96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_1729 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2012  Nitrous-oxide reductase  53.18 
 
 		 663 aa  727    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1729  methyl-accepting chemotaxis protein  100 
 
 		 862 aa  1783    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.371209  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0010  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  91.09 
 
 		 863 aa  1647    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0271061  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1770  nitrous-oxide reductase NosZ  64.31 
 
 		 864 aa  1194    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1298  nitrous-oxide reductase  69.69 
 
 		 865 aa  1236    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.0000502464  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1571  cytochrome c oxidase, subunit II  60.11 
 
 		 760 aa  939    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.915615 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1575  cytochrome c oxidase, subunit II  60.11 
 
 		 760 aa  939    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0440  nitrous-oxide reductase  83.45 
 
 		 864 aa  1500    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.136119  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1928  nitrous-oxide reductase  46.32 
 
 		 673 aa  565  1.0000000000000001e-159  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0209  Nitrous-oxide reductase  42.83 
 
 		 632 aa  474  1e-132  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1461  Nitrous-oxide reductase  43.81 
 
 		 620 aa  462  1e-129  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1556  Nitrous-oxide reductase  43.65 
 
 		 620 aa  462  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.298548  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2402  nitrous-oxide reductase  43.31 
 
 		 620 aa  459  1e-127  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00162507  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0244  nitrous-oxide reductase  42.36 
 
 		 647 aa  448  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.677359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1803  nitrous-oxide reductase  41.83 
 
 		 648 aa  442  9.999999999999999e-123  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.625051  normal  0.62653 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0693  Nitrous-oxide reductase  38.17 
 
 		 658 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.112553  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1165  nitrous-oxide reductase  32.63 
 
 		 699 aa  322  1.9999999999999998e-86  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.804263  normal  0.124168 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3400  nitrous-oxide reductase  34.38 
 
 		 628 aa  312  1e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00206231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1074  nitrous-oxide reductase  32.63 
 
 		 640 aa  305  3.0000000000000004e-81  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.198434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2219  nitrous-oxide reductase  33.03 
 
 		 628 aa  304  4.0000000000000003e-81  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000181055  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2564  nitrous-oxide reductase  33.11 
 
 		 628 aa  301  3e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.164032  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6008  nitrous-oxide reductase  33.87 
 
 		 639 aa  300  6e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.180938  normal  0.0225703 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0428  nitrous-oxide reductase  33.28 
 
 		 649 aa  299  1e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.859318  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3078  nitrous-oxide reductase  33.39 
 
 		 631 aa  299  2e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2351  nitrous-oxide reductase  33.44 
 
 		 645 aa  296  1e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3142  nitrous-oxide reductase  33.77 
 
 		 648 aa  296  2e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20200  nitrous-oxide reductase  32.59 
 
 		 636 aa  294  4e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.89249 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2861  nitrous-oxide reductase  32.6 
 
 		 645 aa  294  6e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.7379  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1368  nitrous-oxide reductase  34.34 
 
 		 646 aa  293  9e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.90287 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1428  nitrous-oxide reductase  33.06 
 
 		 630 aa  292  2e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2325  nitrous-oxide reductase  34.98 
 
 		 690 aa  291  4e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4732  nitrous-oxide reductase  31.58 
 
 		 617 aa  291  5.0000000000000004e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1738  nitrous-oxide reductase  33.06 
 
 		 636 aa  290  6e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2255  nitrous-oxide reductase  33.81 
 
 		 691 aa  290  7e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2060  nitrous-oxide reductase  33.81 
 
 		 693 aa  290  7e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.840269  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2115  nitrous-oxide reductase  33.81 
 
 		 655 aa  290  7e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.62565  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4346  nitrous-oxide reductase  32.63 
 
 		 638 aa  288  2e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0394445  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0995  nitrous-oxide reductase  33.65 
 
 		 660 aa  288  4e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.599003  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4171  nitrous-oxide reductase  33.73 
 
 		 649 aa  287  7e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1483  nitrous-oxide reductase  33.33 
 
 		 644 aa  287  7e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.150565 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4059  nitrous-oxide reductase  33.73 
 
 		 649 aa  287  7e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00566192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4219  nitrous-oxide reductase  33.66 
 
 		 652 aa  285  2.0000000000000002e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.522351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1389  nitrous-oxide reductase  33.38 
 
 		 646 aa  286  2.0000000000000002e-75  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1139  nitrous-oxide reductase  34.14 
 
 		 646 aa  284  4.0000000000000003e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.494075 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3199  nitrous-oxide reductase  32.18 
 
 		 650 aa  283  8.000000000000001e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.324425  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4917  nitrous-oxide reductase  32.84 
 
 		 646 aa  282  2e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0125108 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0275  nitrous-oxide reductase  31.92 
 
 		 639 aa  281  4e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.275953  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3194  nitrous-oxide reductase  32.85 
 
 		 647 aa  281  4e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1060  nitrous-oxide reductase  33.82 
 
 		 645 aa  279  2e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.620388  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0251  nitrous-oxide reductase  31.76 
 
 		 639 aa  278  2e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3319  nitrous-oxide reductase  32.95 
 
 		 644 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0698213  normal  0.2184 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0664  nitrous-oxide reductase  31.6 
 
 		 652 aa  257  8e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0944  mulitcopper oxidase domain-containing protein  35.64 
 
 		 487 aa  62  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0822  nitric oxide reductase, cytochrome c-containing subunit  30.53 
 
 		 277 aa  60.5  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.198002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1966  multicopper oxidase domain-containing protein  22.62 
 
 		 535 aa  59.3  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.328521  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2061  multicopper oxidase domain-containing protein  32 
 
 		 535 aa  58.9  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.429703  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2768  cytochrome c class I  32.32 
 
 		 290 aa  57.4  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.712603  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3436  cytochrome c, class I  32.32 
 
 		 290 aa  57.8  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.441606  normal  0.713637 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2021  cytochrome c oxidase subunit II  29.46 
 
 		 160 aa  56.6  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.388315  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0697  cytochrome c oxidase, subunit II  29 
 
 		 322 aa  56.6  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0477  mulitcopper oxidase domain-containing protein  31 
 
 		 487 aa  56.2  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1613  multicopper oxidase domain-containing protein  31 
 
 		 535 aa  55.5  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0446  cytochrome c class I  27.97 
 
 		 169 aa  55.5  0.000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000163065  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0659  mulitcopper oxidase domain-containing protein  31 
 
 		 535 aa  55.5  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.870882  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0548  mulitcopper oxidase domain-containing protein  31 
 
 		 487 aa  55.5  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.181487  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0798  mulitcopper oxidase domain-containing protein  31 
 
 		 535 aa  55.5  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1256  cytochrome c, class I  28.42 
 
 		 272 aa  55.1  0.000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0692  cytochrome c class I  31.18 
 
 		 153 aa  52  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.189823  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02212  putative cytochrome C oxidase polypeptide II oxidoreductase protein  32.97 
 
 		 125 aa  51.6  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1779  cytochrome c oxidase, subunit II  32.74 
 
 		 339 aa  51.2  0.00009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1826  cytochrome c oxidase subunit II  26.72 
 
 		 160 aa  49.7  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00813215  normal  0.126007 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2533  electron transport protein SCO1/SenC  30.19 
 
 		 327 aa  49.7  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6229  cytochrome c oxidase, subunit II  32.94 
 
 		 359 aa  49.7  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.24435  normal  0.0456922 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4435  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I:cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  25.84 
 
 		 316 aa  49.7  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0428074  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1899  cytochrome c oxidase subunit II  32.93 
 
 		 156 aa  49.7  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.71816  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3183  electron transport protein SCO1/SenC  30.19 
 
 		 327 aa  48.9  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.106344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0828  cytochrome c oxidase, subunit II  35.8 
 
 		 321 aa  48.5  0.0005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.304556 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2385  cytochrome c oxidase subunit II  35 
 
 		 156 aa  47.4  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1618  cytochrome c oxidase subunit II  32.91 
 
 		 125 aa  47.4  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.464579 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0167  putative cytochrome c oxidase subunit II  28.07 
 
 		 371 aa  47  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.26265  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2967  cytochrome c oxidase subunit II  35.44 
 
 		 162 aa  47  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000376263 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06421  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  28.57 
 
 		 274 aa  46.6  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0878998 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1574  cytochrome c oxidase subunit II  31.71 
 
 		 168 aa  46.6  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0533  cytochrome c oxidase, subunit II  20.33 
 
 		 405 aa  45.8  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.251737 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1274  cytochrome c class I  28.12 
 
 		 166 aa  45.8  0.003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0464  cytochrome c oxidase subunit II  25.36 
 
 		 266 aa  46.2  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0096  cytochrome c oxidase, subunit II  29 
 
 		 334 aa  45.8  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.296292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0446  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  22.22 
 
 		 324 aa  45.4  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.112901 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5817  cytochrome c oxidase, subunit II  33.33 
 
 		 310 aa  45.8  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.156146  hitchhiker  0.00847969 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5130  cytochrome c oxidase subunit II  24.53 
 
 		 384 aa  45.1  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1601  chain A, red copper protein nitrosocyanin  32.97 
 
 		 137 aa  45.1  0.006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.0000000567409  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0567  cytochrome c oxidase, subunit II  35 
 
 		 320 aa  45.1  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0584  cytochrome c oxidase, subunit II  35 
 
 		 320 aa  45.1  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0599  cytochrome c oxidase subunit II  27.85 
 
 		 124 aa  44.7  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.632482 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1588  cytochrome c oxidase, subunit II  30.26 
 
 		 342 aa  44.7  0.008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1211  Cytochrome-c oxidase  25.61 
 
 		 351 aa  44.3  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.553445  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>