74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA0275 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_6008  nitrous-oxide reductase  72.23 
 
 		 639 aa  979    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.180938  normal  0.0225703 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2219  nitrous-oxide reductase  61.86 
 
 		 628 aa  835    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000181055  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1074  nitrous-oxide reductase  62.61 
 
 		 640 aa  796    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.198434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20200  nitrous-oxide reductase  60.82 
 
 		 636 aa  802    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.89249 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4219  nitrous-oxide reductase  60.4 
 
 		 652 aa  809    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.522351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1428  nitrous-oxide reductase  63.12 
 
 		 630 aa  828    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3078  nitrous-oxide reductase  61.07 
 
 		 631 aa  801    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3400  nitrous-oxide reductase  63.38 
 
 		 628 aa  832    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00206231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3319  nitrous-oxide reductase  66.04 
 
 		 644 aa  822    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0698213  normal  0.2184 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4732  nitrous-oxide reductase  61.15 
 
 		 617 aa  817    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0251  nitrous-oxide reductase  99.84 
 
 		 639 aa  1335    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1738  nitrous-oxide reductase  60.88 
 
 		 636 aa  795    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4346  nitrous-oxide reductase  92.18 
 
 		 638 aa  1201    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0394445  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3194  nitrous-oxide reductase  64.13 
 
 		 647 aa  802    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2861  nitrous-oxide reductase  77.43 
 
 		 645 aa  1056    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.7379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2351  nitrous-oxide reductase  76.36 
 
 		 645 aa  1048    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2564  nitrous-oxide reductase  59.38 
 
 		 628 aa  759    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.164032  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0428  nitrous-oxide reductase  77.43 
 
 		 649 aa  1059    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.859318  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0275  nitrous-oxide reductase  100 
 
 		 639 aa  1338    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.275953  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3142  nitrous-oxide reductase  77.31 
 
 		 648 aa  1051    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3199  nitrous-oxide reductase  49.24 
 
 		 650 aa  606  9.999999999999999e-173  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.324425  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1389  nitrous-oxide reductase  50 
 
 		 646 aa  607  9.999999999999999e-173  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2255  nitrous-oxide reductase  49.17 
 
 		 691 aa  599  1e-170  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2115  nitrous-oxide reductase  48.78 
 
 		 655 aa  600  1e-170  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.62565  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0995  nitrous-oxide reductase  48.78 
 
 		 660 aa  598  1e-169  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.599003  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2060  nitrous-oxide reductase  49.02 
 
 		 693 aa  598  1e-169  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.840269  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2325  nitrous-oxide reductase  48.85 
 
 		 690 aa  595  1e-169  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1483  nitrous-oxide reductase  46.72 
 
 		 644 aa  567  1e-160  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.150565 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4171  nitrous-oxide reductase  49.75 
 
 		 649 aa  564  1.0000000000000001e-159  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4059  nitrous-oxide reductase  49.75 
 
 		 649 aa  564  1.0000000000000001e-159  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00566192  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1368  nitrous-oxide reductase  49.59 
 
 		 646 aa  565  1.0000000000000001e-159  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.90287 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4917  nitrous-oxide reductase  47.65 
 
 		 646 aa  565  1.0000000000000001e-159  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0125108 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1139  nitrous-oxide reductase  49.92 
 
 		 646 aa  560  1e-158  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.494075 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1060  nitrous-oxide reductase  49.92 
 
 		 645 aa  558  1e-157  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.620388  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0664  nitrous-oxide reductase  47.77 
 
 		 652 aa  550  1e-155  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1165  nitrous-oxide reductase  44.13 
 
 		 699 aa  535  1e-151  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.804263  normal  0.124168 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0209  Nitrous-oxide reductase  38.93 
 
 		 632 aa  381  1e-104  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1803  nitrous-oxide reductase  35.54 
 
 		 648 aa  357  3.9999999999999996e-97  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.625051  normal  0.62653 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0244  nitrous-oxide reductase  37.5 
 
 		 647 aa  353  5.9999999999999994e-96  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.677359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1556  Nitrous-oxide reductase  36.36 
 
 		 620 aa  349  1e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.298548  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1461  Nitrous-oxide reductase  35.87 
 
 		 620 aa  348  2e-94  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2402  nitrous-oxide reductase  35.87 
 
 		 620 aa  346  6e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00162507  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2012  Nitrous-oxide reductase  30.56 
 
 		 663 aa  312  1e-83  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0440  nitrous-oxide reductase  32.14 
 
 		 864 aa  295  1e-78  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.136119  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1298  nitrous-oxide reductase  32.91 
 
 		 865 aa  293  8e-78  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.0000502464  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1770  nitrous-oxide reductase NosZ  31.07 
 
 		 864 aa  293  8e-78  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0010  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  32.22 
 
 		 863 aa  290  5.0000000000000004e-77  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0271061  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1571  cytochrome c oxidase, subunit II  33.39 
 
 		 760 aa  289  1e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.915615 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1575  cytochrome c oxidase, subunit II  33.39 
 
 		 760 aa  289  1e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0693  Nitrous-oxide reductase  32.06 
 
 		 658 aa  289  1e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.112553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1729  methyl-accepting chemotaxis protein  31.87 
 
 		 862 aa  285  1.0000000000000001e-75  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.371209  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1928  nitrous-oxide reductase  29.1 
 
 		 673 aa  258  2e-67  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0464  cytochrome c oxidase subunit II  29.59 
 
 		 266 aa  54.7  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1826  cytochrome c oxidase subunit II  29.9 
 
 		 160 aa  53.5  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00813215  normal  0.126007 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1899  cytochrome c oxidase subunit II  27.2 
 
 		 156 aa  52  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.71816  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3802  cytochrome c oxidase subunit II  29.87 
 
 		 262 aa  51.6  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1565  cytochrome c oxidase subunit II  32.63 
 
 		 155 aa  50.4  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1574  cytochrome c oxidase subunit II  32.1 
 
 		 168 aa  49.7  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0933  cytochrome c oxidase, subunit II  30.86 
 
 		 168 aa  49.7  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4180  cytochrome c oxidase, subunit II  30.95 
 
 		 314 aa  49.3  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.548982  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3756  cytochrome c oxidase subunit II  27.84 
 
 		 300 aa  48.1  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2385  cytochrome c oxidase subunit II  27.2 
 
 		 156 aa  47  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2967  cytochrome c oxidase subunit II  29.82 
 
 		 162 aa  45.8  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000376263 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2412  cytochrome c oxidase subunit II  29.79 
 
 		 171 aa  46.2  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0320  cytochrome c oxidase, subunit II  35.71 
 
 		 147 aa  45.8  0.003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4435  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I:cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  30.51 
 
 		 316 aa  45.1  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0428074  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2950  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.17 
 
 		 821 aa  44.7  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0877418  normal  0.740521 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2257  putative cytochrome c oxidase subunit  35.09 
 
 		 141 aa  43.9  0.008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0923001  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1899  cytochrome c oxidase family protein  35.09 
 
 		 141 aa  43.9  0.008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3408  cytochrome c oxidase family protein  35.09 
 
 		 141 aa  43.9  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.181168  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2296  putative cytochrome c oxidase subunit  35.09 
 
 		 141 aa  43.9  0.008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.375881  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1172  cytochrome c oxidase family protein  35.09 
 
 		 141 aa  43.9  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0182872  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2422  cytochrome c oxidase family protein  35.09 
 
 		 141 aa  43.9  0.008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1408  cytochrome c oxidase family protein  35.09 
 
 		 141 aa  43.9  0.008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0216619  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>