34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1476 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_1476  halocyanin domain protein  100 
 
 		 231 aa  448  1e-125  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1156  halocyanin domain protein  61.95 
 
 		 186 aa  133  1.9999999999999998e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.362387 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2435  halocyanin domain protein  52.63 
 
 		 347 aa  126  3e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000875368 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0581  halocyanin domain protein  50 
 
 		 212 aa  123  2e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0679046  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0793  halocyanin domain protein  55.37 
 
 		 205 aa  122  6e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.289912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0570  halocyanin domain protein  43.43 
 
 		 209 aa  120  1.9999999999999998e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.23024  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2854  halocyanin domain protein  49.57 
 
 		 210 aa  100  1e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.811461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3100  halocyanin domain protein  49.24 
 
 		 224 aa  100  2e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2688  halocyanin domain protein  49.12 
 
 		 179 aa  97.8  1e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.266175  normal  0.114793 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1173  halocyanin domain protein  51.55 
 
 		 136 aa  95.1  9e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00281151 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0583  blue (type 1) copper domain protein  51.4 
 
 		 209 aa  93.2  3e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.308341 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0645  blue (type 1) copper domain protein  50.43 
 
 		 214 aa  92.8  4e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.375984  normal  0.285724 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2576  halocyanin domain protein  36.41 
 
 		 218 aa  91.3  1e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0739  halocyanin domain protein  43.48 
 
 		 160 aa  90.1  3e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2685  halocyanin domain protein  40 
 
 		 292 aa  74.3  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.197365  normal  0.0848247 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0721  blue (type 1) copper domain protein  34.62 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0239  blue (type1) copper domain-containing protein  29.7 
 
 		 97 aa  50.8  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3437  hypothetical protein  39.76 
 
 		 181 aa  49.3  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4301  blue (type 1) copper domain protein  34.02 
 
 		 235 aa  48.5  0.00008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1313  blue (type 1) copper domain protein  39.33 
 
 		 172 aa  48.5  0.00008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.705795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1005  blue (type 1) copper domain protein  28.93 
 
 		 138 aa  48.1  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3202  blue (type 1) copper domain protein  31.48 
 
 		 807 aa  47  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.720894  normal  0.248673 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1088  plastocyanin  35.87 
 
 		 125 aa  45.8  0.0006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000603452 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1244  blue (type1) copper domain-containing protein  31.91 
 
 		 173 aa  45.4  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0177218  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1871  blue (type 1) copper domain protein  48.84 
 
 		 221 aa  45.1  0.0009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0614509 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2129  blue (type 1) copper domain protein  30.91 
 
 		 137 aa  43.9  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.550274 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2294  plastocyanin  33.7 
 
 		 119 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0308558  normal  0.029451 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0975  blue (type1) copper domain-containing protein  34.44 
 
 		 120 aa  43.9  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2240  plastocyanin  33.7 
 
 		 119 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1788  plastocyanin-like protein  31.4 
 
 		 264 aa  43.1  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.341565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3552  blue (type 1) copper domain protein  29.67 
 
 		 119 aa  43.1  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0817  blue (type1) copper domain-containing protein  31.25 
 
 		 97 aa  42.7  0.004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.737466  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2525  blue (type 1) copper domain protein  34.62 
 
 		 179 aa  42.4  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197814  normal  0.378736 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1354  multicopper oxidase type 3  32.91 
 
 		 444 aa  42.4  0.007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.111259 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>