80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1803 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_1556  Nitrous-oxide reductase  59.28 
 
 		 620 aa  755    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.298548  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0209  Nitrous-oxide reductase  51.78 
 
 		 632 aa  640    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1461  Nitrous-oxide reductase  59.62 
 
 		 620 aa  757    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1803  nitrous-oxide reductase  100 
 
 		 648 aa  1333    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.625051  normal  0.62653 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0244  nitrous-oxide reductase  59.41 
 
 		 647 aa  767    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.677359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2402  nitrous-oxide reductase  60.14 
 
 		 620 aa  761    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00162507  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0693  Nitrous-oxide reductase  45.03 
 
 		 658 aa  538  1e-151  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.112553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2012  Nitrous-oxide reductase  44.33 
 
 		 663 aa  520  1e-146  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1571  cytochrome c oxidase, subunit II  44.44 
 
 		 760 aa  492  9.999999999999999e-139  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.915615 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1575  cytochrome c oxidase, subunit II  44.44 
 
 		 760 aa  492  9.999999999999999e-139  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0010  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  42.39 
 
 		 863 aa  448  1.0000000000000001e-124  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0271061  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1729  methyl-accepting chemotaxis protein  41.83 
 
 		 862 aa  443  1e-123  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.371209  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1298  nitrous-oxide reductase  39.93 
 
 		 865 aa  442  1e-123  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.0000502464  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0440  nitrous-oxide reductase  41.18 
 
 		 864 aa  437  1e-121  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.136119  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1928  nitrous-oxide reductase  40.63 
 
 		 673 aa  434  1e-120  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1770  nitrous-oxide reductase NosZ  40.03 
 
 		 864 aa  417  9.999999999999999e-116  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1165  nitrous-oxide reductase  38.68 
 
 		 699 aa  395  1e-108  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.804263  normal  0.124168 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3142  nitrous-oxide reductase  35.65 
 
 		 648 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0428  nitrous-oxide reductase  35.38 
 
 		 649 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.859318  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2351  nitrous-oxide reductase  35.93 
 
 		 645 aa  368  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3078  nitrous-oxide reductase  35.51 
 
 		 631 aa  366  1e-100  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2861  nitrous-oxide reductase  35.3 
 
 		 645 aa  365  1e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.7379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1074  nitrous-oxide reductase  35.45 
 
 		 640 aa  364  2e-99  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.198434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1389  nitrous-oxide reductase  36.28 
 
 		 646 aa  361  3e-98  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20200  nitrous-oxide reductase  34.43 
 
 		 636 aa  359  9.999999999999999e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.89249 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1738  nitrous-oxide reductase  34.96 
 
 		 636 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2219  nitrous-oxide reductase  35.36 
 
 		 628 aa  357  5e-97  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000181055  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0275  nitrous-oxide reductase  35.54 
 
 		 639 aa  357  5e-97  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.275953  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0251  nitrous-oxide reductase  35.37 
 
 		 639 aa  355  2e-96  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6008  nitrous-oxide reductase  34.21 
 
 		 639 aa  355  2e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.180938  normal  0.0225703 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3400  nitrous-oxide reductase  34.54 
 
 		 628 aa  354  2e-96  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00206231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4346  nitrous-oxide reductase  35.21 
 
 		 638 aa  353  8e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0394445  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1428  nitrous-oxide reductase  33.99 
 
 		 630 aa  351  2e-95  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0664  nitrous-oxide reductase  35.25 
 
 		 652 aa  350  3e-95  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2115  nitrous-oxide reductase  36.15 
 
 		 655 aa  350  4e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.62565  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2060  nitrous-oxide reductase  36.63 
 
 		 693 aa  350  5e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.840269  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2255  nitrous-oxide reductase  36.63 
 
 		 691 aa  350  5e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4732  nitrous-oxide reductase  33.5 
 
 		 617 aa  350  6e-95  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2325  nitrous-oxide reductase  36.3 
 
 		 690 aa  348  1e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0995  nitrous-oxide reductase  36 
 
 		 660 aa  347  3e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.599003  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1139  nitrous-oxide reductase  35.7 
 
 		 646 aa  340  4e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.494075 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1483  nitrous-oxide reductase  35.16 
 
 		 644 aa  340  5e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.150565 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3199  nitrous-oxide reductase  36.27 
 
 		 650 aa  340  5e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.324425  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1368  nitrous-oxide reductase  35.44 
 
 		 646 aa  340  7e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.90287 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4917  nitrous-oxide reductase  34.83 
 
 		 646 aa  337  2.9999999999999997e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0125108 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1060  nitrous-oxide reductase  35.32 
 
 		 645 aa  335  1e-90  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.620388  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2564  nitrous-oxide reductase  35.14 
 
 		 628 aa  333  4e-90  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.164032  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4059  nitrous-oxide reductase  34.17 
 
 		 649 aa  334  4e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00566192  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4171  nitrous-oxide reductase  34.17 
 
 		 649 aa  334  4e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3194  nitrous-oxide reductase  32.9 
 
 		 647 aa  322  9.999999999999999e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4219  nitrous-oxide reductase  34.3 
 
 		 652 aa  320  3.9999999999999996e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.522351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3319  nitrous-oxide reductase  33.17 
 
 		 644 aa  314  2.9999999999999996e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0698213  normal  0.2184 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1574  cytochrome c oxidase subunit II  33.67 
 
 		 168 aa  58.5  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226069  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0464  cytochrome c oxidase subunit II  29.91 
 
 		 266 aa  58.2  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1826  cytochrome c oxidase subunit II  28.97 
 
 		 160 aa  56.2  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00813215  normal  0.126007 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0933  cytochrome c oxidase, subunit II  32.22 
 
 		 168 aa  54.3  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1899  cytochrome c oxidase subunit II  30.86 
 
 		 156 aa  53.1  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.71816  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3802  cytochrome c oxidase subunit II  29.03 
 
 		 262 aa  52.4  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0599  cytochrome c oxidase subunit II  30.23 
 
 		 124 aa  52  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.632482 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2921  blue (type 1) copper domain protein  31.96 
 
 		 125 aa  49.3  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0439603  normal  0.638215 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2967  cytochrome c oxidase subunit II  34.57 
 
 		 162 aa  49.7  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000376263 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1565  cytochrome c oxidase subunit II  26.92 
 
 		 155 aa  49.3  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4435  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I:cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  36.76 
 
 		 316 aa  49.3  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0428074  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2385  cytochrome c oxidase subunit II  25.25 
 
 		 156 aa  47.4  0.0008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1172  cytochrome c oxidase family protein  29.41 
 
 		 141 aa  46.6  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0182872  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2296  putative cytochrome c oxidase subunit  29.41 
 
 		 141 aa  46.6  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.375881  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2257  putative cytochrome c oxidase subunit  29.41 
 
 		 141 aa  46.6  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0923001  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1950  cytochrome c oxidase, subunit II  28.87 
 
 		 158 aa  47  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3408  cytochrome c oxidase family protein  29.41 
 
 		 141 aa  46.6  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.181168  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1899  cytochrome c oxidase family protein  29.41 
 
 		 141 aa  46.6  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2422  cytochrome c oxidase family protein  29.41 
 
 		 141 aa  46.6  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1408  cytochrome c oxidase family protein  29.41 
 
 		 141 aa  46.6  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0216619  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2021  cytochrome c oxidase subunit II  24.79 
 
 		 160 aa  45.4  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.388315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0828  cytochrome c oxidase, subunit II  34.21 
 
 		 321 aa  45.8  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.304556 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4180  cytochrome c oxidase, subunit II  32.79 
 
 		 314 aa  45.1  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.548982  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02212  putative cytochrome C oxidase polypeptide II oxidoreductase protein  28.89 
 
 		 125 aa  45.1  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2397  cytochrome c oxidase, subunit II  24.73 
 
 		 177 aa  44.7  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3117  cytochrome c oxidase, subunit II  30.12 
 
 		 316 aa  44.3  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.762727  normal  0.80653 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2175  cytochrome c oxidase family protein  28.43 
 
 		 141 aa  43.9  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.381678  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4253  cytochrome c oxidase, subunit II  28.89 
 
 		 124 aa  43.9  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>