148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_0348 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_0348  cytochrome c oxidase subunit II  100 
 
 		 190 aa  396  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0623  cytochrome c oxidase subunit II  83.16 
 
 		 190 aa  340  7e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.320942 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4077  putative cytochrome c oxidase subunit II  82.63 
 
 		 190 aa  338  2e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.357197 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1491  cytochrome c oxidase, subunit II  64.55 
 
 		 190 aa  273  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.403979  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1352  cytochrome c oxidase, subunit II  65.57 
 
 		 185 aa  268  2.9999999999999997e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1358  cytochrome c oxidase, subunit II  65.57 
 
 		 185 aa  268  2.9999999999999997e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5762  cytochrome c oxidase subunit II  62.57 
 
 		 195 aa  263  8.999999999999999e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.336691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1402  cytochrome c oxidase, subunit II  71.6 
 
 		 162 aa  258  3e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.290296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2875  hypothetical protein  66.87 
 
 		 165 aa  250  8.000000000000001e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.902113  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8116  cytochrome c oxidase subunit II  54.19 
 
 		 187 aa  227  8e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.105438  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2397  cytochrome c oxidase, subunit II  39.52 
 
 		 177 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1899  cytochrome c oxidase subunit II  33.77 
 
 		 156 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.71816  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2385  cytochrome c oxidase subunit II  33.12 
 
 		 156 aa  108  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2412  cytochrome c oxidase subunit II  32.48 
 
 		 171 aa  96.3  2e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0016  cytochrome c oxidase, subunit II  34.52 
 
 		 186 aa  94  1e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1950  cytochrome c oxidase, subunit II  33.33 
 
 		 158 aa  93.6  2e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0933  cytochrome c oxidase, subunit II  34 
 
 		 168 aa  91.3  9e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1574  cytochrome c oxidase subunit II  32 
 
 		 168 aa  90.5  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226069  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3756  cytochrome c oxidase subunit II  31.85 
 
 		 300 aa  89.7  3e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0464  cytochrome c oxidase subunit II  31.85 
 
 		 266 aa  88.2  6e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3373  cytochrome c oxidase subunit II  31.76 
 
 		 172 aa  88.6  6e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.208365  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1826  cytochrome c oxidase subunit II  30.77 
 
 		 160 aa  87.8  8e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00813215  normal  0.126007 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2967  cytochrome c oxidase subunit II  32 
 
 		 162 aa  87.4  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000376263 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3802  cytochrome c oxidase subunit II  30.92 
 
 		 262 aa  84.7  8e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1565  cytochrome c oxidase subunit II  28.57 
 
 		 155 aa  83.2  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2021  cytochrome c oxidase subunit II  29.19 
 
 		 160 aa  78.2  0.00000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.388315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1874  cytochrome c oxidase, subunit II  32.93 
 
 		 256 aa  58.9  0.00000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0533  cytochrome c oxidase, subunit II  37.18 
 
 		 405 aa  57.4  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.251737 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1674  cytochrome c oxidase, subunit II  29.03 
 
 		 380 aa  53.1  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0156  cytochrome c oxidase, subunit II  31.82 
 
 		 232 aa  52.4  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2249  cytochrome c oxidase, subunit II  25.32 
 
 		 329 aa  52  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0264  cytochrome c oxidase, subunit II  35.37 
 
 		 343 aa  52  0.000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.138079  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0320  cytochrome c oxidase, subunit II  27.78 
 
 		 147 aa  51.6  0.000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0186  cytochrome c oxidase subunit II  34.29 
 
 		 172 aa  51.2  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.721142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0956  cytochrome c oxidase, subunit II  28.04 
 
 		 280 aa  50.8  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.137087 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3117  cytochrome c oxidase, subunit II  32.1 
 
 		 316 aa  50.1  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.762727  normal  0.80653 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0036  cytochrome c oxidase, subunit II  31.11 
 
 		 378 aa  49.7  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2712  cytochrome c oxidase, subunit II  30 
 
 		 180 aa  50.1  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.925486  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0310  cytochrome c oxidase, subunit II  31.4 
 
 		 320 aa  50.1  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0572725 
 
 
-
 
NC_003296  RS02212  putative cytochrome C oxidase polypeptide II oxidoreductase protein  28.24 
 
 		 125 aa  49.7  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2670  cytochrome c oxidase, subunit II  31.03 
 
 		 265 aa  49.7  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0983455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1380  cytochrome c oxidase, subunit II  31.03 
 
 		 389 aa  49.3  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.459391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3181  putative cytochrome C oxidase polypeptide II precursor  34.62 
 
 		 398 aa  49.7  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.8149  normal  0.584186 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3573  cytochrome c oxidase subunit II  29.45 
 
 		 360 aa  48.9  0.00004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2489  cytochrome c oxidase, subunit II  25.81 
 
 		 243 aa  48.9  0.00004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.500427  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3818  cytochrome c oxidase, subunit II  34.48 
 
 		 388 aa  48.9  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.198752 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2667  cytochrome c oxidase, subunit II  31.08 
 
 		 175 aa  48.9  0.00005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00000731969  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4253  cytochrome c oxidase, subunit II  29.27 
 
 		 124 aa  48.5  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2263  cytochrome c oxidase, subunit II  24.62 
 
 		 367 aa  48.5  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0175262  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2962  cytochrome c oxidase, subunit II  32.05 
 
 		 401 aa  48.1  0.00008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2811  cytochrome c oxidase, subunit II  32.05 
 
 		 401 aa  48.1  0.00008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2406  cytochrome c oxidase, subunit II  30.23 
 
 		 377 aa  47.8  0.00009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1245  cytochrome c oxidase, subunit II  35.62 
 
 		 400 aa  48.1  0.00009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.731852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4180  cytochrome c oxidase, subunit II  27.59 
 
 		 314 aa  47.4  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.548982  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2797  cytochrome c oxidase, subunit II  22.7 
 
 		 249 aa  47.4  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3558  cytochrome c oxidase subunit II  24 
 
 		 370 aa  47.4  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.22857 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1936  cytochrome c oxidase subunit II  36.96 
 
 		 243 aa  47.4  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.244228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04019  cytochrome c oxidase, subunit II  34.62 
 
 		 308 aa  47  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0162  cytochrome c oxidase subunit II  25.64 
 
 		 179 aa  47.8  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1754  cytochrome c oxidase subunit II  36.84 
 
 		 275 aa  46.6  0.0002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.636353  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3907  cytochrome c oxidase, subunit II  32.5 
 
 		 390 aa  46.6  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1667  cytochrome c oxidase, subunit II  30.12 
 
 		 287 aa  46.6  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.23675 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2167  cytochrome c oxidase, subunit II  30.3 
 
 		 316 aa  47  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.238577  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3078  cytochrome c oxidase, subunit II  32.89 
 
 		 260 aa  47  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000302907  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1618  cytochrome c oxidase subunit II  27.37 
 
 		 125 aa  47  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.464579 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1824  cytochrome c oxidase subunit II  30.95 
 
 		 257 aa  46.6  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2971  cytochrome c oxidase, subunit II  27.91 
 
 		 176 aa  46.2  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000000297195  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06421  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  32.35 
 
 		 274 aa  46.2  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0878998 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0414  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  30.86 
 
 		 311 aa  45.8  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1708  cytochrome c oxidase subunit II  31.03 
 
 		 320 aa  46.2  0.0003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4128  cytochrome c oxidase subunit II  24.22 
 
 		 269 aa  46.2  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4392  cytochrome c oxidase, subunit II  28.74 
 
 		 392 aa  46.2  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1408  cytochrome c oxidase family protein  28.4 
 
 		 141 aa  45.8  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0216619  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2422  cytochrome c oxidase family protein  28.4 
 
 		 141 aa  45.8  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2529  caa3-type cytochrome c oxidase, subunit II  27.36 
 
 		 318 aa  45.8  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.176117  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0621  cytochrome c oxidase, subunit II  30.23 
 
 		 255 aa  45.4  0.0004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  decreased coverage  0.0000000345466  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2860  cytochrome c oxidase, subunit II  28.74 
 
 		 389 aa  45.8  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.699909  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0878  cytochrome c oxidase, subunit II  35.62 
 
 		 401 aa  45.8  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3537  cytochrome c oxidase, subunit II  28.74 
 
 		 389 aa  45.8  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0700115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1899  cytochrome c oxidase family protein  28.4 
 
 		 141 aa  45.8  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3408  cytochrome c oxidase family protein  28.4 
 
 		 141 aa  45.8  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.181168  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2257  putative cytochrome c oxidase subunit  28.4 
 
 		 141 aa  45.8  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0923001  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2296  putative cytochrome c oxidase subunit  28.4 
 
 		 141 aa  45.8  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.375881  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1172  cytochrome c oxidase family protein  28.4 
 
 		 141 aa  45.8  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0182872  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3892  cytochrome c oxidase subunit II  30.23 
 
 		 345 aa  45.8  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.740774  normal  0.178097 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01475  chain II protein of putative cytochrome c oxidase  34.67 
 
 		 234 aa  45.8  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0761  cytochrome c oxidase subunit II  27.27 
 
 		 146 aa  45.4  0.0005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.254887  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0879  cytochrome c oxidase, subunit II  31.87 
 
 		 373 aa  45.4  0.0005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0229  cytochrome c oxidase, subunit II  31.71 
 
 		 316 aa  45.4  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0502681  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7362  cytochrome c oxidase, subunit II  25.41 
 
 		 394 aa  45.1  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.674364 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1680  cytochrome c oxidase, subunit II  32.88 
 
 		 402 aa  45.1  0.0006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.450721  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14120  cytochrome c oxidase, subunit II  27.91 
 
 		 312 aa  45.1  0.0006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0300  cytochrome c oxidase, subunit II  26.14 
 
 		 254 aa  45.1  0.0007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01290  cytochrome c oxidase, subunit II  33.33 
 
 		 374 aa  44.7  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.46157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1348  cytochrome c, monohaem  33.75 
 
 		 426 aa  44.7  0.0007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.195405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2706  cytochrome c oxidase, subunit II  29.63 
 
 		 389 aa  44.7  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.363999 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1903  cytochrome c oxidase, subunit II  26.36 
 
 		 344 aa  44.7  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01020  cytochrome c oxidase, subunit II  30.3 
 
 		 385 aa  44.7  0.0008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.24737  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3668  cytochrome-c oxidase  30.17 
 
 		 378 aa  44.7  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.253259  normal  0.882679 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0180  cytochrome c oxidase subunit II  33.33 
 
 		 366 aa  44.7  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>