150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10247_1172 on replicon NC_009080
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006348  BMA1408  cytochrome c oxidase family protein  100 
 
 		 141 aa  279  7.000000000000001e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0216619  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1899  cytochrome c oxidase family protein  100 
 
 		 141 aa  279  7.000000000000001e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3408  cytochrome c oxidase family protein  100 
 
 		 141 aa  279  7.000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.181168  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1172  cytochrome c oxidase family protein  100 
 
 		 141 aa  279  7.000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0182872  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2422  cytochrome c oxidase family protein  99.29 
 
 		 141 aa  277  3e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2257  putative cytochrome c oxidase subunit  99.29 
 
 		 141 aa  277  3e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0923001  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2296  putative cytochrome c oxidase subunit  99.29 
 
 		 141 aa  277  3e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.375881  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2175  cytochrome c oxidase family protein  90.07 
 
 		 141 aa  233  6e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.381678  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1618  cytochrome c oxidase subunit II  70.08 
 
 		 125 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.464579 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0599  cytochrome c oxidase subunit II  59.78 
 
 		 124 aa  121  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.632482 
 
 
-
 
NC_003296  RS02212  putative cytochrome C oxidase polypeptide II oxidoreductase protein  63.04 
 
 		 125 aa  120  5e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4253  cytochrome c oxidase, subunit II  61.29 
 
 		 124 aa  118  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2967  cytochrome c oxidase subunit II  35.29 
 
 		 162 aa  63.9  0.0000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000376263 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1574  cytochrome c oxidase subunit II  34.26 
 
 		 168 aa  60.5  0.000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226069  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2385  cytochrome c oxidase subunit II  28.57 
 
 		 156 aa  60.1  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2412  cytochrome c oxidase subunit II  32.38 
 
 		 171 aa  60.1  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0761  cytochrome c oxidase subunit II  28.95 
 
 		 146 aa  59.3  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.254887  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3802  cytochrome c oxidase subunit II  32.93 
 
 		 262 aa  58.5  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0320  cytochrome c oxidase, subunit II  30.53 
 
 		 147 aa  58.2  0.00000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1899  cytochrome c oxidase subunit II  25.62 
 
 		 156 aa  57.8  0.00000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.71816  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0933  cytochrome c oxidase, subunit II  30.56 
 
 		 168 aa  57  0.00000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1874  cytochrome c oxidase, subunit II  35.9 
 
 		 256 aa  57  0.00000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0414  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  29.47 
 
 		 311 aa  55.5  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3373  cytochrome c oxidase subunit II  31.46 
 
 		 172 aa  53.9  0.0000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.208365  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3756  cytochrome c oxidase subunit II  32.14 
 
 		 300 aa  53.1  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0464  cytochrome c oxidase subunit II  30.23 
 
 		 266 aa  53.1  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5762  cytochrome c oxidase subunit II  32.5 
 
 		 195 aa  53.1  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.336691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1950  cytochrome c oxidase, subunit II  30.61 
 
 		 158 aa  52  0.000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2862  cytochrome c oxidase subunit II  35.94 
 
 		 272 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0315403 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1944  cytochrome c oxidase, subunit II  30.93 
 
 		 149 aa  50.4  0.000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0252  cytochrome c oxidase, subunit II  34.92 
 
 		 302 aa  50.4  0.000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.433496  normal  0.0258846 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4435  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I:cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  31.82 
 
 		 316 aa  48.9  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0428074  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2706  cytochrome c oxidase, subunit II  33.33 
 
 		 389 aa  49.3  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.363999 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1826  cytochrome c oxidase subunit II  27.03 
 
 		 160 aa  48.9  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00813215  normal  0.126007 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2345  cytochrome c oxidase subunit II  33.33 
 
 		 271 aa  48.5  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.215159  normal  0.967701 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0046  cytochrome c oxidase, subunit II  35.59 
 
 		 301 aa  48.5  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1993  cytochrome c oxidase, subunit II  36.11 
 
 		 314 aa  48.5  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0975891  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1298  nitrous-oxide reductase  32.91 
 
 		 865 aa  48.1  0.00004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.0000502464  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4180  cytochrome c oxidase, subunit II  33.33 
 
 		 314 aa  48.1  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.548982  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0884  cytochrome c oxidase, subunit II  28.28 
 
 		 120 aa  47.8  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.555731  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2021  cytochrome c oxidase subunit II  27.03 
 
 		 160 aa  47.4  0.00007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.388315  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2397  cytochrome c oxidase, subunit II  28.75 
 
 		 177 aa  47.4  0.00008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8116  cytochrome c oxidase subunit II  28.12 
 
 		 187 aa  47  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.105438  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1571  cytochrome c oxidase, subunit II  32.5 
 
 		 760 aa  46.2  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.915615 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1575  cytochrome c oxidase, subunit II  32.5 
 
 		 760 aa  46.2  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1491  cytochrome c oxidase, subunit II  29.63 
 
 		 190 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.403979  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2602  cytochrome c oxidase subunit II  34.85 
 
 		 315 aa  46.2  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.405519 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0016  cytochrome c oxidase, subunit II  29.27 
 
 		 186 aa  46.6  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1352  cytochrome c oxidase, subunit II  30 
 
 		 185 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1358  cytochrome c oxidase, subunit II  30 
 
 		 185 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6886  cytochrome c oxidase, subunit II  35 
 
 		 313 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2351  nitrous-oxide reductase  35.59 
 
 		 645 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0828  cytochrome c oxidase, subunit II  35.94 
 
 		 321 aa  46.6  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.304556 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0162  cytochrome c oxidase subunit II  29.67 
 
 		 179 aa  46.6  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0244  nitrous-oxide reductase  29 
 
 		 647 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.677359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1522  cytochrome c oxidase, subunit II  32.31 
 
 		 330 aa  46.2  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6229  cytochrome c oxidase, subunit II  35 
 
 		 359 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.24435  normal  0.0456922 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1803  nitrous-oxide reductase  29.41 
 
 		 648 aa  46.6  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.625051  normal  0.62653 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1461  Nitrous-oxide reductase  29.41 
 
 		 620 aa  45.4  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2875  hypothetical protein  30 
 
 		 165 aa  46.2  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.902113  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2402  nitrous-oxide reductase  29.41 
 
 		 620 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00162507  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2489  cytochrome c oxidase, subunit II  24 
 
 		 243 aa  46.2  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.500427  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2266  cytochrome c, monohaem  30.56 
 
 		 336 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.380948  normal  0.0167103 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2012  Nitrous-oxide reductase  28.89 
 
 		 663 aa  45.8  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0348  cytochrome c oxidase subunit II  28.4 
 
 		 190 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0222  cytochrome c oxidase, subunit II  31.43 
 
 		 288 aa  45.1  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4077  putative cytochrome c oxidase subunit II  28.4 
 
 		 190 aa  45.1  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.357197 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1556  Nitrous-oxide reductase  29.41 
 
 		 620 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.298548  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1600  cytochrome c oxidase, subunit II  32.81 
 
 		 337 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.884566  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0848  cytochrome c oxidase subunit II  35 
 
 		 351 aa  45.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5502  cytochrome c oxidase, subunit II  29.17 
 
 		 370 aa  45.1  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.535121  normal  0.0572426 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5817  cytochrome c oxidase, subunit II  32.81 
 
 		 310 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.156146  hitchhiker  0.00847969 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1676  cytochrome c oxidase, subunit II  32.81 
 
 		 337 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0446  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  29.03 
 
 		 324 aa  44.7  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.112901 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0275  nitrous-oxide reductase  35.09 
 
 		 639 aa  44.7  0.0005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.275953  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1588  cytochrome c oxidase, subunit II  33.93 
 
 		 342 aa  44.3  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2406  cytochrome c oxidase, subunit II  31.67 
 
 		 377 aa  44.7  0.0005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0440  nitrous-oxide reductase  32.91 
 
 		 864 aa  44.3  0.0005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.136119  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2167  cytochrome c oxidase, subunit II  30.3 
 
 		 316 aa  44.3  0.0005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.238577  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0251  nitrous-oxide reductase  35.09 
 
 		 639 aa  44.7  0.0005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0623  cytochrome c oxidase subunit II  28.4 
 
 		 190 aa  44.3  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.320942 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0024  cytochrome c oxidase, subunit II  33.33 
 
 		 362 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.901821 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2313  cytochrome c oxidase, subunit II  34.62 
 
 		 244 aa  44.3  0.0006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.210732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1770  nitrous-oxide reductase NosZ  32.91 
 
 		 864 aa  44.3  0.0006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0156  cytochrome c oxidase, subunit II  29.17 
 
 		 232 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0166  cytochrome c oxidase, subunit II  33.33 
 
 		 362 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.129501  normal  0.0168942 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1565  cytochrome c oxidase subunit II  31.17 
 
 		 155 aa  44.3  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0222  cytochrome c oxidase, subunit II  33.33 
 
 		 362 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0145699  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2861  nitrous-oxide reductase  35.09 
 
 		 645 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.7379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2275  cytochrome c oxidase, subunit II  31.67 
 
 		 337 aa  43.9  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.869151  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0783  cytochrome c oxidase, subunit II  33.85 
 
 		 372 aa  43.9  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6354  cytochrome c oxidase subunit II  34.21 
 
 		 334 aa  43.9  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16250  cytochrome c oxidase, subunit II  34.85 
 
 		 304 aa  43.9  0.0008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.178752  normal  0.538576 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0293  cytochrome c oxidase, subunit II  35.94 
 
 		 311 aa  43.9  0.0008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.142345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0209  Nitrous-oxide reductase  28.57 
 
 		 632 aa  43.5  0.0009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0467  cytochrome c oxidase, subunit II  27.59 
 
 		 284 aa  43.1  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.870117  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0460  cytochrome c oxidase, subunit II  32.47 
 
 		 353 aa  43.1  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.354816  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2797  cytochrome c oxidase, subunit II  29.41 
 
 		 249 aa  43.5  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0771  cytochrome c oxidase, subunit II  33.85 
 
 		 381 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0315373  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0254  cytochrome c oxidase subunit II  31.25 
 
 		 269 aa  43.5  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00721127 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>