66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4732 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_4732  nitrous-oxide reductase  100 
 
 
617 aa  1295    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4346  nitrous-oxide reductase  63.48 
 
 
638 aa  804    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0394445  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1738  nitrous-oxide reductase  68.12 
 
 
636 aa  884    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3194  nitrous-oxide reductase  58.5 
 
 
647 aa  712    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0251  nitrous-oxide reductase  60.77 
 
 
639 aa  805    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6008  nitrous-oxide reductase  62.67 
 
 
639 aa  777    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.180938  normal  0.0225703 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3319  nitrous-oxide reductase  62.46 
 
 
644 aa  756    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0698213  normal  0.2184 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3400  nitrous-oxide reductase  82.5 
 
 
628 aa  1097    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00206231  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2861  nitrous-oxide reductase  60.8 
 
 
645 aa  786    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.7379  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3078  nitrous-oxide reductase  72.46 
 
 
631 aa  882    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1428  nitrous-oxide reductase  80.88 
 
 
630 aa  1080    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4219  nitrous-oxide reductase  61.02 
 
 
652 aa  745    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.522351  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20200  nitrous-oxide reductase  67.96 
 
 
636 aa  891    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.89249 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1074  nitrous-oxide reductase  62.62 
 
 
640 aa  841    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.198434  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2219  nitrous-oxide reductase  82.5 
 
 
628 aa  1120    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000181055  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0275  nitrous-oxide reductase  63.71 
 
 
639 aa  808    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.275953  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3142  nitrous-oxide reductase  60.17 
 
 
648 aa  775    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2351  nitrous-oxide reductase  57.5 
 
 
645 aa  775    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2564  nitrous-oxide reductase  60.34 
 
 
628 aa  761    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.164032  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0428  nitrous-oxide reductase  60.07 
 
 
649 aa  777    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.859318  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1060  nitrous-oxide reductase  54.41 
 
 
645 aa  633  1e-180  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.620388  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1139  nitrous-oxide reductase  54.41 
 
 
646 aa  634  1e-180  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.494075 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3199  nitrous-oxide reductase  51.24 
 
 
650 aa  630  1e-179  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.324425  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1368  nitrous-oxide reductase  50.71 
 
 
646 aa  630  1e-179  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.90287 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4059  nitrous-oxide reductase  50.62 
 
 
649 aa  627  1e-178  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00566192  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4171  nitrous-oxide reductase  50.62 
 
 
649 aa  627  1e-178  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2325  nitrous-oxide reductase  51.86 
 
 
690 aa  625  1e-178  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2060  nitrous-oxide reductase  51.86 
 
 
693 aa  623  1e-177  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.840269  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2115  nitrous-oxide reductase  51.86 
 
 
655 aa  622  1e-177  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.62565  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2255  nitrous-oxide reductase  51.86 
 
 
691 aa  623  1e-177  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0995  nitrous-oxide reductase  51.69 
 
 
660 aa  620  1e-176  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.599003  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1483  nitrous-oxide reductase  51.87 
 
 
644 aa  620  1e-176  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.150565 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1389  nitrous-oxide reductase  50.31 
 
 
646 aa  617  1e-175  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4917  nitrous-oxide reductase  50.47 
 
 
646 aa  615  1e-175  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0125108 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0664  nitrous-oxide reductase  50.85 
 
 
652 aa  591  1e-167  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1165  nitrous-oxide reductase  42.7 
 
 
699 aa  505  1e-141  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.804263  normal  0.124168 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0209  Nitrous-oxide reductase  37.56 
 
 
632 aa  362  1e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1803  nitrous-oxide reductase  33.5 
 
 
648 aa  350  6e-95  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.625051  normal  0.62653 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0244  nitrous-oxide reductase  37.38 
 
 
647 aa  347  3e-94  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.677359  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1556  Nitrous-oxide reductase  36.82 
 
 
620 aa  346  6e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.298548  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1461  Nitrous-oxide reductase  36.66 
 
 
620 aa  345  1e-93  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2402  nitrous-oxide reductase  36.99 
 
 
620 aa  341  2e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00162507  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2012  Nitrous-oxide reductase  33.39 
 
 
663 aa  323  8e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0693  Nitrous-oxide reductase  33.91 
 
 
658 aa  322  1.9999999999999998e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.112553  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1575  cytochrome c oxidase, subunit II  33.84 
 
 
760 aa  306  5.0000000000000004e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1571  cytochrome c oxidase, subunit II  33.84 
 
 
760 aa  306  5.0000000000000004e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.915615 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1770  nitrous-oxide reductase NosZ  32.27 
 
 
864 aa  300  7e-80  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0440  nitrous-oxide reductase  31.31 
 
 
864 aa  298  1e-79  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.136119  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0010  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  31.08 
 
 
863 aa  291  2e-77  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0271061  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1729  methyl-accepting chemotaxis protein  31.58 
 
 
862 aa  291  4e-77  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.371209  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1928  nitrous-oxide reductase  30.93 
 
 
673 aa  286  9e-76  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1298  nitrous-oxide reductase  34.09 
 
 
865 aa  285  1.0000000000000001e-75  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.0000502464  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2021  cytochrome c oxidase subunit II  27.73 
 
 
160 aa  51.6  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.388315  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1574  cytochrome c oxidase subunit II  33.77 
 
 
168 aa  50.4  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226069  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1826  cytochrome c oxidase subunit II  27.62 
 
 
160 aa  50.1  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00813215  normal  0.126007 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1899  cytochrome c oxidase subunit II  26.02 
 
 
156 aa  49.3  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.71816  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0933  cytochrome c oxidase, subunit II  32.47 
 
 
168 aa  49.7  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1565  cytochrome c oxidase subunit II  35.44 
 
 
155 aa  49.3  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2385  cytochrome c oxidase subunit II  27.2 
 
 
156 aa  48.9  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2967  cytochrome c oxidase subunit II  29.84 
 
 
162 aa  48.5  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000376263 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0599  cytochrome c oxidase subunit II  35.71 
 
 
124 aa  48.1  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.632482 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0464  cytochrome c oxidase subunit II  28.32 
 
 
266 aa  48.5  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2263  cytochrome c oxidase, subunit II  30.49 
 
 
367 aa  46.2  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0175262  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4435  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I:cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  29.11 
 
 
316 aa  45.8  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0428074  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3558  cytochrome c oxidase subunit II  30.49 
 
 
370 aa  45.4  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.22857 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1588  cytochrome c oxidase, subunit II  31.17 
 
 
342 aa  45.4  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>