175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1950 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1950  cytochrome c oxidase, subunit II  100 
 
 		 158 aa  323  4.0000000000000003e-88  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1565  cytochrome c oxidase subunit II  38.85 
 
 		 155 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0464  cytochrome c oxidase subunit II  36.94 
 
 		 266 aa  112  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3756  cytochrome c oxidase subunit II  39.74 
 
 		 300 aa  108  3e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2385  cytochrome c oxidase subunit II  38.41 
 
 		 156 aa  106  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1899  cytochrome c oxidase subunit II  35.48 
 
 		 156 aa  105  3e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.71816  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0933  cytochrome c oxidase, subunit II  37.5 
 
 		 168 aa  104  4e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2967  cytochrome c oxidase subunit II  37.5 
 
 		 162 aa  104  6e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000376263 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3802  cytochrome c oxidase subunit II  33.96 
 
 		 262 aa  103  9e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1574  cytochrome c oxidase subunit II  37.5 
 
 		 168 aa  103  9e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226069  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2412  cytochrome c oxidase subunit II  36.31 
 
 		 171 aa  100  5e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0016  cytochrome c oxidase, subunit II  32.74 
 
 		 186 aa  95.9  2e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1491  cytochrome c oxidase, subunit II  33.96 
 
 		 190 aa  92.8  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.403979  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1352  cytochrome c oxidase, subunit II  33.96 
 
 		 185 aa  92.8  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1358  cytochrome c oxidase, subunit II  33.96 
 
 		 185 aa  93.6  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0348  cytochrome c oxidase subunit II  33.33 
 
 		 190 aa  93.6  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8116  cytochrome c oxidase subunit II  35.67 
 
 		 187 aa  91.3  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.105438  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5762  cytochrome c oxidase subunit II  33.55 
 
 		 195 aa  90.9  6e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.336691  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2397  cytochrome c oxidase, subunit II  31.87 
 
 		 177 aa  89.4  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3373  cytochrome c oxidase subunit II  34.39 
 
 		 172 aa  89.4  2e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.208365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4077  putative cytochrome c oxidase subunit II  31.48 
 
 		 190 aa  87.4  7e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.357197 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1402  cytochrome c oxidase, subunit II  41.41 
 
 		 162 aa  87  8e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.290296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0623  cytochrome c oxidase subunit II  29.63 
 
 		 190 aa  85.5  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.320942 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2875  hypothetical protein  32.89 
 
 		 165 aa  84.3  6e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.902113  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2021  cytochrome c oxidase subunit II  30.92 
 
 		 160 aa  81.6  0.000000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.388315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1826  cytochrome c oxidase subunit II  30.97 
 
 		 160 aa  79.3  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00813215  normal  0.126007 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0222  cytochrome c oxidase, subunit II  41.58 
 
 		 288 aa  64.3  0.0000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02212  putative cytochrome C oxidase polypeptide II oxidoreductase protein  33.73 
 
 		 125 aa  61.2  0.000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0186  cytochrome c oxidase subunit II  35.35 
 
 		 172 aa  58.2  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.721142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0320  cytochrome c oxidase, subunit II  34.65 
 
 		 147 aa  58.2  0.00000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1874  cytochrome c oxidase, subunit II  34.31 
 
 		 256 aa  57.4  0.00000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2667  cytochrome c oxidase, subunit II  32.63 
 
 		 175 aa  56.6  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00000731969  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1618  cytochrome c oxidase subunit II  34.52 
 
 		 125 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.464579 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0162  cytochrome c oxidase subunit II  38.75 
 
 		 179 aa  57  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4253  cytochrome c oxidase, subunit II  31.46 
 
 		 124 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0229  cytochrome c oxidase, subunit II  31.37 
 
 		 316 aa  56.2  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0502681  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2489  cytochrome c oxidase, subunit II  33.33 
 
 		 243 aa  55.8  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.500427  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0414  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  28.97 
 
 		 311 aa  55.5  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3660  cytochrome c oxidase subunit II  28.05 
 
 		 308 aa  54.7  0.0000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6229  cytochrome c oxidase, subunit II  31.63 
 
 		 359 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.24435  normal  0.0456922 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0166  cytochrome c oxidase, subunit II  32.65 
 
 		 362 aa  54.3  0.0000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.129501  normal  0.0168942 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0024  cytochrome c oxidase, subunit II  32.65 
 
 		 362 aa  54.3  0.0000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.901821 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0222  cytochrome c oxidase, subunit II  32.65 
 
 		 362 aa  54.3  0.0000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0145699  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0045  cytochrome c oxidase, subunit II  31 
 
 		 300 aa  53.9  0.0000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00101143 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1538  cytochrome c oxidase, subunit II  31.43 
 
 		 399 aa  53.5  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4298  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  26.25 
 
 		 304 aa  52.8  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00204319  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1244  cytochrome c oxidase, subunit II  35.29 
 
 		 211 aa  52.8  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2996  cytochrome c oxidase, subunit II  34.69 
 
 		 329 aa  52.8  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.941612  hitchhiker  0.00487692 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1211  Cytochrome-c oxidase  33.6 
 
 		 351 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.553445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1826  cytochrome c oxidase, subunit II, putative  32.71 
 
 		 408 aa  52.4  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.086817  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1348  cytochrome c, monohaem  33.65 
 
 		 426 aa  51.6  0.000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.195405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0848  cytochrome c oxidase subunit II  34.69 
 
 		 351 aa  52  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1408  cytochrome c oxidase family protein  30.61 
 
 		 141 aa  51.2  0.000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0216619  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0533  cytochrome c oxidase, subunit II  33 
 
 		 405 aa  51.2  0.000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.251737 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2422  cytochrome c oxidase family protein  30.61 
 
 		 141 aa  51.2  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0252  cytochrome c oxidase, subunit II  36.19 
 
 		 302 aa  51.6  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.433496  normal  0.0258846 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1899  cytochrome c oxidase family protein  30.61 
 
 		 141 aa  51.2  0.000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3408  cytochrome c oxidase family protein  30.61 
 
 		 141 aa  51.2  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.181168  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2797  cytochrome c oxidase, subunit II  37.5 
 
 		 249 aa  51.6  0.000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2257  putative cytochrome c oxidase subunit  30.61 
 
 		 141 aa  51.2  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0923001  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2296  putative cytochrome c oxidase subunit  30.61 
 
 		 141 aa  51.2  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.375881  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1172  cytochrome c oxidase family protein  30.61 
 
 		 141 aa  51.2  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0182872  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4435  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I:cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  28.71 
 
 		 316 aa  50.4  0.000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0428074  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1556  Nitrous-oxide reductase  30.59 
 
 		 620 aa  50.4  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.298548  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0855  cytochrome c oxidase, subunit II  33.67 
 
 		 350 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2175  cytochrome c oxidase family protein  29 
 
 		 141 aa  50.4  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.381678  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0803  cytochrome c oxidase, subunit II  33.67 
 
 		 350 aa  50.4  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.192306  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2275  cytochrome c oxidase, subunit II  28 
 
 		 337 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.869151  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2706  cytochrome c oxidase, subunit II  29.85 
 
 		 389 aa  50.1  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.363999 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0599  cytochrome c oxidase subunit II  26.74 
 
 		 124 aa  50.1  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.632482 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0851  cytochrome c oxidase, subunit II  33.67 
 
 		 350 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2792  cytochrome c oxidase, subunit II  33.63 
 
 		 330 aa  50.1  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.625738  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3795  cytochrome c oxidase subunit II  27.78 
 
 		 382 aa  49.7  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6886  cytochrome c oxidase, subunit II  30.61 
 
 		 313 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4872  cytochrome c oxidase subunit II  27.78 
 
 		 382 aa  49.7  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.780427  normal  0.052805 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5826  cytochrome c oxidase, subunit II  32.43 
 
 		 330 aa  48.9  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4180  cytochrome c oxidase, subunit II  27.55 
 
 		 314 aa  49.7  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.548982  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0046  cytochrome c oxidase, subunit II  31.68 
 
 		 301 aa  49.3  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0693  Nitrous-oxide reductase  35.53 
 
 		 658 aa  49.3  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.112553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1522  cytochrome c oxidase, subunit II  35.85 
 
 		 330 aa  49.7  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14120  cytochrome c oxidase, subunit II  36.36 
 
 		 312 aa  48.5  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0726  cytochrome c oxidase, subunit II  29.37 
 
 		 388 aa  48.9  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.631169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0956  cytochrome c oxidase, subunit II  34.67 
 
 		 280 aa  48.9  0.00003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.137087 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5130  cytochrome c oxidase subunit II  39.73 
 
 		 384 aa  48.9  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2529  caa3-type cytochrome c oxidase, subunit II  26.73 
 
 		 318 aa  48.1  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.176117  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6209  cytochrome c oxidase, subunit II  38.36 
 
 		 382 aa  48.5  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3573  cytochrome c oxidase subunit II  39.13 
 
 		 360 aa  48.5  0.00004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5936  cytochrome c oxidase subunit II  38.36 
 
 		 382 aa  48.5  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1600  cytochrome c oxidase, subunit II  27 
 
 		 337 aa  48.1  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.884566  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1461  Nitrous-oxide reductase  30.59 
 
 		 620 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1676  cytochrome c oxidase, subunit II  27 
 
 		 337 aa  48.1  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3632  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I  34.62 
 
 		 444 aa  47.8  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2712  cytochrome c oxidase, subunit II  30.23 
 
 		 180 aa  47.8  0.00006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.925486  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3955  cytochrome c oxidase subunit II  31.58 
 
 		 391 aa  47.8  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.113374 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0828  cytochrome c oxidase, subunit II  31.68 
 
 		 321 aa  47.8  0.00006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.304556 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2402  nitrous-oxide reductase  29.41 
 
 		 620 aa  47.4  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00162507  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2474  cytochrome c oxidase, subunit II  35.82 
 
 		 273 aa  47.4  0.00007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.850241  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2345  cytochrome c oxidase subunit II  37.88 
 
 		 271 aa  47.8  0.00007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.215159  normal  0.967701 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1564  cytochrome C oxidase polypeptide II  28.57 
 
 		 384 aa  47.4  0.00009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0183  cytochrome c oxidase subunit II  32.11 
 
 		 143 aa  47.4  0.00009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.13824 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>