270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0884 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_0884  cytochrome c oxidase, subunit II  100 
 
 
120 aa  249  6e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.555731  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02212  putative cytochrome C oxidase polypeptide II oxidoreductase protein  35.23 
 
 
125 aa  64.7  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0599  cytochrome c oxidase subunit II  34.41 
 
 
124 aa  63.2  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.632482 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2345  cytochrome c oxidase subunit II  40.54 
 
 
271 aa  61.2  0.000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.215159  normal  0.967701 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3892  cytochrome c oxidase subunit II  30.23 
 
 
345 aa  58.2  0.00000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.740774  normal  0.178097 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0414  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  29.9 
 
 
311 aa  58.2  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04431  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  38.67 
 
 
291 aa  57.4  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0608  cytochrome c oxidase subunit II  33.98 
 
 
276 aa  57  0.00000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2594  cytochrome c oxidase subunit II  38.46 
 
 
272 aa  57  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0132206  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2425  cytochrome c oxidase subunit II  38.16 
 
 
314 aa  57  0.00000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.408327 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2275  cytochrome c oxidase, subunit II  27.05 
 
 
337 aa  56.6  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.869151  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1588  cytochrome c oxidase, subunit II  39.44 
 
 
342 aa  55.8  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1754  cytochrome c oxidase subunit II  34.65 
 
 
275 aa  55.8  0.0000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.636353  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05081  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  32.41 
 
 
267 aa  55.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.189517  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1676  cytochrome c oxidase, subunit II  27.05 
 
 
337 aa  55.1  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3117  cytochrome c oxidase, subunit II  31.31 
 
 
316 aa  55.5  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.762727  normal  0.80653 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1777  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  34.02 
 
 
270 aa  55.1  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1600  cytochrome c oxidase, subunit II  27.05 
 
 
337 aa  55.1  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.884566  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05001  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  34.02 
 
 
270 aa  54.7  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.715952  normal  0.110072 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2021  cytochrome c oxidase subunit II  35.9 
 
 
160 aa  54.3  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.388315  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06421  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  30.69 
 
 
274 aa  54.3  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0878998 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2967  cytochrome c oxidase subunit II  36.71 
 
 
162 aa  54.3  0.0000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000376263 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0445  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  32.11 
 
 
267 aa  54.3  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5130  cytochrome c oxidase subunit II  36.76 
 
 
384 aa  54.3  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5948  cytochrome c oxidase, subunit II  29.91 
 
 
318 aa  54.3  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12220  cytochrome c oxidase, subunit II  37.31 
 
 
286 aa  54.3  0.0000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0561533  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1618  cytochrome c oxidase subunit II  29.91 
 
 
125 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.464579 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2268  cytochrome c oxidase subunit II  36.84 
 
 
272 aa  53.9  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.130236  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0528  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  40.79 
 
 
355 aa  53.5  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0096  cytochrome c oxidase, subunit II  36.36 
 
 
334 aa  53.5  0.0000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.296292  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3558  cytochrome c oxidase subunit II  27.48 
 
 
370 aa  53.5  0.0000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.22857 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05011  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  32.11 
 
 
267 aa  53.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4253  cytochrome c oxidase, subunit II  30.53 
 
 
124 aa  53.5  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04701  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  32.11 
 
 
267 aa  53.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1801  cytochrome c oxidase subunit II  35.06 
 
 
288 aa  52.8  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.191358 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11170  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit II  25.38 
 
 
315 aa  53.5  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.761021  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1165  nitrous-oxide reductase  33.68 
 
 
699 aa  52.4  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.804263  normal  0.124168 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1899  cytochrome c oxidase subunit II  33.71 
 
 
156 aa  52  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.71816  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3573  cytochrome c oxidase subunit II  36 
 
 
360 aa  52.4  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2385  cytochrome c oxidase subunit II  35.96 
 
 
156 aa  52.4  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1903  cytochrome c oxidase, subunit II  35 
 
 
344 aa  52.4  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4435  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I:cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  36.62 
 
 
316 aa  52  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0428074  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2263  cytochrome c oxidase, subunit II  26.72 
 
 
367 aa  52  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0175262  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2474  cytochrome c oxidase, subunit II  35.21 
 
 
273 aa  51.6  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.850241  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2358  cytochrome c oxidase subunit II  36.76 
 
 
280 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.382023  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3898  cytochrome c oxidase subunit II  36.76 
 
 
285 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2602  cytochrome c oxidase subunit II  35.29 
 
 
315 aa  50.8  0.000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.405519 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1449  cytochrome c oxidase, subunit II  31.52 
 
 
346 aa  50.8  0.000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.015711 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1574  cytochrome c oxidase subunit II  34.25 
 
 
168 aa  50.8  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226069  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3632  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I  34.67 
 
 
444 aa  50.4  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2862  cytochrome c oxidase subunit II  27.5 
 
 
272 aa  50.4  0.000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0315403 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2991  cytochrome c oxidase, subunit II  36.36 
 
 
338 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.336386  normal  0.0255364 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0726  cytochrome c oxidase, subunit II  35.29 
 
 
388 aa  49.7  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.631169  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1667  cytochrome c oxidase, subunit II  34.85 
 
 
287 aa  50.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.23675 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16250  cytochrome c oxidase, subunit II  39.06 
 
 
304 aa  50.1  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.178752  normal  0.538576 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1522  cytochrome c oxidase, subunit II  35.71 
 
 
330 aa  49.7  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2217  cytochrome c oxidase, subunit II  38.46 
 
 
290 aa  50.1  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.120292  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0254  cytochrome c oxidase subunit II  35.21 
 
 
269 aa  49.7  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00721127 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0828  cytochrome c oxidase, subunit II  32.05 
 
 
321 aa  49.3  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.304556 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0584  cytochrome c oxidase, subunit II  37.84 
 
 
320 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2026  cytochrome c oxidase, subunit II  32.53 
 
 
346 aa  48.9  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000905775 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0697  cytochrome c oxidase, subunit II  27.1 
 
 
322 aa  48.9  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3139  cytochrome c oxidase subunit II  29.09 
 
 
316 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2996  cytochrome c oxidase, subunit II  37.5 
 
 
329 aa  48.9  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.941612  hitchhiker  0.00487692 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5762  cytochrome c oxidase subunit II  27.66 
 
 
195 aa  49.3  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.336691  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0567  cytochrome c oxidase, subunit II  37.84 
 
 
320 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0222  cytochrome c oxidase, subunit II  34.25 
 
 
288 aa  48.5  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2347  cytochrome c oxidase, subunit II  34.52 
 
 
334 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5936  cytochrome c oxidase subunit II  33.33 
 
 
382 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1244  cytochrome c oxidase, subunit II  32.05 
 
 
211 aa  48.5  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3958  cytochrome c oxidase, subunit II  32.88 
 
 
336 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1954  cytochrome c oxidase, subunit II  36.92 
 
 
290 aa  48.5  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000330547 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1405  cytochrome-c oxidase  32 
 
 
343 aa  48.9  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0686645  normal  0.926821 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6209  cytochrome c oxidase, subunit II  33.33 
 
 
382 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1564  cytochrome C oxidase polypeptide II  34.62 
 
 
384 aa  48.1  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1767  cytochrome c oxidase, subunit II  36 
 
 
352 aa  48.1  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.204958  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0933  cytochrome c oxidase, subunit II  30.67 
 
 
168 aa  48.1  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0464  cytochrome c oxidase subunit II  30.68 
 
 
266 aa  48.1  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1826  cytochrome c oxidase subunit II  30.77 
 
 
160 aa  48.1  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00813215  normal  0.126007 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1368  nitrous-oxide reductase  33.77 
 
 
646 aa  47.8  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.90287 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0186  cytochrome c oxidase subunit II  24.81 
 
 
172 aa  47.8  0.00005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.721142  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2706  cytochrome c oxidase, subunit II  36.36 
 
 
389 aa  47.8  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.363999 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4298  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  34.55 
 
 
304 aa  47.8  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00204319  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7362  cytochrome c oxidase, subunit II  33.33 
 
 
394 aa  47.8  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.674364 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3150  cytochrome c oxidase, subunit II  34.67 
 
 
340 aa  47.8  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6886  cytochrome c oxidase, subunit II  29.9 
 
 
313 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0467  cytochrome c oxidase, subunit II  32 
 
 
284 aa  47.4  0.00006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.870117  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0229  cytochrome c oxidase, subunit II  34.33 
 
 
316 aa  47.4  0.00006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0502681  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1453  cytochrome c oxidase, subunit II  36.76 
 
 
299 aa  47.4  0.00006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0600133  normal  0.252589 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1824  cytochrome c oxidase subunit II  30.19 
 
 
257 aa  47.4  0.00006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4872  cytochrome c oxidase subunit II  33.33 
 
 
382 aa  47.4  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.780427  normal  0.052805 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3795  cytochrome c oxidase subunit II  33.33 
 
 
382 aa  47.4  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3259  Cytochrome c oxidase subunit II  33.85 
 
 
324 aa  47  0.00008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0696554 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0156  cytochrome c oxidase, subunit II  34.15 
 
 
232 aa  47  0.00008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6354  cytochrome c oxidase subunit II  25.58 
 
 
334 aa  47.4  0.00008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3955  cytochrome c oxidase subunit II  32 
 
 
391 aa  47.4  0.00008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.113374 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4171  nitrous-oxide reductase  32.47 
 
 
649 aa  47  0.00008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0581  cytochrome c oxidase subunit II  32 
 
 
294 aa  47.4  0.00008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00300077  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4059  nitrous-oxide reductase  32.47 
 
 
649 aa  47  0.00008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00566192  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2422  cytochrome c oxidase family protein  26.37 
 
 
141 aa  47  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>