113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1165 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_1165  nitrous-oxide reductase  100 
 
 		 699 aa  1436    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.804263  normal  0.124168 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3142  nitrous-oxide reductase  45.93 
 
 		 648 aa  539  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2351  nitrous-oxide reductase  44.17 
 
 		 645 aa  536  1e-151  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0428  nitrous-oxide reductase  45.93 
 
 		 649 aa  533  1e-150  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.859318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2861  nitrous-oxide reductase  44.84 
 
 		 645 aa  532  1e-150  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.7379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20200  nitrous-oxide reductase  44.59 
 
 		 636 aa  530  1e-149  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.89249 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6008  nitrous-oxide reductase  45.81 
 
 		 639 aa  530  1e-149  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.180938  normal  0.0225703 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4346  nitrous-oxide reductase  45.27 
 
 		 638 aa  531  1e-149  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0394445  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1074  nitrous-oxide reductase  45.86 
 
 		 640 aa  527  1e-148  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.198434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3078  nitrous-oxide reductase  45.6 
 
 		 631 aa  527  1e-148  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1738  nitrous-oxide reductase  45.55 
 
 		 636 aa  525  1e-148  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0275  nitrous-oxide reductase  45.44 
 
 		 639 aa  523  1e-147  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.275953  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3400  nitrous-oxide reductase  43.43 
 
 		 628 aa  521  1e-146  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00206231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0251  nitrous-oxide reductase  45.27 
 
 		 639 aa  520  1e-146  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1428  nitrous-oxide reductase  44.9 
 
 		 630 aa  518  1.0000000000000001e-145  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2219  nitrous-oxide reductase  42.5 
 
 		 628 aa  515  1e-144  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000181055  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4732  nitrous-oxide reductase  42.7 
 
 		 617 aa  505  1e-141  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2115  nitrous-oxide reductase  40.56 
 
 		 655 aa  503  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.62565  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2564  nitrous-oxide reductase  43.6 
 
 		 628 aa  503  1e-141  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.164032  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0995  nitrous-oxide reductase  40.24 
 
 		 660 aa  500  1e-140  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.599003  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1389  nitrous-oxide reductase  41.42 
 
 		 646 aa  500  1e-140  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2255  nitrous-oxide reductase  40.18 
 
 		 691 aa  502  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1139  nitrous-oxide reductase  40.83 
 
 		 646 aa  499  1e-140  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.494075 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2060  nitrous-oxide reductase  40.06 
 
 		 693 aa  501  1e-140  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.840269  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2325  nitrous-oxide reductase  39.79 
 
 		 690 aa  497  1e-139  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3194  nitrous-oxide reductase  43.68 
 
 		 647 aa  499  1e-139  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1483  nitrous-oxide reductase  41.48 
 
 		 644 aa  496  1e-139  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.150565 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4917  nitrous-oxide reductase  41.54 
 
 		 646 aa  493  9.999999999999999e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0125108 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1060  nitrous-oxide reductase  40.43 
 
 		 645 aa  494  9.999999999999999e-139  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.620388  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3199  nitrous-oxide reductase  41.1 
 
 		 650 aa  491  1e-137  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.324425  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4059  nitrous-oxide reductase  41.56 
 
 		 649 aa  489  1e-137  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00566192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0664  nitrous-oxide reductase  43.22 
 
 		 652 aa  490  1e-137  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4171  nitrous-oxide reductase  41.56 
 
 		 649 aa  489  1e-137  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1368  nitrous-oxide reductase  41.64 
 
 		 646 aa  485  1e-135  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.90287 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4219  nitrous-oxide reductase  42.79 
 
 		 652 aa  484  1e-135  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.522351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3319  nitrous-oxide reductase  42.71 
 
 		 644 aa  479  1e-134  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0698213  normal  0.2184 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1803  nitrous-oxide reductase  38.83 
 
 		 648 aa  393  1e-108  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.625051  normal  0.62653 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0209  Nitrous-oxide reductase  40.33 
 
 		 632 aa  395  1e-108  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0244  nitrous-oxide reductase  38.61 
 
 		 647 aa  373  1e-102  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.677359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1556  Nitrous-oxide reductase  38.97 
 
 		 620 aa  372  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.298548  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2402  nitrous-oxide reductase  38.97 
 
 		 620 aa  370  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00162507  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1461  Nitrous-oxide reductase  38.97 
 
 		 620 aa  372  1e-101  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2012  Nitrous-oxide reductase  36.54 
 
 		 663 aa  364  4e-99  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1770  nitrous-oxide reductase NosZ  34.57 
 
 		 864 aa  342  1e-92  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1571  cytochrome c oxidase, subunit II  34.68 
 
 		 760 aa  326  1e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.915615 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1575  cytochrome c oxidase, subunit II  34.68 
 
 		 760 aa  326  1e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0010  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  33.43 
 
 		 863 aa  322  9.999999999999999e-87  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0271061  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1729  methyl-accepting chemotaxis protein  32.63 
 
 		 862 aa  322  1.9999999999999998e-86  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.371209  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0440  nitrous-oxide reductase  32.72 
 
 		 864 aa  320  5e-86  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.136119  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1298  nitrous-oxide reductase  33.77 
 
 		 865 aa  315  2.9999999999999996e-84  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.0000502464  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1928  nitrous-oxide reductase  31.19 
 
 		 673 aa  310  5e-83  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0693  Nitrous-oxide reductase  32.48 
 
 		 658 aa  310  6.999999999999999e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.112553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2263  cytochrome c oxidase, subunit II  39.68 
 
 		 367 aa  55.1  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0175262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3558  cytochrome c oxidase subunit II  38.1 
 
 		 370 aa  53.9  0.000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.22857 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3892  cytochrome c oxidase subunit II  37.04 
 
 		 345 aa  53.5  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.740774  normal  0.178097 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4180  cytochrome c oxidase, subunit II  36.76 
 
 		 314 aa  52  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.548982  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0884  cytochrome c oxidase, subunit II  33.68 
 
 		 120 aa  52.4  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.555731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1574  cytochrome c oxidase subunit II  32.91 
 
 		 168 aa  51.6  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4435  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I:cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  32 
 
 		 316 aa  51.2  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0428074  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0599  cytochrome c oxidase subunit II  34.44 
 
 		 124 aa  50.8  0.00009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.632482 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1874  cytochrome c oxidase, subunit II  26.28 
 
 		 256 aa  50.4  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2313  cytochrome c oxidase, subunit II  40.91 
 
 		 244 aa  49.7  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.210732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06421  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  33.33 
 
 		 274 aa  49.7  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0878998 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0464  cytochrome c oxidase subunit II  27.37 
 
 		 266 aa  50.1  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3573  cytochrome c oxidase subunit II  33.33 
 
 		 360 aa  49.7  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1826  cytochrome c oxidase subunit II  27.52 
 
 		 160 aa  49.3  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00813215  normal  0.126007 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5826  cytochrome c oxidase, subunit II  33.33 
 
 		 330 aa  49.3  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0229  cytochrome c oxidase, subunit II  29.63 
 
 		 316 aa  48.9  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0502681  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0528  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  32.1 
 
 		 355 aa  48.9  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2385  cytochrome c oxidase subunit II  32.89 
 
 		 156 aa  48.9  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1348  cytochrome c, monohaem  33.66 
 
 		 426 aa  48.1  0.0006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.195405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3540  cytochrome c oxidase, subunit II  24.65 
 
 		 311 aa  48.1  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0446  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  31.03 
 
 		 324 aa  47.8  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.112901 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1326  nitrite reductase, copper-containing  32 
 
 		 466 aa  47.8  0.0007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.852268  normal  0.995257 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0533  cytochrome c oxidase, subunit II  25.89 
 
 		 405 aa  47.8  0.0007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.251737 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2641  cytochrome c oxidase subunit II  32.05 
 
 		 321 aa  47.4  0.0009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.398022  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0933  cytochrome c oxidase, subunit II  30.38 
 
 		 168 aa  47.4  0.0009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3958  cytochrome c oxidase, subunit II  30.86 
 
 		 336 aa  47.4  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1754  cytochrome c oxidase subunit II  35.62 
 
 		 275 aa  47  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.636353  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0320  cytochrome c oxidase, subunit II  24.37 
 
 		 147 aa  47  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2991  cytochrome c oxidase, subunit II  35.48 
 
 		 338 aa  47  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.336386  normal  0.0255364 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2072  cytochrome c oxidase, subunit II  36.36 
 
 		 425 aa  47  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.54281 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2967  cytochrome c oxidase subunit II  35.38 
 
 		 162 aa  47.4  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000376263 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2275  cytochrome c oxidase, subunit II  30.88 
 
 		 337 aa  46.2  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.869151  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0167  putative cytochrome c oxidase subunit II  39.34 
 
 		 371 aa  46.2  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.26265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1588  cytochrome c oxidase, subunit II  32.26 
 
 		 342 aa  46.2  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2345  cytochrome c oxidase subunit II  32.5 
 
 		 271 aa  45.8  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.215159  normal  0.967701 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0252  cytochrome c oxidase, subunit II  23.53 
 
 		 302 aa  45.4  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.433496  normal  0.0258846 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4760  cytochrome c oxidase subunit II  32.58 
 
 		 327 aa  45.4  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.723293  normal  0.0836993 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0096  cytochrome c oxidase, subunit II  36.76 
 
 		 334 aa  45.4  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.296292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6229  cytochrome c oxidase, subunit II  34.78 
 
 		 359 aa  45.8  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.24435  normal  0.0456922 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6886  cytochrome c oxidase, subunit II  35.48 
 
 		 313 aa  45.8  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1899  cytochrome c oxidase subunit II  29.87 
 
 		 156 aa  45.4  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.71816  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2602  cytochrome c oxidase subunit II  32.1 
 
 		 315 aa  45.4  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.405519 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0803  cytochrome c oxidase, subunit II  33.33 
 
 		 350 aa  45.1  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.192306  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1405  cytochrome-c oxidase  32.84 
 
 		 343 aa  45.4  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0686645  normal  0.926821 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0414  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  27.36 
 
 		 311 aa  45.4  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5817  cytochrome c oxidase, subunit II  37.1 
 
 		 310 aa  45.4  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.156146  hitchhiker  0.00847969 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2347  cytochrome c oxidase, subunit II  33.9 
 
 		 334 aa  45.4  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0697  cytochrome c oxidase, subunit II  38.33 
 
 		 322 aa  45.1  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>