84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0209 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1803  nitrous-oxide reductase  51.78 
 
 		 648 aa  640    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.625051  normal  0.62653 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1461  Nitrous-oxide reductase  58.29 
 
 		 620 aa  691    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0209  Nitrous-oxide reductase  100 
 
 		 632 aa  1310    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2402  nitrous-oxide reductase  58.64 
 
 		 620 aa  695    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00162507  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1556  Nitrous-oxide reductase  58.12 
 
 		 620 aa  689    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.298548  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0244  nitrous-oxide reductase  57.26 
 
 		 647 aa  694    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.677359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2012  Nitrous-oxide reductase  45.72 
 
 		 663 aa  531  1e-149  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0693  Nitrous-oxide reductase  42.74 
 
 		 658 aa  498  1e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.112553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1729  methyl-accepting chemotaxis protein  41.08 
 
 		 862 aa  476  1e-133  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.371209  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1770  nitrous-oxide reductase NosZ  40.43 
 
 		 864 aa  478  1e-133  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1298  nitrous-oxide reductase  42.64 
 
 		 865 aa  471  1.0000000000000001e-131  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.0000502464  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0010  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  42.43 
 
 		 863 aa  467  9.999999999999999e-131  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0271061  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1575  cytochrome c oxidase, subunit II  40.98 
 
 		 760 aa  466  9.999999999999999e-131  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1571  cytochrome c oxidase, subunit II  40.98 
 
 		 760 aa  466  9.999999999999999e-131  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.915615 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0440  nitrous-oxide reductase  42.52 
 
 		 864 aa  464  1e-129  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.136119  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1928  nitrous-oxide reductase  37.11 
 
 		 673 aa  414  1e-114  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3142  nitrous-oxide reductase  39.77 
 
 		 648 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0428  nitrous-oxide reductase  39.15 
 
 		 649 aa  403  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.859318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2861  nitrous-oxide reductase  38.27 
 
 		 645 aa  402  1e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.7379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1074  nitrous-oxide reductase  39.3 
 
 		 640 aa  401  9.999999999999999e-111  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.198434  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1165  nitrous-oxide reductase  40.33 
 
 		 699 aa  396  1e-109  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.804263  normal  0.124168 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2351  nitrous-oxide reductase  38.17 
 
 		 645 aa  398  1e-109  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6008  nitrous-oxide reductase  39.67 
 
 		 639 aa  397  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.180938  normal  0.0225703 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3078  nitrous-oxide reductase  39.53 
 
 		 631 aa  393  1e-108  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4346  nitrous-oxide reductase  38.94 
 
 		 638 aa  387  1e-106  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0394445  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0251  nitrous-oxide reductase  39.37 
 
 		 639 aa  380  1e-104  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3400  nitrous-oxide reductase  38.73 
 
 		 628 aa  381  1e-104  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00206231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1738  nitrous-oxide reductase  40.2 
 
 		 636 aa  382  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0275  nitrous-oxide reductase  39.37 
 
 		 639 aa  381  1e-104  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.275953  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20200  nitrous-oxide reductase  39.87 
 
 		 636 aa  377  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.89249 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1428  nitrous-oxide reductase  38.23 
 
 		 630 aa  375  1e-102  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2325  nitrous-oxide reductase  39.17 
 
 		 690 aa  375  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2255  nitrous-oxide reductase  39.34 
 
 		 691 aa  375  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2060  nitrous-oxide reductase  39.34 
 
 		 693 aa  375  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.840269  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2115  nitrous-oxide reductase  39.34 
 
 		 655 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.62565  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1389  nitrous-oxide reductase  37.4 
 
 		 646 aa  373  1e-102  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0995  nitrous-oxide reductase  39.17 
 
 		 660 aa  372  1e-101  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.599003  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2219  nitrous-oxide reductase  37.27 
 
 		 628 aa  366  1e-100  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000181055  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4732  nitrous-oxide reductase  37.56 
 
 		 617 aa  363  7.0000000000000005e-99  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2564  nitrous-oxide reductase  37.13 
 
 		 628 aa  358  9.999999999999999e-98  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.164032  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1368  nitrous-oxide reductase  38.41 
 
 		 646 aa  355  1e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.90287 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1139  nitrous-oxide reductase  37.7 
 
 		 646 aa  353  4e-96  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.494075 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4171  nitrous-oxide reductase  38.08 
 
 		 649 aa  352  8e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4059  nitrous-oxide reductase  38.08 
 
 		 649 aa  352  8e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00566192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4917  nitrous-oxide reductase  37.54 
 
 		 646 aa  352  1e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0125108 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0664  nitrous-oxide reductase  37.66 
 
 		 652 aa  349  7e-95  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3319  nitrous-oxide reductase  37.89 
 
 		 644 aa  349  1e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0698213  normal  0.2184 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1060  nitrous-oxide reductase  37.54 
 
 		 645 aa  348  1e-94  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.620388  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3199  nitrous-oxide reductase  36.79 
 
 		 650 aa  348  2e-94  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.324425  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4219  nitrous-oxide reductase  35.17 
 
 		 652 aa  348  2e-94  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.522351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1483  nitrous-oxide reductase  37.13 
 
 		 644 aa  343  8e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.150565 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3194  nitrous-oxide reductase  36.17 
 
 		 647 aa  338  9.999999999999999e-92  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2021  cytochrome c oxidase subunit II  33.98 
 
 		 160 aa  69.7  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.388315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1826  cytochrome c oxidase subunit II  31.73 
 
 		 160 aa  63.9  0.000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00813215  normal  0.126007 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0464  cytochrome c oxidase subunit II  31.76 
 
 		 266 aa  54.7  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02212  putative cytochrome C oxidase polypeptide II oxidoreductase protein  30.86 
 
 		 125 aa  54.7  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0599  cytochrome c oxidase subunit II  35 
 
 		 124 aa  54.3  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.632482 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3802  cytochrome c oxidase subunit II  32.56 
 
 		 262 aa  52  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1779  cytochrome c oxidase, subunit II  35 
 
 		 339 aa  50.8  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4435  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I:cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  30.49 
 
 		 316 aa  50.4  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0428074  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1574  cytochrome c oxidase subunit II  30.12 
 
 		 168 aa  49.7  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226069  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2641  cytochrome c oxidase subunit II  34.43 
 
 		 321 aa  49.3  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.398022  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2967  cytochrome c oxidase subunit II  29.86 
 
 		 162 aa  49.3  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000376263 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2602  cytochrome c oxidase subunit II  31.03 
 
 		 315 aa  48.5  0.0004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.405519 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0848  cytochrome c oxidase subunit II  30.86 
 
 		 351 aa  48.1  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2412  cytochrome c oxidase subunit II  28.87 
 
 		 171 aa  47.8  0.0006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0414  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  30.39 
 
 		 311 aa  47.4  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4548  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  31.01 
 
 		 347 aa  47.4  0.0007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.433204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0446  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  35.09 
 
 		 324 aa  47.4  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.112901 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1618  cytochrome c oxidase subunit II  28.4 
 
 		 125 aa  47.4  0.0009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.464579 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0933  cytochrome c oxidase, subunit II  28.92 
 
 		 168 aa  46.6  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2706  cytochrome c oxidase, subunit II  34.48 
 
 		 389 aa  47  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.363999 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1211  Cytochrome-c oxidase  31.58 
 
 		 351 aa  46.2  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.553445  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6229  cytochrome c oxidase, subunit II  35.06 
 
 		 359 aa  46.2  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.24435  normal  0.0456922 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3756  cytochrome c oxidase subunit II  29.41 
 
 		 300 aa  45.4  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3958  cytochrome c oxidase, subunit II  32.69 
 
 		 336 aa  44.3  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0828  cytochrome c oxidase, subunit II  30.11 
 
 		 321 aa  44.3  0.006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.304556 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1565  cytochrome c oxidase subunit II  27.59 
 
 		 155 aa  44.3  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4180  cytochrome c oxidase, subunit II  29.51 
 
 		 314 aa  44.3  0.007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.548982  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0803  cytochrome c oxidase, subunit II  28.75 
 
 		 350 aa  44.3  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.192306  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2026  cytochrome c oxidase, subunit II  38 
 
 		 346 aa  43.5  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000905775 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0851  cytochrome c oxidase, subunit II  28.75 
 
 		 350 aa  43.9  0.01  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1899  cytochrome c oxidase subunit II  27.27 
 
 		 156 aa  43.5  0.01  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.71816  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0855  cytochrome c oxidase, subunit II  28.75 
 
 		 350 aa  43.9  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>