  0.00000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.71816  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2385  cytochrome c oxidase subunit II  36.71 
 
 		 156 aa  67  0.00000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0884  cytochrome c oxidase, subunit II  32.48 
 
 		 120 aa  66.6  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.555731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1826  cytochrome c oxidase subunit II  30.91 
 
 		 160 aa  65.5  0.0000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00813215  normal  0.126007 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3373  cytochrome c oxidase subunit II  32.58 
 
 		 172 aa  64.7  0.0000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.208365  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0761  cytochrome c oxidase subunit II  34.31 
 
 		 146 aa  64.3  0.0000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.254887  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0464  cytochrome c oxidase subunit II  32.93 
 
 		 266 aa  64.3  0.0000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0252  cytochrome c oxidase, subunit II  40.98 
 
 		 302 aa  62.4  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.433496  normal  0.0258846 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3802  cytochrome c oxidase subunit II  33.33 
 
 		 262 aa  62.4  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1574  cytochrome c oxidase subunit II  33.73 
 
 		 168 aa  60.1  0.000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0933  cytochrome c oxidase, subunit II  33.73 
 
 		 168 aa  60.1  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0222  cytochrome c oxidase, subunit II  36.11 
 
 		 288 aa  58.5  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0046  cytochrome c oxidase, subunit II  33.33 
 
 		 301 aa  58.5  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0016  cytochrome c oxidase, subunit II  32.89 
 
 		 186 aa  58.2  0.00000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06421  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  35.21 
 
 		 274 aa  57.8  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0878998 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1588  cytochrome c oxidase, subunit II  34.72 
 
 		 342 aa  57.8  0.00000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3756  cytochrome c oxidase subunit II  30.95 
 
 		 300 aa  57.8  0.00000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2021  cytochrome c oxidase subunit II  30.43 
 
 		 160 aa  57.8  0.00000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.388315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2489  cytochrome c oxidase, subunit II  27.46 
 
 		 243 aa  57  0.00000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.500427  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4435  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I:cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  32.43 
 
 		 316 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0428074  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2706  cytochrome c oxidase, subunit II  38.24 
 
 		 389 aa  56.2  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.363999 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0414  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  31.94 
 
 		 311 aa  56.6  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0828  cytochrome c oxidase, subunit II  33.78 
 
 		 321 aa  55.8  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.304556 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1874  cytochrome c oxidase, subunit II  33.33 
 
 		 256 aa  55.5  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1522  cytochrome c oxidase, subunit II  34.29 
 
 		 330 aa  55.8  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0244  nitrous-oxide reductase  31.46 
 
 		 647 aa  56.2  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.677359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4180  cytochrome c oxidase, subunit II  39.06 
 
 		 314 aa  55.8  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.548982  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1565  cytochrome c oxidase subunit II  36.36 
 
 		 155 aa  55.5  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3078  nitrous-oxide reductase  39.44 
 
 		 631 aa  55.1  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2313  cytochrome c oxidase, subunit II  36.84 
 
 		 244 aa  55.5  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.210732  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2797  cytochrome c oxidase, subunit II  35.71 
 
 		 249 aa  55.1  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1754  cytochrome c oxidase subunit II  30.85 
 
 		 275 aa  54.7  0.0000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.636353  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2275  cytochrome c oxidase, subunit II  35.29 
 
 		 337 aa  54.7  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.869151  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2012  Nitrous-oxide reductase  31.4 
 
 		 663 aa  54.7  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2397  cytochrome c oxidase, subunit II  32.89 
 
 		 177 aa  54.3  0.0000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0848  cytochrome c oxidase subunit II  37.14 
 
 		 351 aa  54.3  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0209  Nitrous-oxide reductase  35 
 
 		 632 aa  54.7  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0803  cytochrome c oxidase, subunit II  35.14 
 
 		 350 aa  53.9  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.192306  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5130  cytochrome c oxidase subunit II  35.14 
 
 		 384 aa  54.3  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0320  cytochrome c oxidase, subunit II  30.67 
 
 		 147 aa  53.9  0.0000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0855  cytochrome c oxidase, subunit II  35.14 
 
 		 350 aa  53.9  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0851  cytochrome c oxidase, subunit II  35.14 
 
 		 350 aa  53.9  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2345  cytochrome c oxidase subunit II  34.29 
 
 		 271 aa  53.5  0.0000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.215159  normal  0.967701 
 
 
-
 
NC_004310  BR0467  cytochrome c oxidase, subunit II  34.74 
 
 		 284 aa  53.1  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.870117  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0563  cytochrome c oxidase subunit II  38.98 
 
 		 394 aa  53.1  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2602  cytochrome c oxidase subunit II  33.8 
 
 		 315 aa  53.1  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.405519 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0229  cytochrome c oxidase, subunit II  33.82 
 
 		 316 aa  53.1  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0502681  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1600  cytochrome c oxidase, subunit II  33.82 
 
 		 337 aa  52.8  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.884566  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1676  cytochrome c oxidase, subunit II  33.82 
 
 		 337 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0222  cytochrome c oxidase, subunit II  31.94 
 
 		 362 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0145699  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2958  cytochrome c oxidase subunit II  30.21 
 
 		 269 aa  52.8  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3573  cytochrome c oxidase subunit II  27.27 
 
 		 360 aa  52.4  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0162  cytochrome c oxidase subunit II  37.65 
 
 		 179 aa  52.4  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0024  cytochrome c oxidase, subunit II  31.94 
 
 		 362 aa  52  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.901821 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2862  cytochrome c oxidase subunit II  30.56 
 
 		 272 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0315403 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0166  cytochrome c oxidase, subunit II  31.94 
 
 		 362 aa  52  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.129501  normal  0.0168942 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5762  cytochrome c oxidase subunit II  30.49 
 
 		 195 aa  51.6  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.336691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6008  nitrous-oxide reductase  32.91 
 
 		 639 aa  51.6  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.180938  normal  0.0225703 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1767  cytochrome c oxidase, subunit II  33.8 
 
 		 352 aa  51.2  0.000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.204958  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6886  cytochrome c oxidase, subunit II  32.43 
 
 		 313 aa  50.8  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1950  cytochrome c oxidase, subunit II  26.32 
 
 		 158 aa  51.2  0.000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2406  cytochrome c oxidase, subunit II  33.33 
 
 		 377 aa  51.2  0.000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1358  cytochrome c oxidase, subunit II  30.86 
 
 		 185 aa  50.8  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1352  cytochrome c oxidase, subunit II  30.86 
 
 		 185 aa  50.8  0.000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1491  cytochrome c oxidase, subunit II  30.86 
 
 		 190 aa  50.8  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.403979  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0608  cytochrome c oxidase subunit II  29.52 
 
 		 276 aa  50.8  0.000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2667  cytochrome c oxidase, subunit II  30.77 
 
 		 175 aa  50.8  0.000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00000731969  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1165  nitrous-oxide reductase  34.44 
 
 		 699 aa  50.8  0.000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.804263  normal  0.124168 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1461  Nitrous-oxide reductase  27.45 
 
 		 620 aa  50.8  0.000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1556  Nitrous-oxide reductase  27.45 
 
 		 620 aa  50.8  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.298548  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0045  cytochrome c oxidase, subunit II  32.84 
 
 		 300 aa  50.8  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00101143 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1244  cytochrome c oxidase, subunit II  27.03 
 
 		 211 aa  50.4  0.000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4792  cytochrome c oxidase, subunit II  33.33 
 
 		 354 aa  50.4  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0280165  normal  0.517537 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2861  nitrous-oxide reductase  34.29 
 
 		 645 aa  50.4  0.000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.7379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1449  cytochrome c oxidase, subunit II  30.43 
 
 		 346 aa  50.4  0.000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.015711 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3958  cytochrome c oxidase, subunit II  29.29 
 
 		 336 aa  50.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1571  cytochrome c oxidase, subunit II  30.38 
 
 		 760 aa  50.4  0.000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.915615 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1575  cytochrome c oxidase, subunit II  30.38 
 
 		 760 aa  50.4  0.000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0581  cytochrome c oxidase subunit II  34.88 
 
 		 294 aa  50.4  0.000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00300077  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1803  nitrous-oxide reductase  30.23 
 
 		 648 aa  50.4  0.000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.625051  normal  0.62653 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0446  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  32.84 
 
 		 324 aa  50.4  0.000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.112901 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2875  hypothetical protein  30.86 
 
 		 165 aa  50.1  0.000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.902113  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1405  cytochrome-c oxidase  36.49 
 
 		 343 aa  50.4  0.000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0686645  normal  0.926821 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2402  nitrous-oxide reductase  30.95 
 
 		 620 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00162507  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0156  cytochrome c oxidase, subunit II  32.89 
 
 		 232 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5817  cytochrome c oxidase, subunit II  33.78 
 
 		 310 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.156146  hitchhiker  0.00847969 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>