21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1090 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_1090  chain A, red copper protein nitrosocyanin  100 
 
 		 140 aa  284  2.9999999999999996e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.61148  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1601  chain A, red copper protein nitrosocyanin  74.82 
 
 		 137 aa  216  7e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.0000000567409  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3142  nitrous-oxide reductase  30.28 
 
 		 648 aa  47  0.00008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2012  Nitrous-oxide reductase  38.03 
 
 		 663 aa  46.2  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0428  nitrous-oxide reductase  28.44 
 
 		 649 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.859318  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3199  nitrous-oxide reductase  25.3 
 
 		 650 aa  43.1  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.324425  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1556  Nitrous-oxide reductase  37.1 
 
 		 620 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.298548  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0664  nitrous-oxide reductase  42.55 
 
 		 652 aa  43.1  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0244  nitrous-oxide reductase  37.1 
 
 		 647 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.677359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1461  Nitrous-oxide reductase  37.1 
 
 		 620 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1298  nitrous-oxide reductase  32.39 
 
 		 865 aa  42.7  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.0000502464  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2861  nitrous-oxide reductase  26.61 
 
 		 645 aa  42.7  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.7379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1729  methyl-accepting chemotaxis protein  33.8 
 
 		 862 aa  42.4  0.002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.371209  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2402  nitrous-oxide reductase  37.1 
 
 		 620 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00162507  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0010  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  33.8 
 
 		 863 aa  41.6  0.003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0271061  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1139  nitrous-oxide reductase  35.29 
 
 		 646 aa  42  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.494075 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0440  nitrous-oxide reductase  32.39 
 
 		 864 aa  42  0.003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.136119  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1060  nitrous-oxide reductase  35.29 
 
 		 645 aa  42  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.620388  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1016  nitrite reductase, copper-containing  30.99 
 
 		 364 aa  41.2  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.552057 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1483  nitrous-oxide reductase  31.82 
 
 		 644 aa  40.8  0.007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.150565 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0655  hypothetical protein  36.36 
 
 		 159 aa  40.8  0.007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>