150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I2175 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007651  BTH_I2175  cytochrome c oxidase family protein  100 
 
 
141 aa  281  2.0000000000000002e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.381678  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1408  cytochrome c oxidase family protein  90.07 
 
 
141 aa  236  1e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0216619  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1899  cytochrome c oxidase family protein  90.07 
 
 
141 aa  236  1e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3408  cytochrome c oxidase family protein  90.07 
 
 
141 aa  236  1e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.181168  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1172  cytochrome c oxidase family protein  90.07 
 
 
141 aa  236  1e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0182872  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2422  cytochrome c oxidase family protein  90.78 
 
 
141 aa  233  6e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2257  putative cytochrome c oxidase subunit  90.78 
 
 
141 aa  233  6e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0923001  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2296  putative cytochrome c oxidase subunit  90.78 
 
 
141 aa  233  6e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.375881  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1618  cytochrome c oxidase subunit II  69.29 
 
 
125 aa  169  1e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.464579 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0599  cytochrome c oxidase subunit II  58.7 
 
 
124 aa  118  3e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.632482 
 
 
-
 
NC_003296  RS02212  putative cytochrome C oxidase polypeptide II oxidoreductase protein  64.04 
 
 
125 aa  117  7e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4253  cytochrome c oxidase, subunit II  61.29 
 
 
124 aa  115  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2967  cytochrome c oxidase subunit II  33.33 
 
 
162 aa  61.2  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000376263 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2385  cytochrome c oxidase subunit II  29.41 
 
 
156 aa  60.8  0.000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0761  cytochrome c oxidase subunit II  31.63 
 
 
146 aa  60.5  0.000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.254887  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2412  cytochrome c oxidase subunit II  31.63 
 
 
171 aa  59.3  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0320  cytochrome c oxidase, subunit II  31.63 
 
 
147 aa  59.3  0.00000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1899  cytochrome c oxidase subunit II  27.27 
 
 
156 aa  59.3  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.71816  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1574  cytochrome c oxidase subunit II  33.33 
 
 
168 aa  58.5  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226069  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1874  cytochrome c oxidase, subunit II  30.69 
 
 
256 aa  58.2  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0414  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  29.52 
 
 
311 aa  58.2  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3802  cytochrome c oxidase subunit II  31.71 
 
 
262 aa  57.8  0.00000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3373  cytochrome c oxidase subunit II  31.46 
 
 
172 aa  55.1  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.208365  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0933  cytochrome c oxidase, subunit II  29.63 
 
 
168 aa  54.7  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0464  cytochrome c oxidase subunit II  29.07 
 
 
266 aa  53.5  0.0000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0252  cytochrome c oxidase, subunit II  36.51 
 
 
302 aa  52.8  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.433496  normal  0.0258846 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5762  cytochrome c oxidase subunit II  32.1 
 
 
195 aa  53.5  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.336691  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3756  cytochrome c oxidase subunit II  30.95 
 
 
300 aa  52.4  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1944  cytochrome c oxidase, subunit II  28.87 
 
 
149 aa  52  0.000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0046  cytochrome c oxidase, subunit II  37.29 
 
 
301 aa  51.6  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4180  cytochrome c oxidase, subunit II  25.2 
 
 
314 aa  51.2  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.548982  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1993  cytochrome c oxidase, subunit II  36.11 
 
 
314 aa  51.2  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0975891  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1950  cytochrome c oxidase, subunit II  29 
 
 
158 aa  50.4  0.000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2706  cytochrome c oxidase, subunit II  33.33 
 
 
389 aa  50.1  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.363999 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0222  cytochrome c oxidase, subunit II  32.86 
 
 
288 aa  48.5  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4435  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I:cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  31.82 
 
 
316 aa  48.5  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0428074  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2489  cytochrome c oxidase, subunit II  26.32 
 
 
243 aa  48.5  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.500427  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2862  cytochrome c oxidase subunit II  34.38 
 
 
272 aa  48.9  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0315403 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1298  nitrous-oxide reductase  32.91 
 
 
865 aa  47.8  0.00005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.0000502464  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6886  cytochrome c oxidase, subunit II  36.67 
 
 
313 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2345  cytochrome c oxidase subunit II  31.94 
 
 
271 aa  47.8  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.215159  normal  0.967701 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0828  cytochrome c oxidase, subunit II  35.94 
 
 
321 aa  47  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.304556 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1522  cytochrome c oxidase, subunit II  33.9 
 
 
330 aa  46.2  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2167  cytochrome c oxidase, subunit II  31.82 
 
 
316 aa  46.2  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.238577  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0244  nitrous-oxide reductase  29.91 
 
 
647 aa  46.2  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.677359  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6229  cytochrome c oxidase, subunit II  35 
 
 
359 aa  47  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.24435  normal  0.0456922 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0162  cytochrome c oxidase subunit II  29.67 
 
 
179 aa  46.6  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2397  cytochrome c oxidase, subunit II  27.5 
 
 
177 aa  45.8  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1571  cytochrome c oxidase, subunit II  32.5 
 
 
760 aa  45.8  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.915615 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1575  cytochrome c oxidase, subunit II  32.5 
 
 
760 aa  45.8  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2602  cytochrome c oxidase subunit II  30.36 
 
 
315 aa  45.8  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.405519 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8116  cytochrome c oxidase subunit II  30.67 
 
 
187 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.105438  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2012  Nitrous-oxide reductase  28.89 
 
 
663 aa  45.8  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0016  cytochrome c oxidase, subunit II  28.05 
 
 
186 aa  45.8  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1826  cytochrome c oxidase subunit II  27.56 
 
 
160 aa  45.8  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00813215  normal  0.126007 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2351  nitrous-oxide reductase  35.59 
 
 
645 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0848  cytochrome c oxidase subunit II  35 
 
 
351 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6572  cytochrome c, monohaem  32.09 
 
 
352 aa  45.1  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.381109  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1588  cytochrome c oxidase, subunit II  33.93 
 
 
342 aa  44.7  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0166  cytochrome c oxidase, subunit II  33.33 
 
 
362 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.129501  normal  0.0168942 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5817  cytochrome c oxidase, subunit II  35.38 
 
 
310 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.156146  hitchhiker  0.00847969 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0446  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  34.38 
 
 
324 aa  44.7  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.112901 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1491  cytochrome c oxidase, subunit II  28.4 
 
 
190 aa  44.7  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.403979  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2402  nitrous-oxide reductase  29.36 
 
 
620 aa  44.3  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00162507  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0293  cytochrome c oxidase, subunit II  34.38 
 
 
311 aa  44.7  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.142345  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1352  cytochrome c oxidase, subunit II  28.75 
 
 
185 aa  44.7  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1358  cytochrome c oxidase, subunit II  28.4 
 
 
185 aa  44.3  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0669  cytochrome c oxidase subunit II  36.25 
 
 
279 aa  44.7  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.12333  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0222  cytochrome c oxidase, subunit II  33.33 
 
 
362 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0145699  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1803  nitrous-oxide reductase  28.7 
 
 
648 aa  44.7  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.625051  normal  0.62653 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0024  cytochrome c oxidase, subunit II  33.33 
 
 
362 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.901821 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0275  nitrous-oxide reductase  35.09 
 
 
639 aa  44.3  0.0006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.275953  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2875  hypothetical protein  28.75 
 
 
165 aa  44.3  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.902113  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2021  cytochrome c oxidase subunit II  28.57 
 
 
160 aa  44.3  0.0006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.388315  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1461  Nitrous-oxide reductase  29.36 
 
 
620 aa  44.3  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0251  nitrous-oxide reductase  35.09 
 
 
639 aa  44.3  0.0006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2797  cytochrome c oxidase, subunit II  29.41 
 
 
249 aa  44.3  0.0006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1556  Nitrous-oxide reductase  29.36 
 
 
620 aa  44.3  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.298548  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2861  nitrous-oxide reductase  35.09 
 
 
645 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.7379  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6286  cytochrome c oxidase, subunit II  31.43 
 
 
352 aa  44.3  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.257472  normal  0.0263748 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0884  cytochrome c oxidase, subunit II  26.14 
 
 
120 aa  43.9  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.555731  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0348  cytochrome c oxidase subunit II  27.16 
 
 
190 aa  43.9  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1770  nitrous-oxide reductase NosZ  32.91 
 
 
864 aa  43.9  0.0008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0440  nitrous-oxide reductase  32.91 
 
 
864 aa  43.5  0.0009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.136119  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0045  cytochrome c oxidase, subunit II  31.03 
 
 
300 aa  43.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00101143 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2313  cytochrome c oxidase, subunit II  30.26 
 
 
244 aa  43.1  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.210732  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1676  cytochrome c oxidase, subunit II  31.67 
 
 
337 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1402  cytochrome c oxidase, subunit II  26.25 
 
 
162 aa  43.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.290296  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0156  cytochrome c oxidase, subunit II  27.78 
 
 
232 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3155  cytochrome c oxidase, subunit II  29.87 
 
 
320 aa  43.5  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1600  cytochrome c oxidase, subunit II  31.67 
 
 
337 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.884566  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0062  cytochrome c oxidase, subunit II  31.58 
 
 
374 aa  43.5  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0885746  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2266  cytochrome c, monohaem  29.17 
 
 
336 aa  43.1  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.380948  normal  0.0167103 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5502  cytochrome c oxidase, subunit II  27.78 
 
 
370 aa  43.5  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.535121  normal  0.0572426 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3011  Cytochrome-c oxidase  28.74 
 
 
380 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.913445  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0803  cytochrome c oxidase, subunit II  33.33 
 
 
350 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.192306  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2406  cytochrome c oxidase, subunit II  30 
 
 
377 aa  42.7  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0563  cytochrome c oxidase subunit II  35.19 
 
 
394 aa  42.7  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0033  cytochrome c oxidase, subunit II  27.03 
 
 
279 aa  42.4  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.979273  normal  0.511366 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0254  cytochrome c oxidase subunit II  29.69 
 
 
269 aa  42.4  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00721127 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>