More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_3756 on replicon NC_013923
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013923  Nmag_3756  cytochrome c oxidase subunit II  100 
 
 
300 aa  589  1e-167  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3802  cytochrome c oxidase subunit II  65.78 
 
 
262 aa  338  8e-92  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0464  cytochrome c oxidase subunit II  60.47 
 
 
266 aa  308  6.999999999999999e-83  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2412  cytochrome c oxidase subunit II  60.49 
 
 
171 aa  216  4e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3373  cytochrome c oxidase subunit II  51.79 
 
 
172 aa  179  7e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.208365  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1565  cytochrome c oxidase subunit II  39.35 
 
 
155 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1899  cytochrome c oxidase subunit II  38.89 
 
 
156 aa  132  5e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.71816  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2385  cytochrome c oxidase subunit II  40.62 
 
 
156 aa  132  6.999999999999999e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0933  cytochrome c oxidase, subunit II  40.38 
 
 
168 aa  128  9.000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1574  cytochrome c oxidase subunit II  39.1 
 
 
168 aa  127  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226069  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2967  cytochrome c oxidase subunit II  35.95 
 
 
162 aa  118  9.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000376263 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1826  cytochrome c oxidase subunit II  41.29 
 
 
160 aa  117  1.9999999999999998e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00813215  normal  0.126007 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2021  cytochrome c oxidase subunit II  41.03 
 
 
160 aa  113  5e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.388315  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1950  cytochrome c oxidase, subunit II  39.24 
 
 
158 aa  108  9.000000000000001e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0016  cytochrome c oxidase, subunit II  34.81 
 
 
186 aa  105  6e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1358  cytochrome c oxidase, subunit II  34.18 
 
 
185 aa  102  9e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1491  cytochrome c oxidase, subunit II  34.59 
 
 
190 aa  100  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.403979  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1352  cytochrome c oxidase, subunit II  34.59 
 
 
185 aa  100  4e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5762  cytochrome c oxidase subunit II  33.53 
 
 
195 aa  97.8  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.336691  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4077  putative cytochrome c oxidase subunit II  32.48 
 
 
190 aa  94  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.357197 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8116  cytochrome c oxidase subunit II  34.34 
 
 
187 aa  93.6  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.105438  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0623  cytochrome c oxidase subunit II  31.85 
 
 
190 aa  91.7  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.320942 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2875  hypothetical protein  34.87 
 
 
165 aa  91.3  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.902113  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0348  cytochrome c oxidase subunit II  31.85 
 
 
190 aa  89  9e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1402  cytochrome c oxidase, subunit II  32 
 
 
162 aa  87  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.290296  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2397  cytochrome c oxidase, subunit II  28.12 
 
 
177 aa  81.3  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1874  cytochrome c oxidase, subunit II  42.55 
 
 
256 aa  72  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0848  cytochrome c oxidase subunit II  28.9 
 
 
351 aa  71.2  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0855  cytochrome c oxidase, subunit II  40.26 
 
 
350 aa  68.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0803  cytochrome c oxidase, subunit II  40.26 
 
 
350 aa  68.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.192306  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0851  cytochrome c oxidase, subunit II  40.26 
 
 
350 aa  68.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0162  cytochrome c oxidase subunit II  27.44 
 
 
179 aa  65.9  0.0000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2862  cytochrome c oxidase subunit II  33.33 
 
 
272 aa  65.1  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0315403 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2797  cytochrome c oxidase, subunit II  36.71 
 
 
249 aa  65.5  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2167  cytochrome c oxidase, subunit II  35.16 
 
 
316 aa  64.3  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.238577  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06272  cytochrome c oxidase, subunit II  40.74 
 
 
405 aa  64.3  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0180  cytochrome c oxidase subunit II  41.98 
 
 
366 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3991  cytochrome c oxidase, subunit II  39.51 
 
 
513 aa  63.9  0.000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2706  cytochrome c oxidase, subunit II  35.64 
 
 
389 aa  63.9  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.363999 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0320  cytochrome c oxidase, subunit II  36.49 
 
 
147 aa  63.5  0.000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01290  cytochrome c oxidase, subunit II  41.98 
 
 
374 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.46157  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3791  cytochrome c oxidase, subunit II  39.51 
 
 
513 aa  63.5  0.000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0414  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  34.18 
 
 
311 aa  63.2  0.000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2962  cytochrome c oxidase, subunit II  39.51 
 
 
401 aa  63.2  0.000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2811  cytochrome c oxidase, subunit II  39.51 
 
 
401 aa  63.2  0.000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3864  cytochrome c oxidase, subunit II  39.51 
 
 
513 aa  62.8  0.000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3782  cytochrome c oxidase, subunit II  39.51 
 
 
512 aa  62.4  0.000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0154  cytochrome c oxidase, subunit II  38.27 
 
 
518 aa  62  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4180  cytochrome c oxidase, subunit II  38.27 
 
 
518 aa  61.2  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4112  cytochrome c oxidase, subunit II  38.27 
 
 
518 aa  61.2  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001445  cytochrome c oxidase polypeptide II  39.51 
 
 
356 aa  61.6  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.633895  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0229  cytochrome c oxidase, subunit II  36.56 
 
 
316 aa  61.6  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0502681  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2712  cytochrome c oxidase, subunit II  38.55 
 
 
180 aa  60.8  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.925486  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1522  cytochrome c oxidase, subunit II  38.96 
 
 
330 aa  60.5  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3483  cytochrome c oxidase, subunit II  32.61 
 
 
520 aa  60.5  0.00000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.243767 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1826  cytochrome c oxidase, subunit II, putative  29.73 
 
 
408 aa  60.1  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.086817  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4311  cytochrome c oxidase, subunit II  37.04 
 
 
518 aa  60.1  0.00000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.997623  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0125  cytochrome c oxidase, subunit II  38.27 
 
 
521 aa  59.3  0.00000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2489  cytochrome c oxidase, subunit II  34.18 
 
 
243 aa  59.3  0.00000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.500427  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1471  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I:cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  36.27 
 
 
401 aa  58.5  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0294  cytochrome c oxidase subunit II  34.41 
 
 
408 aa  58.5  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00251297  hitchhiker  0.000594912 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0117  cytochrome c oxidase, subunit II  33.06 
 
 
375 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0102376 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0533  cytochrome c oxidase, subunit II  31.62 
 
 
405 aa  58.9  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.251737 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0103  cytochrome c oxidase, subunit II  32.26 
 
 
375 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.193198 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4606  cytochrome c oxidase, subunit II  37.04 
 
 
513 aa  58.2  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4435  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I:cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  35.53 
 
 
316 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0428074  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3999  cytochrome c oxidase subunit II  37.04 
 
 
524 aa  58.2  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2406  cytochrome c oxidase, subunit II  36.46 
 
 
377 aa  57.8  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0079  cytochrome c oxidase, subunit II  37.36 
 
 
375 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0599  cytochrome c oxidase subunit II  30.95 
 
 
124 aa  57.4  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.632482 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0119  cytochrome c oxidase, subunit II  36.26 
 
 
375 aa  57  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0518  cytochrome c oxidase subunit II  36.71 
 
 
294 aa  57  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2345  cytochrome c oxidase subunit II  36.25 
 
 
271 aa  56.6  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.215159  normal  0.967701 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0252  cytochrome c oxidase, subunit II  30.51 
 
 
302 aa  57  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.433496  normal  0.0258846 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0036  cytochrome c oxidase, subunit II  37.97 
 
 
378 aa  56.6  0.0000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2234  cytochrome-c oxidase  37.39 
 
 
292 aa  57  0.0000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00748725 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0122  cytochrome c oxidase, subunit II  36.26 
 
 
375 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.946881 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0236  cytochrome c oxidase, subunit II  35.37 
 
 
519 aa  56.6  0.0000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.717105  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0258  cytochrome c oxidase, subunit II  38.27 
 
 
528 aa  56.6  0.0000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0761  cytochrome c oxidase subunit II  34.25 
 
 
146 aa  56.2  0.0000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.254887  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0264  cytochrome c oxidase, subunit II  40.51 
 
 
343 aa  56.2  0.0000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.138079  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2249  cytochrome c oxidase, subunit II  38.96 
 
 
329 aa  56.2  0.0000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0741  cytochrome c oxidase, subunit II  31.43 
 
 
287 aa  55.8  0.0000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3558  cytochrome c oxidase subunit II  27.32 
 
 
370 aa  55.8  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.22857 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0437  cytochrome c oxidase, subunit II  32.91 
 
 
267 aa  55.8  0.0000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0468935 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04019  cytochrome c oxidase, subunit II  34.18 
 
 
308 aa  55.8  0.0000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3047  cytochrome c oxidase, subunit II  31.13 
 
 
281 aa  55.8  0.0000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000013174  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02212  putative cytochrome C oxidase polypeptide II oxidoreductase protein  29.35 
 
 
125 aa  55.1  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2263  cytochrome c oxidase, subunit II  27.87 
 
 
367 aa  55.5  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0175262  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0785  cytochrome c oxidase, subunit II  37.93 
 
 
258 aa  55.5  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.358332  normal  0.86718 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3573  cytochrome c oxidase subunit II  33.08 
 
 
360 aa  55.5  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4506  cytochrome c oxidase, subunit II  37.04 
 
 
304 aa  55.5  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.578189 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3892  cytochrome c oxidase subunit II  32.91 
 
 
345 aa  55.5  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.740774  normal  0.178097 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1449  cytochrome c oxidase, subunit II  34.48 
 
 
346 aa  55.5  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.015711 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4180  cytochrome c oxidase, subunit II  34.21 
 
 
314 aa  55.5  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.548982  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0293  cytochrome c oxidase, subunit II  41.77 
 
 
311 aa  55.5  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.142345  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0467  cytochrome c oxidase, subunit II  34.44 
 
 
284 aa  54.3  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.870117  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0198  cytochrome-c oxidase  37.04 
 
 
524 aa  54.7  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0142  cytochrome c oxidase, subunit II  35 
 
 
374 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2670  cytochrome c oxidase, subunit II  38.75 
 
 
265 aa  54.7  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0983455  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>