65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1928 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1928  nitrous-oxide reductase  100 
 
 		 673 aa  1384    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2012  Nitrous-oxide reductase  50.37 
 
 		 663 aa  622  1e-177  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1571  cytochrome c oxidase, subunit II  46.93 
 
 		 760 aa  573  1.0000000000000001e-162  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.915615 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1575  cytochrome c oxidase, subunit II  46.93 
 
 		 760 aa  573  1.0000000000000001e-162  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0010  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  44.9 
 
 		 863 aa  569  1e-161  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0271061  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1729  methyl-accepting chemotaxis protein  46.32 
 
 		 862 aa  565  1.0000000000000001e-159  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.371209  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0440  nitrous-oxide reductase  46.72 
 
 		 864 aa  560  1e-158  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.136119  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1298  nitrous-oxide reductase  45.5 
 
 		 865 aa  553  1e-156  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.0000502464  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1770  nitrous-oxide reductase NosZ  44.22 
 
 		 864 aa  544  1e-153  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1803  nitrous-oxide reductase  40.63 
 
 		 648 aa  435  1e-120  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.625051  normal  0.62653 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1461  Nitrous-oxide reductase  38.08 
 
 		 620 aa  411  1e-113  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1556  Nitrous-oxide reductase  38.08 
 
 		 620 aa  411  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.298548  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2402  nitrous-oxide reductase  38.24 
 
 		 620 aa  410  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00162507  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0209  Nitrous-oxide reductase  38.33 
 
 		 632 aa  411  1e-113  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0244  nitrous-oxide reductase  37.87 
 
 		 647 aa  402  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.677359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0693  Nitrous-oxide reductase  36.77 
 
 		 658 aa  377  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.112553  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1165  nitrous-oxide reductase  31.19 
 
 		 699 aa  310  5e-83  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.804263  normal  0.124168 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4732  nitrous-oxide reductase  30.93 
 
 		 617 aa  286  1.0000000000000001e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3199  nitrous-oxide reductase  32.61 
 
 		 650 aa  284  4.0000000000000003e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.324425  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3400  nitrous-oxide reductase  30.5 
 
 		 628 aa  280  9e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00206231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3078  nitrous-oxide reductase  31.46 
 
 		 631 aa  279  1e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2351  nitrous-oxide reductase  31.4 
 
 		 645 aa  276  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2219  nitrous-oxide reductase  30.68 
 
 		 628 aa  274  4.0000000000000004e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000181055  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1389  nitrous-oxide reductase  32.13 
 
 		 646 aa  274  4.0000000000000004e-72  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2564  nitrous-oxide reductase  31.45 
 
 		 628 aa  273  6e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.164032  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20200  nitrous-oxide reductase  31.3 
 
 		 636 aa  273  7e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.89249 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2861  nitrous-oxide reductase  31.35 
 
 		 645 aa  273  7e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.7379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2325  nitrous-oxide reductase  32.23 
 
 		 690 aa  273  1e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6008  nitrous-oxide reductase  31.7 
 
 		 639 aa  272  2e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.180938  normal  0.0225703 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3142  nitrous-oxide reductase  31.11 
 
 		 648 aa  271  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1738  nitrous-oxide reductase  31.11 
 
 		 636 aa  271  4e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2060  nitrous-oxide reductase  31.82 
 
 		 693 aa  270  5e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.840269  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2255  nitrous-oxide reductase  31.82 
 
 		 691 aa  270  5e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2115  nitrous-oxide reductase  31.82 
 
 		 655 aa  270  5.9999999999999995e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.62565  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0428  nitrous-oxide reductase  31.01 
 
 		 649 aa  270  5.9999999999999995e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.859318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1483  nitrous-oxide reductase  32.6 
 
 		 644 aa  270  7e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.150565 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1139  nitrous-oxide reductase  34.06 
 
 		 646 aa  269  1e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.494075 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0995  nitrous-oxide reductase  31.66 
 
 		 660 aa  268  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.599003  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1060  nitrous-oxide reductase  33.75 
 
 		 645 aa  265  2e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.620388  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4346  nitrous-oxide reductase  30.65 
 
 		 638 aa  263  8e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0394445  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1074  nitrous-oxide reductase  30.83 
 
 		 640 aa  257  5e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.198434  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4171  nitrous-oxide reductase  31.22 
 
 		 649 aa  256  8e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4059  nitrous-oxide reductase  31.22 
 
 		 649 aa  256  8e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00566192  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1368  nitrous-oxide reductase  31.38 
 
 		 646 aa  256  1.0000000000000001e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.90287 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0275  nitrous-oxide reductase  30.57 
 
 		 639 aa  256  1.0000000000000001e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.275953  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4917  nitrous-oxide reductase  32.76 
 
 		 646 aa  255  2.0000000000000002e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0125108 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1428  nitrous-oxide reductase  29.83 
 
 		 630 aa  254  3e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0251  nitrous-oxide reductase  30.41 
 
 		 639 aa  253  6e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4219  nitrous-oxide reductase  30.71 
 
 		 652 aa  247  4.9999999999999997e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.522351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0664  nitrous-oxide reductase  31.1 
 
 		 652 aa  243  7.999999999999999e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3319  nitrous-oxide reductase  29.7 
 
 		 644 aa  241  5e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0698213  normal  0.2184 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3194  nitrous-oxide reductase  28.73 
 
 		 647 aa  231  2e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1588  cytochrome c oxidase, subunit II  27.62 
 
 		 342 aa  50.1  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2021  cytochrome c oxidase subunit II  34.57 
 
 		 160 aa  48.9  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.388315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4180  cytochrome c oxidase, subunit II  36.76 
 
 		 314 aa  47.8  0.0007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.548982  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0803  cytochrome c oxidase, subunit II  33.33 
 
 		 350 aa  47.4  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.192306  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0851  cytochrome c oxidase, subunit II  33.33 
 
 		 350 aa  47  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0855  cytochrome c oxidase, subunit II  33.33 
 
 		 350 aa  47  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1950  cytochrome c oxidase, subunit II  34.94 
 
 		 158 aa  45.1  0.004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0162  cytochrome c oxidase subunit II  37.35 
 
 		 179 aa  45.1  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1574  cytochrome c oxidase subunit II  35.94 
 
 		 168 aa  44.7  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226069  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02212  putative cytochrome C oxidase polypeptide II oxidoreductase protein  34.15 
 
 		 125 aa  44.3  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2249  cytochrome c oxidase, subunit II  40 
 
 		 329 aa  44.3  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0320  cytochrome c oxidase, subunit II  26.61 
 
 		 147 aa  43.9  0.009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3573  cytochrome c oxidase subunit II  35.09 
 
 		 360 aa  43.9  0.009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>