69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0428 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_3194  nitrous-oxide reductase  63.39 
 
 		 647 aa  816    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20200  nitrous-oxide reductase  57.53 
 
 		 636 aa  795    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.89249 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1074  nitrous-oxide reductase  58.33 
 
 		 640 aa  795    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.198434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3319  nitrous-oxide reductase  67.12 
 
 		 644 aa  839    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0698213  normal  0.2184 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6008  nitrous-oxide reductase  80.58 
 
 		 639 aa  1028    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.180938  normal  0.0225703 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2219  nitrous-oxide reductase  60.56 
 
 		 628 aa  808    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000181055  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0428  nitrous-oxide reductase  100 
 
 		 649 aa  1354    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.859318  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3142  nitrous-oxide reductase  91.2 
 
 		 648 aa  1223    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0251  nitrous-oxide reductase  76.66 
 
 		 639 aa  1050    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1738  nitrous-oxide reductase  58.14 
 
 		 636 aa  788    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4346  nitrous-oxide reductase  82.59 
 
 		 638 aa  1066    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0394445  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2861  nitrous-oxide reductase  83.88 
 
 		 645 aa  1101    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.7379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4219  nitrous-oxide reductase  61.16 
 
 		 652 aa  828    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.522351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1428  nitrous-oxide reductase  61.82 
 
 		 630 aa  788    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3078  nitrous-oxide reductase  63.1 
 
 		 631 aa  799    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2351  nitrous-oxide reductase  89.69 
 
 		 645 aa  1197    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2564  nitrous-oxide reductase  59.28 
 
 		 628 aa  749    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.164032  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3400  nitrous-oxide reductase  62.38 
 
 		 628 aa  799    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00206231  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0275  nitrous-oxide reductase  76.82 
 
 		 639 aa  1051    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.275953  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4732  nitrous-oxide reductase  58.33 
 
 		 617 aa  783    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2325  nitrous-oxide reductase  49.92 
 
 		 690 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1389  nitrous-oxide reductase  49.47 
 
 		 646 aa  607  9.999999999999999e-173  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3199  nitrous-oxide reductase  48.64 
 
 		 650 aa  602  1.0000000000000001e-171  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.324425  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2115  nitrous-oxide reductase  49.54 
 
 		 655 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.62565  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2060  nitrous-oxide reductase  51.75 
 
 		 693 aa  600  1e-170  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.840269  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2255  nitrous-oxide reductase  51.75 
 
 		 691 aa  600  1e-170  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0995  nitrous-oxide reductase  49.39 
 
 		 660 aa  599  1e-170  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.599003  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4917  nitrous-oxide reductase  48.47 
 
 		 646 aa  575  1.0000000000000001e-162  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0125108 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1483  nitrous-oxide reductase  48.31 
 
 		 644 aa  573  1.0000000000000001e-162  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.150565 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4059  nitrous-oxide reductase  48.31 
 
 		 649 aa  573  1.0000000000000001e-162  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00566192  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4171  nitrous-oxide reductase  48.31 
 
 		 649 aa  573  1.0000000000000001e-162  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1368  nitrous-oxide reductase  50.08 
 
 		 646 aa  569  1e-161  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.90287 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1060  nitrous-oxide reductase  47.41 
 
 		 645 aa  567  1e-160  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.620388  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1139  nitrous-oxide reductase  47.18 
 
 		 646 aa  564  1.0000000000000001e-159  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.494075 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0664  nitrous-oxide reductase  48.68 
 
 		 652 aa  556  1e-157  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1165  nitrous-oxide reductase  43.81 
 
 		 699 aa  534  1e-150  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.804263  normal  0.124168 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0209  Nitrous-oxide reductase  39.15 
 
 		 632 aa  403  1e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0244  nitrous-oxide reductase  36.8 
 
 		 647 aa  366  1e-100  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.677359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1803  nitrous-oxide reductase  35.77 
 
 		 648 aa  369  1e-100  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.625051  normal  0.62653 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1556  Nitrous-oxide reductase  35.07 
 
 		 620 aa  354  2.9999999999999997e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.298548  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1461  Nitrous-oxide reductase  35.07 
 
 		 620 aa  354  2.9999999999999997e-96  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2402  nitrous-oxide reductase  34.75 
 
 		 620 aa  353  4e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00162507  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2012  Nitrous-oxide reductase  31.38 
 
 		 663 aa  330  7e-89  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0010  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  33.71 
 
 		 863 aa  305  1.0000000000000001e-81  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0271061  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1770  nitrous-oxide reductase NosZ  31.7 
 
 		 864 aa  303  7.000000000000001e-81  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0693  Nitrous-oxide reductase  32.22 
 
 		 658 aa  303  7.000000000000001e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.112553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1729  methyl-accepting chemotaxis protein  32.84 
 
 		 862 aa  300  4e-80  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.371209  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0440  nitrous-oxide reductase  32.41 
 
 		 864 aa  296  6e-79  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.136119  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1298  nitrous-oxide reductase  33.12 
 
 		 865 aa  294  4e-78  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.0000502464  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1575  cytochrome c oxidase, subunit II  32.7 
 
 		 760 aa  290  7e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1571  cytochrome c oxidase, subunit II  32.7 
 
 		 760 aa  290  7e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.915615 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1928  nitrous-oxide reductase  30.2 
 
 		 673 aa  271  2e-71  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0464  cytochrome c oxidase subunit II  32.65 
 
 		 266 aa  60.1  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1826  cytochrome c oxidase subunit II  28.57 
 
 		 160 aa  55.8  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00813215  normal  0.126007 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2021  cytochrome c oxidase subunit II  32.95 
 
 		 160 aa  53.1  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.388315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0933  cytochrome c oxidase, subunit II  32.22 
 
 		 168 aa  53.5  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3756  cytochrome c oxidase subunit II  27.87 
 
 		 300 aa  52.8  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1574  cytochrome c oxidase subunit II  34.18 
 
 		 168 aa  51.6  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226069  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1899  cytochrome c oxidase subunit II  29 
 
 		 156 aa  52  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.71816  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3802  cytochrome c oxidase subunit II  24.74 
 
 		 262 aa  51.6  0.00005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2385  cytochrome c oxidase subunit II  29.46 
 
 		 156 aa  51.2  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2967  cytochrome c oxidase subunit II  32.95 
 
 		 162 aa  50.8  0.00008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000376263 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4435  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I:cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  29.63 
 
 		 316 aa  50.4  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0428074  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02212  putative cytochrome C oxidase polypeptide II oxidoreductase protein  28.4 
 
 		 125 aa  46.6  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0320  cytochrome c oxidase, subunit II  36.67 
 
 		 147 aa  47  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0599  cytochrome c oxidase subunit II  26.74 
 
 		 124 aa  47.4  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.632482 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4253  cytochrome c oxidase, subunit II  26.37 
 
 		 124 aa  47  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1090  chain A, red copper protein nitrosocyanin  28.44 
 
 		 140 aa  44.7  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.61148  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0803  cytochrome c oxidase, subunit II  28.4 
 
 		 350 aa  43.9  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.192306  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>