259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3707 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_3707  transglutaminase domain-containing protein  100 
 
 
876 aa  1800    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1056  transglutaminase-like protein  26.37 
 
 
890 aa  125  3e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0389  transglutaminase domain protein  32.3 
 
 
677 aa  119  1.9999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2272  putative membrane-bound protease  26.5 
 
 
635 aa  112  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1966  transglutaminase domain-containing protein  27.94 
 
 
742 aa  111  5e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.524806  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1972  membrane-bound protease  25.87 
 
 
742 aa  111  7.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.608731  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1951  transglutaminase superfamily protease  25.87 
 
 
742 aa  111  7.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1927  transglutaminase superfamily protease  26.5 
 
 
742 aa  111  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0890481  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2120  membrane-bound protease  25.87 
 
 
742 aa  111  7.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.901767  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2155  putative membrane-bound protease  25.87 
 
 
742 aa  110  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2132  putative membrane-bound protease  26.51 
 
 
742 aa  108  6e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3183  putative membrane-bound protease  34.95 
 
 
742 aa  107  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0236  transglutaminase domain protein  27.54 
 
 
728 aa  105  3e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1711  transglutaminase domain protein  38.41 
 
 
806 aa  104  7e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2203  membrane-bound protease, putative  37.18 
 
 
742 aa  103  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1117  transglutaminase domain protein  25.32 
 
 
720 aa  101  7e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0930  transglutaminase domain-containing protein  29.48 
 
 
730 aa  98.2  5e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3364  transglutaminase domain-containing protein  26.16 
 
 
795 aa  95.9  3e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1078  transglutaminase domain protein  30.65 
 
 
862 aa  92  4e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0440  transglutaminase domain protein  30.9 
 
 
748 aa  91.3  7e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1181  transglutaminase-like protein  34.44 
 
 
760 aa  89.4  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.160419  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1793  transglutaminase-like protein  30.64 
 
 
943 aa  87.8  9e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.634482  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0773  transglutaminase domain protein  31 
 
 
790 aa  87  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1098  transglutaminase-like  30.39 
 
 
788 aa  85.1  0.000000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1095  transglutaminase domain protein  33.96 
 
 
886 aa  83.6  0.00000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1885  transglutaminase domain-containing protein  33.85 
 
 
656 aa  82.8  0.00000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.307822  normal  0.724755 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0964  transglutaminase domain-containing protein  34.39 
 
 
800 aa  82.4  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.490195  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0245  transglutaminase domain-containing protein  29.69 
 
 
826 aa  82  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.894287  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0884  transglutaminase domain protein  27.85 
 
 
800 aa  82  0.00000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0726  transglutaminase domain protein  29.52 
 
 
668 aa  80.9  0.0000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0047  transglutaminase domain protein  34.25 
 
 
681 aa  80.1  0.0000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.10552  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1683  transglutaminase domain protein  36.61 
 
 
673 aa  79.7  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.151081  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0315  transglutaminase domain-containing protein  30.16 
 
 
815 aa  79.7  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.072892  normal  0.0490481 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3379  transglutaminase domain protein  28 
 
 
673 aa  79  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.207314  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2532  transglutaminase domain-containing protein  30.64 
 
 
691 aa  78.6  0.0000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2074  transglutaminase domain protein  32.14 
 
 
645 aa  78.6  0.0000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.618768  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1489  transglutaminase domain-containing protein  30.38 
 
 
662 aa  78.2  0.0000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00458411  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5565  transglutaminase-like  36.21 
 
 
676 aa  78.2  0.0000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.633958  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2055  transglutaminase-like  31.58 
 
 
669 aa  77.8  0.0000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.323806  normal  0.622642 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5110  transglutaminase domain-containing protein  24.59 
 
 
825 aa  77.4  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167034  normal  0.118743 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2424  transglutaminase domain-containing protein  31.11 
 
 
639 aa  77.4  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000343547  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1839  transglutaminase-like protein  30.95 
 
 
653 aa  76.3  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.544604  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1278  transglutaminase domain protein  35.51 
 
 
846 aa  76.6  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000235429 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2250  transglutaminase-like domain protein  29.71 
 
 
641 aa  75.9  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2128  transglutaminase domain-containing protein  28.7 
 
 
680 aa  75.9  0.000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2519  transglutaminase-like  31.34 
 
 
645 aa  75.9  0.000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.135415 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2350  transglutaminase-like protein  28.93 
 
 
730 aa  75.1  0.000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0581  transglutaminase-like domain-containing protein  34.75 
 
 
1238 aa  75.1  0.000000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1899  transglutaminase family protein  24.92 
 
 
689 aa  75.1  0.000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.642436  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0862  transglutaminase domain protein  28.29 
 
 
649 aa  74.7  0.000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1943  transglutaminase-like  26.42 
 
 
767 aa  74.7  0.000000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.444996  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1674  transglutaminase-like superfamily protein  25.94 
 
 
767 aa  74.3  0.000000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1877  transglutaminase-like  32.31 
 
 
667 aa  73.9  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16680  transglutaminase-like enzyme, predicted cysteine protease  30.43 
 
 
783 aa  73.6  0.00000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.738671  normal  0.0217109 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1325  transglutaminase domain protein  30.32 
 
 
680 aa  73.9  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00529222  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2776  putative protease  34.59 
 
 
754 aa  73.2  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.60504  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3011  transglutaminase domain protein  33.07 
 
 
672 aa  73.6  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.340664  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3460  transglutaminase domain-containing protein  27.22 
 
 
822 aa  73.2  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0458672 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0628  transglutaminase domain protein  26.61 
 
 
736 aa  73.2  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0435182 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0661  transglutaminase domain-containing protein  33.04 
 
 
706 aa  73.6  0.00000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.233246  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02438  hypothetical protein  29.93 
 
 
635 aa  73.2  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2448  transglutaminase domain-containing protein  33.9 
 
 
661 aa  73.2  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.401326  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1873  hypothetical protein  28.41 
 
 
662 aa  72  0.00000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1588  transglutaminase domain protein  30.95 
 
 
840 aa  72  0.00000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2161  transglutaminase domain-containing protein  30.81 
 
 
684 aa  71.6  0.00000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0907066  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2531  transglutaminase-like  29.23 
 
 
673 aa  71.6  0.00000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2042  transglutaminase domain protein  32.02 
 
 
633 aa  70.9  0.00000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2289  transglutaminase domain protein  34.95 
 
 
707 aa  70.5  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0224849  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0189  transglutaminase domain-containing protein  33.57 
 
 
763 aa  70.9  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3624  hypothetical protein  36.28 
 
 
671 aa  70.5  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.67941  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2625  transglutaminase domain-containing protein  25.89 
 
 
667 aa  70.5  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.253988  normal  0.029419 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2150  transglutaminase family protein  28.33 
 
 
732 aa  69.7  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2281  transglutaminase family protein  28.02 
 
 
662 aa  70.1  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2096  transglutaminase domain-containing protein  34.95 
 
 
734 aa  69.7  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2773  transglutaminase-like protein  24.15 
 
 
749 aa  70.1  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.663199  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2049  transglutaminase domain-containing protein  34.95 
 
 
734 aa  69.7  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1575  transglutaminase domain-containing protein  27.71 
 
 
696 aa  70.1  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1217  transglutaminase domain-containing protein  37.04 
 
 
689 aa  69.7  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.726162  normal  0.124375 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1864  hypothetical protein  28.41 
 
 
662 aa  69.3  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1212  hypothetical protein  29.71 
 
 
685 aa  69.3  0.0000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.558928  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1118  transglutaminase domain-containing protein  29.71 
 
 
685 aa  69.3  0.0000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2914  transglutaminase domain-containing protein  28.68 
 
 
706 aa  69.3  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.384683 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3579  transglutaminase domain protein  34.27 
 
 
774 aa  68.9  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3274  transglutaminase domain protein  36.7 
 
 
792 aa  68.6  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2098  transglutaminase domain-containing protein  31.82 
 
 
685 aa  68.9  0.0000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2305  transglutaminase domain protein  31.58 
 
 
688 aa  68.6  0.0000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2067  hypothetical protein  31.62 
 
 
683 aa  68.6  0.0000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.312074  normal  0.672104 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3148  transglutaminase-like  31.5 
 
 
676 aa  68.6  0.0000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.442197 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4563  hypothetical protein  34.95 
 
 
739 aa  68.6  0.0000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2277  transglutaminase domain-containing protein  34.95 
 
 
739 aa  68.6  0.0000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2146  transglutaminase-like  35.4 
 
 
744 aa  68.2  0.0000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.360106  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2368  transglutaminase domain-containing protein  37.96 
 
 
660 aa  68.6  0.0000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.34384  normal  0.577646 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0413  transglutaminase domain-containing protein  34.43 
 
 
507 aa  68.2  0.0000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.939018 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1776  transglutaminase domain-containing protein  30.46 
 
 
715 aa  68.2  0.0000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1854  transglutaminase domain-containing protein  31.03 
 
 
715 aa  68.2  0.0000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2422  transglutaminase domain protein  24.74 
 
 
725 aa  67.8  0.0000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0450779 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26930  transglutaminase-like domain-containing protein  27.96 
 
 
668 aa  67.8  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2938  transglutaminase domain protein  31.08 
 
 
810 aa  67.8  0.0000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00806271  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2244  transglutaminase domain-containing protein  31.03 
 
 
715 aa  67.8  0.0000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.572767  normal  0.393914 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2109  transglutaminase domain-containing protein  29.29 
 
 
709 aa  67  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>