19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0645 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_0645  blue (type 1) copper domain protein  100 
 
 		 214 aa  427  1e-119  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.375984  normal  0.285724 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0583  blue (type 1) copper domain protein  72.91 
 
 		 209 aa  239  2e-62  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.308341 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0581  halocyanin domain protein  45.91 
 
 		 212 aa  150  1e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0679046  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3100  halocyanin domain protein  47.27 
 
 		 224 aa  123  2e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0793  halocyanin domain protein  50.94 
 
 		 205 aa  96.7  3e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.289912  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1476  halocyanin domain protein  46 
 
 		 231 aa  95.9  5e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0570  halocyanin domain protein  38.01 
 
 		 209 aa  93.2  3e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.23024  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2854  halocyanin domain protein  40.24 
 
 		 210 aa  84.7  9e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.811461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2688  halocyanin domain protein  45.71 
 
 		 179 aa  77.4  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.266175  normal  0.114793 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2435  halocyanin domain protein  37.09 
 
 		 347 aa  72.8  0.000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000875368 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1156  halocyanin domain protein  45.45 
 
 		 186 aa  70.9  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.362387 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1173  halocyanin domain protein  46.53 
 
 		 136 aa  71.2  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00281151 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0739  halocyanin domain protein  40.95 
 
 		 160 aa  62.4  0.000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2576  halocyanin domain protein  32.82 
 
 		 218 aa  54.3  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2685  halocyanin domain protein  33.64 
 
 		 292 aa  54.3  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.197365  normal  0.0848247 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1663  pseudoazurin  30.77 
 
 		 153 aa  43.9  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0434336  normal  0.465433 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1088  plastocyanin  34.41 
 
 		 125 aa  43.5  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000603452 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2686  pseudoazurin  26.72 
 
 		 173 aa  43.1  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0680681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0263  blue (type1) copper domain-containing protein  33.33 
 
 		 146 aa  42  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.804107  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>