More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_2533 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3183  electron transport protein SCO1/SenC  98.17 
 
 		 327 aa  666    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.106344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2666  electron transport protein SCO1/SenC  93.88 
 
 		 327 aa  640    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.239586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2533  electron transport protein SCO1/SenC  100 
 
 		 327 aa  677    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2002  electron transport protein SCO1/SenC  60.88 
 
 		 363 aa  412  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4298  electron transport protein SCO1/SenC  54.58 
 
 		 356 aa  342  4e-93  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.576554  normal  0.116198 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0650  electron transport protein SCO1/SenC  52.13 
 
 		 340 aa  328  5.0000000000000004e-89  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1256  hypothetical protein  37.57 
 
 		 207 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1977  electron transport protein SCO1/SenC  36.08 
 
 		 216 aa  124  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.918767 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3890  electron transport protein SCO1/SenC  38.99 
 
 		 228 aa  121  9.999999999999999e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3891  electron transport protein SCO1/SenC  37.91 
 
 		 222 aa  120  3e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2450  electron transport protein SCO1/SenC  37.82 
 
 		 221 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0486605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0070  hypothetical protein  41.72 
 
 		 198 aa  118  1.9999999999999998e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2627  electron transport protein SCO1/SenC  36.25 
 
 		 425 aa  116  6e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3487  electron transport protein SCO1/SenC  37.18 
 
 		 221 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.108073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2459  SCO1/SenC family protein  35.71 
 
 		 221 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.471351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2284  electron transport protein SCO1/SenC  37.18 
 
 		 221 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.882124 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3488  electron transport protein SCO1/SenC  36.6 
 
 		 218 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2458  electron transport protein SCO1/SenC  36.6 
 
 		 218 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.657864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2449  electron transport protein SCO1/SenC  35.29 
 
 		 218 aa  110  5e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.010405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2283  electron transport protein SCO1/SenC  35.29 
 
 		 218 aa  109  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.897597  normal  0.85963 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1978  hypothetical protein  35.9 
 
 		 208 aa  103  5e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.572357 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1255  hypothetical protein  36.32 
 
 		 194 aa  102  6e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.847765  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1019  hypothetical protein  40.74 
 
 		 296 aa  91.7  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.166316 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1398  SCO1/SenC family protein  32.69 
 
 		 193 aa  86.3  7e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0728  hypothetical protein  35.34 
 
 		 200 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2292  putative transmembrane protein  34.97 
 
 		 207 aa  83.2  0.000000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.765986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2235  hypothetical protein  35.9 
 
 		 204 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0773  cytochrome c, class I  43.33 
 
 		 326 aa  83.2  0.000000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0714  hypothetical protein  35.9 
 
 		 204 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2319  hypothetical protein  35.9 
 
 		 204 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.735788  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3450  cytochrome c, class I  40.45 
 
 		 326 aa  82  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.60831  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4695  hypothetical protein  43.3 
 
 		 235 aa  80.9  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0489031  normal  0.712544 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1666  hypothetical protein  35.04 
 
 		 204 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1919  hypothetical protein  35.04 
 
 		 204 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.854236  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1711  hypothetical protein  35.04 
 
 		 204 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0594  hypothetical protein  35.04 
 
 		 204 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1482  electron transport protein SCO1/SenC  34.46 
 
 		 193 aa  79.7  0.00000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0048  electron transport protein SCO1/SenC  34.4 
 
 		 208 aa  76.3  0.0000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1366  hypothetical protein  35.54 
 
 		 186 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0134232  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0648  hypothetical protein  35.54 
 
 		 186 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0599933  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1595  hypothetical protein  35.54 
 
 		 197 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0258875  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0508  hypothetical protein  35.54 
 
 		 186 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.588285  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1756  hypothetical protein  35.54 
 
 		 197 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1570  hypothetical protein  35.54 
 
 		 186 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.310526  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0216  protein of unknown function DUF420  36.15 
 
 		 444 aa  72.4  0.000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.614446  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5990  electron transport protein SCO1/SenC  40 
 
 		 240 aa  70.9  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1172  electron transport protein SCO1/SenC  30.32 
 
 		 283 aa  68.9  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0944  mulitcopper oxidase domain-containing protein  39 
 
 		 487 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01150  YpmQ  36.75 
 
 		 243 aa  67  0.0000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5677  electron transport protein SCO1/SenC  38.46 
 
 		 236 aa  66.6  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0514  electron transport protein SCO1/SenC  32.11 
 
 		 219 aa  65.5  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2213  cytochrome c, mono- and diheme variant  30 
 
 		 435 aa  65.5  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0189  hypothetical protein  32.82 
 
 		 211 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00930  Electron transport protein SCO1/SenC  32.48 
 
 		 211 aa  65.1  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.330102  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1966  multicopper oxidase domain-containing protein  26.7 
 
 		 535 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.328521  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2061  multicopper oxidase domain-containing protein  26.49 
 
 		 535 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.429703  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2297  hypothetical protein  31.78 
 
 		 302 aa  64.7  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0292911 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3898  electron transport protein SCO1/SenC  33.05 
 
 		 207 aa  64.3  0.000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.88916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2512  electron transport protein SCO1/SenC  29.24 
 
 		 217 aa  63.9  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2665  electron transport protein SCO1/SenC  28.85 
 
 		 204 aa  63.5  0.000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00000706149  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0151  electron transport protein SCO1/SenC  30.52 
 
 		 210 aa  63.2  0.000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2969  electron transport protein SCO1/SenC  29.91 
 
 		 241 aa  63.2  0.000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000412315 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3429  electron transport protein SCO1/SenC  30.25 
 
 		 201 aa  62.4  0.000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.042976  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0931  electron transport protein SCO1/SenC  33.96 
 
 		 248 aa  62.8  0.000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3477  cytochrome c class I  32.22 
 
 		 425 aa  62.8  0.000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.333881  normal  0.501976 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1066  hypothetical protein  29.32 
 
 		 204 aa  62  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.172468  normal  0.032179 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1595  electron transport protein SCO1/SenC  27.22 
 
 		 211 aa  62  0.00000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000402998  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0477  mulitcopper oxidase domain-containing protein  26.14 
 
 		 487 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01390  hypothetical protein  31.3 
 
 		 211 aa  62  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0517  electron transport protein SCO1/SenC  33.33 
 
 		 228 aa  61.6  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.576409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5562  electron transport protein SCO1/SenC  28.87 
 
 		 210 aa  61.6  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.608638 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1613  multicopper oxidase domain-containing protein  26.14 
 
 		 535 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0548  mulitcopper oxidase domain-containing protein  26.14 
 
 		 487 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.181487  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0798  mulitcopper oxidase domain-containing protein  26.14 
 
 		 535 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0659  mulitcopper oxidase domain-containing protein  26.14 
 
 		 535 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.870882  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2200  hypothetical protein  31.51 
 
 		 223 aa  61.6  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.911586  normal  0.909176 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5207  electron transport protein SCO1/SenC  30.77 
 
 		 220 aa  60.8  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.723595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2688  electron transport protein SCO1/SenC  29.69 
 
 		 211 aa  60.8  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1683  electron transport protein SCO1/SenC  31.25 
 
 		 204 aa  60.8  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1634  cytochrome c, class I  27.55 
 
 		 444 aa  60.1  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0202  cytochrome c class I  34.09 
 
 		 264 aa  60.1  0.00000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0328  cytochrome c, class I  35.05 
 
 		 262 aa  60.1  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000605449  hitchhiker  0.0000000937241 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1801  electron transport protein SCO1/SenC  31.93 
 
 		 291 aa  60.1  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.53156 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0131  electron transport protein SCO1/SenC  30.26 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.801805  normal  0.912872 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1588  electron transport protein SCO1/SenC  44.16 
 
 		 188 aa  60.1  0.00000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000473469  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1992  electron transport protein SCO1/SenC  24.16 
 
 		 220 aa  59.3  0.00000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0454  electron transport protein SCO1/SenC  36.14 
 
 		 203 aa  59.3  0.00000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0888  electron transport protein SCO1/SenC  31.82 
 
 		 210 aa  58.5  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.147718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2077  electron transport protein SCO1/SenC  31.82 
 
 		 296 aa  58.5  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0831544  normal  0.489667 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1389  electron transport protein SCO1/SenC  25.43 
 
 		 206 aa  58.9  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.324761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0976  major antigenic protein  31.75 
 
 		 205 aa  58.9  0.0000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2329  hypothetical protein  32.63 
 
 		 202 aa  58.9  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2573  hypothetical protein  28.21 
 
 		 593 aa  58.5  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.122591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0284  electron transport protein SCO1/SenC  28.19 
 
 		 210 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1479  electron transport protein SCO1/SenC  30.58 
 
 		 196 aa  57.8  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1690  electron transport protein SCO1/SenC  25.3 
 
 		 201 aa  57.8  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.805804  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3791  electron transport protein SCO1/SenC  29.8 
 
 		 217 aa  58.5  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4381  electron transport protein SCO1/SenC  28.47 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.558879  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0663  electron transport protein SCO1/SenC  33.33 
 
 		 197 aa  57.4  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000146035  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0408  hypothetical protein  25.24 
 
 		 149 aa  57.4  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0357243  normal  0.780002 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>