74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1313 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1313  blue (type 1) copper domain protein  100 
 
 
172 aa  326  8e-89  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.705795  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1621  blue (type 1) copper domain protein  50.54 
 
 
110 aa  92.4  3e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0571414  normal  0.244235 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1088  plastocyanin  38.46 
 
 
125 aa  60.1  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000603452 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1005  blue (type 1) copper domain protein  38.24 
 
 
138 aa  60.1  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0739  halocyanin domain protein  33.52 
 
 
160 aa  58.9  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1871  blue (type 1) copper domain protein  28.65 
 
 
221 aa  58.2  0.00000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0614509 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1156  halocyanin domain protein  40.22 
 
 
186 aa  58.2  0.00000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.362387 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4559  plastocyanin  37.14 
 
 
127 aa  57.8  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2688  halocyanin domain protein  31.65 
 
 
179 aa  57.4  0.00000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.266175  normal  0.114793 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2288  serine/threonine protein kinase  60 
 
 
771 aa  56.2  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000513908 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2435  halocyanin domain protein  42.7 
 
 
347 aa  55.5  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  decreased coverage  0.000875368 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3078  cellulosome anchoring protein, cohesin region  61.22 
 
 
2313 aa  55.8  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1173  halocyanin domain protein  38.3 
 
 
136 aa  55.1  0.0000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.00281151 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34733  plastocyanin, chloroplast precursor  37.62 
 
 
104 aa  53.9  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06371  plastocyanin  39.78 
 
 
116 aa  53.1  0.000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06371  plastocyanin  38.37 
 
 
116 aa  52.8  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0952102  normal  0.874773 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0793  halocyanin domain protein  39.29 
 
 
205 aa  53.1  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.289912  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0017  plastocyanin  38.37 
 
 
116 aa  53.1  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.771707  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0581  plastocyanin  38.71 
 
 
116 aa  51.2  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2294  plastocyanin  34 
 
 
119 aa  49.7  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0308558  normal  0.029451 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1476  halocyanin domain protein  39.33 
 
 
231 aa  49.3  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2240  plastocyanin  34 
 
 
119 aa  49.7  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0451  hypothetical protein  44.26 
 
 
682 aa  49.3  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.935118  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1679  hypothetical protein  47.83 
 
 
746 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.548222  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06071  plastocyanin  38.71 
 
 
116 aa  48.5  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0830  redoxin domain-containing protein  56 
 
 
329 aa  48.1  0.00006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2854  halocyanin domain protein  38.89 
 
 
210 aa  48.1  0.00006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.811461  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3100  halocyanin domain protein  39.77 
 
 
224 aa  48.1  0.00006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0679  hypothetical protein  50.72 
 
 
625 aa  47.8  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00239733  hitchhiker  0.00966173 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0916  plastocyanin  40 
 
 
119 aa  47.8  0.00007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.222865  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6275  pseudoazurin  30.11 
 
 
147 aa  47.8  0.00008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.246646 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3202  blue (type 1) copper domain protein  37.78 
 
 
807 aa  47.8  0.00008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.720894  normal  0.248673 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06461  plastocyanin  37.63 
 
 
116 aa  47  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.937671  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1015  plastocyanin  36.71 
 
 
126 aa  47  0.0001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.381594  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18341  plastocyanin  37.5 
 
 
119 aa  46.6  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.259314 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3226  hypothetical protein  26.74 
 
 
188 aa  46.6  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0129718  normal  0.0283497 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2129  blue (type 1) copper domain protein  34.34 
 
 
137 aa  46.6  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.550274 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1087  pseudoazurin  28.09 
 
 
148 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.155956 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5624  pseudoazurin  32.58 
 
 
152 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.300096  normal  0.462695 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0098  hypothetical protein  61.22 
 
 
605 aa  45.8  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0997115  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5841  pseudoazurin  31.91 
 
 
152 aa  45.8  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1667  blue (type1) copper domain-containing protein  30.43 
 
 
164 aa  45.4  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.393546 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0822  kelch repeat-containing protein  70.21 
 
 
497 aa  45.4  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.803957  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4301  blue (type 1) copper domain protein  35.19 
 
 
235 aa  45.4  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1926  pseudoazurin  26.88 
 
 
144 aa  45.1  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0642736 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10711  plastocyanin  35.87 
 
 
128 aa  45.1  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.590546 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1527  hypothetical protein  46.38 
 
 
229 aa  44.3  0.0009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0816972  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  58.49 
 
 
846 aa  44.3  0.0009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2246  hypothetical protein  46.77 
 
 
240 aa  43.5  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1216  pseudoazurin  26.97 
 
 
146 aa  43.5  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4006  blue (type 1) copper domain protein  31.25 
 
 
140 aa  43.9  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1509  blue (type 1) copper domain protein  25.93 
 
 
146 aa  43.9  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3995  blue (type1) copper domain-containing protein  27.64 
 
 
180 aa  44.3  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.704782  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0282  pseudoazurin  30.23 
 
 
146 aa  44.3  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1549  hypothetical protein  43.28 
 
 
595 aa  43.9  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0768704  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0258  pseudoazurin (cupredoxin) (blue copper protein)  30.23 
 
 
168 aa  43.5  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1021  pseudoazurin  28.57 
 
 
144 aa  43.9  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0960  plastocyanin  30.11 
 
 
139 aa  43.1  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.821855  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3707  transglutaminase domain-containing protein  44.19 
 
 
876 aa  42.7  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1244  blue (type1) copper domain-containing protein  31.07 
 
 
173 aa  43.1  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0177218  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2077  pseudoazurin  29.76 
 
 
151 aa  43.5  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.227415  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4621  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  60.78 
 
 
830 aa  43.1  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.184337  normal  0.0506116 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0581  halocyanin domain protein  32.95 
 
 
212 aa  42.4  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0679046  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1666  cellulose-binding family II protein  46.91 
 
 
455 aa  42.7  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000449243  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4504  PT repeat-containing protein  59.65 
 
 
456 aa  42  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4336  alpha amylase catalytic region  58.18 
 
 
914 aa  42  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0331  hypothetical protein  53.19 
 
 
476 aa  42  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.638038  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2576  halocyanin domain protein  28.47 
 
 
218 aa  42  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0568  pseudoazurin  32.26 
 
 
144 aa  41.6  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.402992  normal  0.3405 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0810  laminin G  52.54 
 
 
433 aa  41.6  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.478954  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4505  PT repeat-containing protein  58.82 
 
 
453 aa  41.6  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3711  peptidase-like  40.54 
 
 
232 aa  41.2  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0580  hypothetical protein  53.57 
 
 
253 aa  40.8  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.306305  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2900  pseudoazurin  30.23 
 
 
146 aa  40.8  0.009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.497446  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>