37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1274 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1274  cytochrome c class I  100 
 
 		 166 aa  346  1e-94  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2011  hypothetical protein  40.79 
 
 		 152 aa  124  5e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0446  cytochrome c class I  44.86 
 
 		 169 aa  105  3e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000163065  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0692  cytochrome c class I  28.66 
 
 		 153 aa  80.9  0.000000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.189823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2002  electron transport protein SCO1/SenC  35.29 
 
 		 363 aa  61.6  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3183  electron transport protein SCO1/SenC  32.32 
 
 		 327 aa  58.2  0.00000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.106344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0650  electron transport protein SCO1/SenC  34.17 
 
 		 340 aa  58.2  0.00000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2666  electron transport protein SCO1/SenC  33.33 
 
 		 327 aa  58.2  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.239586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1770  nitrous-oxide reductase NosZ  33.33 
 
 		 864 aa  57  0.0000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1298  nitrous-oxide reductase  31 
 
 		 865 aa  57.4  0.0000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.0000502464  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2533  electron transport protein SCO1/SenC  31.31 
 
 		 327 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1634  cytochrome c, class I  30.34 
 
 		 444 aa  55.5  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0328  cytochrome c, class I  30.12 
 
 		 262 aa  55.5  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000605449  hitchhiker  0.0000000937241 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01315  Cytochrome c3  31.43 
 
 		 427 aa  55.1  0.0000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0440  nitrous-oxide reductase  30.91 
 
 		 864 aa  54.3  0.0000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.136119  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0477  mulitcopper oxidase domain-containing protein  28.12 
 
 		 487 aa  53.9  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4298  electron transport protein SCO1/SenC  33.68 
 
 		 356 aa  53.1  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.576554  normal  0.116198 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0548  mulitcopper oxidase domain-containing protein  28.12 
 
 		 487 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.181487  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1019  hypothetical protein  35.71 
 
 		 296 aa  53.9  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.166316 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2297  hypothetical protein  27.47 
 
 		 302 aa  53.1  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0292911 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0010  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  31.25 
 
 		 863 aa  51.2  0.000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0271061  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0944  mulitcopper oxidase domain-containing protein  27.08 
 
 		 487 aa  50.4  0.000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0798  mulitcopper oxidase domain-containing protein  28.72 
 
 		 535 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1613  multicopper oxidase domain-containing protein  28.72 
 
 		 535 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0659  mulitcopper oxidase domain-containing protein  28.72 
 
 		 535 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.870882  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2061  multicopper oxidase domain-containing protein  27.66 
 
 		 535 aa  48.5  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.429703  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1966  multicopper oxidase domain-containing protein  27.66 
 
 		 535 aa  48.1  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.328521  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2213  cytochrome c, mono- and diheme variant  34.72 
 
 		 435 aa  47  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0202  cytochrome c class I  24.42 
 
 		 264 aa  46.2  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3450  cytochrome c, class I  31.76 
 
 		 326 aa  46.6  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.60831  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1729  methyl-accepting chemotaxis protein  28.12 
 
 		 862 aa  45.8  0.0003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.371209  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0773  cytochrome c, class I  29.41 
 
 		 326 aa  44.7  0.0007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0529  cytochrome c class I  30.26 
 
 		 400 aa  42.7  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3477  cytochrome c class I  26.19 
 
 		 425 aa  42.4  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.333881  normal  0.501976 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0408  hypothetical protein  29.03 
 
 		 149 aa  41.6  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0357243  normal  0.780002 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5370  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  30.34 
 
 		 531 aa  40.8  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.173213  normal  0.778162 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4825  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  30.34 
 
 		 531 aa  40.8  0.009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0605523 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>